Protein–RNA interactions for Protein: Q6UY18

LINGO4, Leucine-rich repeat and immunoglobulin-like domain-containing nogo receptor-interacting protein 4, humanhuman

Predictions only

Length 593 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
LINGO4Q6UY18 GPR137B-202ENST00000366592 2042 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.68■■□□□ 1.06
LINGO4Q6UY18 ZSWIM7-201ENST00000399277 2008 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.68■■□□□ 1.06
LINGO4Q6UY18 BCL2L12-201ENST00000246784 990 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.68■■□□□ 1.06
LINGO4Q6UY18 AC004911.1-201ENST00000416316 871 ntBASIC21.68■■□□□ 1.06
LINGO4Q6UY18 AC093833.1-201ENST00000442821 553 ntTSL 5 BASIC21.68■■□□□ 1.06
LINGO4Q6UY18 AC092368.3-201ENST00000562549 1107 ntTSL 5 BASIC21.68■■□□□ 1.06
LINGO4Q6UY18 Z97653.1-201ENST00000567096 446 ntTSL 3 BASIC21.68■■□□□ 1.06
LINGO4Q6UY18 AL137784.2-201ENST00000607332 1000 ntBASIC21.68■■□□□ 1.06
LINGO4Q6UY18 CSNK1G3-206ENST00000511130 1356 ntTSL 2 BASIC21.68■■□□□ 1.06
LINGO4Q6UY18 AC010542.4-201ENST00000563151 1910 ntBASIC21.68■■□□□ 1.06
LINGO4Q6UY18 SLC39A4-202ENST00000301305 2174 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.68■■□□□ 1.06
LINGO4Q6UY18 LSR-204ENST00000361790 2210 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.68■■□□□ 1.06
LINGO4Q6UY18 MANEAL-203ENST00000397631 2327 ntTSL 1 (best) BASIC21.68■■□□□ 1.06
LINGO4Q6UY18 EP400NL-214ENST00000641289 2402 ntBASIC21.68■■□□□ 1.06
LINGO4Q6UY18 FAM43A-201ENST00000329759 2494 ntAPPRIS P1 BASIC21.68■■□□□ 1.06
LINGO4Q6UY18 EYA2-203ENST00000357410 2465 ntTSL 1 (best) BASIC21.68■■□□□ 1.06
LINGO4Q6UY18 FRAT1-201ENST00000371021 2649 ntAPPRIS P1 BASIC21.68■■□□□ 1.06
LINGO4Q6UY18 BICDL2-201ENST00000389347 1811 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.67■■□□□ 1.06
LINGO4Q6UY18 VPS29-206ENST00000549578 1523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.67■■□□□ 1.06
LINGO4Q6UY18 HCFC1R1-201ENST00000248089 965 ntTSL 1 (best) BASIC21.67■■□□□ 1.06
LINGO4Q6UY18 EMC7-201ENST00000256545 1155 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.67■■□□□ 1.06
LINGO4Q6UY18 RAMP1-203ENST00000404910 857 ntTSL 2 BASIC21.67■■□□□ 1.06
LINGO4Q6UY18 AC099681.3-201ENST00000421500 939 ntTSL 4 BASIC21.67■■□□□ 1.06
LINGO4Q6UY18 ZFPL1-203ENST00000525509 478 ntTSL 2 BASIC21.67■■□□□ 1.06
LINGO4Q6UY18 HCFC1R1-207ENST00000574980 845 ntTSL 5 BASIC21.67■■□□□ 1.06
LINGO4Q6UY18 NKX2-4-201ENST00000351817 2238 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.67■■□□□ 1.06
LINGO4Q6UY18 PIP5KL1-202ENST00000388747 2198 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.67■■□□□ 1.06
LINGO4Q6UY18 TTYH1-203ENST00000376531 1763 ntTSL 1 (best) BASIC21.66■■□□□ 1.06
LINGO4Q6UY18 RUSC1-AS1-203ENST00000450199 1636 ntTSL 1 (best) BASIC21.66■■□□□ 1.06
LINGO4Q6UY18 GSTM3-202ENST00000361066 1565 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.66■■□□□ 1.06
LINGO4Q6UY18 HLA-C-203ENST00000383329 1554 ntAPPRIS ALT2 BASIC21.66■■□□□ 1.06
LINGO4Q6UY18 PITX1-205ENST00000506438 1305 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.66■■□□□ 1.06
LINGO4Q6UY18 RAP1B-202ENST00000341355 714 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.66■■□□□ 1.06
LINGO4Q6UY18 GRPEL2-202ENST00000416916 1006 ntTSL 2 BASIC21.66■■□□□ 1.06
LINGO4Q6UY18 RBBP7-202ENST00000380084 2036 ntTSL 2 BASIC21.66■■□□□ 1.06
LINGO4Q6UY18 AKT1S1-206ENST00000391834 1849 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.66■■□□□ 1.06
LINGO4Q6UY18 GMDS-202ENST00000380815 1752 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.66■■□□□ 1.06
LINGO4Q6UY18 SHMT1-202ENST00000352886 2437 ntTSL 2 BASIC21.66■■□□□ 1.06
LINGO4Q6UY18 HLA-DPB1-211ENST00000418931 1560 ntAPPRIS P2 BASIC21.65■■□□□ 1.06
LINGO4Q6UY18 NAT8L-202ENST00000423729 5870 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.65■■□□□ 1.06
LINGO4Q6UY18 MSRB1-201ENST00000361871 1423 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.65■■□□□ 1.06
LINGO4Q6UY18 SMPD5-201ENST00000528912 1390 ntTSL 5 BASIC21.65■■□□□ 1.06
LINGO4Q6UY18 AC016769.1-201ENST00000409132 1010 ntBASIC21.65■■□□□ 1.06
LINGO4Q6UY18 ASRGL1-210ENST00000534571 639 ntTSL 2 BASIC21.65■■□□□ 1.06
LINGO4Q6UY18 IDH2-203ENST00000559482 1278 ntTSL 5 BASIC21.65■■□□□ 1.06
LINGO4Q6UY18 SCN1B-203ENST00000595652 814 ntTSL 2 BASIC21.65■■□□□ 1.06
LINGO4Q6UY18 SERTAD3-201ENST00000322354 1734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.65■■□□□ 1.06
LINGO4Q6UY18 LRP5L-203ENST00000444995 1714 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.65■■□□□ 1.06
LINGO4Q6UY18 GNB1-210ENST00000615252 3048 ntTSL 5 BASIC21.65■■□□□ 1.06
LINGO4Q6UY18 CREG1-201ENST00000370509 1974 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.65■■□□□ 1.06
LINGO4Q6UY18 GMPPA-201ENST00000313597 1544 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.65■■□□□ 1.06
LINGO4Q6UY18 NRSN1-204ENST00000378491 2354 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.65■■□□□ 1.06
LINGO4Q6UY18 KCNQ5-208ENST00000414165 6236 ntTSL 5 BASIC21.65■■□□□ 1.06
LINGO4Q6UY18 TMEM165-201ENST00000381334 1928 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.65■■□□□ 1.06
LINGO4Q6UY18 SPN-202ENST00000395389 1935 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.65■■□□□ 1.06
LINGO4Q6UY18 ZBTB46-202ENST00000302995 2335 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.64■■□□□ 1.06
LINGO4Q6UY18 FAHD1-202ENST00000382668 1845 ntTSL 1 (best) BASIC21.64■■□□□ 1.06
LINGO4Q6UY18 ST3GAL4-215ENST00000532243 1825 ntTSL 1 (best) BASIC21.64■■□□□ 1.06
LINGO4Q6UY18 EPS8L1-202ENST00000245618 2198 ntTSL 1 (best) BASIC21.64■■□□□ 1.06
LINGO4Q6UY18 SLC41A3-201ENST00000315891 1797 ntTSL 1 (best) BASIC21.64■■□□□ 1.06
LINGO4Q6UY18 CHRAC1-203ENST00000519533 1678 ntTSL 1 (best) BASIC21.64■■□□□ 1.05
LINGO4Q6UY18 NPAS1-202ENST00000449844 2043 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.64■■□□□ 1.05
LINGO4Q6UY18 MLNR-201ENST00000218721 1239 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.64■■□□□ 1.05
LINGO4Q6UY18 PTRH1-201ENST00000335223 759 ntTSL 1 (best) BASIC21.64■■□□□ 1.05
LINGO4Q6UY18 SMIM12-202ENST00000423898 897 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.64■■□□□ 1.05
LINGO4Q6UY18 SEC11A-208ENST00000559729 1256 ntTSL 2 BASIC21.64■■□□□ 1.05
LINGO4Q6UY18 AP001160.3-201ENST00000601484 763 ntBASIC21.64■■□□□ 1.05
LINGO4Q6UY18 DYRK1B-204ENST00000593685 2724 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC21.64■■□□□ 1.05
LINGO4Q6UY18 IRX2-202ENST00000382611 2630 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.64■■□□□ 1.05
LINGO4Q6UY18 ME2-206ENST00000638410 2289 ntTSL 5 BASIC21.64■■□□□ 1.05
LINGO4Q6UY18 ME2-210ENST00000639255 2262 ntTSL 5 BASIC21.64■■□□□ 1.05
LINGO4Q6UY18 ASCL2-201ENST00000331289 1852 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.64■■□□□ 1.05
LINGO4Q6UY18 CHODL-201ENST00000299295 2548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.64■■□□□ 1.05
LINGO4Q6UY18 SHMT1-201ENST00000316694 2464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.64■■□□□ 1.05
LINGO4Q6UY18 BRWD1-202ENST00000341322 2495 ntTSL 1 (best) BASIC21.64■■□□□ 1.05
LINGO4Q6UY18 IRX4-207ENST00000613726 2403 ntTSL 1 (best) BASIC21.64■■□□□ 1.05
LINGO4Q6UY18 ACAA1-202ENST00000333167 1785 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.64■■□□□ 1.05
LINGO4Q6UY18 ITM2C-202ENST00000326427 2078 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.64■■□□□ 1.05
LINGO4Q6UY18 GRAMD1A-201ENST00000317991 2695 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.63■■□□□ 1.05
LINGO4Q6UY18 SPRED3-202ENST00000586301 1366 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.63■■□□□ 1.05
LINGO4Q6UY18 CHST7-201ENST00000276055 2289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.63■■□□□ 1.05
LINGO4Q6UY18 PHLDB2-210ENST00000478922 1861 ntTSL 1 (best) BASIC21.63■■□□□ 1.05
LINGO4Q6UY18 CPED1-202ENST00000340646 1056 ntTSL 5 BASIC21.63■■□□□ 1.05
LINGO4Q6UY18 C17orf49-202ENST00000546495 996 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC21.63■■□□□ 1.05
LINGO4Q6UY18 EEF1DP3-203ENST00000566025 782 ntBASIC21.63■■□□□ 1.05
LINGO4Q6UY18 FAM71E1-204ENST00000600100 1281 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.63■■□□□ 1.05
LINGO4Q6UY18 UBE2Q2P2-204ENST00000618775 648 ntTSL 1 (best) BASIC21.63■■□□□ 1.05
LINGO4Q6UY18 CDKN1C-204ENST00000440480 1811 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.63■■□□□ 1.05
LINGO4Q6UY18 USP12-201ENST00000282344 4511 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.63■■□□□ 1.05
LINGO4Q6UY18 ZNF784-201ENST00000325351 2021 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.63■■□□□ 1.05
LINGO4Q6UY18 DNAJC25-201ENST00000313525 2268 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.63■■□□□ 1.05
LINGO4Q6UY18 CXCL16-203ENST00000574412 1668 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.63■■□□□ 1.05
LINGO4Q6UY18 PPP5C-201ENST00000012443 2109 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.62■■□□□ 1.05
LINGO4Q6UY18 PACRGL-208ENST00000503585 1582 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.62■■□□□ 1.05
LINGO4Q6UY18 LIMS2-202ENST00000355119 2045 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.62■■□□□ 1.05
LINGO4Q6UY18 MYH7B-209ENST00000618182 6197 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.62■■□□□ 1.05
LINGO4Q6UY18 HSCB-202ENST00000398941 955 ntTSL 2 BASIC21.62■■□□□ 1.05
LINGO4Q6UY18 AC006015.1-201ENST00000429970 570 ntBASIC21.62■■□□□ 1.05
LINGO4Q6UY18 AP001363.2-201ENST00000538101 391 ntTSL 3 BASIC21.62■■□□□ 1.05
LINGO4Q6UY18 AC106738.1-201ENST00000560487 359 ntTSL 3 BASIC21.62■■□□□ 1.05
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 30.9 ms