Protein–RNA interactions for Protein: Q92664

GTF3A, Transcription factor IIIA, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 365 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
GTF3AQ92664 AL162430.1-201ENST00000480705 870 ntBASIC18.34■□□□□ 0.53
GTF3AQ92664 TERF1P2-201ENST00000583350 1212 ntBASIC18.34■□□□□ 0.53
GTF3AQ92664 DUSP26-201ENST00000256261 1835 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.34■□□□□ 0.53
GTF3AQ92664 CD6-203ENST00000352009 1809 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.34■□□□□ 0.53
GTF3AQ92664 MIR222HG-202ENST00000602507 1758 ntTSL 5 BASIC18.34■□□□□ 0.53
GTF3AQ92664 SLC35F5-203ENST00000409342 2284 ntTSL 2 BASIC18.34■□□□□ 0.53
GTF3AQ92664 LHPP-202ENST00000368842 1622 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.34■□□□□ 0.53
GTF3AQ92664 AC133065.2-201ENST00000573379 2147 ntTSL 2 BASIC18.34■□□□□ 0.53
GTF3AQ92664 WRNIP1-203ENST00000380771 2595 ntTSL 1 (best) BASIC18.34■□□□□ 0.53
GTF3AQ92664 SLC4A3-203ENST00000358055 4454 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.33■□□□□ 0.53
GTF3AQ92664 GNB2-209ENST00000436220 1479 ntTSL 5 BASIC18.33■□□□□ 0.53
GTF3AQ92664 SPTBN4-203ENST00000392023 2419 ntTSL 1 (best) BASIC18.33■□□□□ 0.53
GTF3AQ92664 PRMT5-204ENST00000397441 2418 ntTSL 2 BASIC18.33■□□□□ 0.53
GTF3AQ92664 PTP4A3-203ENST00000520105 1866 ntTSL 5 BASIC18.33■□□□□ 0.53
GTF3AQ92664 C2orf72-201ENST00000373640 3657 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.33■□□□□ 0.53
GTF3AQ92664 DYRK1B-204ENST00000593685 2724 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC18.33■□□□□ 0.53
GTF3AQ92664 PRKACA-201ENST00000308677 2677 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.33■□□□□ 0.53
GTF3AQ92664 GLI4-201ENST00000340042 1341 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.33■□□□□ 0.53
GTF3AQ92664 PCMT1-201ENST00000367378 1293 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.33■□□□□ 0.52
GTF3AQ92664 RNF208-202ENST00000392827 1135 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.33■□□□□ 0.52
GTF3AQ92664 ARHGAP24-206ENST00000503995 1273 ntTSL 1 (best) BASIC18.33■□□□□ 0.52
GTF3AQ92664 ATOX1-207ENST00000524142 749 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.33■□□□□ 0.52
GTF3AQ92664 DMPK-220ENST00000618091 2503 ntTSL 1 (best) BASIC18.33■□□□□ 0.52
GTF3AQ92664 DPP7-201ENST00000371579 1590 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.33■□□□□ 0.52
GTF3AQ92664 RNF166-202ENST00000537718 1525 ntTSL 2 BASIC18.33■□□□□ 0.52
GTF3AQ92664 HMCES-203ENST00000417226 1490 ntTSL 1 (best) BASIC18.33■□□□□ 0.52
GTF3AQ92664 JUNB-201ENST00000302754 1820 ntAPPRIS P1 BASIC18.33■□□□□ 0.52
GTF3AQ92664 SPRN-201ENST00000414069 3128 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.32■□□□□ 0.52
GTF3AQ92664 STX18-205ENST00000505286 1380 ntTSL 1 (best) BASIC18.32■□□□□ 0.52
GTF3AQ92664 ALDH5A1-204ENST00000491546 1699 ntTSL 5 BASIC18.32■□□□□ 0.52
GTF3AQ92664 SELENOO-201ENST00000380903 2315 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.32■□□□□ 0.52
GTF3AQ92664 SELENOO-203ENST00000611222 2311 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.32■□□□□ 0.52
GTF3AQ92664 DNAJC25-201ENST00000313525 2268 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.32■□□□□ 0.52
GTF3AQ92664 TRIP6-201ENST00000200457 1942 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.32■□□□□ 0.52
GTF3AQ92664 PRKAA1-202ENST00000354209 1918 ntTSL 1 (best) BASIC18.32■□□□□ 0.52
GTF3AQ92664 LY6E-201ENST00000292494 1181 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.32■□□□□ 0.52
GTF3AQ92664 PHLDA3-201ENST00000367309 896 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.32■□□□□ 0.52
GTF3AQ92664 SDHAP3-201ENST00000436493 736 ntTSL 1 (best) BASIC18.32■□□□□ 0.52
GTF3AQ92664 AC012313.1-204ENST00000444227 462 ntTSL 1 (best) BASIC18.32■□□□□ 0.52
GTF3AQ92664 BRD2-214ENST00000496118 735 ntTSL 1 (best) BASIC18.32■□□□□ 0.52
GTF3AQ92664 TRAPPC6A-205ENST00000592647 514 ntTSL 2 BASIC18.32■□□□□ 0.52
GTF3AQ92664 TMEM51-203ENST00000400796 1842 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.32■□□□□ 0.52
GTF3AQ92664 PLPP7-202ENST00000372264 2095 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.32■□□□□ 0.52
GTF3AQ92664 NELFCD-213ENST00000602795 2305 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.32■□□□□ 0.52
GTF3AQ92664 TUB-201ENST00000299506 2019 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.32■□□□□ 0.52
GTF3AQ92664 RASD1-202ENST00000579152 1404 ntTSL 2 BASIC18.32■□□□□ 0.52
GTF3AQ92664 ILKAP-211ENST00000612675 1335 ntTSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
GTF3AQ92664 LONP1-203ENST00000585374 2882 ntTSL 5 BASIC18.31■□□□□ 0.52
GTF3AQ92664 LGALS9B-201ENST00000324290 1243 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.31■□□□□ 0.52
GTF3AQ92664 GUK1-207ENST00000366726 873 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC18.31■□□□□ 0.52
GTF3AQ92664 SLC35A2-205ENST00000376529 865 ntTSL 3 BASIC18.31■□□□□ 0.52
GTF3AQ92664 LINC01678-201ENST00000411694 863 ntTSL 5 BASIC18.31■□□□□ 0.52
GTF3AQ92664 AC034268.1-201ENST00000441047 882 ntBASIC18.31■□□□□ 0.52
GTF3AQ92664 SLC25A45-206ENST00000526432 894 ntTSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
GTF3AQ92664 AL355102.2-201ENST00000553811 600 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.31■□□□□ 0.52
GTF3AQ92664 KRT18P61-201ENST00000585825 1298 ntBASIC18.31■□□□□ 0.52
GTF3AQ92664 AL831711.1-201ENST00000636824 569 ntTSL 4 BASIC18.31■□□□□ 0.52
GTF3AQ92664 GGA2-211ENST00000567468 1713 ntTSL 2 BASIC18.31■□□□□ 0.52
GTF3AQ92664 TMEM25-205ENST00000411589 2442 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.31■□□□□ 0.52
GTF3AQ92664 PSMD7-201ENST00000219313 1670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
GTF3AQ92664 AC005224.4-201ENST00000583262 1652 ntBASIC18.31■□□□□ 0.52
GTF3AQ92664 HPS6-201ENST00000299238 2649 ntAPPRIS P1 BASIC18.31■□□□□ 0.52
GTF3AQ92664 LIMS2-201ENST00000324938 2111 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
GTF3AQ92664 ANKHD1-205ENST00000394723 2135 ntTSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
GTF3AQ92664 CBWD6-213ENST00000613716 1820 ntTSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
GTF3AQ92664 QPCT-201ENST00000338415 1739 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
GTF3AQ92664 SLC22A31-201ENST00000562855 1909 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.3■□□□□ 0.52
GTF3AQ92664 CFAP99-206ENST00000616117 1941 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.3■□□□□ 0.52
GTF3AQ92664 ADAMTS13-204ENST00000371911 1155 ntTSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
GTF3AQ92664 ASMT-202ENST00000381233 989 ntTSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
GTF3AQ92664 BHLHA9-201ENST00000391429 902 ntAPPRIS P1 BASIC18.3■□□□□ 0.52
GTF3AQ92664 SPOCK2-203ENST00000412663 1284 ntTSL 5 BASIC18.3■□□□□ 0.52
GTF3AQ92664 FNDC3B-204ENST00000421757 946 ntTSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
GTF3AQ92664 FAM66D-201ENST00000434078 918 ntTSL 5 BASIC18.3■□□□□ 0.52
GTF3AQ92664 YJEFN3-203ENST00000514277 995 ntTSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
GTF3AQ92664 SLC35A2-212ENST00000634665 486 ntTSL 4 BASIC18.3■□□□□ 0.52
GTF3AQ92664 MPST-205ENST00000404802 1453 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.3■□□□□ 0.52
GTF3AQ92664 LARGE2-208ENST00000531526 2528 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC18.3■□□□□ 0.52
GTF3AQ92664 NPTXR-201ENST00000333039 5784 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
GTF3AQ92664 TM9SF3-201ENST00000371142 6141 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
GTF3AQ92664 NSMF-201ENST00000265663 2981 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
GTF3AQ92664 NSMF-206ENST00000371475 2987 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
GTF3AQ92664 MIR210HG-201ENST00000500447 1965 ntTSL 2 BASIC18.3■□□□□ 0.52
GTF3AQ92664 NOX4-209ENST00000527626 1774 ntTSL 2 BASIC18.3■□□□□ 0.52
GTF3AQ92664 RPS6-203ENST00000380384 1355 ntTSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
GTF3AQ92664 GPR35-204ENST00000430267 1399 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.3■□□□□ 0.52
GTF3AQ92664 SDR39U1-208ENST00000554698 1364 ntTSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
GTF3AQ92664 VAV3-202ENST00000370056 4990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
GTF3AQ92664 BRWD1-202ENST00000341322 2495 ntTSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
GTF3AQ92664 NEURL4-201ENST00000315614 5182 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
GTF3AQ92664 TANGO2-202ENST00000398042 2011 ntTSL 2 BASIC18.29■□□□□ 0.52
GTF3AQ92664 CAMKK2-208ENST00000412367 2006 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
GTF3AQ92664 ANKRD19P-205ENST00000473204 2370 ntTSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
GTF3AQ92664 UCN-201ENST00000296099 795 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
GTF3AQ92664 HIST2H2AC-201ENST00000331380 390 ntAPPRIS P1 BASIC18.29■□□□□ 0.52
GTF3AQ92664 AC019068.1-201ENST00000415226 552 ntTSL 4 BASIC18.29■□□□□ 0.52
GTF3AQ92664 PGAP3-204ENST00000429199 970 ntTSL 2 BASIC18.29■□□□□ 0.52
GTF3AQ92664 KRT18P5-201ENST00000436075 1291 ntBASIC18.29■□□□□ 0.52
GTF3AQ92664 LINC01942-201ENST00000521373 513 ntTSL 4 BASIC18.29■□□□□ 0.52
GTF3AQ92664 ASRGL1-201ENST00000301776 2182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 18.7 ms