Protein–RNA interactions for Protein: Q5BJF6

ODF2, Outer dense fiber protein 2, humanhuman

Predictions only

Length 829 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ODF2Q5BJF6 SAXO1-201ENST00000380530 1727 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.55■■□□□ 1.2
ODF2Q5BJF6 UBE2C-202ENST00000335046 737 ntTSL 2 BASIC22.55■■□□□ 1.2
ODF2Q5BJF6 TNFRSF6B-201ENST00000369996 1124 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.55■■□□□ 1.2
ODF2Q5BJF6 AC007009.1-201ENST00000458624 429 ntTSL 2 BASIC22.55■■□□□ 1.2
ODF2Q5BJF6 AL138724.1-201ENST00000606771 1088 ntBASIC22.55■■□□□ 1.2
ODF2Q5BJF6 MMP28-203ENST00000612672 1092 ntTSL 1 (best) BASIC22.55■■□□□ 1.2
ODF2Q5BJF6 TLE3-201ENST00000317509 5207 ntTSL 1 (best) BASIC22.55■■□□□ 1.2
ODF2Q5BJF6 CCDC130-201ENST00000221554 1792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.55■■□□□ 1.2
ODF2Q5BJF6 XBP1-207ENST00000611155 1794 ntTSL 5 BASIC22.55■■□□□ 1.2
ODF2Q5BJF6 EIF2B4-211ENST00000616081 1754 ntTSL 5 BASIC22.55■■□□□ 1.2
ODF2Q5BJF6 DLGAP4-201ENST00000339266 5016 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.55■■□□□ 1.2
ODF2Q5BJF6 RHBDD2-201ENST00000006777 1802 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
ODF2Q5BJF6 CLPB-202ENST00000340729 2071 ntTSL 2 BASIC22.54■■□□□ 1.2
ODF2Q5BJF6 TEX22-201ENST00000451127 2571 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.54■■□□□ 1.2
ODF2Q5BJF6 CAV2-201ENST00000222693 3301 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
ODF2Q5BJF6 NAT8L-201ENST00000331662 5571 ntTSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
ODF2Q5BJF6 ZNF48-201ENST00000320159 3234 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
ODF2Q5BJF6 DECR2-201ENST00000219481 1615 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
ODF2Q5BJF6 WTAP-201ENST00000337387 1622 ntTSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
ODF2Q5BJF6 LHFPL3-202ENST00000424859 1852 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
ODF2Q5BJF6 NBPF9-209ENST00000621645 5632 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.54■■□□□ 1.2
ODF2Q5BJF6 DNAJC4-202ENST00000321685 1288 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
ODF2Q5BJF6 CDKN2A-208ENST00000498124 880 ntTSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
ODF2Q5BJF6 TMEM218-215ENST00000532407 1103 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
ODF2Q5BJF6 SNAI3-AS1-201ENST00000563261 998 ntTSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
ODF2Q5BJF6 FIZ1-205ENST00000592585 489 ntTSL 5 BASIC22.54■■□□□ 1.2
ODF2Q5BJF6 DNAJC4-212ENST00000628077 938 ntTSL 5 BASIC22.54■■□□□ 1.2
ODF2Q5BJF6 DUSP5-201ENST00000369583 2557 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
ODF2Q5BJF6 MAG-203ENST00000537831 2341 ntTSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
ODF2Q5BJF6 SLC1A5-203ENST00000542575 2882 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
ODF2Q5BJF6 EED-201ENST00000263360 2223 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
ODF2Q5BJF6 TMC6-212ENST00000589553 2389 ntTSL 2 BASIC22.54■■□□□ 1.2
ODF2Q5BJF6 HTATIP2-204ENST00000451739 1748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
ODF2Q5BJF6 SOX18-201ENST00000340356 1864 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
ODF2Q5BJF6 TSPAN3-202ENST00000346495 1647 ntTSL 2 BASIC22.53■■□□□ 1.2
ODF2Q5BJF6 PAXIP1-202ENST00000404141 3827 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.53■■□□□ 1.2
ODF2Q5BJF6 SYNGR2-201ENST00000225777 2325 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
ODF2Q5BJF6 AC010542.4-201ENST00000563151 1910 ntBASIC22.53■■□□□ 1.2
ODF2Q5BJF6 IMPA2-201ENST00000269159 1534 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
ODF2Q5BJF6 MARCH8-201ENST00000319836 5272 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
ODF2Q5BJF6 DUSP26-201ENST00000256261 1835 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
ODF2Q5BJF6 MIR210HG-201ENST00000500447 1965 ntTSL 2 BASIC22.53■■□□□ 1.2
ODF2Q5BJF6 ATRN-201ENST00000262919 8633 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC22.53■■□□□ 1.2
ODF2Q5BJF6 FBXO27-202ENST00000509137 2130 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
ODF2Q5BJF6 SHISA9-205ENST00000639941 1135 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.53■■□□□ 1.2
ODF2Q5BJF6 C2CD4B-201ENST00000380392 1579 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.53■■□□□ 1.2
ODF2Q5BJF6 GXYLT1-202ENST00000398675 7497 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
ODF2Q5BJF6 SYF2-201ENST00000236273 1345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
ODF2Q5BJF6 FAM120B-204ENST00000625626 1794 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.53■■□□□ 1.2
ODF2Q5BJF6 IKBKG-212ENST00000617207 1949 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC22.53■■□□□ 1.2
ODF2Q5BJF6 NAGPA-202ENST00000381955 2100 ntTSL 5 BASIC22.52■■□□□ 1.2
ODF2Q5BJF6 CD6-203ENST00000352009 1809 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.2
ODF2Q5BJF6 C1orf174-201ENST00000361605 1666 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.2
ODF2Q5BJF6 TRIB3-201ENST00000217233 2499 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.2
ODF2Q5BJF6 FFAR1-201ENST00000246553 2311 ntAPPRIS P1 BASIC22.52■■□□□ 1.2
ODF2Q5BJF6 STX6-204ENST00000542060 4809 ntTSL 2 BASIC22.52■■□□□ 1.2
ODF2Q5BJF6 GCH1-206ENST00000543643 1897 ntTSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.2
ODF2Q5BJF6 TMEM250-205ENST00000561457 2804 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.52■■□□□ 1.2
ODF2Q5BJF6 PLEKHM2-202ENST00000375799 4122 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.2
ODF2Q5BJF6 SERBP1P1-201ENST00000396021 1160 ntBASIC22.52■■□□□ 1.2
ODF2Q5BJF6 AC010141.3-201ENST00000456659 717 ntBASIC22.52■■□□□ 1.2
ODF2Q5BJF6 MIR4466-201ENST00000606121 54 ntBASIC22.52■■□□□ 1.2
ODF2Q5BJF6 SH2B3-201ENST00000341259 5406 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.2
ODF2Q5BJF6 SMARCD2-203ENST00000448276 2716 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.2
ODF2Q5BJF6 SSBP3-216ENST00000610401 3168 ntTSL 5 BASIC22.52■■□□□ 1.2
ODF2Q5BJF6 SLAIN1-206ENST00000418532 2855 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.52■■□□□ 1.19
ODF2Q5BJF6 DISC1-205ENST00000366636 2224 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
ODF2Q5BJF6 HOMER3-203ENST00000433218 1418 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.51■■□□□ 1.19
ODF2Q5BJF6 KANSL1-218ENST00000638275 5352 ntTSL 5 BASIC22.51■■□□□ 1.19
ODF2Q5BJF6 TRAF7-203ENST00000565383 799 ntTSL 5 BASIC22.51■■□□□ 1.19
ODF2Q5BJF6 Z98883.1-202ENST00000635107 1289 ntTSL 5 BASIC22.51■■□□□ 1.19
ODF2Q5BJF6 TUB-201ENST00000299506 2019 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
ODF2Q5BJF6 EEF1D-201ENST00000317198 1458 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.51■■□□□ 1.19
ODF2Q5BJF6 RPS6KL1-216ENST00000557413 2425 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.51■■□□□ 1.19
ODF2Q5BJF6 C12orf75-208ENST00000612117 1329 ntTSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
ODF2Q5BJF6 IL15RA-206ENST00000397248 1799 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
ODF2Q5BJF6 PHLDA1-202ENST00000602540 5741 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
ODF2Q5BJF6 FAH-202ENST00000407106 2152 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.5■■□□□ 1.19
ODF2Q5BJF6 DNAJB5-203ENST00000453597 2589 ntTSL 2 BASIC22.5■■□□□ 1.19
ODF2Q5BJF6 PGRMC2-201ENST00000296425 2767 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
ODF2Q5BJF6 LINC01123-202ENST00000419296 2436 ntTSL 2 BASIC22.5■■□□□ 1.19
ODF2Q5BJF6 DYRK3-202ENST00000367108 2218 ntTSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
ODF2Q5BJF6 TMEM9B-201ENST00000309134 1659 ntTSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
ODF2Q5BJF6 AC009506.1-201ENST00000418474 1494 ntTSL 2 BASIC22.5■■□□□ 1.19
ODF2Q5BJF6 AURKAIP1-204ENST00000378853 875 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.5■■□□□ 1.19
ODF2Q5BJF6 KRTAP5-4-201ENST00000399682 1181 ntAPPRIS P5 BASIC22.5■■□□□ 1.19
ODF2Q5BJF6 EXOC3L2-202ENST00000413988 2964 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.5■■□□□ 1.19
ODF2Q5BJF6 VAMP2-204ENST00000488857 874 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC22.5■■□□□ 1.19
ODF2Q5BJF6 AC131281.2-201ENST00000520478 145 ntBASIC22.5■■□□□ 1.19
ODF2Q5BJF6 LINC01011-201ENST00000445000 2811 ntTSL 2 BASIC22.5■■□□□ 1.19
ODF2Q5BJF6 CERKL-205ENST00000409440 2425 ntTSL 2 BASIC22.5■■□□□ 1.19
ODF2Q5BJF6 NUTF2-201ENST00000219169 2321 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
ODF2Q5BJF6 B4GALNT1-202ENST00000418555 1861 ntTSL 2 BASIC22.49■■□□□ 1.19
ODF2Q5BJF6 PDLIM3-203ENST00000284771 1672 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
ODF2Q5BJF6 FBXW11-203ENST00000393802 2181 ntTSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
ODF2Q5BJF6 A1BG-201ENST00000263100 1722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
ODF2Q5BJF6 FASTK-212ENST00000482571 1764 ntTSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
ODF2Q5BJF6 SF1-220ENST00000626028 704 ntTSL 2 BASIC22.49■■□□□ 1.19
ODF2Q5BJF6 TCEA1-214ENST00000640382 1234 ntTSL 5 BASIC22.49■■□□□ 1.19
ODF2Q5BJF6 PDK3-201ENST00000379162 1809 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 60.7 ms