Protein–RNA interactions for Protein: Q9H190

SDCBP2, Syntenin-2, humanhuman

Predictions only

Length 292 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SDCBP2Q9H190 MFF-207ENST00000409565 1548 ntTSL 2 BASIC22.76■■□□□ 1.23
SDCBP2Q9H190 PFKFB3-216ENST00000625260 1752 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.76■■□□□ 1.23
SDCBP2Q9H190 RUSC1-AS1-203ENST00000450199 1636 ntTSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
SDCBP2Q9H190 ILDR2-205ENST00000526687 2299 ntTSL 5 BASIC22.75■■□□□ 1.23
SDCBP2Q9H190 DACT2-203ENST00000607983 1620 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
SDCBP2Q9H190 LY6E-201ENST00000292494 1181 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
SDCBP2Q9H190 COX20-201ENST00000366528 568 ntTSL 2 BASIC22.75■■□□□ 1.23
SDCBP2Q9H190 NRL-201ENST00000396995 810 ntTSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
SDCBP2Q9H190 FAXDC2-211ENST00000520968 558 ntTSL 4 BASIC22.75■■□□□ 1.23
SDCBP2Q9H190 AC012414.4-201ENST00000560839 1074 ntTSL 5 BASIC22.75■■□□□ 1.23
SDCBP2Q9H190 NTF6G-201ENST00000591094 616 ntBASIC22.75■■□□□ 1.23
SDCBP2Q9H190 AC060814.5-201ENST00000630916 1074 ntTSL 2 BASIC22.75■■□□□ 1.23
SDCBP2Q9H190 C6orf136-201ENST00000293604 1978 ntTSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
SDCBP2Q9H190 CSNK1G3-206ENST00000511130 1356 ntTSL 2 BASIC22.75■■□□□ 1.23
SDCBP2Q9H190 NRG3-201ENST00000372141 2158 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
SDCBP2Q9H190 DENND1A-201ENST00000373618 3003 ntTSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
SDCBP2Q9H190 CACYBP-201ENST00000367679 2766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
SDCBP2Q9H190 NFKBIL1-203ENST00000376148 1478 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
SDCBP2Q9H190 GFRA3-201ENST00000274721 2039 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
SDCBP2Q9H190 SPHK1-202ENST00000392496 1779 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
SDCBP2Q9H190 EPHA8-202ENST00000374644 1802 ntTSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
SDCBP2Q9H190 GJB6-203ENST00000400065 1805 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
SDCBP2Q9H190 NDUFB2-207ENST00000465506 1101 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
SDCBP2Q9H190 ATPIF1-204ENST00000497986 599 ntTSL 2 BASIC22.74■■□□□ 1.23
SDCBP2Q9H190 AP002748.1-201ENST00000504911 580 ntTSL 3 BASIC22.74■■□□□ 1.23
SDCBP2Q9H190 Z97653.1-201ENST00000567096 446 ntTSL 3 BASIC22.74■■□□□ 1.23
SDCBP2Q9H190 NOC4L-201ENST00000330579 1632 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
SDCBP2Q9H190 LAMP5-AS1-201ENST00000443469 1928 ntTSL 2 BASIC22.74■■□□□ 1.23
SDCBP2Q9H190 HERC2P8-204ENST00000567073 1988 ntTSL 5 BASIC22.74■■□□□ 1.23
SDCBP2Q9H190 TPST1-201ENST00000304842 2116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
SDCBP2Q9H190 FARP2-223ENST00000627550 2122 ntTSL 2 BASIC22.73■■□□□ 1.23
SDCBP2Q9H190 KRT87P-202ENST00000534226 1464 ntBASIC22.73■■□□□ 1.23
SDCBP2Q9H190 SLCO3A1-201ENST00000318445 5115 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
SDCBP2Q9H190 SLC2A11-202ENST00000316185 1555 ntTSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
SDCBP2Q9H190 LRIG1-202ENST00000383703 5283 ntTSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
SDCBP2Q9H190 GZMM-201ENST00000264553 940 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
SDCBP2Q9H190 TSPAN2-201ENST00000369515 793 ntTSL 3 BASIC22.73■■□□□ 1.23
SDCBP2Q9H190 AC104986.2-201ENST00000521696 380 ntTSL 2 BASIC22.73■■□□□ 1.23
SDCBP2Q9H190 FAM72A-202ENST00000367128 2398 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
SDCBP2Q9H190 FAM72D-201ENST00000400889 2397 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
SDCBP2Q9H190 NEIL1-206ENST00000564784 2019 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.73■■□□□ 1.23
SDCBP2Q9H190 SPATA22-214ENST00000575375 1374 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
SDCBP2Q9H190 MGAT4D-208ENST00000515354 1806 ntTSL 3 BASIC22.73■■□□□ 1.23
SDCBP2Q9H190 TCF3-203ENST00000395423 2779 ntTSL 5 BASIC22.72■■□□□ 1.23
SDCBP2Q9H190 ACVRL1-201ENST00000388922 1971 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
SDCBP2Q9H190 ZNF784-201ENST00000325351 2021 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
SDCBP2Q9H190 B4GALNT1-203ENST00000449184 1633 ntTSL 2 BASIC22.72■■□□□ 1.23
SDCBP2Q9H190 WDR86-203ENST00000469830 1691 ntTSL 2 BASIC22.72■■□□□ 1.23
SDCBP2Q9H190 SMG7-AS1-201ENST00000421703 2220 ntTSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
SDCBP2Q9H190 PACRGL-227ENST00000513459 1773 ntTSL 5 BASIC22.72■■□□□ 1.23
SDCBP2Q9H190 EIF2B4-211ENST00000616081 1754 ntTSL 5 BASIC22.72■■□□□ 1.23
SDCBP2Q9H190 FXN-202ENST00000396364 980 ntTSL 5 BASIC22.72■■□□□ 1.23
SDCBP2Q9H190 AP001005.4-202ENST00000575325 560 ntTSL 4 BASIC22.72■■□□□ 1.23
SDCBP2Q9H190 CDKN1C-204ENST00000440480 1811 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
SDCBP2Q9H190 FMR1-AS1-202ENST00000596112 1845 ntTSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
SDCBP2Q9H190 BCS1L-210ENST00000431802 2015 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.72■■□□□ 1.23
SDCBP2Q9H190 CRTC2-203ENST00000368633 2644 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
SDCBP2Q9H190 CUEDC1-202ENST00000407144 2190 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.72■■□□□ 1.23
SDCBP2Q9H190 TERF1-202ENST00000276603 1677 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
SDCBP2Q9H190 KCNAB3-201ENST00000303790 2458 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
SDCBP2Q9H190 POTEC-204ENST00000620346 1988 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
SDCBP2Q9H190 CPED1-202ENST00000340646 1056 ntTSL 5 BASIC22.71■■□□□ 1.23
SDCBP2Q9H190 AC108002.2-201ENST00000519782 340 ntTSL 4 BASIC22.71■■□□□ 1.23
SDCBP2Q9H190 SFTPC-205ENST00000521315 1046 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
SDCBP2Q9H190 HSD17B14-204ENST00000599157 991 ntTSL 3 BASIC22.71■■□□□ 1.23
SDCBP2Q9H190 SMPD5-201ENST00000528912 1390 ntTSL 5 BASIC22.71■■□□□ 1.23
SDCBP2Q9H190 ENTPD5-206ENST00000556242 1437 ntTSL 5 BASIC22.71■■□□□ 1.23
SDCBP2Q9H190 PML-217ENST00000567543 1404 ntTSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
SDCBP2Q9H190 TMEM121-201ENST00000392519 1532 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
SDCBP2Q9H190 VPS29-206ENST00000549578 1523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
SDCBP2Q9H190 SH2D3A-201ENST00000245908 2296 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
SDCBP2Q9H190 PHACTR3-202ENST00000359926 2252 ntTSL 2 BASIC22.7■■□□□ 1.22
SDCBP2Q9H190 KCNK15-201ENST00000372861 2599 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
SDCBP2Q9H190 KRTAP5-2-201ENST00000412090 1118 ntAPPRIS P1 BASIC22.7■■□□□ 1.22
SDCBP2Q9H190 ATE1-AS1-201ENST00000437593 951 ntTSL 2 BASIC22.7■■□□□ 1.22
SDCBP2Q9H190 AC068385.1-201ENST00000533218 409 ntTSL 3 BASIC22.7■■□□□ 1.22
SDCBP2Q9H190 EEF1DP3-203ENST00000566025 782 ntBASIC22.7■■□□□ 1.22
SDCBP2Q9H190 TRAPPC2L-213ENST00000567895 854 ntTSL 3 BASIC22.7■■□□□ 1.22
SDCBP2Q9H190 AC104187.1-201ENST00000607510 612 ntBASIC22.7■■□□□ 1.22
SDCBP2Q9H190 MSRB1-201ENST00000361871 1423 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
SDCBP2Q9H190 CXCL16-203ENST00000574412 1668 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
SDCBP2Q9H190 CDC14A-203ENST00000370124 1883 ntTSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
SDCBP2Q9H190 LINC00565-201ENST00000562710 2331 ntBASIC22.7■■□□□ 1.22
SDCBP2Q9H190 MESP1-201ENST00000300057 2369 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
SDCBP2Q9H190 PGRMC2-201ENST00000296425 2767 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
SDCBP2Q9H190 VRK2-201ENST00000340157 1888 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
SDCBP2Q9H190 CENPS-CORT-201ENST00000400900 1469 ntTSL 2 BASIC22.69■■□□□ 1.22
SDCBP2Q9H190 EPO-201ENST00000252723 1330 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
SDCBP2Q9H190 LARP6-202ENST00000344870 527 ntTSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
SDCBP2Q9H190 ZSWIM7-205ENST00000472495 703 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
SDCBP2Q9H190 GALNS-213ENST00000569433 723 ntTSL 3 BASIC22.69■■□□□ 1.22
SDCBP2Q9H190 SCN1B-203ENST00000595652 814 ntTSL 2 BASIC22.69■■□□□ 1.22
SDCBP2Q9H190 TDRKH-205ENST00000368827 2318 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
SDCBP2Q9H190 ORAI1-202ENST00000617316 2138 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
SDCBP2Q9H190 CNTFR-202ENST00000378980 2052 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
SDCBP2Q9H190 GOLGA2P6-201ENST00000340929 2049 ntBASIC22.69■■□□□ 1.22
SDCBP2Q9H190 KRT18P55-201ENST00000577198 1950 ntTSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
SDCBP2Q9H190 ASCL2-201ENST00000331289 1852 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
SDCBP2Q9H190 CCDC106-207ENST00000591578 1592 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
SDCBP2Q9H190 SPI1-202ENST00000378538 1403 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 29.6 ms