Protein–RNA interactions for Protein: Q5VTD9

GFI1B, Zinc finger protein Gfi-1b, humanhuman

Predictions only

Length 330 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
GFI1BQ5VTD9 VAV1-201ENST00000304076 2825 ntTSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
GFI1BQ5VTD9 WRAP73-201ENST00000270708 1665 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
GFI1BQ5VTD9 CNOT11-201ENST00000289382 2599 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
GFI1BQ5VTD9 PYCR3-207ENST00000495276 2332 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
GFI1BQ5VTD9 RIMBP3C-202ENST00000433039 5784 ntAPPRIS P2 BASIC16.56■□□□□ 0.24
GFI1BQ5VTD9 CMTM3-201ENST00000361909 2159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
GFI1BQ5VTD9 ZNF180-205ENST00000587047 525 ntTSL 4 BASIC16.56■□□□□ 0.24
GFI1BQ5VTD9 AC254629.1-202ENST00000618276 2112 ntTSL 2 BASIC16.56■□□□□ 0.24
GFI1BQ5VTD9 RAP1B-204ENST00000393436 2049 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
GFI1BQ5VTD9 AC008105.1-201ENST00000587534 2003 ntTSL 2 BASIC16.56■□□□□ 0.24
GFI1BQ5VTD9 PPFIA1-202ENST00000389547 4133 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
GFI1BQ5VTD9 TCP1-202ENST00000392168 1878 ntTSL 5 BASIC16.56■□□□□ 0.24
GFI1BQ5VTD9 ARFRP1-210ENST00000614942 2554 ntTSL 5 BASIC16.56■□□□□ 0.24
GFI1BQ5VTD9 DALRD3-206ENST00000441576 1706 ntTSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
GFI1BQ5VTD9 PCDHAC2-203ENST00000615316 3011 ntBASIC16.56■□□□□ 0.24
GFI1BQ5VTD9 ST8SIA2-201ENST00000268164 5708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
GFI1BQ5VTD9 PRICKLE3-206ENST00000599218 2062 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
GFI1BQ5VTD9 ADGRD2-201ENST00000334810 3244 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.55■□□□□ 0.24
GFI1BQ5VTD9 POTED-202ENST00000620442 1988 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
GFI1BQ5VTD9 BCR-202ENST00000359540 4708 ntTSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
GFI1BQ5VTD9 OSR1-201ENST00000272223 1936 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
GFI1BQ5VTD9 MMP21-201ENST00000368808 1919 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
GFI1BQ5VTD9 ZNF839-202ENST00000442396 2987 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.55■□□□□ 0.24
GFI1BQ5VTD9 C6orf89-201ENST00000355190 1309 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
GFI1BQ5VTD9 CNPY3-202ENST00000394142 954 ntTSL 5 BASIC16.55■□□□□ 0.24
GFI1BQ5VTD9 PRR7-204ENST00000510492 1285 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
GFI1BQ5VTD9 PRTG-204ENST00000561292 833 ntTSL 3 BASIC16.55■□□□□ 0.24
GFI1BQ5VTD9 LINC01925-201ENST00000579492 500 ntTSL 5 BASIC16.55■□□□□ 0.24
GFI1BQ5VTD9 CD82-201ENST00000227155 2289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
GFI1BQ5VTD9 SYT6-209ENST00000610222 1707 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.55■□□□□ 0.24
GFI1BQ5VTD9 LRRC1-202ENST00000370888 3180 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
GFI1BQ5VTD9 RCCD1-201ENST00000394258 2689 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
GFI1BQ5VTD9 AC064853.3-201ENST00000641801 1658 ntAPPRIS P1 BASIC16.55■□□□□ 0.24
GFI1BQ5VTD9 SH2B2-202ENST00000536178 2113 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
GFI1BQ5VTD9 RMND5A-201ENST00000283632 6301 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
GFI1BQ5VTD9 LARGE2-201ENST00000325468 2522 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
GFI1BQ5VTD9 SUSD2-201ENST00000358321 3404 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
GFI1BQ5VTD9 MFSD7-202ENST00000347950 1599 ntTSL 2 BASIC16.55■□□□□ 0.24
GFI1BQ5VTD9 SEPT2-203ENST00000391971 3315 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
GFI1BQ5VTD9 MAP3K15-201ENST00000338883 4012 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.54■□□□□ 0.24
GFI1BQ5VTD9 EBF1-202ENST00000380654 2345 ntTSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
GFI1BQ5VTD9 DNAJC25-GNG10-201ENST00000374294 1448 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.54■□□□□ 0.24
GFI1BQ5VTD9 TNFSF11-203ENST00000398795 2199 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
GFI1BQ5VTD9 AC021242.3-201ENST00000607598 1377 ntBASIC16.54■□□□□ 0.24
GFI1BQ5VTD9 FAM20B-201ENST00000263733 5984 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
GFI1BQ5VTD9 UROS-204ENST00000368797 1313 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
GFI1BQ5VTD9 CERS5-201ENST00000317551 2051 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC16.54■□□□□ 0.24
GFI1BQ5VTD9 SIGMAR1-201ENST00000277010 1656 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
GFI1BQ5VTD9 ZFAND5-202ENST00000343431 1073 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.54■□□□□ 0.24
GFI1BQ5VTD9 AC026785.2-201ENST00000511821 867 ntTSL 2 BASIC16.54■□□□□ 0.24
GFI1BQ5VTD9 PMPCA-203ENST00000399219 1987 ntTSL 2 BASIC16.54■□□□□ 0.24
GFI1BQ5VTD9 SORCS2-203ENST00000507866 6152 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
GFI1BQ5VTD9 AL591684.2-201ENST00000605970 1594 ntTSL 5 BASIC16.54■□□□□ 0.24
GFI1BQ5VTD9 AP004608.1-202ENST00000533390 1863 ntTSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
GFI1BQ5VTD9 TCAIM-203ENST00000396078 2178 ntTSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
GFI1BQ5VTD9 PPP2R5A-201ENST00000261461 3128 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
GFI1BQ5VTD9 CCDC157-202ENST00000399824 1759 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
GFI1BQ5VTD9 UHRF1BP1L-202ENST00000356828 2023 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
GFI1BQ5VTD9 DRD5-201ENST00000304374 2330 ntAPPRIS P1 BASIC16.53■□□□□ 0.24
GFI1BQ5VTD9 CYB561-213ENST00000581573 2344 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
GFI1BQ5VTD9 FOLH1-203ENST00000343844 2258 ntTSL 2 BASIC16.53■□□□□ 0.24
GFI1BQ5VTD9 SLC35F4-206ENST00000556826 1908 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.53■□□□□ 0.24
GFI1BQ5VTD9 RAB33A-201ENST00000257017 1258 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
GFI1BQ5VTD9 TMEM147-203ENST00000392205 767 ntTSL 2 BASIC16.53■□□□□ 0.24
GFI1BQ5VTD9 AC090587.2-201ENST00000430222 527 ntTSL 2 BASIC16.53■□□□□ 0.24
GFI1BQ5VTD9 CLTA-204ENST00000433436 1235 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
GFI1BQ5VTD9 RNF146-205ENST00000477776 762 ntTSL 3 BASIC16.53■□□□□ 0.24
GFI1BQ5VTD9 CLTA-209ENST00000538225 1181 ntTSL 2 BASIC16.53■□□□□ 0.24
GFI1BQ5VTD9 CLTA-210ENST00000540080 989 ntTSL 2 BASIC16.53■□□□□ 0.24
GFI1BQ5VTD9 UBFD1-208ENST00000567264 642 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.53■□□□□ 0.24
GFI1BQ5VTD9 ZNF692-204ENST00000451251 2065 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.53■□□□□ 0.24
GFI1BQ5VTD9 CTDP1-208ENST00000613122 5866 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
GFI1BQ5VTD9 ZNF598-204ENST00000563630 3371 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
GFI1BQ5VTD9 RPP38-201ENST00000378197 1457 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
GFI1BQ5VTD9 SUDS3-204ENST00000543473 4897 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
GFI1BQ5VTD9 NOTCH2NL-204ENST00000579793 1954 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.53■□□□□ 0.24
GFI1BQ5VTD9 TUBGCP3-204ENST00000464139 2461 ntTSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
GFI1BQ5VTD9 CCDC106-205ENST00000588740 1404 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
GFI1BQ5VTD9 PDIA2-201ENST00000219406 1698 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
GFI1BQ5VTD9 ZNF281-202ENST00000367352 2933 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.52■□□□□ 0.24
GFI1BQ5VTD9 RAD9A-201ENST00000307980 2119 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
GFI1BQ5VTD9 FBLN5-202ENST00000342058 2123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
GFI1BQ5VTD9 SCARF1-202ENST00000348987 2619 ntTSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
GFI1BQ5VTD9 SPHK2-211ENST00000600537 2136 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.52■□□□□ 0.24
GFI1BQ5VTD9 CDKN1C-204ENST00000440480 1811 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
GFI1BQ5VTD9 FGF22-201ENST00000215530 1311 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
GFI1BQ5VTD9 AL160276.1-201ENST00000636672 1312 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.52■□□□□ 0.24
GFI1BQ5VTD9 NPR3-204ENST00000434067 2715 ntTSL 5 BASIC16.52■□□□□ 0.24
GFI1BQ5VTD9 NPW-201ENST00000329610 498 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
GFI1BQ5VTD9 SUSD3-202ENST00000375472 1195 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
GFI1BQ5VTD9 SMUG1-203ENST00000401977 1082 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.52■□□□□ 0.24
GFI1BQ5VTD9 AC243829.1-202ENST00000618848 486 ntTSL 3 BASIC16.52■□□□□ 0.24
GFI1BQ5VTD9 PARP15-202ENST00000464300 2156 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
GFI1BQ5VTD9 TBC1D22A-206ENST00000407381 1949 ntTSL 5 BASIC16.52■□□□□ 0.23
GFI1BQ5VTD9 AC084757.3-201ENST00000558061 1943 ntTSL 3 BASIC16.52■□□□□ 0.23
GFI1BQ5VTD9 PLK5-201ENST00000334770 2106 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC16.52■□□□□ 0.23
GFI1BQ5VTD9 FPGS-203ENST00000373247 2279 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.23
GFI1BQ5VTD9 KRT8-217ENST00000619952 2437 ntTSL 2 BASIC16.51■□□□□ 0.23
GFI1BQ5VTD9 SCARB1-201ENST00000261693 2611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
GFI1BQ5VTD9 NDOR1-201ENST00000344894 1794 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 17.7 ms