Protein–RNA interactions for Protein: Q16143

SNCB, Beta-synuclein, humanhuman

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Length 134 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SNCBQ16143 ZDHHC3-203ENST00000342790 1336 ntTSL 5 BASIC20.76■□□□□ 0.91
SNCBQ16143 ISCA1-203ENST00000375991 1958 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.76■□□□□ 0.91
SNCBQ16143 DGKZ-203ENST00000421244 2862 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.75■□□□□ 0.91
SNCBQ16143 KANK4-202ENST00000354381 2103 ntTSL 2 BASIC20.75■□□□□ 0.91
SNCBQ16143 BID-204ENST00000399767 2129 ntTSL 2 BASIC20.75■□□□□ 0.91
SNCBQ16143 SUMF2-201ENST00000275607 1894 ntTSL 1 (best) BASIC20.75■□□□□ 0.91
SNCBQ16143 TIGD6-202ENST00000515406 2429 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.75■□□□□ 0.91
SNCBQ16143 VSX1-202ENST00000376709 2192 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.75■□□□□ 0.91
SNCBQ16143 RAB20-201ENST00000267328 1518 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.75■□□□□ 0.91
SNCBQ16143 U2AF1-201ENST00000291552 962 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.75■□□□□ 0.91
SNCBQ16143 VIPR2-204ENST00000421760 717 ntTSL 3 BASIC20.75■□□□□ 0.91
SNCBQ16143 U2AF1L5-202ENST00000619610 813 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.75■□□□□ 0.91
SNCBQ16143 RIMBP3B-201ENST00000620804 6105 ntAPPRIS P1 BASIC20.75■□□□□ 0.91
SNCBQ16143 ZBTB25-202ENST00000555220 1440 ntTSL 1 (best) BASIC20.75■□□□□ 0.91
SNCBQ16143 LARGE2-201ENST00000325468 2522 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.75■□□□□ 0.91
SNCBQ16143 RIMKLB-202ENST00000357529 5830 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.75■□□□□ 0.91
SNCBQ16143 TMED4-203ENST00000457408 2322 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.75■□□□□ 0.91
SNCBQ16143 IL15RA-206ENST00000397248 1799 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.74■□□□□ 0.91
SNCBQ16143 XBP1-207ENST00000611155 1794 ntTSL 5 BASIC20.74■□□□□ 0.91
SNCBQ16143 ZNF324B-202ENST00000545523 2368 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.74■□□□□ 0.91
SNCBQ16143 EML2-220ENST00000589876 2364 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.74■□□□□ 0.91
SNCBQ16143 SLC39A2-201ENST00000298681 1379 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.74■□□□□ 0.91
SNCBQ16143 ITPKB-203ENST00000429204 6162 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.74■□□□□ 0.91
SNCBQ16143 ZFYVE19-201ENST00000299173 1555 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.74■□□□□ 0.91
SNCBQ16143 RABL6-204ENST00000371671 1580 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.74■□□□□ 0.91
SNCBQ16143 SLC6A11-202ENST00000454147 2794 ntTSL 1 (best) BASIC20.74■□□□□ 0.91
SNCBQ16143 RCCD1-206ENST00000556618 1556 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC20.74■□□□□ 0.91
SNCBQ16143 PAPOLA-225ENST00000557471 1421 ntTSL 1 (best) BASIC20.74■□□□□ 0.91
SNCBQ16143 SYNGR3-202ENST00000562045 1743 ntTSL 2 BASIC20.74■□□□□ 0.91
SNCBQ16143 C16orf52-207ENST00000569656 1257 ntTSL 5 BASIC20.74■□□□□ 0.91
SNCBQ16143 R3HDM4-208ENST00000626716 138 ntTSL 5 BASIC20.74■□□□□ 0.91
SNCBQ16143 GRAMD2B-219ENST00000544396 2822 ntTSL 2 BASIC20.74■□□□□ 0.91
SNCBQ16143 UBTF-203ENST00000393606 2683 ntTSL 1 (best) BASIC20.74■□□□□ 0.91
SNCBQ16143 GRB10-201ENST00000335866 5032 ntTSL 1 (best) BASIC20.74■□□□□ 0.91
SNCBQ16143 COL13A1-201ENST00000354547 3027 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.74■□□□□ 0.91
SNCBQ16143 GNG10-201ENST00000374293 1491 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.74■□□□□ 0.91
SNCBQ16143 NRL-206ENST00000561028 2103 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.74■□□□□ 0.91
SNCBQ16143 PPM1B-201ENST00000282412 2606 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC20.74■□□□□ 0.91
SNCBQ16143 STK19-201ENST00000375331 1663 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.73■□□□□ 0.91
SNCBQ16143 CCDC50-202ENST00000392456 2454 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC20.73■□□□□ 0.91
SNCBQ16143 MED25-211ENST00000617849 1548 ntTSL 1 (best) BASIC20.73■□□□□ 0.91
SNCBQ16143 MIR222HG-201ENST00000602461 1379 ntTSL 5 BASIC20.73■□□□□ 0.91
SNCBQ16143 FIP1L1-201ENST00000306932 1878 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.73■□□□□ 0.91
SNCBQ16143 ARMC6-202ENST00000392335 2383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.73■□□□□ 0.91
SNCBQ16143 TSHZ3-201ENST00000240587 5176 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.73■□□□□ 0.91
SNCBQ16143 RNF180-201ENST00000296615 1727 ntTSL 1 (best) BASIC20.73■□□□□ 0.91
SNCBQ16143 HNRNPA3-204ENST00000435711 1731 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.73■□□□□ 0.91
SNCBQ16143 FHL2-203ENST00000358129 1578 ntTSL 5 BASIC20.73■□□□□ 0.91
SNCBQ16143 MLX-201ENST00000246912 2586 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.73■□□□□ 0.91
SNCBQ16143 NKX2-1-203ENST00000518149 2583 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.73■□□□□ 0.91
SNCBQ16143 CAPN1-226ENST00000533820 3083 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.73■□□□□ 0.91
SNCBQ16143 GPR6-202ENST00000414000 1945 ntTSL 2 BASIC20.73■□□□□ 0.91
SNCBQ16143 SERINC5-203ENST00000509193 1441 ntTSL 1 (best) BASIC20.73■□□□□ 0.91
SNCBQ16143 AL022341.2-201ENST00000573609 1417 ntTSL 3 BASIC20.73■□□□□ 0.91
SNCBQ16143 ENTPD6-202ENST00000360031 2766 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.73■□□□□ 0.91
SNCBQ16143 SPAG16-204ENST00000413312 2258 ntTSL 5 BASIC20.73■□□□□ 0.91
SNCBQ16143 MTSS1L-201ENST00000338779 4992 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.73■□□□□ 0.91
SNCBQ16143 PIGX-201ENST00000296333 953 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.73■□□□□ 0.91
SNCBQ16143 RPS2-201ENST00000343262 985 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.73■□□□□ 0.91
SNCBQ16143 AGO3-204ENST00000397828 1035 ntTSL 2 BASIC20.73■□□□□ 0.91
SNCBQ16143 TTC39C-209ENST00000584250 1048 ntTSL 1 (best) BASIC20.73■□□□□ 0.91
SNCBQ16143 TRPV6-209ENST00000638686 2298 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.73■□□□□ 0.91
SNCBQ16143 SH2D5-202ENST00000444387 1934 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.72■□□□□ 0.91
SNCBQ16143 MAP3K14-AS1-203ENST00000585780 2475 ntTSL 2 BASIC20.72■□□□□ 0.91
SNCBQ16143 HMOX2-218ENST00000619913 1908 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.72■□□□□ 0.91
SNCBQ16143 MIDN-206ENST00000591446 3243 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.72■□□□□ 0.91
SNCBQ16143 RNF212-202ENST00000382968 2335 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.72■□□□□ 0.91
SNCBQ16143 PFKFB3-204ENST00000379785 2181 ntTSL 5 BASIC20.72■□□□□ 0.91
SNCBQ16143 PKIG-205ENST00000372891 1443 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.72■□□□□ 0.91
SNCBQ16143 KRT8-217ENST00000619952 2437 ntTSL 2 BASIC20.72■□□□□ 0.91
SNCBQ16143 ALKAL1-201ENST00000358543 1217 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.72■□□□□ 0.91
SNCBQ16143 KPTN-201ENST00000338134 1691 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.72■□□□□ 0.91
SNCBQ16143 SEPT2-203ENST00000391971 3315 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.72■□□□□ 0.91
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SNCBQ16143 MAFF-202ENST00000407965 2325 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.72■□□□□ 0.91
SNCBQ16143 RASSF1-203ENST00000359365 1923 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.72■□□□□ 0.91
SNCBQ16143 CCNL1-203ENST00000461804 1998 ntTSL 2 BASIC20.72■□□□□ 0.91
SNCBQ16143 RIPPLY3-201ENST00000329553 2235 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.72■□□□□ 0.91
SNCBQ16143 E4F1-206ENST00000565090 2028 ntTSL 1 (best) BASIC20.71■□□□□ 0.91
SNCBQ16143 UHRF1-203ENST00000615884 2651 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.71■□□□□ 0.91
SNCBQ16143 CDK13-202ENST00000340829 5066 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.71■□□□□ 0.91
SNCBQ16143 ZNF800-208ENST00000619291 2099 ntTSL 5 BASIC20.71■□□□□ 0.91
SNCBQ16143 BACE2-202ENST00000330333 2993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.71■□□□□ 0.91
SNCBQ16143 HSF2BP-201ENST00000291560 1899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.71■□□□□ 0.91
SNCBQ16143 STARD10-213ENST00000538536 1678 ntTSL 1 (best) BASIC20.71■□□□□ 0.91
SNCBQ16143 ZNF771-201ENST00000319296 2371 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.71■□□□□ 0.91
SNCBQ16143 PRKAA1-202ENST00000354209 1918 ntTSL 1 (best) BASIC20.71■□□□□ 0.91
SNCBQ16143 BCL7B-202ENST00000411832 1458 ntTSL 2 BASIC20.71■□□□□ 0.91
SNCBQ16143 IQCJ-SCHIP1-207ENST00000638749 2633 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.71■□□□□ 0.91
SNCBQ16143 PKIG-207ENST00000372894 1191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.71■□□□□ 0.91
SNCBQ16143 AC016910.1-201ENST00000422799 1046 ntTSL 1 (best) BASIC20.71■□□□□ 0.91
SNCBQ16143 TMEM114-202ENST00000568335 899 ntTSL 3 BASIC20.71■□□□□ 0.91
SNCBQ16143 KCNS2-201ENST00000287042 5219 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.71■□□□□ 0.91
SNCBQ16143 AC245041.2-204ENST00000610809 1962 ntTSL 1 (best) BASIC20.71■□□□□ 0.91
SNCBQ16143 TMPRSS5-201ENST00000299882 2232 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.71■□□□□ 0.91
SNCBQ16143 SPHK1-203ENST00000545180 2238 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC20.71■□□□□ 0.91
SNCBQ16143 ACAA1-202ENST00000333167 1785 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.71■□□□□ 0.91
SNCBQ16143 RBBP7-202ENST00000380084 2036 ntTSL 2 BASIC20.71■□□□□ 0.91
SNCBQ16143 OTOP1-201ENST00000296358 1864 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.71■□□□□ 0.91
SNCBQ16143 DNLZ-202ENST00000371739 2934 ntTSL 5 BASIC20.71■□□□□ 0.91
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