Protein–RNA interactions for Protein: Q16619

CTF1, Cardiotrophin-1, humanhuman

Predictions only

Length 201 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CTF1Q16619 C7orf43-206ENST00000456769 2046 ntTSL 2 BASIC18.97■□□□□ 0.63
CTF1Q16619 BX323043.1-201ENST00000641006 1765 ntBASIC18.97■□□□□ 0.63
CTF1Q16619 AL035252.2-201ENST00000454676 3168 ntTSL 2 BASIC18.97■□□□□ 0.63
CTF1Q16619 HSPB11-201ENST00000194214 915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.97■□□□□ 0.63
CTF1Q16619 PKIG-207ENST00000372894 1191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.97■□□□□ 0.63
CTF1Q16619 UBFD1-208ENST00000567264 642 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.97■□□□□ 0.63
CTF1Q16619 IGFBP2-201ENST00000233809 1439 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.97■□□□□ 0.63
CTF1Q16619 ZBTB25-202ENST00000555220 1440 ntTSL 1 (best) BASIC18.97■□□□□ 0.63
CTF1Q16619 SCOC-207ENST00000506597 1838 ntTSL 1 (best) BASIC18.97■□□□□ 0.63
CTF1Q16619 RIPPLY3-201ENST00000329553 2235 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.97■□□□□ 0.63
CTF1Q16619 CD82-201ENST00000227155 2289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.97■□□□□ 0.63
CTF1Q16619 SPAG16-204ENST00000413312 2258 ntTSL 5 BASIC18.97■□□□□ 0.63
CTF1Q16619 CAMK2B-207ENST00000358707 1895 ntTSL 1 (best) BASIC18.97■□□□□ 0.63
CTF1Q16619 CDC14A-203ENST00000370124 1883 ntTSL 1 (best) BASIC18.97■□□□□ 0.63
CTF1Q16619 AC004687.1-201ENST00000579003 1625 ntBASIC18.96■□□□□ 0.63
CTF1Q16619 SLC35C1-202ENST00000442528 1756 ntTSL 1 (best) BASIC18.96■□□□□ 0.63
CTF1Q16619 NTRK1-201ENST00000358660 2492 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.96■□□□□ 0.63
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CTF1Q16619 SUMO3-204ENST00000411651 1921 ntTSL 2 BASIC18.96■□□□□ 0.63
CTF1Q16619 SCARB1-201ENST00000261693 2611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.96■□□□□ 0.63
CTF1Q16619 AC009014.1-201ENST00000607574 1667 ntAPPRIS P1 BASIC18.96■□□□□ 0.63
CTF1Q16619 IL17RC-202ENST00000383812 2384 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.96■□□□□ 0.63
CTF1Q16619 IL17RC-203ENST00000403601 2388 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.96■□□□□ 0.63
CTF1Q16619 PITX3-202ENST00000539804 1187 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.96■□□□□ 0.63
CTF1Q16619 AFDN-202ENST00000351017 5823 ntTSL 5 BASIC18.96■□□□□ 0.63
CTF1Q16619 SEMA6B-202ENST00000586965 2034 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.96■□□□□ 0.63
CTF1Q16619 AC098818.2-201ENST00000564925 2320 ntBASIC18.96■□□□□ 0.63
CTF1Q16619 CEP78-202ENST00000376597 2618 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.96■□□□□ 0.63
CTF1Q16619 GATA4-207ENST00000532059 1459 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.96■□□□□ 0.63
CTF1Q16619 BCL7A-201ENST00000261822 2581 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.95■□□□□ 0.62
CTF1Q16619 SLC39A5-209ENST00000454355 1968 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.95■□□□□ 0.62
CTF1Q16619 PGF-201ENST00000238607 1693 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC18.95■□□□□ 0.62
CTF1Q16619 TMEM151B-202ENST00000451188 4895 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.95■□□□□ 0.62
CTF1Q16619 EPCAM-202ENST00000405271 1530 ntTSL 5 BASIC18.95■□□□□ 0.62
CTF1Q16619 PSMG3-202ENST00000288607 1391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.95■□□□□ 0.62
CTF1Q16619 TMED4-203ENST00000457408 2322 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.95■□□□□ 0.62
CTF1Q16619 TMEM125-201ENST00000432792 1850 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.95■□□□□ 0.62
CTF1Q16619 VAV1-201ENST00000304076 2825 ntTSL 1 (best) BASIC18.95■□□□□ 0.62
CTF1Q16619 PKIB-204ENST00000368448 1561 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.95■□□□□ 0.62
CTF1Q16619 SRRM3-204ENST00000611745 3612 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.95■□□□□ 0.62
CTF1Q16619 APOE-201ENST00000252486 1208 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.95■□□□□ 0.62
CTF1Q16619 ENDOG-201ENST00000372642 1172 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.95■□□□□ 0.62
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CTF1Q16619 SLC16A5-202ENST00000450736 2051 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.95■□□□□ 0.62
CTF1Q16619 TMEM17-201ENST00000335390 1797 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.95■□□□□ 0.62
CTF1Q16619 LRFN4-201ENST00000309602 2431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.95■□□□□ 0.62
CTF1Q16619 FPGS-203ENST00000373247 2279 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.95■□□□□ 0.62
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CTF1Q16619 NRL-206ENST00000561028 2103 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.95■□□□□ 0.62
CTF1Q16619 TRA2A-201ENST00000297071 1845 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.95■□□□□ 0.62
CTF1Q16619 RAC1-201ENST00000348035 2323 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.95■□□□□ 0.62
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CTF1Q16619 C5orf47-201ENST00000340147 2522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.95■□□□□ 0.62
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CTF1Q16619 HDAC11-211ENST00000433119 2043 ntTSL 1 (best) BASIC18.95■□□□□ 0.62
CTF1Q16619 AGTR1-209ENST00000497524 2359 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.95■□□□□ 0.62
CTF1Q16619 ZNF746-203ENST00000461958 5051 ntTSL 1 (best) BASIC18.94■□□□□ 0.62
CTF1Q16619 YAP1-202ENST00000345877 5284 ntTSL 5 BASIC18.94■□□□□ 0.62
CTF1Q16619 MYDGF-201ENST00000262947 1018 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.94■□□□□ 0.62
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CTF1Q16619 CREB3L3-205ENST00000602257 1475 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.94■□□□□ 0.62
CTF1Q16619 AC112907.3-201ENST00000577781 2400 ntBASIC18.94■□□□□ 0.62
CTF1Q16619 HSPD1-202ENST00000388968 2455 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.94■□□□□ 0.62
CTF1Q16619 NUTM2D-201ENST00000381697 3290 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC18.94■□□□□ 0.62
CTF1Q16619 S1PR5-201ENST00000333430 2341 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.94■□□□□ 0.62
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CTF1Q16619 ILDR2-207ENST00000529071 2566 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.93■□□□□ 0.62
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CTF1Q16619 PACSIN3-211ENST00000539589 2009 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.93■□□□□ 0.62
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CTF1Q16619 TMEM163-201ENST00000281924 1892 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.93■□□□□ 0.62
CTF1Q16619 SQLE-206ENST00000523430 1879 ntTSL 2 BASIC18.93■□□□□ 0.62
CTF1Q16619 ABHD16B-201ENST00000369916 1491 ntAPPRIS P1 BASIC18.93■□□□□ 0.62
CTF1Q16619 UGP2-201ENST00000337130 2338 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.93■□□□□ 0.62
CTF1Q16619 ASB1-202ENST00000409297 878 ntTSL 5 BASIC18.93■□□□□ 0.62
CTF1Q16619 GUCD1-207ENST00000447813 895 ntTSL 3 BASIC18.93■□□□□ 0.62
CTF1Q16619 ACTR5-201ENST00000243903 2565 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.93■□□□□ 0.62
CTF1Q16619 TMEM151A-201ENST00000327259 2562 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.93■□□□□ 0.62
CTF1Q16619 HTATIP2-204ENST00000451739 1748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.93■□□□□ 0.62
CTF1Q16619 COL13A1-201ENST00000354547 3027 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.93■□□□□ 0.62
CTF1Q16619 PLEKHJ1-206ENST00000587962 1311 ntTSL 2 BASIC18.93■□□□□ 0.62
CTF1Q16619 ARPP19-201ENST00000249822 5301 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.93■□□□□ 0.62
CTF1Q16619 AC027702.1-201ENST00000563810 1770 ntBASIC18.93■□□□□ 0.62
CTF1Q16619 GAS6-201ENST00000327773 2490 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.93■□□□□ 0.62
CTF1Q16619 ZNF316-201ENST00000382252 5392 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.92■□□□□ 0.62
CTF1Q16619 CEP55-201ENST00000371485 2638 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.92■□□□□ 0.62
CTF1Q16619 ZDHHC17-201ENST00000426126 5259 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.92■□□□□ 0.62
CTF1Q16619 C7orf49-213ENST00000617987 1727 ntTSL 5 BASIC18.92■□□□□ 0.62
CTF1Q16619 ASPG-201ENST00000546892 1791 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.92■□□□□ 0.62
CTF1Q16619 RNF212-202ENST00000382968 2335 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.92■□□□□ 0.62
CTF1Q16619 ZNF12-201ENST00000342651 2921 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.92■□□□□ 0.62
CTF1Q16619 RNASEH2B-201ENST00000336617 1629 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.92■□□□□ 0.62
CTF1Q16619 VSTM2A-203ENST00000404951 2521 ntTSL 5 BASIC18.92■□□□□ 0.62
CTF1Q16619 DACH1-201ENST00000611519 4789 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.92■□□□□ 0.62
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