Protein–RNA interactions for Protein: Q15651

HMGN3, High mobility group nucleosome-binding domain-containing protein 3, humanhuman

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
HMGN3Q15651 AC087239.1-201ENST00000622671 572 ntBASIC17.9■□□□□ 0.46
HMGN3Q15651 PHKA1-204ENST00000373545 6173 ntTSL 5 BASIC17.9■□□□□ 0.46
HMGN3Q15651 AC026310.3-201ENST00000625186 2373 ntBASIC17.9■□□□□ 0.46
HMGN3Q15651 LINC02175-201ENST00000571219 1875 ntTSL 1 (best) BASIC17.9■□□□□ 0.46
HMGN3Q15651 IKBKG-212ENST00000617207 1949 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC17.9■□□□□ 0.46
HMGN3Q15651 ARID1A-201ENST00000324856 8577 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.9■□□□□ 0.46
HMGN3Q15651 PILRB-207ENST00000448382 2314 ntTSL 2 BASIC17.89■□□□□ 0.46
HMGN3Q15651 LOXL1-AS1-210ENST00000567257 2358 ntTSL 2 BASIC17.89■□□□□ 0.45
HMGN3Q15651 FBXO27-202ENST00000509137 2130 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.89■□□□□ 0.45
HMGN3Q15651 FAM20B-201ENST00000263733 5984 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.89■□□□□ 0.45
HMGN3Q15651 ZNF688-201ENST00000223459 2506 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.89■□□□□ 0.45
HMGN3Q15651 AC007009.1-201ENST00000458624 429 ntTSL 2 BASIC17.89■□□□□ 0.45
HMGN3Q15651 AC091982.4-201ENST00000623943 726 ntTSL 2 BASIC17.89■□□□□ 0.45
HMGN3Q15651 SHISA9-205ENST00000639941 1135 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.89■□□□□ 0.45
HMGN3Q15651 AC084757.3-201ENST00000558061 1943 ntTSL 3 BASIC17.89■□□□□ 0.45
HMGN3Q15651 STRADB-201ENST00000194530 2293 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.89■□□□□ 0.45
HMGN3Q15651 ZNF282-204ENST00000610704 3722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.89■□□□□ 0.45
HMGN3Q15651 GALNT10-202ENST00000377661 3778 ntTSL 5 BASIC17.89■□□□□ 0.45
HMGN3Q15651 PAQR6-212ENST00000540423 1729 ntTSL 3 BASIC17.89■□□□□ 0.45
HMGN3Q15651 SUMF1-202ENST00000383843 1447 ntTSL 2 BASIC17.89■□□□□ 0.45
HMGN3Q15651 SPIRE2-202ENST00000393062 2172 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.89■□□□□ 0.45
HMGN3Q15651 ZXDB-201ENST00000374888 5894 ntAPPRIS P1 BASIC17.88■□□□□ 0.45
HMGN3Q15651 PDXK-205ENST00000398081 2251 ntTSL 2 BASIC17.88■□□□□ 0.45
HMGN3Q15651 KRT18P55-201ENST00000577198 1950 ntTSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
HMGN3Q15651 CPNE7-202ENST00000319518 2409 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
HMGN3Q15651 MAG-201ENST00000361922 2426 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
HMGN3Q15651 WISP2-203ENST00000372868 1600 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.88■□□□□ 0.45
HMGN3Q15651 MDFI-203ENST00000373051 1622 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.88■□□□□ 0.45
HMGN3Q15651 DNAJC4-202ENST00000321685 1288 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
HMGN3Q15651 UBE2C-202ENST00000335046 737 ntTSL 2 BASIC17.88■□□□□ 0.45
HMGN3Q15651 TNFRSF25-201ENST00000348333 1119 ntTSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
HMGN3Q15651 TNFRSF25-202ENST00000351748 705 ntTSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
HMGN3Q15651 PTCHD3P2-201ENST00000424937 1205 ntBASIC17.88■□□□□ 0.45
HMGN3Q15651 RPP21-222ENST00000433076 577 ntTSL 2 BASIC17.88■□□□□ 0.45
HMGN3Q15651 AC010141.3-201ENST00000456659 717 ntBASIC17.88■□□□□ 0.45
HMGN3Q15651 SUMF1-205ENST00000458465 1102 ntTSL 2 BASIC17.88■□□□□ 0.45
HMGN3Q15651 SSR2-210ENST00000480567 895 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.88■□□□□ 0.45
HMGN3Q15651 CDKN2A-208ENST00000498124 880 ntTSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
HMGN3Q15651 SNAI3-AS1-201ENST00000563261 998 ntTSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
HMGN3Q15651 AL138724.1-201ENST00000606771 1088 ntBASIC17.88■□□□□ 0.45
HMGN3Q15651 HOXA11-AS1_1.1-201ENST00000613939 98 ntBASIC17.88■□□□□ 0.45
HMGN3Q15651 DNAJC4-212ENST00000628077 938 ntTSL 5 BASIC17.88■□□□□ 0.45
HMGN3Q15651 SUDS3-204ENST00000543473 4897 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
HMGN3Q15651 CTU2-202ENST00000453996 1751 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
HMGN3Q15651 CDKN1C-204ENST00000440480 1811 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
HMGN3Q15651 SOX17-201ENST00000297316 2342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
HMGN3Q15651 CHRAC1-203ENST00000519533 1678 ntTSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
HMGN3Q15651 SGMS1-210ENST00000619438 1680 ntTSL 5 BASIC17.87■□□□□ 0.45
HMGN3Q15651 TUB-203ENST00000534099 1759 ntTSL 2 BASIC17.87■□□□□ 0.45
HMGN3Q15651 SOX8-201ENST00000293894 3049 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
HMGN3Q15651 CPEB1-218ENST00000620182 2422 ntTSL 2 BASIC17.87■□□□□ 0.45
HMGN3Q15651 EMC9-201ENST00000216799 835 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
HMGN3Q15651 C4orf36-201ENST00000295898 881 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
HMGN3Q15651 PCMTD2-202ENST00000299468 1049 ntTSL 5 BASIC17.87■□□□□ 0.45
HMGN3Q15651 TMEM134-202ENST00000393877 823 ntTSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
HMGN3Q15651 AC055876.1-201ENST00000430589 895 ntTSL 2 BASIC17.87■□□□□ 0.45
HMGN3Q15651 AC010525.1-201ENST00000585559 441 ntBASIC17.87■□□□□ 0.45
HMGN3Q15651 LINC01881-206ENST00000614114 957 ntTSL 2 BASIC17.87■□□□□ 0.45
HMGN3Q15651 ATG4D-201ENST00000309469 1949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
HMGN3Q15651 CACNA1B-203ENST00000371355 9647 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.87■□□□□ 0.45
HMGN3Q15651 UBE2N-201ENST00000318066 5186 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
HMGN3Q15651 POTEC-204ENST00000620346 1988 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
HMGN3Q15651 AP000662.2-202ENST00000530595 2790 ntTSL 2 BASIC17.86■□□□□ 0.45
HMGN3Q15651 PNMA2-204ENST00000522362 4965 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
HMGN3Q15651 FBXO25-202ENST00000350302 2229 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
HMGN3Q15651 ZYG11B-202ENST00000545132 2294 ntTSL 2 BASIC17.86■□□□□ 0.45
HMGN3Q15651 ATOH8-201ENST00000306279 2438 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
HMGN3Q15651 PAQR9-201ENST00000340634 2452 ntAPPRIS P1 BASIC17.86■□□□□ 0.45
HMGN3Q15651 RAB32-201ENST00000367495 1217 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
HMGN3Q15651 HES6-206ENST00000409574 738 ntTSL 2 BASIC17.86■□□□□ 0.45
HMGN3Q15651 MOSPD3-204ENST00000424091 1115 ntTSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
HMGN3Q15651 VAMP2-204ENST00000488857 874 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC17.86■□□□□ 0.45
HMGN3Q15651 DUX4L19-201ENST00000557448 1267 ntBASIC17.86■□□□□ 0.45
HMGN3Q15651 DBX2-201ENST00000332700 2806 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.86■□□□□ 0.45
HMGN3Q15651 ZMAT3-203ENST00000432729 2944 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC17.86■□□□□ 0.45
HMGN3Q15651 NSMF-201ENST00000265663 2981 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
HMGN3Q15651 NSMF-206ENST00000371475 2987 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
HMGN3Q15651 USP48-201ENST00000308271 4595 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
HMGN3Q15651 ADGRA2-201ENST00000315215 6270 ntTSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
HMGN3Q15651 PGF-201ENST00000238607 1693 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC17.86■□□□□ 0.45
HMGN3Q15651 NR2F2-201ENST00000394166 5275 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
HMGN3Q15651 DTNBP1-201ENST00000338950 1880 ntTSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
HMGN3Q15651 SERBP1P1-201ENST00000396021 1160 ntBASIC17.85■□□□□ 0.45
HMGN3Q15651 HDHD5-203ENST00000399852 1118 ntTSL 3 BASIC17.85■□□□□ 0.45
HMGN3Q15651 MFSD7-209ENST00000515118 1556 ntTSL 5 BASIC17.85■□□□□ 0.45
HMGN3Q15651 ST3GAL4-209ENST00000526727 1967 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
HMGN3Q15651 PPP2R5E-204ENST00000555899 2164 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
HMGN3Q15651 KCTD13-207ENST00000568000 2528 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
HMGN3Q15651 MIR4466-201ENST00000606121 54 ntBASIC17.85■□□□□ 0.45
HMGN3Q15651 ME2-206ENST00000638410 2289 ntTSL 5 BASIC17.85■□□□□ 0.45
HMGN3Q15651 ME2-210ENST00000639255 2262 ntTSL 5 BASIC17.85■□□□□ 0.45
HMGN3Q15651 TMEM250-205ENST00000561457 2804 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.85■□□□□ 0.45
HMGN3Q15651 TTYH1-201ENST00000301194 2088 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
HMGN3Q15651 CCDC189-206ENST00000543610 1967 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
HMGN3Q15651 LAMP5-AS1-201ENST00000443469 1928 ntTSL 2 BASIC17.84■□□□□ 0.45
HMGN3Q15651 EPHX3-204ENST00000602233 1805 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.84■□□□□ 0.45
HMGN3Q15651 PFKFB3-216ENST00000625260 1752 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC17.84■□□□□ 0.45
HMGN3Q15651 WTAP-201ENST00000337387 1622 ntTSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
HMGN3Q15651 PIAS2-203ENST00000545673 1590 ntTSL 2 BASIC17.84■□□□□ 0.45
HMGN3Q15651 ADAP2-204ENST00000580525 1598 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
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