Protein–RNA interactions for Protein: Q6XLA1

CASC2, Protein CASC2, isoform 3, humanhuman

Predictions only

Length 102 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CASC2Q6XLA1 RAP1B-204ENST00000393436 2049 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.42□□□□□ -0.42
CASC2Q6XLA1 F11R-202ENST00000368026 4835 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.42□□□□□ -0.42
CASC2Q6XLA1 BTBD17-201ENST00000375366 1805 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.42□□□□□ -0.42
CASC2Q6XLA1 DUSP22-201ENST00000344450 1485 ntTSL 1 (best) BASIC12.42□□□□□ -0.42
CASC2Q6XLA1 TMEM206-205ENST00000535273 2119 ntTSL 2 BASIC12.42□□□□□ -0.42
CASC2Q6XLA1 AC093536.1-201ENST00000569153 554 ntBASIC12.42□□□□□ -0.42
CASC2Q6XLA1 HGH1-207ENST00000628266 258 ntTSL 5 BASIC12.42□□□□□ -0.42
CASC2Q6XLA1 MINDY2-202ENST00000450403 4820 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.42□□□□□ -0.42
CASC2Q6XLA1 Z98882.1-201ENST00000622160 2253 ntBASIC12.42□□□□□ -0.42
CASC2Q6XLA1 TBC1D22A-206ENST00000407381 1949 ntTSL 5 BASIC12.42□□□□□ -0.42
CASC2Q6XLA1 HOXC13-201ENST00000243056 2423 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.42□□□□□ -0.42
CASC2Q6XLA1 ALDOA-221ENST00000566897 2448 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC12.42□□□□□ -0.42
CASC2Q6XLA1 HGH1-201ENST00000347708 2531 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.42□□□□□ -0.42
CASC2Q6XLA1 ATP2A2-201ENST00000308664 4453 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC12.42□□□□□ -0.42
CASC2Q6XLA1 PKMYT1-201ENST00000262300 2171 ntTSL 1 (best) BASIC12.42□□□□□ -0.42
CASC2Q6XLA1 PHOSPHO1-202ENST00000413580 2173 ntTSL 2 BASIC12.42□□□□□ -0.42
CASC2Q6XLA1 SMPD4-202ENST00000409031 4896 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.42□□□□□ -0.42
CASC2Q6XLA1 AC007326.4-201ENST00000638240 1669 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.42□□□□□ -0.42
CASC2Q6XLA1 HPS6-201ENST00000299238 2649 ntAPPRIS P1 BASIC12.41□□□□□ -0.42
CASC2Q6XLA1 KIRREL2-201ENST00000262625 1969 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.41□□□□□ -0.42
CASC2Q6XLA1 STUM-201ENST00000366788 7705 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC12.41□□□□□ -0.42
CASC2Q6XLA1 ZDHHC3-203ENST00000342790 1336 ntTSL 5 BASIC12.41□□□□□ -0.42
CASC2Q6XLA1 TMEM230-205ENST00000379279 1636 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC12.41□□□□□ -0.42
CASC2Q6XLA1 HOMER3-205ENST00000542541 1607 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.41□□□□□ -0.42
CASC2Q6XLA1 SLC12A5-201ENST00000243964 6061 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.41□□□□□ -0.42
CASC2Q6XLA1 PLEKHO1-201ENST00000369124 2050 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.41□□□□□ -0.42
CASC2Q6XLA1 PLCH2-203ENST00000378486 4837 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.41□□□□□ -0.42
CASC2Q6XLA1 PLCH2-204ENST00000419816 4837 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.41□□□□□ -0.42
CASC2Q6XLA1 NRXN1-204ENST00000401669 5870 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC12.41□□□□□ -0.42
CASC2Q6XLA1 KIF5C-201ENST00000435030 6931 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.41□□□□□ -0.42
CASC2Q6XLA1 SERTAD3-201ENST00000322354 1734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.41□□□□□ -0.42
CASC2Q6XLA1 GOLGA2P6-201ENST00000340929 2049 ntBASIC12.41□□□□□ -0.42
CASC2Q6XLA1 NMB-201ENST00000360476 1007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.41□□□□□ -0.42
CASC2Q6XLA1 SLC13A3-204ENST00000413164 2008 ntTSL 2 BASIC12.41□□□□□ -0.42
CASC2Q6XLA1 SYNGR3-202ENST00000562045 1743 ntTSL 2 BASIC12.41□□□□□ -0.42
CASC2Q6XLA1 FAM111A-204ENST00000528737 6189 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC12.41□□□□□ -0.42
CASC2Q6XLA1 PON1-201ENST00000222381 2568 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.41□□□□□ -0.42
CASC2Q6XLA1 NEU4-205ENST00000407683 2273 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC12.41□□□□□ -0.42
CASC2Q6XLA1 PTDSS1-202ENST00000517309 5177 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.41□□□□□ -0.42
CASC2Q6XLA1 EIF4G3-212ENST00000602326 6196 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.41□□□□□ -0.42
CASC2Q6XLA1 CRTC1-203ENST00000594658 2384 ntTSL 1 (best) BASIC12.41□□□□□ -0.42
CASC2Q6XLA1 DISC1-205ENST00000366636 2224 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC12.41□□□□□ -0.42
CASC2Q6XLA1 KDM6A-211ENST00000536777 5633 ntTSL 1 (best) BASIC12.41□□□□□ -0.42
CASC2Q6XLA1 SHB-201ENST00000377707 2783 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.41□□□□□ -0.42
CASC2Q6XLA1 GMDS-202ENST00000380815 1752 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.41□□□□□ -0.42
CASC2Q6XLA1 TUB-203ENST00000534099 1759 ntTSL 2 BASIC12.41□□□□□ -0.42
CASC2Q6XLA1 LACTBL1-201ENST00000426928 1641 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC12.4□□□□□ -0.42
CASC2Q6XLA1 COQ2-201ENST00000311461 1464 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.4□□□□□ -0.42
CASC2Q6XLA1 RHOF-203ENST00000537171 1485 ntTSL 1 (best) BASIC12.4□□□□□ -0.42
CASC2Q6XLA1 SETD6-202ENST00000310682 2042 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC12.4□□□□□ -0.42
CASC2Q6XLA1 PAQR6-213ENST00000612424 2037 ntTSL 2 BASIC12.4□□□□□ -0.42
CASC2Q6XLA1 ITGB5-201ENST00000296181 4372 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.4□□□□□ -0.42
CASC2Q6XLA1 KREMEN2-203ENST00000571007 1877 ntTSL 2 BASIC12.4□□□□□ -0.42
CASC2Q6XLA1 TTBK2-208ENST00000622375 6891 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.4□□□□□ -0.42
CASC2Q6XLA1 ARHGEF4-205ENST00000409359 5489 ntTSL 5 BASIC12.4□□□□□ -0.42
CASC2Q6XLA1 LRRC34-201ENST00000446859 1718 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC12.4□□□□□ -0.42
CASC2Q6XLA1 CSPG5-202ENST00000383738 4161 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.4□□□□□ -0.42
CASC2Q6XLA1 ZNF668-207ENST00000535577 2396 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.4□□□□□ -0.42
CASC2Q6XLA1 NOMO1-201ENST00000287667 4355 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.4□□□□□ -0.42
CASC2Q6XLA1 HOXD-AS2-201ENST00000426965 927 ntTSL 1 (best) BASIC12.4□□□□□ -0.42
CASC2Q6XLA1 AC004540.2-201ENST00000451368 611 ntTSL 2 BASIC12.4□□□□□ -0.42
CASC2Q6XLA1 SAP25-204ENST00000622764 1031 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.4□□□□□ -0.42
CASC2Q6XLA1 JAGN1-201ENST00000307768 1693 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.4□□□□□ -0.42
CASC2Q6XLA1 HDAC2-201ENST00000368632 2084 ntTSL 2 BASIC12.4□□□□□ -0.42
CASC2Q6XLA1 ESPN-216ENST00000636330 4731 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.4□□□□□ -0.42
CASC2Q6XLA1 METRNL-203ENST00000571814 1900 ntTSL 1 (best) BASIC12.4□□□□□ -0.42
CASC2Q6XLA1 LHPP-201ENST00000368839 1522 ntTSL 1 (best) BASIC12.4□□□□□ -0.42
CASC2Q6XLA1 ATP2A3-201ENST00000309890 4826 ntTSL 5 BASIC12.4□□□□□ -0.42
CASC2Q6XLA1 EGLN2-202ENST00000406058 2150 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.4□□□□□ -0.42
CASC2Q6XLA1 CDK5-204ENST00000485972 1758 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.4□□□□□ -0.42
CASC2Q6XLA1 PCGF3-201ENST00000362003 5685 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.4□□□□□ -0.42
CASC2Q6XLA1 EIF2AK3-201ENST00000303236 4646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.4□□□□□ -0.42
CASC2Q6XLA1 AGPAT3-201ENST00000291572 5546 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.4□□□□□ -0.42
CASC2Q6XLA1 LINC01006-201ENST00000333319 2292 ntBASIC12.4□□□□□ -0.42
CASC2Q6XLA1 ZIM2-208ENST00000629319 2253 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.4□□□□□ -0.42
CASC2Q6XLA1 GCH1-206ENST00000543643 1897 ntTSL 1 (best) BASIC12.4□□□□□ -0.42
CASC2Q6XLA1 NTRK3-206ENST00000540489 2145 ntTSL 5 BASIC12.4□□□□□ -0.43
CASC2Q6XLA1 JMJD1C-202ENST00000399262 8666 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC12.4□□□□□ -0.43
CASC2Q6XLA1 RASL10A-201ENST00000216101 1490 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.4□□□□□ -0.43
CASC2Q6XLA1 FEM1AP4-201ENST00000443167 1987 ntBASIC12.39□□□□□ -0.43
CASC2Q6XLA1 AC092384.1-201ENST00000378347 1812 ntTSL 2 BASIC12.39□□□□□ -0.43
CASC2Q6XLA1 RHBDD2-201ENST00000006777 1802 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.39□□□□□ -0.43
CASC2Q6XLA1 AF106564.1-201ENST00000607058 2553 ntBASIC12.39□□□□□ -0.43
CASC2Q6XLA1 FIGNL2-202ENST00000618634 4812 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.39□□□□□ -0.43
CASC2Q6XLA1 MIB1-201ENST00000261537 9576 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.39□□□□□ -0.43
CASC2Q6XLA1 CBWD3-201ENST00000360171 2165 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.39□□□□□ -0.43
CASC2Q6XLA1 RPUSD1-202ENST00000561734 2159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.39□□□□□ -0.43
CASC2Q6XLA1 ATG4D-201ENST00000309469 1949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.39□□□□□ -0.43
CASC2Q6XLA1 LINC01979-201ENST00000576738 5271 ntTSL 1 (best) BASIC12.39□□□□□ -0.43
CASC2Q6XLA1 ADCY6-206ENST00000550422 5877 ntTSL 2 BASIC12.39□□□□□ -0.43
CASC2Q6XLA1 CYP27A1-201ENST00000258415 2286 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.39□□□□□ -0.43
CASC2Q6XLA1 TTYH1-203ENST00000376531 1763 ntTSL 1 (best) BASIC12.39□□□□□ -0.43
CASC2Q6XLA1 MTNR1A-201ENST00000307161 1289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.39□□□□□ -0.43
CASC2Q6XLA1 MCCD1-201ENST00000376191 955 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.39□□□□□ -0.43
CASC2Q6XLA1 CDKN2A-214ENST00000579755 1283 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.39□□□□□ -0.43
CASC2Q6XLA1 FAM167A-204ENST00000528897 1620 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC12.39□□□□□ -0.43
CASC2Q6XLA1 HCN2-201ENST00000251287 3408 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.39□□□□□ -0.43
CASC2Q6XLA1 SGTA-201ENST00000221566 2330 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.39□□□□□ -0.43
CASC2Q6XLA1 PURB-201ENST00000395699 9069 ntAPPRIS P1 BASIC12.39□□□□□ -0.43
CASC2Q6XLA1 MATN4-204ENST00000372756 2077 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.39□□□□□ -0.43
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 22.8 ms