Protein–RNA interactions for Protein: Q9H6D8

FNDC4, Fibronectin type III domain-containing protein 4, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 234 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
FNDC4Q9H6D8 GSPT1-203ENST00000439887 2509 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
FNDC4Q9H6D8 APPL2-201ENST00000258530 3239 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
FNDC4Q9H6D8 SEPT5-209ENST00000438754 2241 ntTSL 2 BASIC16.78■□□□□ 0.28
FNDC4Q9H6D8 DMRT2-203ENST00000358146 1965 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
FNDC4Q9H6D8 TRABD2A-203ENST00000409520 1975 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
FNDC4Q9H6D8 SPRN-201ENST00000414069 3128 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
FNDC4Q9H6D8 PRRT4-207ENST00000535159 2897 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.78■□□□□ 0.28
FNDC4Q9H6D8 SOX3-201ENST00000370536 2132 ntAPPRIS P1 BASIC16.78■□□□□ 0.28
FNDC4Q9H6D8 ARSA-202ENST00000356098 1895 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
FNDC4Q9H6D8 SKI-201ENST00000378536 5613 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
FNDC4Q9H6D8 CPNE9-203ENST00000383832 2068 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.77■□□□□ 0.28
FNDC4Q9H6D8 PPP3CC-203ENST00000397775 2094 ntTSL 2 BASIC16.77■□□□□ 0.28
FNDC4Q9H6D8 STRADB-201ENST00000194530 2293 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.28
FNDC4Q9H6D8 TMC7-205ENST00000569532 2738 ntTSL 2 BASIC16.77■□□□□ 0.28
FNDC4Q9H6D8 GNS-207ENST00000542058 2020 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.77■□□□□ 0.28
FNDC4Q9H6D8 HHIPL1-202ENST00000357223 2241 ntTSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.28
FNDC4Q9H6D8 TTYH1-203ENST00000376531 1763 ntTSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.28
FNDC4Q9H6D8 SLC1A5-203ENST00000542575 2882 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.28
FNDC4Q9H6D8 PYGO2-201ENST00000368456 1306 ntTSL 2 BASIC16.77■□□□□ 0.28
FNDC4Q9H6D8 HYI-204ENST00000372432 1066 ntTSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.28
FNDC4Q9H6D8 SERGEF-219ENST00000532265 1124 ntTSL 2 BASIC16.77■□□□□ 0.28
FNDC4Q9H6D8 DUX4L19-201ENST00000557448 1267 ntBASIC16.77■□□□□ 0.28
FNDC4Q9H6D8 TMC6-218ENST00000591436 1155 ntTSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.28
FNDC4Q9H6D8 ZNF264-206ENST00000600531 774 ntTSL 2 BASIC16.77■□□□□ 0.28
FNDC4Q9H6D8 MMP28-203ENST00000612672 1092 ntTSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.28
FNDC4Q9H6D8 SAP25-203ENST00000614631 987 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC16.77■□□□□ 0.28
FNDC4Q9H6D8 KRTAP5-4-202ENST00000616115 660 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.77■□□□□ 0.28
FNDC4Q9H6D8 AC136469.2-201ENST00000623944 1028 ntBASIC16.77■□□□□ 0.28
FNDC4Q9H6D8 WT1-210ENST00000639563 1494 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.28
FNDC4Q9H6D8 DCK-201ENST00000286648 2716 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.28
FNDC4Q9H6D8 ARFGAP3-201ENST00000263245 2857 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.27
FNDC4Q9H6D8 CAPG-201ENST00000263867 1442 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.27
FNDC4Q9H6D8 CERKL-205ENST00000409440 2425 ntTSL 2 BASIC16.77■□□□□ 0.27
FNDC4Q9H6D8 KDM2A-202ENST00000398645 6511 ntTSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.27
FNDC4Q9H6D8 MEIS3-202ENST00000441740 1758 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.27
FNDC4Q9H6D8 QPCT-201ENST00000338415 1739 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
FNDC4Q9H6D8 CCKBR-206ENST00000532715 1734 ntTSL 3 BASIC16.76■□□□□ 0.27
FNDC4Q9H6D8 RHBDL3-204ENST00000538145 1338 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
FNDC4Q9H6D8 C12orf75-208ENST00000612117 1329 ntTSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
FNDC4Q9H6D8 FGF2-201ENST00000264498 6775 ntTSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
FNDC4Q9H6D8 CDV3-201ENST00000264993 3307 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
FNDC4Q9H6D8 P2RX4-202ENST00000337233 2032 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
FNDC4Q9H6D8 DNAJB5-203ENST00000453597 2589 ntTSL 2 BASIC16.76■□□□□ 0.27
FNDC4Q9H6D8 RAB32-201ENST00000367495 1217 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
FNDC4Q9H6D8 STOX1-202ENST00000399162 935 ntTSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
FNDC4Q9H6D8 STOX1-203ENST00000399165 1135 ntTSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
FNDC4Q9H6D8 SLC47A1P1-202ENST00000449666 945 ntBASIC16.76■□□□□ 0.27
FNDC4Q9H6D8 AC011298.3-201ENST00000615796 283 ntBASIC16.76■□□□□ 0.27
FNDC4Q9H6D8 DYM-203ENST00000442713 2147 ntTSL 2 BASIC16.76■□□□□ 0.27
FNDC4Q9H6D8 CPNE7-202ENST00000319518 2409 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
FNDC4Q9H6D8 RITA1-201ENST00000548278 2053 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
FNDC4Q9H6D8 PPP1R13B-201ENST00000202556 4958 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
FNDC4Q9H6D8 DYRK3-202ENST00000367108 2218 ntTSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
FNDC4Q9H6D8 EFS-202ENST00000351354 2704 ntTSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
FNDC4Q9H6D8 KLHDC2-201ENST00000298307 5514 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
FNDC4Q9H6D8 ZNF707-201ENST00000358656 2183 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.75■□□□□ 0.27
FNDC4Q9H6D8 SGTA-201ENST00000221566 2330 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
FNDC4Q9H6D8 ACP4-201ENST00000270593 1347 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
FNDC4Q9H6D8 DCTD-202ENST00000438320 1972 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
FNDC4Q9H6D8 CENPS-CORT-201ENST00000400900 1469 ntTSL 2 BASIC16.75■□□□□ 0.27
FNDC4Q9H6D8 SMPD2-201ENST00000258052 1645 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
FNDC4Q9H6D8 RASSF1-203ENST00000359365 1923 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
FNDC4Q9H6D8 AC131281.2-201ENST00000520478 145 ntBASIC16.75■□□□□ 0.27
FNDC4Q9H6D8 AP005435.1-201ENST00000529293 1178 ntBASIC16.75■□□□□ 0.27
FNDC4Q9H6D8 LRP5L-203ENST00000444995 1714 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.75■□□□□ 0.27
FNDC4Q9H6D8 OTOP1-201ENST00000296358 1864 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
FNDC4Q9H6D8 TNFAIP2-209ENST00000560869 4683 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.75■□□□□ 0.27
FNDC4Q9H6D8 KCNQ1-202ENST00000335475 2159 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
FNDC4Q9H6D8 LINC00094-201ENST00000432807 2300 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.75■□□□□ 0.27
FNDC4Q9H6D8 AP004607.7-201ENST00000527152 1677 ntBASIC16.75■□□□□ 0.27
FNDC4Q9H6D8 C10orf55-202ENST00000412307 2360 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.74■□□□□ 0.27
FNDC4Q9H6D8 AC003102.1-202ENST00000563394 1796 ntBASIC16.74■□□□□ 0.27
FNDC4Q9H6D8 SMIM19-203ENST00000417410 1466 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.74■□□□□ 0.27
FNDC4Q9H6D8 SNAP23-202ENST00000349777 2480 ntTSL 2 BASIC16.74■□□□□ 0.27
FNDC4Q9H6D8 TUBA1A-201ENST00000295766 1887 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.74■□□□□ 0.27
FNDC4Q9H6D8 ZNF282-204ENST00000610704 3722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
FNDC4Q9H6D8 DUSP9-201ENST00000342782 2433 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
FNDC4Q9H6D8 LINC01123-202ENST00000419296 2436 ntTSL 2 BASIC16.74■□□□□ 0.27
FNDC4Q9H6D8 AP006621.3-202ENST00000530083 765 ntTSL 3 BASIC16.74■□□□□ 0.27
FNDC4Q9H6D8 TMEM206-205ENST00000535273 2119 ntTSL 2 BASIC16.74■□□□□ 0.27
FNDC4Q9H6D8 RAB6A-204ENST00000536566 1267 ntTSL 5 BASIC16.74■□□□□ 0.27
FNDC4Q9H6D8 AL034346.1-201ENST00000568244 1277 ntBASIC16.74■□□□□ 0.27
FNDC4Q9H6D8 GCH1-202ENST00000395514 1977 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
FNDC4Q9H6D8 ZNF746-203ENST00000461958 5051 ntTSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
FNDC4Q9H6D8 CHST8-202ENST00000434302 2225 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.74■□□□□ 0.27
FNDC4Q9H6D8 HTRA3-202ENST00000382512 2023 ntTSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
FNDC4Q9H6D8 PAQR6-213ENST00000612424 2037 ntTSL 2 BASIC16.74■□□□□ 0.27
FNDC4Q9H6D8 TRIM14-202ENST00000342043 1479 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
FNDC4Q9H6D8 HTATIP2-201ENST00000419348 1477 ntTSL 2 BASIC16.73■□□□□ 0.27
FNDC4Q9H6D8 AC025164.2-201ENST00000501008 1898 ntTSL 5 BASIC16.73■□□□□ 0.27
FNDC4Q9H6D8 GAL3ST3-201ENST00000312006 2133 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
FNDC4Q9H6D8 PBX4-201ENST00000251203 1724 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
FNDC4Q9H6D8 YBX3-202ENST00000279550 1708 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
FNDC4Q9H6D8 CCDC166-201ENST00000542437 1320 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.73■□□□□ 0.27
FNDC4Q9H6D8 SYT7-201ENST00000263846 4854 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
FNDC4Q9H6D8 SOBP-201ENST00000317357 5245 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.73■□□□□ 0.27
FNDC4Q9H6D8 FARSA-201ENST00000314606 1814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
FNDC4Q9H6D8 SOCS7-202ENST00000613678 1827 ntTSL 5 BASIC16.73■□□□□ 0.27
FNDC4Q9H6D8 C16orf59-201ENST00000361837 1662 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
FNDC4Q9H6D8 FAM118B-209ENST00000533050 2402 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 47.1 ms