Protein–RNA interactions for Protein: Q9BYG8

GSDMC, Gasdermin-C, humanhuman

Predictions only

Length 508 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
GSDMCQ9BYG8 AC127496.7-201ENST00000625110 1798 ntBASIC20.83■□□□□ 0.93
GSDMCQ9BYG8 TRIM28-202ENST00000341753 2709 ntTSL 1 (best) BASIC20.83■□□□□ 0.93
GSDMCQ9BYG8 GGTLC1-202ENST00000286890 1028 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.83■□□□□ 0.93
GSDMCQ9BYG8 SNRNP25-202ENST00000383018 1085 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.83■□□□□ 0.93
GSDMCQ9BYG8 AC006970.2-201ENST00000450065 779 ntBASIC20.83■□□□□ 0.93
GSDMCQ9BYG8 CMTM8-202ENST00000458535 996 ntTSL 1 (best) BASIC20.83■□□□□ 0.93
GSDMCQ9BYG8 AC016888.1-201ENST00000585285 565 ntTSL 3 BASIC20.83■□□□□ 0.93
GSDMCQ9BYG8 BIN1-209ENST00000393040 2293 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.83■□□□□ 0.92
GSDMCQ9BYG8 SH3D19-211ENST00000604030 5228 ntTSL 5 BASIC20.82■□□□□ 0.92
GSDMCQ9BYG8 DACT3-201ENST00000300875 2526 ntTSL 1 (best) BASIC20.82■□□□□ 0.92
GSDMCQ9BYG8 HAS1-201ENST00000222115 2087 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.82■□□□□ 0.92
GSDMCQ9BYG8 SLC41A3-201ENST00000315891 1797 ntTSL 1 (best) BASIC20.82■□□□□ 0.92
GSDMCQ9BYG8 KDF1-201ENST00000320567 1793 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.82■□□□□ 0.92
GSDMCQ9BYG8 HAUS4-201ENST00000206474 1642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.82■□□□□ 0.92
GSDMCQ9BYG8 LGR4-201ENST00000379214 5206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.82■□□□□ 0.92
GSDMCQ9BYG8 NEURL3-201ENST00000310865 1710 ntTSL 1 (best) BASIC20.82■□□□□ 0.92
GSDMCQ9BYG8 KCNH6-203ENST00000580652 1703 ntTSL 1 (best) BASIC20.82■□□□□ 0.92
GSDMCQ9BYG8 USP45-202ENST00000329966 1444 ntTSL 1 (best) BASIC20.82■□□□□ 0.92
GSDMCQ9BYG8 TNFRSF18-201ENST00000328596 851 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC20.82■□□□□ 0.92
GSDMCQ9BYG8 MBD3L1-202ENST00000595891 872 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.82■□□□□ 0.92
GSDMCQ9BYG8 MAL2-204ENST00000614891 2818 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.82■□□□□ 0.92
GSDMCQ9BYG8 FAM43A-201ENST00000329759 2494 ntAPPRIS P1 BASIC20.82■□□□□ 0.92
GSDMCQ9BYG8 MMEL1-206ENST00000502556 1943 ntTSL 1 (best) BASIC20.82■□□□□ 0.92
GSDMCQ9BYG8 CSNK1G3-206ENST00000511130 1356 ntTSL 2 BASIC20.82■□□□□ 0.92
GSDMCQ9BYG8 MEIS3-212ENST00000561293 1918 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.82■□□□□ 0.92
GSDMCQ9BYG8 CADM1-201ENST00000331581 1766 ntTSL 1 (best) BASIC20.82■□□□□ 0.92
GSDMCQ9BYG8 NOX4-209ENST00000527626 1774 ntTSL 2 BASIC20.82■□□□□ 0.92
GSDMCQ9BYG8 MIR222HG-202ENST00000602507 1758 ntTSL 5 BASIC20.82■□□□□ 0.92
GSDMCQ9BYG8 C1orf229-201ENST00000623686 2258 ntBASIC20.81■□□□□ 0.92
GSDMCQ9BYG8 GGA2-211ENST00000567468 1713 ntTSL 2 BASIC20.81■□□□□ 0.92
GSDMCQ9BYG8 CERKL-203ENST00000374969 1330 ntTSL 1 (best) BASIC20.81■□□□□ 0.92
GSDMCQ9BYG8 SKI-201ENST00000378536 5613 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.81■□□□□ 0.92
GSDMCQ9BYG8 RARG-201ENST00000338561 1836 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.81■□□□□ 0.92
GSDMCQ9BYG8 NTN1-201ENST00000173229 5954 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.81■□□□□ 0.92
GSDMCQ9BYG8 CITED1-201ENST00000246139 1231 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.81■□□□□ 0.92
GSDMCQ9BYG8 FAM207A-201ENST00000291634 927 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.81■□□□□ 0.92
GSDMCQ9BYG8 DCXR-201ENST00000306869 887 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.81■□□□□ 0.92
GSDMCQ9BYG8 CPED1-202ENST00000340646 1056 ntTSL 5 BASIC20.81■□□□□ 0.92
GSDMCQ9BYG8 ZNF451-202ENST00000370702 458 ntTSL 2 BASIC20.81■□□□□ 0.92
GSDMCQ9BYG8 KANSL1-AS1-201ENST00000398275 517 ntTSL 1 (best) BASIC20.81■□□□□ 0.92
GSDMCQ9BYG8 POLE4-205ENST00000483063 1248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.81■□□□□ 0.92
GSDMCQ9BYG8 BX890604.1-207ENST00000486571 904 ntTSL 5 BASIC20.81■□□□□ 0.92
GSDMCQ9BYG8 ZNF561-AS1-205ENST00000588765 579 ntTSL 4 BASIC20.81■□□□□ 0.92
GSDMCQ9BYG8 SCN1B-203ENST00000595652 814 ntTSL 2 BASIC20.81■□□□□ 0.92
GSDMCQ9BYG8 NDUFA6-AS1-207ENST00000595777 833 ntTSL 5 BASIC20.81■□□□□ 0.92
GSDMCQ9BYG8 AC231657.2-201ENST00000624556 255 ntBASIC20.81■□□□□ 0.92
GSDMCQ9BYG8 MFSD3-201ENST00000301327 1548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.81■□□□□ 0.92
GSDMCQ9BYG8 YBX1-201ENST00000321358 1514 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.81■□□□□ 0.92
GSDMCQ9BYG8 ZNF668-205ENST00000426488 2282 ntTSL 5 BASIC20.81■□□□□ 0.92
GSDMCQ9BYG8 VAV3-202ENST00000370056 4990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.81■□□□□ 0.92
GSDMCQ9BYG8 KLC1-227ENST00000634686 2229 ntTSL 5 BASIC20.81■□□□□ 0.92
GSDMCQ9BYG8 TBXA2R-202ENST00000411851 1494 ntTSL 2 BASIC20.81■□□□□ 0.92
GSDMCQ9BYG8 HRK-201ENST00000257572 5789 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.81■□□□□ 0.92
GSDMCQ9BYG8 PTPRJ-201ENST00000418331 5122 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.81■□□□□ 0.92
GSDMCQ9BYG8 MRPL37-206ENST00000605337 1582 ntTSL 5 BASIC20.8■□□□□ 0.92
GSDMCQ9BYG8 STOML1-201ENST00000316900 2169 ntTSL 2 BASIC20.8■□□□□ 0.92
GSDMCQ9BYG8 ALG1L9P-201ENST00000508969 2165 ntTSL 1 (best) BASIC20.8■□□□□ 0.92
GSDMCQ9BYG8 LYPLA1-201ENST00000316963 2585 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.8■□□□□ 0.92
GSDMCQ9BYG8 PDS5A-202ENST00000503396 2685 ntTSL 1 (best) BASIC20.8■□□□□ 0.92
GSDMCQ9BYG8 CPNE2-202ENST00000535318 2316 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.8■□□□□ 0.92
GSDMCQ9BYG8 CFD-201ENST00000327726 1201 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.8■□□□□ 0.92
GSDMCQ9BYG8 KHDC3L-201ENST00000370367 1018 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.8■□□□□ 0.92
GSDMCQ9BYG8 YBEY-204ENST00000397692 433 ntTSL 1 (best) BASIC20.8■□□□□ 0.92
GSDMCQ9BYG8 PPP1R14BP3-201ENST00000509033 445 ntBASIC20.8■□□□□ 0.92
GSDMCQ9BYG8 AC037459.4-201ENST00000517384 585 ntTSL 4 BASIC20.8■□□□□ 0.92
GSDMCQ9BYG8 HTATIP2-208ENST00000532505 595 ntTSL 2 BASIC20.8■□□□□ 0.92
GSDMCQ9BYG8 BEX2-204ENST00000536889 1077 ntTSL 2 BASIC20.8■□□□□ 0.92
GSDMCQ9BYG8 BRI3-207ENST00000539286 699 ntTSL 2 BASIC20.8■□□□□ 0.92
GSDMCQ9BYG8 NMRAL1-212ENST00000574425 1240 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.8■□□□□ 0.92
GSDMCQ9BYG8 FP565260.3-201ENST00000612610 1162 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC20.8■□□□□ 0.92
GSDMCQ9BYG8 GXYLT1P5-201ENST00000614548 1189 ntBASIC20.8■□□□□ 0.92
GSDMCQ9BYG8 C18orf65-201ENST00000622985 2076 ntTSL 2 BASIC20.8■□□□□ 0.92
GSDMCQ9BYG8 INPPL1-201ENST00000298229 4733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.8■□□□□ 0.92
GSDMCQ9BYG8 CADPS-202ENST00000357948 5190 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.8■□□□□ 0.92
GSDMCQ9BYG8 FOXK2-201ENST00000335255 5265 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.8■□□□□ 0.92
GSDMCQ9BYG8 TRADD-202ENST00000486556 1833 ntTSL 2 BASIC20.8■□□□□ 0.92
GSDMCQ9BYG8 PRKAA1-202ENST00000354209 1918 ntTSL 1 (best) BASIC20.8■□□□□ 0.92
GSDMCQ9BYG8 WDR86-203ENST00000469830 1691 ntTSL 2 BASIC20.8■□□□□ 0.92
GSDMCQ9BYG8 GRAMD1A-201ENST00000317991 2695 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.8■□□□□ 0.92
GSDMCQ9BYG8 KLF3-203ENST00000514033 1871 ntTSL 1 (best) BASIC20.79■□□□□ 0.92
GSDMCQ9BYG8 ADA-201ENST00000372874 1539 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.79■□□□□ 0.92
GSDMCQ9BYG8 DISC1-223ENST00000628350 2363 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.79■□□□□ 0.92
GSDMCQ9BYG8 AC092053.2-201ENST00000640557 1818 ntBASIC20.79■□□□□ 0.92
GSDMCQ9BYG8 HEXB-201ENST00000261416 1901 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.79■□□□□ 0.92
GSDMCQ9BYG8 CEACAM4-201ENST00000221954 1205 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.79■□□□□ 0.92
GSDMCQ9BYG8 COX5B-201ENST00000258424 712 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.79■□□□□ 0.92
GSDMCQ9BYG8 DTYMK-201ENST00000305784 1232 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.79■□□□□ 0.92
GSDMCQ9BYG8 XBP1-202ENST00000344347 1131 ntTSL 5 BASIC20.79■□□□□ 0.92
GSDMCQ9BYG8 CYB5R4-201ENST00000369679 768 ntTSL 3 BASIC20.79■□□□□ 0.92
GSDMCQ9BYG8 HLA-L-209ENST00000420110 1011 ntBASIC20.79■□□□□ 0.92
GSDMCQ9BYG8 HERC2P5-204ENST00000569697 1214 ntTSL 2 BASIC20.79■□□□□ 0.92
GSDMCQ9BYG8 AC005697.1-201ENST00000582441 582 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC20.79■□□□□ 0.92
GSDMCQ9BYG8 CEACAM4-203ENST00000600925 899 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.79■□□□□ 0.92
GSDMCQ9BYG8 FNDC5-207ENST00000640867 639 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC20.79■□□□□ 0.92
GSDMCQ9BYG8 ACTR1B-201ENST00000289228 2243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.79■□□□□ 0.92
GSDMCQ9BYG8 DCPS-201ENST00000263579 1479 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.79■□□□□ 0.92
GSDMCQ9BYG8 PGF-201ENST00000238607 1693 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC20.79■□□□□ 0.92
GSDMCQ9BYG8 RAB28-203ENST00000338176 1787 ntTSL 3 BASIC20.79■□□□□ 0.92
GSDMCQ9BYG8 RBAK-202ENST00000396912 6551 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.79■□□□□ 0.92
GSDMCQ9BYG8 PANK1-201ENST00000307534 6976 ntTSL 1 (best) BASIC20.79■□□□□ 0.92
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 63.9 ms