Protein–RNA interactions for Protein: Q16629

SRSF7, Serine/arginine-rich splicing factor 7, humanhuman

Known RBP eCLIP

Length 238 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SRSF7Q16629 ERBIN-202ENST00000380935 6692 ntTSL 5 BASIC2.09□□□□□ -2.077e-6■□□□□ 9.3
SRSF7Q16629 HNRNPL-201ENST00000221419 2471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.32■□□□□ 0.847e-7■□□□□ 9.3
SRSF7Q16629 HNRNPL-212ENST00000601449 1918 ntTSL 514.55□□□□□ -0.087e-7■□□□□ 9.3
SRSF7Q16629 HNRNPL-211ENST00000601047 1127 ntTSL 512.53□□□□□ -0.47e-7■□□□□ 9.3
SRSF7Q16629 HNRNPL-208ENST00000600233 659 ntTSL 511.82□□□□□ -0.527e-7■□□□□ 9.3
SRSF7Q16629 HNRNPL-210ENST00000600873 1633 ntTSL 5 BASIC11.38□□□□□ -0.597e-7■□□□□ 9.3
SRSF7Q16629 HNRNPL-207ENST00000598985 900 ntTSL 511.17□□□□□ -0.627e-7■□□□□ 9.3
SRSF7Q16629 HNRNPL-209ENST00000600741 624 ntTSL 210.69□□□□□ -0.77e-7■□□□□ 9.3
SRSF7Q16629 ZFC3H1-212ENST00000552994 7597 ntTSL 1 (best)10.28□□□□□ -0.767e-7■□□□□ 9.3
SRSF7Q16629 ZFC3H1-201ENST00000378743 7285 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.18□□□□□ -0.787e-7■□□□□ 9.3
SRSF7Q16629 HNRNPL-214ENST00000601813 593 ntTSL 510.03□□□□□ -0.87e-7■□□□□ 9.3
SRSF7Q16629 HNRNPL-202ENST00000388749 1952 ntTSL 59.23□□□□□ -0.937e-7■□□□□ 9.3
SRSF7Q16629 WDR4-202ENST00000398208 2122 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.371e-8■□□□□ 9.3
SRSF7Q16629 WDR4-207ENST00000492742 2205 ntTSL 217.15■□□□□ 0.341e-8■□□□□ 9.3
SRSF7Q16629 WDR4-205ENST00000476326 1977 ntTSL 1 (best)12.82□□□□□ -0.361e-8■□□□□ 9.3
SRSF7Q16629 HLF-209ENST00000575307 582 ntTSL 28.14□□□□□ -1.118e-12■□□□□ 9.3
SRSF7Q16629 CALM2-207ENST00000484408 682 ntTSL 517.08■□□□□ 0.329e-12■□□□□ 9.2
SRSF7Q16629 CALM2-201ENST00000272298 1302 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.019e-12■□□□□ 9.2
SRSF7Q16629 CALM2-209ENST00000628793 1103 ntTSL 5 BASIC14.22□□□□□ -0.139e-12■□□□□ 9.2
SRSF7Q16629 CALM2-203ENST00000432899 1004 ntTSL 510.4□□□□□ -0.749e-12■□□□□ 9.2
SRSF7Q16629 STPG4-206ENST00000422269 983 ntTSL 29.49□□□□□ -0.899e-12■□□□□ 9.2
SRSF7Q16629 CALM2-206ENST00000482532 1891 ntTSL 29.16□□□□□ -0.949e-12■□□□□ 9.2
SRSF7Q16629 CALM2-202ENST00000409563 770 ntTSL 5 BASIC7.59□□□□□ -1.199e-12■□□□□ 9.2
SRSF7Q16629 CALM2-204ENST00000456319 703 ntTSL 25.73□□□□□ -1.499e-12■□□□□ 9.2
SRSF7Q16629 CALM2-205ENST00000460218 4502 ntTSL 1 (best)1.51□□□□□ -2.179e-12■□□□□ 9.2
SRSF7Q16629 GMDS-202ENST00000380815 1752 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.517e-7■□□□□ 9.2
SRSF7Q16629 GMDS-201ENST00000380805 1743 ntTSL 216.48■□□□□ 0.237e-7■□□□□ 9.2
SRSF7Q16629 GMDS-208ENST00000530927 1440 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.75□□□□□ -0.057e-7■□□□□ 9.2
SRSF7Q16629 GMDS-209ENST00000531690 515 ntTSL 55.53□□□□□ -1.527e-7■□□□□ 9.2
SRSF7Q16629 ARFGEF2-201ENST00000371917 8852 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.82□□□□□ -1.647e-7■□□□□ 9.2
SRSF7Q16629 LINC01203-201ENST00000419566 580 ntTSL 2 BASIC4.53□□□□□ -1.686e-8■□□□□ 9.2
SRSF7Q16629 OGT-204ENST00000455587 632 ntTSL 36.7□□□□□ -1.346e-18■□□□□ 9.2
SRSF7Q16629 OGT-202ENST00000373719 5461 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC6.25□□□□□ -1.416e-18■□□□□ 9.2
SRSF7Q16629 OGT-201ENST00000373701 3310 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC5.58□□□□□ -1.526e-18■□□□□ 9.2
SRSF7Q16629 OGT-210ENST00000488174 7243 ntTSL 55.17□□□□□ -1.586e-18■□□□□ 9.2
SRSF7Q16629 RSL1D1-204ENST00000571133 5483 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC8.2□□□□□ -1.11e-8■□□□□ 9.2
SRSF7Q16629 RSL1D1-209ENST00000573618 710 ntTSL 57.26□□□□□ -1.251e-8■□□□□ 9.2
SRSF7Q16629 RSL1D1-202ENST00000396503 1470 ntTSL 26.6□□□□□ -1.351e-8■□□□□ 9.2
SRSF7Q16629 RSL1D1-208ENST00000573251 894 ntTSL 36.58□□□□□ -1.361e-8■□□□□ 9.2
SRSF7Q16629 RSL1D1-201ENST00000355674 1323 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best)6.13□□□□□ -1.431e-8■□□□□ 9.2
SRSF7Q16629 RSL1D1-207ENST00000573029 766 ntTSL 35.02□□□□□ -1.611e-8■□□□□ 9.2
SRSF7Q16629 SQSTM1-202ENST00000389805 2986 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.74□□□□□ -0.054e-8■□□□□ 9.2
SRSF7Q16629 SQSTM1-213ENST00000510187 1714 ntTSL 5 BASIC13.75□□□□□ -0.214e-8■□□□□ 9.2
SRSF7Q16629 SQSTM1-201ENST00000360718 2253 ntTSL 1 (best) BASIC11.08□□□□□ -0.644e-8■□□□□ 9.2
SRSF7Q16629 RBMS1-211ENST00000477486 562 ntTSL 416.93■□□□□ 0.32e-8■□□□□ 9.1
SRSF7Q16629 RBMS1-214ENST00000491781 1533 ntTSL 1 (best)13.53□□□□□ -0.242e-8■□□□□ 9.1
SRSF7Q16629 RBMS1-201ENST00000348849 4273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.5□□□□□ -0.732e-8■□□□□ 9.1
SRSF7Q16629 RBMS1-209ENST00000474820 4016 ntTSL 1 (best)4.34□□□□□ -1.712e-8■□□□□ 9.1
SRSF7Q16629 VEGFA-217ENST00000518538 535 ntTSL 217.63■□□□□ 0.417e-11■□□□□ 9.1
SRSF7Q16629 VEGFA-222ENST00000520948 1199 ntTSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.067e-11■□□□□ 9.1
SRSF7Q16629 VEGFA-221ENST00000520265 336 ntTSL 511.13□□□□□ -0.637e-11■□□□□ 9.1
SRSF7Q16629 VEGFA-201ENST00000230480 993 ntTSL 1 (best) BASIC10.88□□□□□ -0.677e-11■□□□□ 9.1
SRSF7Q16629 VEGFA-219ENST00000518824 606 ntTSL 1 (best) BASIC10.44□□□□□ -0.747e-11■□□□□ 9.1
SRSF7Q16629 VEGFA-224ENST00000523873 784 ntTSL 1 (best) BASIC10.27□□□□□ -0.777e-11■□□□□ 9.1
SRSF7Q16629 VEGFA-225ENST00000523950 954 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.1□□□□□ -0.797e-11■□□□□ 9.1
SRSF7Q16629 VEGFA-216ENST00000512683 475 ntTSL 1 (best)9.61□□□□□ -0.877e-11■□□□□ 9.1
SRSF7Q16629 VEGFA-210ENST00000457104 414 ntTSL 1 (best) BASIC9.59□□□□□ -0.877e-11■□□□□ 9.1
SRSF7Q16629 VEGFA-218ENST00000518689 630 ntTSL 1 (best) BASIC9.59□□□□□ -0.877e-11■□□□□ 9.1
SRSF7Q16629 VEGFA-223ENST00000523125 541 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC9.59□□□□□ -0.877e-11■□□□□ 9.1
SRSF7Q16629 VEGFA-212ENST00000480614 12167 ntTSL 1 (best)7.99□□□□□ -1.137e-11■□□□□ 9.1
SRSF7Q16629 GOLGA4-212ENST00000617480 1545 ntTSL 5 BASIC16.59■□□□□ 0.251e-6■□□□□ 9.1
SRSF7Q16629 GOLGA4-208ENST00000444882 1451 ntTSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.211e-6■□□□□ 9.1
SRSF7Q16629 TAL1-202ENST00000371884 4642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.111e-6■□□□□ 9.1
SRSF7Q16629 GOLGA4-209ENST00000450863 1617 ntTSL 515.36■□□□□ 0.051e-6■□□□□ 9.1
SRSF7Q16629 TAL1-201ENST00000294339 5001 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.92□□□□□ -0.021e-6■□□□□ 9.1
SRSF7Q16629 GOLGA4-203ENST00000419177 760 ntTSL 313.48□□□□□ -0.251e-6■□□□□ 9.1
SRSF7Q16629 GOLGA4-204ENST00000429018 2036 ntTSL 1 (best)13.26□□□□□ -0.291e-6■□□□□ 9.1
SRSF7Q16629 DDX46-212ENST00000628477 1584 ntTSL 5 BASIC11.63□□□□□ -0.551e-6■□□□□ 9.1
SRSF7Q16629 NEAT1-203ENST00000601801 487 ntTSL 4 BASIC11.52□□□□□ -0.575e-10■□□□□ 9.1
SRSF7Q16629 GOLGA4-202ENST00000361924 7772 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.19□□□□□ -0.781e-6■□□□□ 9.1
SRSF7Q16629 GOLGA4-201ENST00000356847 7673 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC9.55□□□□□ -0.881e-6■□□□□ 9.1
SRSF7Q16629 NEAT1_1.1-201ENST00000620348 120 ntBASIC9.03□□□□□ -0.965e-10■□□□□ 9.1
SRSF7Q16629 GOLGA4-206ENST00000435830 4152 ntTSL 1 (best)8.63□□□□□ -1.031e-6■□□□□ 9.1
SRSF7Q16629 DDX46-202ENST00000452510 5689 ntTSL 1 (best) BASIC8.52□□□□□ -1.041e-6■□□□□ 9.1
SRSF7Q16629 DDX46-207ENST00000507392 3565 ntTSL 26.87□□□□□ -1.311e-6■□□□□ 9.1
SRSF7Q16629 DDX46-201ENST00000354283 3821 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.21□□□□□ -1.421e-6■□□□□ 9.1
SRSF7Q16629 DDX46-209ENST00000509255 398 ntTSL 22.84□□□□□ -1.951e-6■□□□□ 9.1
SRSF7Q16629 GOLGA4-207ENST00000437131 6947 ntTSL 1 (best)1.93□□□□□ -2.11e-6■□□□□ 9.1
SRSF7Q16629 PDIA4-202ENST00000413966 550 ntTSL 214.07□□□□□ -0.167e-10■□□□□ 9.1
SRSF7Q16629 PDIA4-201ENST00000286091 2903 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.54□□□□□ -0.47e-10■□□□□ 9.1
SRSF7Q16629 SET-209ENST00000480217 509 ntTSL 512.24□□□□□ -0.452e-8■□□□□ 9
SRSF7Q16629 SET-210ENST00000480536 388 ntTSL 24.36□□□□□ -1.712e-8■□□□□ 9
SRSF7Q16629 MIR224-201ENST00000384889 81 ntBASIC-0.44□□□□□ -2.482e-8■□□□□ 9
SRSF7Q16629 SH3BP2-221ENST00000511747 2351 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.23■■□□□ 1.311e-6■□□□□ 9
SRSF7Q16629 SH3BP2-210ENST00000505941 917 ntTSL 216.72■□□□□ 0.271e-6■□□□□ 9
SRSF7Q16629 SH3BP2-228ENST00000515737 2579 ntTSL 214.27□□□□□ -0.131e-6■□□□□ 9
SRSF7Q16629 SH3BP2-207ENST00000503393 9158 ntTSL 1 (best) BASIC13.04□□□□□ -0.321e-6■□□□□ 9
SRSF7Q16629 SH3BP2-229ENST00000515802 2247 ntTSL 212.8□□□□□ -0.361e-6■□□□□ 9
SRSF7Q16629 MDM2-219ENST00000493419 577 ntTSL 211.31□□□□□ -0.61e-6■□□□□ 9
SRSF7Q16629 SH3BP2-227ENST00000515183 566 ntTSL 411.18□□□□□ -0.621e-6■□□□□ 9
SRSF7Q16629 SH3BP2-217ENST00000510204 3617 ntTSL 210.39□□□□□ -0.751e-6■□□□□ 9
SRSF7Q16629 SH3BP2-209ENST00000504450 844 ntTSL 59.23□□□□□ -0.931e-6■□□□□ 9
SRSF7Q16629 SH3BP2-201ENST00000356331 9211 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC9.12□□□□□ -0.951e-6■□□□□ 9
SRSF7Q16629 MDM2-216ENST00000471946 251 ntTSL 34.41□□□□□ -1.71e-6■□□□□ 9
SRSF7Q16629 ZNF277-202ENST00000361946 1736 ntTSL 1 (best)13.78□□□□□ -0.25e-7■□□□□ 9
SRSF7Q16629 ZNF277-201ENST00000361822 1849 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.6□□□□□ -0.555e-7■□□□□ 9
SRSF7Q16629 ZNF277-207ENST00000457808 891 ntTSL 511.37□□□□□ -0.595e-7■□□□□ 9
SRSF7Q16629 ZNF277-205ENST00000425229 617 ntTSL 39.91□□□□□ -0.825e-7■□□□□ 9
SRSF7Q16629 ZNF277-206ENST00000450657 1075 ntTSL 1 (best) BASIC9.02□□□□□ -0.975e-7■□□□□ 9
SRSF7Q16629 ZNF277-203ENST00000421043 2218 ntTSL 2 BASIC8.99□□□□□ -0.975e-7■□□□□ 9
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