Protein–RNA interactions for Protein: Q13595

TRA2A, Transformer-2 protein homolog alpha, humanhuman

Known RBP eCLIP

Length 282 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TRA2AQ13595 NR2F2-AS1-202ENST00000557863 515 ntTSL 315.61■□□□□ 0.093e-10■■□□□ 14
TRA2AQ13595 NR2F2-AS1-210ENST00000561344 966 ntTSL 1 (best) BASIC11.82□□□□□ -0.523e-10■■□□□ 14
TRA2AQ13595 NR2F2-AS1-201ENST00000502125 1930 ntTSL 2 BASIC9.99□□□□□ -0.813e-10■■□□□ 14
TRA2AQ13595 NR2F2-AS1-203ENST00000558929 574 ntTSL 5 BASIC9.1□□□□□ -0.953e-10■■□□□ 14
TRA2AQ13595 NR2F2-AS1-209ENST00000560800 549 ntTSL 4 BASIC6.38□□□□□ -1.393e-10■■□□□ 14
TRA2AQ13595 NR2F2-AS1-211ENST00000561402 589 ntTSL 3 BASIC3.3□□□□□ -1.883e-10■■□□□ 14
TRA2AQ13595 AKR1B10-202ENST00000475559 869 ntTSL 513.12□□□□□ -0.316e-7■■□□□ 14
TRA2AQ13595 AKR1B10-201ENST00000359579 1590 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.25□□□□□ -0.776e-7■■□□□ 14
TRA2AQ13595 UBR4-211ENST00000467272 891 ntTSL 512.23□□□□□ -0.453e-7■■□□□ 14
TRA2AQ13595 UBR4-202ENST00000375224 3475 ntTSL 2 BASIC7.42□□□□□ -1.223e-7■■□□□ 14
TRA2AQ13595 UBR4-204ENST00000375254 15906 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.7□□□□□ -1.52e-7■■□□□ 14
TRA2AQ13595 SPEN-201ENST00000375759 12232 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.67□□□□□ -1.021e-6■■□□□ 13.9
TRA2AQ13595 BRD4-202ENST00000360016 3240 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.53e-9■■□□□ 13.9
TRA2AQ13595 BRD4-201ENST00000263377 7169 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.13□□□□□ -0.793e-9■■□□□ 13.9
TRA2AQ13595 BRD4-203ENST00000371835 4624 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.02□□□□□ -0.83e-9■■□□□ 13.9
TRA2AQ13595 TRIM25-203ENST00000570473 498 ntTSL 38.69□□□□□ -1.022e-7■■□□□ 13.9
TRA2AQ13595 ARL6IP4-211ENST00000454885 1318 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.04■■□□□ 1.61e-8■■□□□ 13.9
TRA2AQ13595 ARL6IP4-217ENST00000540382 1677 ntTSL 524.35■■□□□ 1.491e-8■■□□□ 13.9
TRA2AQ13595 ARL6IP4-208ENST00000439686 796 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC24.02■■□□□ 1.441e-8■■□□□ 13.9
TRA2AQ13595 ARL6IP4-219ENST00000542099 1119 ntTSL 323.3■■□□□ 1.321e-8■■□□□ 13.9
TRA2AQ13595 ARL6IP4-218ENST00000540708 1782 ntTSL 223.04■■□□□ 1.281e-8■■□□□ 13.9
TRA2AQ13595 ARL6IP4-209ENST00000442210 716 ntTSL 321.99■■□□□ 1.111e-8■■□□□ 13.9
TRA2AQ13595 ARL6IP4-210ENST00000453766 1491 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.111e-8■■□□□ 13.9
TRA2AQ13595 ARL6IP4-216ENST00000539770 1295 ntTSL 1 (best)21.86■■□□□ 1.091e-8■■□□□ 13.9
TRA2AQ13595 ARL6IP4-201ENST00000315580 1644 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.54■■□□□ 1.041e-8■■□□□ 13.9
TRA2AQ13595 ARL6IP4-214ENST00000536502 1273 ntTSL 220.77■□□□□ 0.921e-8■■□□□ 13.9
TRA2AQ13595 ARL6IP4-205ENST00000412505 818 ntTSL 5 BASIC20.48■□□□□ 0.871e-8■■□□□ 13.9
TRA2AQ13595 ARL6IP4-204ENST00000392435 1339 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.41■□□□□ 0.861e-8■■□□□ 13.9
TRA2AQ13595 ARL6IP4-220ENST00000543566 1591 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.61■□□□□ 0.731e-8■■□□□ 13.9
TRA2AQ13595 ARL6IP4-215ENST00000539576 1684 ntTSL 517.96■□□□□ 0.471e-8■■□□□ 13.9
TRA2AQ13595 ARL6IP4-203ENST00000392433 1370 ntTSL 217.79■□□□□ 0.441e-8■■□□□ 13.9
TRA2AQ13595 AC026362.1-201ENST00000540866 5618 ntTSL 2 BASIC17.5■□□□□ 0.391e-8■■□□□ 13.9
TRA2AQ13595 ARL6IP4-212ENST00000456762 796 ntAPPRIS ALT2 TSL 216.91■□□□□ 0.31e-8■■□□□ 13.9
TRA2AQ13595 ARL6IP4-207ENST00000426960 910 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC15.41■□□□□ 0.061e-8■■□□□ 13.9
TRA2AQ13595 ARL6IP4-206ENST00000413381 799 ntAPPRIS ALT2 TSL 512.92□□□□□ -0.341e-8■■□□□ 13.9
TRA2AQ13595 ARL6IP4-202ENST00000357866 546 ntTSL 1 (best) BASIC10.85□□□□□ -0.671e-8■■□□□ 13.9
TRA2AQ13595 CHD2-217ENST00000629136 480 ntTSL 510.61□□□□□ -0.712e-9■■□□□ 13.9
TRA2AQ13595 CHD2-206ENST00000625990 888 ntTSL 58.68□□□□□ -1.022e-9■■□□□ 13.9
TRA2AQ13595 PDE4D-208ENST00000502484 2478 ntTSL 1 (best) BASIC7.45□□□□□ -1.227e-8■■□□□ 13.9
TRA2AQ13595 SETP21-201ENST00000514799 892 ntBASIC6.19□□□□□ -1.427e-8■■□□□ 13.9
TRA2AQ13595 PDE4D-225ENST00000515835 590 ntTSL 4 BASIC5.87□□□□□ -1.477e-8■■□□□ 13.9
TRA2AQ13595 PDE4D-219ENST00000511382 581 ntTSL 44.97□□□□□ -1.617e-8■■□□□ 13.9
TRA2AQ13595 PDE4D-215ENST00000506510 558 ntTSL 44.62□□□□□ -1.677e-8■■□□□ 13.9
TRA2AQ13595 PDE4D-217ENST00000509355 847 ntTSL 1 (best)4.19□□□□□ -1.747e-8■■□□□ 13.9
TRA2AQ13595 PDE4D-213ENST00000505507 577 ntTSL 43.49□□□□□ -1.857e-8■■□□□ 13.9
TRA2AQ13595 CHD4-208ENST00000540960 892 ntTSL 57.82□□□□□ -1.163e-6■■□□□ 13.9
TRA2AQ13595 CHD4-205ENST00000536301 107 ntTSL 35.23□□□□□ -1.573e-6■■□□□ 13.9
TRA2AQ13595 SRRM2-229ENST00000576894 2210 ntTSL 1 (best)18.17■□□□□ 0.51e-9■■□□□ 13.8
TRA2AQ13595 MDC1-206ENST00000489540 1402 ntTSL 216.99■□□□□ 0.314e-6■■□□□ 13.8
TRA2AQ13595 MDC1-201ENST00000376406 7576 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.2□□□□□ -0.784e-6■■□□□ 13.8
TRA2AQ13595 LINC00854-214ENST00000615433 874 ntAPPRIS ALT2 TSL 59.24□□□□□ -0.932e-13■■□□□ 13.8
TRA2AQ13595 LINC00854-204ENST00000594691 649 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC8.63□□□□□ -1.032e-13■■□□□ 13.8
TRA2AQ13595 U2.6-201ENST00000619225 191 ntBASIC1.96□□□□□ -2.12e-13■■□□□ 13.8
TRA2AQ13595 MTDH-203ENST00000519934 2184 ntTSL 5 BASIC16.62■□□□□ 0.252e-6■■□□□ 13.8
TRA2AQ13595 MTDH-201ENST00000336273 6177 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.072e-6■■□□□ 13.8
TRA2AQ13595 SF3B2-209ENST00000530322 1163 ntTSL 516.5■□□□□ 0.234e-9■■□□□ 13.8
TRA2AQ13595 SF3B2-214ENST00000533595 1081 ntTSL 514.15□□□□□ -0.144e-9■■□□□ 13.8
TRA2AQ13595 RHOBTB3-201ENST00000379982 5537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.48■□□□□ 0.391e-7■■□□□ 13.8
TRA2AQ13595 RHOBTB3-205ENST00000504949 1511 ntTSL 211.38□□□□□ -0.591e-7■■□□□ 13.8
TRA2AQ13595 WASF2-202ENST00000618852 5676 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.88□□□□□ -0.671e-7■■□□□ 13.8
TRA2AQ13595 WASF2-201ENST00000536657 1083 ntTSL 2 BASIC7.79□□□□□ -1.161e-7■■□□□ 13.8
TRA2AQ13595 RHOBTB3-202ENST00000502541 693 ntTSL 55.86□□□□□ -1.471e-7■■□□□ 13.8
TRA2AQ13595 BRD2-208ENST00000464592 1590 ntTSL 510.45□□□□□ -0.746e-13■■□□□ 13.7
TRA2AQ13595 LUC7L3-206ENST00000504563 840 ntTSL 514.04□□□□□ -0.166e-9■■□□□ 13.7
TRA2AQ13595 KIF23-205ENST00000558346 1656 ntTSL 1 (best)15.67■□□□□ 0.13e-6■■□□□ 13.7
TRA2AQ13595 KIF23-213ENST00000561089 2743 ntTSL 1 (best)10.35□□□□□ -0.753e-6■■□□□ 13.7
TRA2AQ13595 KIF23-207ENST00000559279 3411 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC8.87□□□□□ -0.993e-6■■□□□ 13.7
TRA2AQ13595 KIF23-202ENST00000352331 3351 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC8.32□□□□□ -1.083e-6■■□□□ 13.7
TRA2AQ13595 KIF23-203ENST00000395392 3357 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC8.21□□□□□ -1.13e-6■■□□□ 13.7
TRA2AQ13595 KIF23-201ENST00000260363 3713 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC7.9□□□□□ -1.143e-6■■□□□ 13.7
TRA2AQ13595 KIF23-208ENST00000559283 1081 ntTSL 56.06□□□□□ -1.443e-6■■□□□ 13.7
TRA2AQ13595 KIF23-206ENST00000558585 2296 ntTSL 2 BASIC4.41□□□□□ -1.73e-6■■□□□ 13.7
TRA2AQ13595 KIF23-209ENST00000559456 1282 ntTSL 33.89□□□□□ -1.793e-6■■□□□ 13.7
TRA2AQ13595 NKTR-211ENST00000468735 7964 ntTSL 26.87□□□□□ -1.312e-7■■□□□ 13.6
TRA2AQ13595 NKTR-217ENST00000498730 4912 ntTSL 24.1□□□□□ -1.752e-7■■□□□ 13.6
TRA2AQ13595 NKTR-209ENST00000465584 3839 ntTSL 22.13□□□□□ -2.072e-7■■□□□ 13.6
TRA2AQ13595 CHD6-204ENST00000440647 536 ntTSL 35.82□□□□□ -1.483e-7■■□□□ 13.6
TRA2AQ13595 TLK1-204ENST00000413010 603 ntTSL 516.81■□□□□ 0.282e-7■■□□□ 13.6
TRA2AQ13595 TLK1-203ENST00000409443 2783 ntTSL 213.67□□□□□ -0.222e-7■■□□□ 13.6
TRA2AQ13595 TLK1-202ENST00000360843 5726 ntTSL 1 (best) BASIC12.72□□□□□ -0.372e-7■■□□□ 13.6
TRA2AQ13595 TLK1-205ENST00000431350 5663 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.93□□□□□ -0.52e-7■■□□□ 13.6
TRA2AQ13595 TLK1-201ENST00000359766 4321 ntTSL 510.07□□□□□ -0.82e-7■■□□□ 13.6
TRA2AQ13595 TLK1-212ENST00000521943 2605 ntTSL 2 BASIC4.47□□□□□ -1.692e-7■■□□□ 13.6
TRA2AQ13595 TLK1-206ENST00000434911 2156 ntTSL 2 BASIC2.32□□□□□ -2.042e-7■■□□□ 13.6
TRA2AQ13595 MYH9-201ENST00000216181 7501 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.38□□□□□ -0.755e-7■■□□□ 13.6
TRA2AQ13595 DDIT3-201ENST00000346473 906 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.24□□□□□ -0.613e-7■■□□□ 13.6
TRA2AQ13595 DDIT3-202ENST00000547303 872 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC10.8□□□□□ -0.683e-7■■□□□ 13.6
TRA2AQ13595 DDIT3-205ENST00000552740 951 ntTSL 1 (best) BASIC8.53□□□□□ -1.043e-7■■□□□ 13.6
TRA2AQ13595 DDIT3-204ENST00000551116 1067 ntTSL 1 (best) BASIC7.41□□□□□ -1.223e-7■■□□□ 13.6
TRA2AQ13595 DDIT3-206ENST00000623876 1151 nt5.64□□□□□ -1.513e-7■■□□□ 13.6
TRA2AQ13595 SNRNP200-204ENST00000480615 1646 ntTSL 512.98□□□□□ -0.331e-10■■□□□ 13.6
TRA2AQ13595 SNRNP200-201ENST00000323853 7165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.75□□□□□ -0.851e-10■■□□□ 13.6
TRA2AQ13595 NKTR-208ENST00000464315 544 ntTSL 35.1□□□□□ -1.591e-10■■□□□ 13.6
TRA2AQ13595 LAMB1-210ENST00000474380 945 ntTSL 59.01□□□□□ -0.971e-6■■□□□ 13.6
TRA2AQ13595 GPC3-202ENST00000394299 2379 ntTSL 1 (best) BASIC13.52□□□□□ -0.252e-7■■□□□ 13.6
TRA2AQ13595 GPC3-201ENST00000370818 2568 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.49□□□□□ -0.572e-7■■□□□ 13.6
TRA2AQ13595 GPC3-204ENST00000631057 1581 ntTSL 1 (best) BASIC7.1□□□□□ -1.272e-7■■□□□ 13.6
TRA2AQ13595 PLEC-211ENST00000527303 598 ntTSL 321.73■■□□□ 1.077e-7■■□□□ 13.5
TRA2AQ13595 PLEC-202ENST00000345136 14803 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.6□□□□□ -0.717e-7■■□□□ 13.5
TRA2AQ13595 PLEC-208ENST00000436759 14787 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.45□□□□□ -0.747e-7■■□□□ 13.5
Retrieved 100 of 7,337 protein–RNA pairs in 93.4 ms