Protein–RNA interactions for Protein: Q96RK1

CITED4, Cbp/p300-interacting transactivator 4, humanhuman

Predictions only

Length 184 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CITED4Q96RK1 MPC1-207ENST00000621685 1192 ntTSL 5 BASIC18.09■□□□□ 0.49
CITED4Q96RK1 ATP2A2-201ENST00000308664 4453 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
CITED4Q96RK1 C3orf58-207ENST00000495414 1876 ntTSL 2 BASIC18.09■□□□□ 0.49
CITED4Q96RK1 WDTC1-201ENST00000319394 4819 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
CITED4Q96RK1 SPINT2-201ENST00000301244 1802 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
CITED4Q96RK1 ASPSCR1-202ENST00000306739 1843 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
CITED4Q96RK1 CRHR1-202ENST00000314537 2535 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
CITED4Q96RK1 KCTD12-201ENST00000377474 6225 ntAPPRIS P1 BASIC18.09■□□□□ 0.49
CITED4Q96RK1 PTRH1-205ENST00000423807 1570 ntTSL 2 BASIC18.08■□□□□ 0.49
CITED4Q96RK1 HSPBP1-202ENST00000433386 1572 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.49
CITED4Q96RK1 TDRKH-203ENST00000368824 2824 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.49
CITED4Q96RK1 LMTK2-201ENST00000297293 8946 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.49
CITED4Q96RK1 FBXO24-202ENST00000427939 2087 ntTSL 2 BASIC18.08■□□□□ 0.49
CITED4Q96RK1 SMPD3-201ENST00000219334 5453 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.49
CITED4Q96RK1 PMPCA-203ENST00000399219 1987 ntTSL 2 BASIC18.08■□□□□ 0.49
CITED4Q96RK1 SNRK-203ENST00000437827 1995 ntTSL 2 BASIC18.08■□□□□ 0.49
CITED4Q96RK1 ISYNA1-201ENST00000338128 2420 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.49
CITED4Q96RK1 LEMD2-214ENST00000614475 2883 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.08■□□□□ 0.48
CITED4Q96RK1 C16orf58-209ENST00000567994 1845 ntTSL 5 BASIC18.08■□□□□ 0.48
CITED4Q96RK1 RAB32-201ENST00000367495 1217 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.48
CITED4Q96RK1 BIN2-210ENST00000615107 2255 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.48
CITED4Q96RK1 KLRG2-201ENST00000340940 2197 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.48
CITED4Q96RK1 PRELID2-201ENST00000334744 2140 ntTSL 2 BASIC18.08■□□□□ 0.48
CITED4Q96RK1 DPYS-201ENST00000351513 2127 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.48
CITED4Q96RK1 SLC19A1-209ENST00000485649 1896 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.07■□□□□ 0.48
CITED4Q96RK1 IGFBP7-201ENST00000295666 1427 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
CITED4Q96RK1 TRABD2A-201ENST00000335459 1844 ntTSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
CITED4Q96RK1 NDOR1-201ENST00000344894 1794 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
CITED4Q96RK1 EIF2B4-211ENST00000616081 1754 ntTSL 5 BASIC18.07■□□□□ 0.48
CITED4Q96RK1 RGS20-202ENST00000297313 2104 ntTSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
CITED4Q96RK1 TLNRD1-201ENST00000267984 4845 ntAPPRIS P1 BASIC18.07■□□□□ 0.48
CITED4Q96RK1 PRSS23-201ENST00000280258 4015 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
CITED4Q96RK1 RBM15B-201ENST00000563281 6641 ntAPPRIS P1 BASIC18.07■□□□□ 0.48
CITED4Q96RK1 CGRRF1-201ENST00000216420 2057 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
CITED4Q96RK1 WAC-202ENST00000347934 2839 ntTSL 5 BASIC18.07■□□□□ 0.48
CITED4Q96RK1 EIF4ENIF1-202ENST00000344710 3115 ntTSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
CITED4Q96RK1 ARHGEF7-AS2-201ENST00000425094 1239 ntTSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
CITED4Q96RK1 HSPB6-202ENST00000587965 711 ntTSL 2 BASIC18.07■□□□□ 0.48
CITED4Q96RK1 SLC12A4-201ENST00000316341 4765 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
CITED4Q96RK1 HEXB-201ENST00000261416 1901 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
CITED4Q96RK1 PPM1B-201ENST00000282412 2606 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
CITED4Q96RK1 LTB4R2-205ENST00000543919 1560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
CITED4Q96RK1 KCTD20-210ENST00000536244 5345 ntTSL 2 BASIC18.07■□□□□ 0.48
CITED4Q96RK1 IMPAD1-201ENST00000262644 7199 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
CITED4Q96RK1 TLK2-203ENST00000346027 3449 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
CITED4Q96RK1 KANK4-204ENST00000371153 4665 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
CITED4Q96RK1 ADGRL1-202ENST00000361434 5610 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
CITED4Q96RK1 PPP4C-201ENST00000279387 1407 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
CITED4Q96RK1 CLUH-201ENST00000435359 5224 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.06■□□□□ 0.48
CITED4Q96RK1 PTPN13-205ENST00000502971 1708 ntTSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
CITED4Q96RK1 MEIS3-204ENST00000558555 1715 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.06■□□□□ 0.48
CITED4Q96RK1 PTPRE-201ENST00000254667 5331 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
CITED4Q96RK1 SCUBE1-201ENST00000290460 2258 ntTSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
CITED4Q96RK1 FSTL3-201ENST00000166139 2542 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
CITED4Q96RK1 H19-210ENST00000439725 1929 ntTSL 2 BASIC18.06■□□□□ 0.48
CITED4Q96RK1 AC018445.3-201ENST00000624177 1945 ntBASIC18.06■□□□□ 0.48
CITED4Q96RK1 TUBGCP3-204ENST00000464139 2461 ntTSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
CITED4Q96RK1 RBMXL2-201ENST00000306904 1874 ntAPPRIS P1 BASIC18.06■□□□□ 0.48
CITED4Q96RK1 FZD10-202ENST00000539839 3282 ntBASIC18.06■□□□□ 0.48
CITED4Q96RK1 OXCT2-201ENST00000327582 1826 ntAPPRIS P1 BASIC18.06■□□□□ 0.48
CITED4Q96RK1 SIMC1-202ENST00000341199 2056 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC18.06■□□□□ 0.48
CITED4Q96RK1 ADSSL1-201ENST00000330877 1766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
CITED4Q96RK1 GATA6-AS1-202ENST00000583490 1788 ntTSL 2 BASIC18.06■□□□□ 0.48
CITED4Q96RK1 ZAR1-201ENST00000327939 1460 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
CITED4Q96RK1 DDX59-201ENST00000331314 2289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
CITED4Q96RK1 FOXP4-202ENST00000373057 3300 ntTSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
CITED4Q96RK1 RAPH1-201ENST00000308091 2768 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
CITED4Q96RK1 TMEM189-201ENST00000371650 2222 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
CITED4Q96RK1 OSR1-201ENST00000272223 1936 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
CITED4Q96RK1 TBC1D22A-206ENST00000407381 1949 ntTSL 5 BASIC18.06■□□□□ 0.48
CITED4Q96RK1 CSPG5-203ENST00000456150 2089 ntTSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
CITED4Q96RK1 C15orf59-201ENST00000379822 1342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
CITED4Q96RK1 SNX4-201ENST00000251775 2513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
CITED4Q96RK1 C5orf47-201ENST00000340147 2522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
CITED4Q96RK1 SETD6-202ENST00000310682 2042 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC18.05■□□□□ 0.48
CITED4Q96RK1 BACE2-202ENST00000330333 2993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
CITED4Q96RK1 KCNQ5-203ENST00000355635 6623 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC18.05■□□□□ 0.48
CITED4Q96RK1 DPF1-203ENST00000414789 1960 ntTSL 2 BASIC18.05■□□□□ 0.48
CITED4Q96RK1 ANAPC13-201ENST00000354910 1209 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
CITED4Q96RK1 ADAMTS13-203ENST00000371910 1074 ntTSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
CITED4Q96RK1 SPCS2P3-201ENST00000500401 656 ntBASIC18.05■□□□□ 0.48
CITED4Q96RK1 FAM53A-202ENST00000461064 2159 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.05■□□□□ 0.48
CITED4Q96RK1 HIPK1-207ENST00000369561 3777 ntTSL 5 BASIC18.05■□□□□ 0.48
CITED4Q96RK1 TMEM120A-214ENST00000493111 1456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
CITED4Q96RK1 ZNF688-203ENST00000563276 1492 ntTSL 2 BASIC18.05■□□□□ 0.48
CITED4Q96RK1 UNC5B-201ENST00000335350 6841 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
CITED4Q96RK1 MSLN-205ENST00000563941 2109 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
CITED4Q96RK1 CNNM3-202ENST00000377060 3308 ntTSL 2 BASIC18.05■□□□□ 0.48
CITED4Q96RK1 RAP1B-204ENST00000393436 2049 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
CITED4Q96RK1 TTBK1-202ENST00000304139 2449 ntTSL 5 BASIC18.04■□□□□ 0.48
CITED4Q96RK1 WT1-205ENST00000452863 2768 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
CITED4Q96RK1 EGR3-203ENST00000519492 1500 ntTSL 5 BASIC18.04■□□□□ 0.48
CITED4Q96RK1 LIMS2-207ENST00000409808 2315 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC18.04■□□□□ 0.48
CITED4Q96RK1 HTRA3-201ENST00000307358 2541 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
CITED4Q96RK1 KCTD18-201ENST00000359878 2940 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
CITED4Q96RK1 RAX2-201ENST00000555633 2414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
CITED4Q96RK1 SCRIB-201ENST00000320476 5143 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
CITED4Q96RK1 RAB4A-205ENST00000618010 2799 ntTSL 3 BASIC18.04■□□□□ 0.48
CITED4Q96RK1 ATG16L2-205ENST00000534905 1614 ntTSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
CITED4Q96RK1 BCKDK-203ENST00000394950 1997 ntTSL 2 BASIC18.04■□□□□ 0.48
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 35.6 ms