Protein–RNA interactions for Protein: Q13761

RUNX3, Runt-related transcription factor 3, humanhuman

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Length 415 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RUNX3Q13761 MREG-201ENST00000263268 1314 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.78■■□□□ 1.08
RUNX3Q13761 HSD17B10-202ENST00000375298 823 ntTSL 3 BASIC21.77■■□□□ 1.08
RUNX3Q13761 RAMP1-202ENST00000403885 650 ntTSL 3 BASIC21.77■■□□□ 1.08
RUNX3Q13761 AL512625.2-201ENST00000417533 625 ntBASIC21.77■■□□□ 1.08
RUNX3Q13761 FAM201B-201ENST00000458407 597 ntBASIC21.77■■□□□ 1.08
RUNX3Q13761 ATPIF1-203ENST00000468425 539 ntTSL 2 BASIC21.77■■□□□ 1.08
RUNX3Q13761 TRIM35-203ENST00000521253 1215 ntTSL 1 (best) BASIC21.77■■□□□ 1.08
RUNX3Q13761 C17orf107-202ENST00000521575 1275 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.77■■□□□ 1.08
RUNX3Q13761 AC068987.5-201ENST00000642069 987 ntAPPRIS P1 BASIC21.77■■□□□ 1.08
RUNX3Q13761 MTAP-204ENST00000460874 1434 ntTSL 2 BASIC21.77■■□□□ 1.08
RUNX3Q13761 AC139530.1-201ENST00000575312 1977 ntBASIC21.77■■□□□ 1.08
RUNX3Q13761 HLA-DPB1-211ENST00000418931 1560 ntAPPRIS P2 BASIC21.77■■□□□ 1.08
RUNX3Q13761 TANGO2-202ENST00000398042 2011 ntTSL 2 BASIC21.77■■□□□ 1.07
RUNX3Q13761 PRR35-201ENST00000409413 2216 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.76■■□□□ 1.07
RUNX3Q13761 TOP1MT-201ENST00000329245 1958 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.76■■□□□ 1.07
RUNX3Q13761 FJX1-201ENST00000317811 2450 ntAPPRIS P1 BASIC21.76■■□□□ 1.07
RUNX3Q13761 HAUS4-203ENST00000347758 1428 ntTSL 2 BASIC21.76■■□□□ 1.07
RUNX3Q13761 CUEDC2-201ENST00000369937 1191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.76■■□□□ 1.07
RUNX3Q13761 C2orf82-203ENST00000409533 561 ntAPPRIS P2 TSL 4 BASIC21.76■■□□□ 1.07
RUNX3Q13761 ZNF295-AS1-201ENST00000412906 952 ntTSL 1 (best) BASIC21.76■■□□□ 1.07
RUNX3Q13761 ZCCHC9-204ENST00000438268 1248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.76■■□□□ 1.07
RUNX3Q13761 AC105001.1-201ENST00000506149 821 ntTSL 1 (best) BASIC21.76■■□□□ 1.07
RUNX3Q13761 RAB11FIP1-203ENST00000522727 1866 ntTSL 1 (best) BASIC21.76■■□□□ 1.07
RUNX3Q13761 ZBTB45-205ENST00000600990 2159 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.76■■□□□ 1.07
RUNX3Q13761 KPTN-201ENST00000338134 1691 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.75■■□□□ 1.07
RUNX3Q13761 TNIP2-203ENST00000503235 1653 ntTSL 3 BASIC21.75■■□□□ 1.07
RUNX3Q13761 CDCA4-202ENST00000392590 1536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.75■■□□□ 1.07
RUNX3Q13761 CACNG2-201ENST00000300105 2384 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.75■■□□□ 1.07
RUNX3Q13761 CLN3-240ENST00000631023 1586 ntTSL 5 BASIC21.75■■□□□ 1.07
RUNX3Q13761 CDK5-204ENST00000485972 1758 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.75■■□□□ 1.07
RUNX3Q13761 NUDT8-202ENST00000376693 728 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.75■■□□□ 1.07
RUNX3Q13761 EMC6-202ENST00000397133 762 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.75■■□□□ 1.07
RUNX3Q13761 PPP1R14BP2-201ENST00000426284 444 ntBASIC21.75■■□□□ 1.07
RUNX3Q13761 AC093787.1-201ENST00000450396 207 ntBASIC21.75■■□□□ 1.07
RUNX3Q13761 ALKBH6-212ENST00000485128 959 ntTSL 5 BASIC21.75■■□□□ 1.07
RUNX3Q13761 LINC02199-202ENST00000510067 1008 ntTSL 2 BASIC21.75■■□□□ 1.07
RUNX3Q13761 AC016405.3-201ENST00000607710 860 ntBASIC21.75■■□□□ 1.07
RUNX3Q13761 GPX1-204ENST00000620890 897 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.75■■□□□ 1.07
RUNX3Q13761 ABHD1-207ENST00000621324 1078 ntTSL 5 BASIC21.75■■□□□ 1.07
RUNX3Q13761 H2AFX-202ENST00000530167 1614 ntAPPRIS P1 BASIC21.75■■□□□ 1.07
RUNX3Q13761 TMEM51-203ENST00000400796 1842 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.75■■□□□ 1.07
RUNX3Q13761 CERS4-208ENST00000559336 1515 ntTSL 1 (best) BASIC21.75■■□□□ 1.07
RUNX3Q13761 SERTAD3-201ENST00000322354 1734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.75■■□□□ 1.07
RUNX3Q13761 PCYT2-201ENST00000331285 2147 ntTSL 2 BASIC21.74■■□□□ 1.07
RUNX3Q13761 GRK4-206ENST00000504933 1971 ntTSL 1 (best) BASIC21.74■■□□□ 1.07
RUNX3Q13761 DAZAP1-201ENST00000233078 2160 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.74■■□□□ 1.07
RUNX3Q13761 LOXL1-201ENST00000261921 2351 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.74■■□□□ 1.07
RUNX3Q13761 ZBTB42-202ENST00000555360 1411 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.74■■□□□ 1.07
RUNX3Q13761 HAUS4-205ENST00000541587 1637 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.74■■□□□ 1.07
RUNX3Q13761 GUK1-201ENST00000312726 1084 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.74■■□□□ 1.07
RUNX3Q13761 FMR1-202ENST00000334557 1295 ntTSL 1 (best) BASIC21.74■■□□□ 1.07
RUNX3Q13761 UMAD1-202ENST00000463725 559 ntTSL 4 BASIC21.74■■□□□ 1.07
RUNX3Q13761 ATMIN-201ENST00000299575 4884 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.74■■□□□ 1.07
RUNX3Q13761 CCDC151-203ENST00000591179 1943 ntTSL 1 (best) BASIC21.74■■□□□ 1.07
RUNX3Q13761 CBWD6-213ENST00000613716 1820 ntTSL 1 (best) BASIC21.73■■□□□ 1.07
RUNX3Q13761 KREMEN2-203ENST00000571007 1877 ntTSL 2 BASIC21.73■■□□□ 1.07
RUNX3Q13761 SMARCB1-202ENST00000344921 1728 ntTSL 2 BASIC21.73■■□□□ 1.07
RUNX3Q13761 PPP1CA-202ENST00000358239 1054 ntTSL 2 BASIC21.73■■□□□ 1.07
RUNX3Q13761 SMNDC1-201ENST00000369592 1110 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.73■■□□□ 1.07
RUNX3Q13761 WIPF1-207ENST00000410117 777 ntTSL 3 BASIC21.73■■□□□ 1.07
RUNX3Q13761 AP000785.1-201ENST00000527314 613 ntTSL 4 BASIC21.73■■□□□ 1.07
RUNX3Q13761 AC106738.2-202ENST00000558156 533 ntTSL 4 BASIC21.73■■□□□ 1.07
RUNX3Q13761 UBXN2B-206ENST00000638450 591 ntTSL 5 BASIC21.73■■□□□ 1.07
RUNX3Q13761 AC066615.1-201ENST00000640911 628 ntBASIC21.73■■□□□ 1.07
RUNX3Q13761 DCAF15-201ENST00000254337 2278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.73■■□□□ 1.07
RUNX3Q13761 OLIG1-201ENST00000382348 2277 ntAPPRIS P1 BASIC21.73■■□□□ 1.07
RUNX3Q13761 MIF4GD-202ENST00000325102 1306 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.73■■□□□ 1.07
RUNX3Q13761 KLF1-201ENST00000264834 1592 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.73■■□□□ 1.07
RUNX3Q13761 TRAP1-202ENST00000538171 2052 ntTSL 2 BASIC21.73■■□□□ 1.07
RUNX3Q13761 PCDH1-204ENST00000503492 2373 ntTSL 5 BASIC21.73■■□□□ 1.07
RUNX3Q13761 PPP2R2D-201ENST00000455566 5738 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.73■■□□□ 1.07
RUNX3Q13761 ARMC10-204ENST00000425331 2443 ntTSL 2 BASIC21.72■■□□□ 1.07
RUNX3Q13761 KRT16P2-201ENST00000414673 1423 ntBASIC21.72■■□□□ 1.07
RUNX3Q13761 WDR86-207ENST00000621812 1542 ntTSL 5 BASIC21.72■■□□□ 1.07
RUNX3Q13761 RARRES2-201ENST00000223271 740 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.72■■□□□ 1.07
RUNX3Q13761 RNPS1-201ENST00000301730 1276 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.72■■□□□ 1.07
RUNX3Q13761 ASIP-201ENST00000374954 586 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.72■■□□□ 1.07
RUNX3Q13761 DDN-AS1-201ENST00000547395 858 ntTSL 2 BASIC21.72■■□□□ 1.07
RUNX3Q13761 JADE2-211ENST00000612830 1251 ntTSL 1 (best) BASIC21.72■■□□□ 1.07
RUNX3Q13761 AL772284.2-201ENST00000620151 1147 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.72■■□□□ 1.07
RUNX3Q13761 TULP1-202ENST00000322263 1941 ntTSL 1 (best) BASIC21.72■■□□□ 1.07
RUNX3Q13761 CLEC14A-201ENST00000342213 2267 ntAPPRIS P1 BASIC21.72■■□□□ 1.07
RUNX3Q13761 TUB-201ENST00000299506 2019 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.72■■□□□ 1.07
RUNX3Q13761 DYRK1B-201ENST00000323039 2535 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.71■■□□□ 1.07
RUNX3Q13761 GCC2-AS1-201ENST00000322353 558 ntTSL 2 BASIC21.71■■□□□ 1.07
RUNX3Q13761 GUK1-209ENST00000366730 937 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC21.71■■□□□ 1.07
RUNX3Q13761 CD58-201ENST00000369487 892 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.71■■□□□ 1.07
RUNX3Q13761 CD58-202ENST00000369489 1098 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.71■■□□□ 1.07
RUNX3Q13761 IPO13-201ENST00000372339 1201 ntTSL 2 BASIC21.71■■□□□ 1.07
RUNX3Q13761 EIF4E3-203ENST00000421769 777 ntTSL 1 (best) BASIC21.71■■□□□ 1.07
RUNX3Q13761 TPT1-AS1-210ENST00000520590 873 ntTSL 5 BASIC21.71■■□□□ 1.07
RUNX3Q13761 AC027451.1-201ENST00000530667 553 ntTSL 4 BASIC21.71■■□□□ 1.07
RUNX3Q13761 PSME3-210ENST00000590720 998 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.71■■□□□ 1.07
RUNX3Q13761 AP2S1-207ENST00000599990 829 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC21.71■■□□□ 1.07
RUNX3Q13761 AC092118.2-201ENST00000613495 667 ntBASIC21.71■■□□□ 1.07
RUNX3Q13761 CSNK1E-203ENST00000396832 2791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.71■■□□□ 1.07
RUNX3Q13761 RNF4-207ENST00000506706 2098 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.71■■□□□ 1.07
RUNX3Q13761 MMP23B-202ENST00000378675 1309 ntTSL 1 (best) BASIC21.71■■□□□ 1.07
RUNX3Q13761 GPIHBP1-201ENST00000622500 2282 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.71■■□□□ 1.07
RUNX3Q13761 NFE2L3P1-201ENST00000588207 1959 ntBASIC21.7■■□□□ 1.07
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