Protein–RNA interactions for Protein: Q9NPR2

SEMA4B, Semaphorin-4B, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 832 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SEMA4BQ9NPR2 EIF4EBP1-201ENST00000338825 1020 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.77■□□□□ 0.92
SEMA4BQ9NPR2 AC096631.2-201ENST00000436136 790 ntBASIC20.77■□□□□ 0.92
SEMA4BQ9NPR2 TOLLIP-208ENST00000527938 549 ntTSL 4 BASIC20.77■□□□□ 0.92
SEMA4BQ9NPR2 GALNS-211ENST00000568311 703 ntTSL 1 (best) BASIC20.77■□□□□ 0.92
SEMA4BQ9NPR2 ACP1-201ENST00000272065 1549 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC20.77■□□□□ 0.92
SEMA4BQ9NPR2 CDC14A-203ENST00000370124 1883 ntTSL 1 (best) BASIC20.77■□□□□ 0.92
SEMA4BQ9NPR2 SPRN-201ENST00000414069 3128 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.77■□□□□ 0.92
SEMA4BQ9NPR2 TRIB3-201ENST00000217233 2499 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.77■□□□□ 0.91
SEMA4BQ9NPR2 UNC119-201ENST00000301032 1653 ntTSL 1 (best) BASIC20.77■□□□□ 0.91
SEMA4BQ9NPR2 PPP3CC-203ENST00000397775 2094 ntTSL 2 BASIC20.76■□□□□ 0.91
SEMA4BQ9NPR2 PLEKHG4-201ENST00000360461 6782 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC20.76■□□□□ 0.91
SEMA4BQ9NPR2 ORAI3-201ENST00000318663 2206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.76■□□□□ 0.91
SEMA4BQ9NPR2 ZNF517-207ENST00000531720 1615 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.76■□□□□ 0.91
SEMA4BQ9NPR2 HSF2BP-201ENST00000291560 1899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.76■□□□□ 0.91
SEMA4BQ9NPR2 UNC93B3-201ENST00000308076 687 ntBASIC20.76■□□□□ 0.91
SEMA4BQ9NPR2 CHTF8-208ENST00000522091 863 ntTSL 2 BASIC20.76■□□□□ 0.91
SEMA4BQ9NPR2 AC110285.6-201ENST00000617652 491 ntBASIC20.76■□□□□ 0.91
SEMA4BQ9NPR2 ITGBL1-206ENST00000618057 2368 ntTSL 1 (best) BASIC20.76■□□□□ 0.91
SEMA4BQ9NPR2 IKBKG-206ENST00000594239 2299 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.76■□□□□ 0.91
SEMA4BQ9NPR2 TRIP13-201ENST00000166345 2672 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.76■□□□□ 0.91
SEMA4BQ9NPR2 FAM171A2-201ENST00000293443 3160 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.76■□□□□ 0.91
SEMA4BQ9NPR2 ZFYVE9-201ENST00000287727 5194 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC20.76■□□□□ 0.91
SEMA4BQ9NPR2 AL606970.3-201ENST00000446811 2246 ntTSL 2 BASIC20.76■□□□□ 0.91
SEMA4BQ9NPR2 ANKRD13D-202ENST00000447274 2881 ntTSL 1 (best) BASIC20.75■□□□□ 0.91
SEMA4BQ9NPR2 ZNF446-208ENST00000622313 1884 ntTSL 1 (best) BASIC20.75■□□□□ 0.91
SEMA4BQ9NPR2 DISC1-212ENST00000535983 2505 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.75■□□□□ 0.91
SEMA4BQ9NPR2 AP001107.5-202ENST00000533759 948 ntTSL 5 BASIC20.75■□□□□ 0.91
SEMA4BQ9NPR2 TYROBP-203ENST00000544690 522 ntTSL 1 (best) BASIC20.75■□□□□ 0.91
SEMA4BQ9NPR2 MIR4767-201ENST00000582827 78 ntBASIC20.75■□□□□ 0.91
SEMA4BQ9NPR2 GFRA3-202ENST00000378362 1837 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.75■□□□□ 0.91
SEMA4BQ9NPR2 SOCS7-202ENST00000613678 1827 ntTSL 5 BASIC20.75■□□□□ 0.91
SEMA4BQ9NPR2 CAPG-201ENST00000263867 1442 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.75■□□□□ 0.91
SEMA4BQ9NPR2 LRP5L-203ENST00000444995 1714 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.75■□□□□ 0.91
SEMA4BQ9NPR2 SPOP-206ENST00000504102 1865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.75■□□□□ 0.91
SEMA4BQ9NPR2 MTURN-201ENST00000324453 5937 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.75■□□□□ 0.91
SEMA4BQ9NPR2 MRPL37-202ENST00000360840 1483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.75■□□□□ 0.91
SEMA4BQ9NPR2 TMCC2-209ENST00000637895 1455 ntTSL 1 (best) BASIC20.75■□□□□ 0.91
SEMA4BQ9NPR2 TRIM3-202ENST00000359518 3042 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.75■□□□□ 0.91
SEMA4BQ9NPR2 SMPD2-201ENST00000258052 1645 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.75■□□□□ 0.91
SEMA4BQ9NPR2 AC003102.1-202ENST00000563394 1796 ntBASIC20.74■□□□□ 0.91
SEMA4BQ9NPR2 IRX4-206ENST00000513692 2391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.74■□□□□ 0.91
SEMA4BQ9NPR2 AOC3-207ENST00000617500 2392 ntTSL 4 BASIC20.74■□□□□ 0.91
SEMA4BQ9NPR2 TMEM98-206ENST00000579849 4434 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.74■□□□□ 0.91
SEMA4BQ9NPR2 GCH1-202ENST00000395514 1977 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.74■□□□□ 0.91
SEMA4BQ9NPR2 AL024507.2-201ENST00000606070 2574 ntBASIC20.74■□□□□ 0.91
SEMA4BQ9NPR2 CACNA1B-201ENST00000277549 7158 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.74■□□□□ 0.91
SEMA4BQ9NPR2 CACNA1B-202ENST00000277551 7158 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.74■□□□□ 0.91
SEMA4BQ9NPR2 APPL2-201ENST00000258530 3239 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.74■□□□□ 0.91
SEMA4BQ9NPR2 HES4-201ENST00000304952 899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.74■□□□□ 0.91
SEMA4BQ9NPR2 C8orf82-201ENST00000313465 2186 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.74■□□□□ 0.91
SEMA4BQ9NPR2 PCGF3-202ENST00000400151 1175 ntTSL 2 BASIC20.74■□□□□ 0.91
SEMA4BQ9NPR2 AC061979.1-201ENST00000532061 434 ntTSL 5 BASIC20.74■□□□□ 0.91
SEMA4BQ9NPR2 AL139246.5-201ENST00000606645 996 ntBASIC20.74■□□□□ 0.91
SEMA4BQ9NPR2 CBWD3-212ENST00000616550 721 ntTSL 2 BASIC20.74■□□□□ 0.91
SEMA4BQ9NPR2 CBWD6-216ENST00000617933 721 ntTSL 3 BASIC20.74■□□□□ 0.91
SEMA4BQ9NPR2 EEF1D-204ENST00000423316 2378 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC20.74■□□□□ 0.91
SEMA4BQ9NPR2 CENPS-CORT-201ENST00000400900 1469 ntTSL 2 BASIC20.74■□□□□ 0.91
SEMA4BQ9NPR2 GPSM1-206ENST00000616132 2270 ntTSL 1 (best) BASIC20.74■□□□□ 0.91
SEMA4BQ9NPR2 ECE2-203ENST00000359140 3147 ntTSL 1 (best) BASIC20.73■□□□□ 0.91
SEMA4BQ9NPR2 ACADVL-202ENST00000350303 2191 ntTSL 1 (best) BASIC20.73■□□□□ 0.91
SEMA4BQ9NPR2 BOK-201ENST00000318407 2657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.73■□□□□ 0.91
SEMA4BQ9NPR2 LPAR1-201ENST00000358883 2687 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC20.73■□□□□ 0.91
SEMA4BQ9NPR2 RASGEF1C-201ENST00000361132 2243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.73■□□□□ 0.91
SEMA4BQ9NPR2 ZNF331-202ENST00000411977 2248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.73■□□□□ 0.91
SEMA4BQ9NPR2 DNPH1-201ENST00000230431 657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.73■□□□□ 0.91
SEMA4BQ9NPR2 PHPT1-201ENST00000247665 890 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.73■□□□□ 0.91
SEMA4BQ9NPR2 IGHV3-20-201ENST00000390606 415 ntAPPRIS P1 BASIC20.73■□□□□ 0.91
SEMA4BQ9NPR2 PRMT2-204ENST00000397628 954 ntTSL 2 BASIC20.73■□□□□ 0.91
SEMA4BQ9NPR2 ZNF584-205ENST00000596281 575 ntTSL 2 BASIC20.73■□□□□ 0.91
SEMA4BQ9NPR2 EPHX3-204ENST00000602233 1805 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.73■□□□□ 0.91
SEMA4BQ9NPR2 TMEM121-202ENST00000431372 1519 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.73■□□□□ 0.91
SEMA4BQ9NPR2 ST3GAL5-222ENST00000638572 4431 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.73■□□□□ 0.91
SEMA4BQ9NPR2 DYM-203ENST00000442713 2147 ntTSL 2 BASIC20.72■□□□□ 0.91
SEMA4BQ9NPR2 NKX6-1-202ENST00000515820 2194 ntTSL 3 BASIC20.72■□□□□ 0.91
SEMA4BQ9NPR2 SRM-201ENST00000376957 1266 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.72■□□□□ 0.91
SEMA4BQ9NPR2 RNF208-201ENST00000391553 1077 ntAPPRIS P1 BASIC20.72■□□□□ 0.91
SEMA4BQ9NPR2 CKLF-205ENST00000417030 628 ntAPPRIS ALT2 TSL 4 BASIC20.72■□□□□ 0.91
SEMA4BQ9NPR2 BX842568.3-201ENST00000418104 571 ntBASIC20.72■□□□□ 0.91
SEMA4BQ9NPR2 POLR2F-211ENST00000488684 564 ntTSL 2 BASIC20.72■□□□□ 0.91
SEMA4BQ9NPR2 GJD3-201ENST00000578689 885 ntAPPRIS P1 BASIC20.72■□□□□ 0.91
SEMA4BQ9NPR2 PCSK6-217ENST00000618548 4269 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.72■□□□□ 0.91
SEMA4BQ9NPR2 NUDT10-201ENST00000356450 1917 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.72■□□□□ 0.91
SEMA4BQ9NPR2 GGA2-211ENST00000567468 1713 ntTSL 2 BASIC20.72■□□□□ 0.91
SEMA4BQ9NPR2 CHN1-203ENST00000409156 1761 ntTSL 2 BASIC20.72■□□□□ 0.91
SEMA4BQ9NPR2 FPGS-202ENST00000373228 1383 ntTSL 5 BASIC20.72■□□□□ 0.91
SEMA4BQ9NPR2 CPNE9-203ENST00000383832 2068 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.71■□□□□ 0.91
SEMA4BQ9NPR2 CIZ1-204ENST00000372938 2984 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.71■□□□□ 0.91
SEMA4BQ9NPR2 GAL3ST3-201ENST00000312006 2133 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.71■□□□□ 0.91
SEMA4BQ9NPR2 C10orf55-202ENST00000412307 2360 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.71■□□□□ 0.91
SEMA4BQ9NPR2 NEU4-204ENST00000405370 1907 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.71■□□□□ 0.91
SEMA4BQ9NPR2 CCKBR-206ENST00000532715 1734 ntTSL 3 BASIC20.71■□□□□ 0.91
SEMA4BQ9NPR2 PRRT4-207ENST00000535159 2897 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.71■□□□□ 0.91
SEMA4BQ9NPR2 NAA38-201ENST00000333775 999 ntTSL 1 (best) BASIC20.71■□□□□ 0.91
SEMA4BQ9NPR2 LYPD2-201ENST00000359228 594 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.71■□□□□ 0.91
SEMA4BQ9NPR2 NRIP3-203ENST00000531090 980 ntTSL 2 BASIC20.71■□□□□ 0.91
SEMA4BQ9NPR2 AC024257.2-201ENST00000549699 147 ntBASIC20.71■□□□□ 0.91
SEMA4BQ9NPR2 AL136162.1-201ENST00000607711 1078 ntBASIC20.71■□□□□ 0.91
SEMA4BQ9NPR2 PMPCA-203ENST00000399219 1987 ntTSL 2 BASIC20.71■□□□□ 0.91
SEMA4BQ9NPR2 RAB3A-201ENST00000222256 1528 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.71■□□□□ 0.91
SEMA4BQ9NPR2 KDELR1-203ENST00000597017 1594 ntTSL 2 BASIC20.71■□□□□ 0.91
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 32.9 ms