Protein–RNA interactions for Protein: Q9BZQ6

EDEM3, ER degradation-enhancing alpha-mannosidase-like protein 3, humanhuman

Predictions only

Length 932 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
EDEM3Q9BZQ6 INPPL1-201ENST00000298229 4733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.91■■□□□ 1.26
EDEM3Q9BZQ6 PDXDC1-205ENST00000535621 2048 ntTSL 1 (best) BASIC22.91■■□□□ 1.26
EDEM3Q9BZQ6 LONP1-203ENST00000585374 2882 ntTSL 5 BASIC22.91■■□□□ 1.26
EDEM3Q9BZQ6 RNF208-201ENST00000391553 1077 ntAPPRIS P1 BASIC22.91■■□□□ 1.26
EDEM3Q9BZQ6 SENCR-201ENST00000526269 1298 ntTSL 1 (best) BASIC22.91■■□□□ 1.26
EDEM3Q9BZQ6 BAZ1A-201ENST00000358716 5920 ntTSL 1 (best) BASIC22.91■■□□□ 1.26
EDEM3Q9BZQ6 HFE2-202ENST00000357836 2123 ntTSL 1 (best) BASIC22.91■■□□□ 1.26
EDEM3Q9BZQ6 RELA-201ENST00000308639 2681 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.91■■□□□ 1.26
EDEM3Q9BZQ6 BOK-201ENST00000318407 2657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.91■■□□□ 1.26
EDEM3Q9BZQ6 ZDHHC8P1-201ENST00000255890 2382 ntTSL 2 BASIC22.91■■□□□ 1.26
EDEM3Q9BZQ6 LINC00094-201ENST00000432807 2300 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.91■■□□□ 1.26
EDEM3Q9BZQ6 UBALD1-201ENST00000283474 1413 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.91■■□□□ 1.26
EDEM3Q9BZQ6 CYHR1-201ENST00000306145 1409 ntTSL 1 (best) BASIC22.91■■□□□ 1.26
EDEM3Q9BZQ6 T-202ENST00000366871 2250 ntTSL 1 (best) BASIC22.91■■□□□ 1.26
EDEM3Q9BZQ6 CDK5R2-201ENST00000302625 2508 ntAPPRIS P1 BASIC22.9■■□□□ 1.26
EDEM3Q9BZQ6 PARD3-213ENST00000545260 5740 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.9■■□□□ 1.26
EDEM3Q9BZQ6 ZNF517-207ENST00000531720 1615 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.9■■□□□ 1.26
EDEM3Q9BZQ6 TMEM125-201ENST00000432792 1850 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.9■■□□□ 1.26
EDEM3Q9BZQ6 MAP7-206ENST00000611373 2317 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.9■■□□□ 1.26
EDEM3Q9BZQ6 AL161908.1-203ENST00000425370 506 ntTSL 2 BASIC22.9■■□□□ 1.26
EDEM3Q9BZQ6 GJD3-201ENST00000578689 885 ntAPPRIS P1 BASIC22.9■■□□□ 1.26
EDEM3Q9BZQ6 GSPT1-203ENST00000439887 2509 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.9■■□□□ 1.26
EDEM3Q9BZQ6 DRD2-202ENST00000362072 2789 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.9■■□□□ 1.26
EDEM3Q9BZQ6 PARD3-209ENST00000374790 5825 ntTSL 5 BASIC22.9■■□□□ 1.26
EDEM3Q9BZQ6 LINC01123-202ENST00000419296 2436 ntTSL 2 BASIC22.9■■□□□ 1.26
EDEM3Q9BZQ6 TPM1-208ENST00000404484 1568 ntTSL 1 (best) BASIC22.89■■□□□ 1.26
EDEM3Q9BZQ6 POFUT1-201ENST00000375730 1507 ntTSL 1 (best) BASIC22.89■■□□□ 1.26
EDEM3Q9BZQ6 IGHV3-20-201ENST00000390606 415 ntAPPRIS P1 BASIC22.89■■□□□ 1.25
EDEM3Q9BZQ6 BX842568.3-201ENST00000418104 571 ntBASIC22.89■■□□□ 1.25
EDEM3Q9BZQ6 AP001107.5-202ENST00000533759 948 ntTSL 5 BASIC22.89■■□□□ 1.25
EDEM3Q9BZQ6 TGFBR3L-202ENST00000565886 1260 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.89■■□□□ 1.25
EDEM3Q9BZQ6 SMUG1P1-201ENST00000590640 811 ntBASIC22.89■■□□□ 1.25
EDEM3Q9BZQ6 GNB1L-202ENST00000403325 1699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.89■■□□□ 1.25
EDEM3Q9BZQ6 LYPD1-202ENST00000397463 1891 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.89■■□□□ 1.25
EDEM3Q9BZQ6 PKD1P6-201ENST00000343738 4769 ntBASIC22.89■■□□□ 1.25
EDEM3Q9BZQ6 WAS-201ENST00000376701 1849 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.89■■□□□ 1.25
EDEM3Q9BZQ6 NDUFAF3-202ENST00000326925 2012 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.89■■□□□ 1.25
EDEM3Q9BZQ6 PCED1A-202ENST00000360652 2016 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.89■■□□□ 1.25
EDEM3Q9BZQ6 RABL2B-206ENST00000395598 2169 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.89■■□□□ 1.25
EDEM3Q9BZQ6 S1PR5-202ENST00000439028 2191 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.89■■□□□ 1.25
EDEM3Q9BZQ6 MAP1LC3A-201ENST00000360668 1574 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.89■■□□□ 1.25
EDEM3Q9BZQ6 PAQR4-201ENST00000293978 2644 ntTSL 2 BASIC22.88■■□□□ 1.25
EDEM3Q9BZQ6 FAM118B-209ENST00000533050 2402 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.88■■□□□ 1.25
EDEM3Q9BZQ6 MRPL37-202ENST00000360840 1483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.88■■□□□ 1.25
EDEM3Q9BZQ6 RAB1B-201ENST00000311481 2007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.88■■□□□ 1.25
EDEM3Q9BZQ6 ITGBL1-206ENST00000618057 2368 ntTSL 1 (best) BASIC22.88■■□□□ 1.25
EDEM3Q9BZQ6 PRR20B-201ENST00000377930 1847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.88■■□□□ 1.25
EDEM3Q9BZQ6 PRR20A-201ENST00000377931 1847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.88■■□□□ 1.25
EDEM3Q9BZQ6 PRR20E-201ENST00000434815 1847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.88■■□□□ 1.25
EDEM3Q9BZQ6 PRR20D-201ENST00000452123 1847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.88■■□□□ 1.25
EDEM3Q9BZQ6 PRR20C-201ENST00000544357 1847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.88■■□□□ 1.25
EDEM3Q9BZQ6 PRR20C-202ENST00000614894 1847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.88■■□□□ 1.25
EDEM3Q9BZQ6 MAST4-206ENST00000406374 1066 ntTSL 1 (best) BASIC22.88■■□□□ 1.25
EDEM3Q9BZQ6 PTMA-205ENST00000410064 814 ntTSL 2 BASIC22.88■■□□□ 1.25
EDEM3Q9BZQ6 TEAD2-208ENST00000598810 2191 ntTSL 1 (best) BASIC22.88■■□□□ 1.25
EDEM3Q9BZQ6 SLC25A39-201ENST00000225308 1607 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.88■■□□□ 1.25
EDEM3Q9BZQ6 KRTAP5-7-201ENST00000398536 1408 ntAPPRIS P1 BASIC22.88■■□□□ 1.25
EDEM3Q9BZQ6 FAM20C-201ENST00000313766 2751 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.88■■□□□ 1.25
EDEM3Q9BZQ6 CERKL-205ENST00000409440 2425 ntTSL 2 BASIC22.88■■□□□ 1.25
EDEM3Q9BZQ6 CELF2-213ENST00000633077 1733 ntTSL 1 (best) BASIC22.88■■□□□ 1.25
EDEM3Q9BZQ6 DNAJB5-201ENST00000312316 2391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.87■■□□□ 1.25
EDEM3Q9BZQ6 ACP1-201ENST00000272065 1549 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC22.87■■□□□ 1.25
EDEM3Q9BZQ6 LGR4-201ENST00000379214 5206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.87■■□□□ 1.25
EDEM3Q9BZQ6 CD55-205ENST00000367067 1843 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.87■■□□□ 1.25
EDEM3Q9BZQ6 CCDC102A-201ENST00000258214 2463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.87■■□□□ 1.25
EDEM3Q9BZQ6 COMT-202ENST00000361682 2437 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.87■■□□□ 1.25
EDEM3Q9BZQ6 METTL1-202ENST00000324871 2066 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.87■■□□□ 1.25
EDEM3Q9BZQ6 OLA1-204ENST00000409546 2071 ntTSL 5 BASIC22.87■■□□□ 1.25
EDEM3Q9BZQ6 AL445237.1-202ENST00000604581 425 ntTSL 5 BASIC22.87■■□□□ 1.25
EDEM3Q9BZQ6 WWTR1-AS1-202ENST00000479752 1700 ntTSL 1 (best) BASIC22.87■■□□□ 1.25
EDEM3Q9BZQ6 E4F1-206ENST00000565090 2028 ntTSL 1 (best) BASIC22.87■■□□□ 1.25
EDEM3Q9BZQ6 TCP11-202ENST00000311875 2166 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.87■■□□□ 1.25
EDEM3Q9BZQ6 UBE2Q1-201ENST00000292211 3210 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.87■■□□□ 1.25
EDEM3Q9BZQ6 ZNF497-202ENST00000425453 2261 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.87■■□□□ 1.25
EDEM3Q9BZQ6 CPNE7-202ENST00000319518 2409 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.87■■□□□ 1.25
EDEM3Q9BZQ6 CTCF-202ENST00000401394 2978 ntTSL 1 (best) BASIC22.86■■□□□ 1.25
EDEM3Q9BZQ6 GSN-204ENST00000373818 2657 ntTSL 1 (best) BASIC22.86■■□□□ 1.25
EDEM3Q9BZQ6 CBWD6-201ENST00000377391 1792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.86■■□□□ 1.25
EDEM3Q9BZQ6 CLN8-213ENST00000637156 1897 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.86■■□□□ 1.25
EDEM3Q9BZQ6 GGA2-211ENST00000567468 1713 ntTSL 2 BASIC22.86■■□□□ 1.25
EDEM3Q9BZQ6 TRIM3-214ENST00000536344 2704 ntTSL 2 BASIC22.86■■□□□ 1.25
EDEM3Q9BZQ6 DAZAP2-201ENST00000412716 2598 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.86■■□□□ 1.25
EDEM3Q9BZQ6 CLTB-201ENST00000310418 1215 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.86■■□□□ 1.25
EDEM3Q9BZQ6 CLTB-202ENST00000345807 1161 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.86■■□□□ 1.25
EDEM3Q9BZQ6 LYPD2-201ENST00000359228 594 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.86■■□□□ 1.25
EDEM3Q9BZQ6 GADD45G-202ENST00000375769 977 ntTSL 2 BASIC22.86■■□□□ 1.25
EDEM3Q9BZQ6 SRM-201ENST00000376957 1266 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.86■■□□□ 1.25
EDEM3Q9BZQ6 CCDC115-202ENST00000409127 1247 ntTSL 2 BASIC22.86■■□□□ 1.25
EDEM3Q9BZQ6 HM13-AS1-201ENST00000412178 489 ntTSL 3 BASIC22.86■■□□□ 1.25
EDEM3Q9BZQ6 TUSC3-209ENST00000509380 1266 ntTSL 5 BASIC22.86■■□□□ 1.25
EDEM3Q9BZQ6 CDKN3-207ENST00000543789 610 ntTSL 5 BASIC22.86■■□□□ 1.25
EDEM3Q9BZQ6 CENPU-201ENST00000281453 1998 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.86■■□□□ 1.25
EDEM3Q9BZQ6 C10orf55-202ENST00000412307 2360 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.86■■□□□ 1.25
EDEM3Q9BZQ6 SMPD5-201ENST00000528912 1390 ntTSL 5 BASIC22.86■■□□□ 1.25
EDEM3Q9BZQ6 ACOT2-201ENST00000238651 1774 ntTSL 1 (best) BASIC22.86■■□□□ 1.25
EDEM3Q9BZQ6 COCH-201ENST00000216361 2397 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
EDEM3Q9BZQ6 MAFF-204ENST00000426621 2216 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC22.85■■□□□ 1.25
EDEM3Q9BZQ6 SLC1A5-203ENST00000542575 2882 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
EDEM3Q9BZQ6 TRMT2A-204ENST00000439169 2473 ntTSL 5 BASIC22.85■■□□□ 1.25
EDEM3Q9BZQ6 CAMK2B-216ENST00000440254 2097 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 12.7 ms