Protein–RNA interactions for Protein: Q00872

MYBPC1, Myosin-binding protein C, slow-type, humanhuman

Predictions only

Length 1,141 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
MYBPC1Q00872 CLTA-206ENST00000466396 695 ntTSL 2 BASIC20.01■□□□□ 0.79
MYBPC1Q00872 MTDHP2-201ENST00000601468 714 ntBASIC20.01■□□□□ 0.79
MYBPC1Q00872 MMP28-203ENST00000612672 1092 ntTSL 1 (best) BASIC20.01■□□□□ 0.79
MYBPC1Q00872 MIR6722-201ENST00000617286 78 ntBASIC20.01■□□□□ 0.79
MYBPC1Q00872 PRKAA1-202ENST00000354209 1918 ntTSL 1 (best) BASIC20.01■□□□□ 0.79
MYBPC1Q00872 GPR6-202ENST00000414000 1945 ntTSL 2 BASIC20.01■□□□□ 0.79
MYBPC1Q00872 SNUPN-205ENST00000564644 1931 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.01■□□□□ 0.79
MYBPC1Q00872 RBM42-203ENST00000588161 1609 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.01■□□□□ 0.79
MYBPC1Q00872 GNS-208ENST00000543646 2164 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.01■□□□□ 0.79
MYBPC1Q00872 TEAD2-208ENST00000598810 2191 ntTSL 1 (best) BASIC20.01■□□□□ 0.79
MYBPC1Q00872 FDXR-201ENST00000293195 1875 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.01■□□□□ 0.79
MYBPC1Q00872 DACH1-201ENST00000611519 4789 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20■□□□□ 0.79
MYBPC1Q00872 USP25-202ENST00000285681 5216 ntTSL 1 (best) BASIC20■□□□□ 0.79
MYBPC1Q00872 MGEA5-205ENST00000439817 5043 ntTSL 5 BASIC20■□□□□ 0.79
MYBPC1Q00872 ADAMTS2-202ENST00000274609 2044 ntTSL 1 (best) BASIC20■□□□□ 0.79
MYBPC1Q00872 GNA14-201ENST00000341700 2482 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20■□□□□ 0.79
MYBPC1Q00872 PXK-211ENST00000484288 2031 ntTSL 1 (best) BASIC20■□□□□ 0.79
MYBPC1Q00872 SPG7-202ENST00000341316 2288 ntTSL 1 (best) BASIC20■□□□□ 0.79
MYBPC1Q00872 C1QTNF1-207ENST00000580454 1396 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20■□□□□ 0.79
MYBPC1Q00872 ADAMTS13-203ENST00000371910 1074 ntTSL 1 (best) BASIC20■□□□□ 0.79
MYBPC1Q00872 C12orf75-207ENST00000552457 689 ntTSL 5 BASIC20■□□□□ 0.79
MYBPC1Q00872 ODF3L2-201ENST00000315489 1604 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20■□□□□ 0.79
MYBPC1Q00872 DTNBP1-201ENST00000338950 1880 ntTSL 1 (best) BASIC20■□□□□ 0.79
MYBPC1Q00872 SPTBN4-201ENST00000338932 8686 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC20■□□□□ 0.79
MYBPC1Q00872 KLC1-208ENST00000452929 2453 ntTSL 5 BASIC20■□□□□ 0.79
MYBPC1Q00872 ATP6V0E2-203ENST00000456496 2722 ntTSL 1 (best) BASIC20■□□□□ 0.79
MYBPC1Q00872 ATP6V0E2-213ENST00000615196 2727 ntTSL 1 (best) BASIC20■□□□□ 0.79
MYBPC1Q00872 SESN3-202ENST00000416495 1408 ntTSL 1 (best) BASIC20■□□□□ 0.79
MYBPC1Q00872 AC138696.1-201ENST00000522452 2897 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20■□□□□ 0.79
MYBPC1Q00872 AC005703.6-201ENST00000623265 1329 ntBASIC20■□□□□ 0.79
MYBPC1Q00872 PWWP2A-205ENST00000523662 1819 ntTSL 1 (best) BASIC19.99■□□□□ 0.79
MYBPC1Q00872 YBX3-202ENST00000279550 1708 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.99■□□□□ 0.79
MYBPC1Q00872 RNF180-201ENST00000296615 1727 ntTSL 1 (best) BASIC19.99■□□□□ 0.79
MYBPC1Q00872 MAP3K3-201ENST00000361357 4818 ntTSL 1 (best) BASIC19.99■□□□□ 0.79
MYBPC1Q00872 TMUB1-201ENST00000297533 1353 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.99■□□□□ 0.79
MYBPC1Q00872 FAM110D-201ENST00000374268 2858 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.99■□□□□ 0.79
MYBPC1Q00872 NUDT11-201ENST00000375992 2385 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.99■□□□□ 0.79
MYBPC1Q00872 DIO3-201ENST00000510508 2102 ntAPPRIS P1 BASIC19.99■□□□□ 0.79
MYBPC1Q00872 CPXM2-204ENST00000615851 2512 ntTSL 5 BASIC19.99■□□□□ 0.79
MYBPC1Q00872 RPP38-207ENST00000616640 1537 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.99■□□□□ 0.79
MYBPC1Q00872 WDR86-207ENST00000621812 1542 ntTSL 5 BASIC19.99■□□□□ 0.79
MYBPC1Q00872 RAB32-201ENST00000367495 1217 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.99■□□□□ 0.79
MYBPC1Q00872 MDK-202ENST00000395565 951 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC19.99■□□□□ 0.79
MYBPC1Q00872 NOP56-201ENST00000329276 2400 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.99■□□□□ 0.79
MYBPC1Q00872 RNF32-207ENST00000405335 1938 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.99■□□□□ 0.79
MYBPC1Q00872 TMEM214-203ENST00000404032 2830 ntTSL 2 BASIC19.99■□□□□ 0.79
MYBPC1Q00872 NKX2-1-202ENST00000498187 2338 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.99■□□□□ 0.79
MYBPC1Q00872 AL020996.1-203ENST00000536896 2307 ntBASIC19.99■□□□□ 0.79
MYBPC1Q00872 ARRDC2-201ENST00000222250 2503 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.99■□□□□ 0.79
MYBPC1Q00872 SOX2-201ENST00000325404 2513 ntAPPRIS P1 BASIC19.99■□□□□ 0.79
MYBPC1Q00872 CBLN2-201ENST00000269503 2945 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.99■□□□□ 0.79
MYBPC1Q00872 SOX18-201ENST00000340356 1864 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.99■□□□□ 0.79
MYBPC1Q00872 HMGA1-205ENST00000447654 2159 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC19.98■□□□□ 0.79
MYBPC1Q00872 ACAA1-202ENST00000333167 1785 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.98■□□□□ 0.79
MYBPC1Q00872 NRP2-206ENST00000417189 2386 ntTSL 2 BASIC19.98■□□□□ 0.79
MYBPC1Q00872 JMJD4-202ENST00000438896 2502 ntTSL 2 BASIC19.98■□□□□ 0.79
MYBPC1Q00872 MAGI2-AS3-201ENST00000414797 1072 ntTSL 2 BASIC19.98■□□□□ 0.79
MYBPC1Q00872 AC055876.1-201ENST00000430589 895 ntTSL 2 BASIC19.98■□□□□ 0.79
MYBPC1Q00872 GDF6-202ENST00000620978 973 ntTSL 1 (best) BASIC19.98■□□□□ 0.79
MYBPC1Q00872 AFG3L1P-217ENST00000557444 2447 ntBASIC19.98■□□□□ 0.79
MYBPC1Q00872 BASP1-201ENST00000322611 1878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.98■□□□□ 0.79
MYBPC1Q00872 FUT4-201ENST00000358752 6059 ntAPPRIS P1 BASIC19.98■□□□□ 0.79
MYBPC1Q00872 RMI2-201ENST00000312499 1457 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.98■□□□□ 0.79
MYBPC1Q00872 CBWD3-213ENST00000618217 1611 ntTSL 1 (best) BASIC19.98■□□□□ 0.79
MYBPC1Q00872 SIMC1-204ENST00000430704 1925 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC19.98■□□□□ 0.79
MYBPC1Q00872 USP21-202ENST00000368001 2095 ntTSL 1 (best) BASIC19.98■□□□□ 0.79
MYBPC1Q00872 APBB3-203ENST00000357560 2218 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC19.98■□□□□ 0.79
MYBPC1Q00872 AR-204ENST00000504326 3615 ntTSL 1 (best) BASIC19.97■□□□□ 0.79
MYBPC1Q00872 PAXIP1-AS1-201ENST00000608317 2256 ntBASIC19.97■□□□□ 0.79
MYBPC1Q00872 C17orf67-201ENST00000397861 2013 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.97■□□□□ 0.79
MYBPC1Q00872 FBXO31-207ENST00000618298 1871 ntTSL 5 BASIC19.97■□□□□ 0.79
MYBPC1Q00872 PNMT-201ENST00000269582 1253 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.97■□□□□ 0.79
MYBPC1Q00872 MT1E-201ENST00000306061 704 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.97■□□□□ 0.79
MYBPC1Q00872 TMEM54-201ENST00000329151 871 ntTSL 1 (best) BASIC19.97■□□□□ 0.79
MYBPC1Q00872 ANAPC13-201ENST00000354910 1209 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.97■□□□□ 0.79
MYBPC1Q00872 HES6-204ENST00000409182 863 ntTSL 2 BASIC19.97■□□□□ 0.79
MYBPC1Q00872 AC010997.5-201ENST00000609182 354 ntBASIC19.97■□□□□ 0.79
MYBPC1Q00872 CITED2-202ENST00000536159 1797 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC19.97■□□□□ 0.79
MYBPC1Q00872 NTRK1-206ENST00000524377 2432 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.97■□□□□ 0.79
MYBPC1Q00872 SET-201ENST00000322030 2915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.97■□□□□ 0.79
MYBPC1Q00872 SOBP-201ENST00000317357 5245 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.97■□□□□ 0.79
MYBPC1Q00872 MAP2K5-204ENST00000395476 1689 ntTSL 1 (best) BASIC19.97■□□□□ 0.79
MYBPC1Q00872 ZNF37BP-201ENST00000435805 1695 ntTSL 5 BASIC19.97■□□□□ 0.79
MYBPC1Q00872 RBBP7-202ENST00000380084 2036 ntTSL 2 BASIC19.97■□□□□ 0.79
MYBPC1Q00872 PIKFYVE-203ENST00000392202 2039 ntTSL 1 (best) BASIC19.97■□□□□ 0.79
MYBPC1Q00872 MCC-208ENST00000514701 2855 ntTSL 2 BASIC19.97■□□□□ 0.79
MYBPC1Q00872 NEURL3-201ENST00000310865 1710 ntTSL 1 (best) BASIC19.96■□□□□ 0.79
MYBPC1Q00872 NFIB-207ENST00000397579 3129 ntTSL 5 BASIC19.96■□□□□ 0.79
MYBPC1Q00872 NDUFAF6-203ENST00000396124 1798 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.96■□□□□ 0.79
MYBPC1Q00872 EBF1-202ENST00000380654 2345 ntTSL 1 (best) BASIC19.96■□□□□ 0.79
MYBPC1Q00872 PCMT1-205ENST00000464889 1984 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.96■□□□□ 0.79
MYBPC1Q00872 SLC25A5-AS1-202ENST00000445759 1616 ntTSL 1 (best) BASIC19.96■□□□□ 0.79
MYBPC1Q00872 LRIG1-201ENST00000273261 5273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.96■□□□□ 0.79
MYBPC1Q00872 CD72-202ENST00000378430 585 ntTSL 3 BASIC19.96■□□□□ 0.79
MYBPC1Q00872 CREM-229ENST00000474362 1030 ntTSL 2 BASIC19.96■□□□□ 0.79
MYBPC1Q00872 LINC01960-201ENST00000563759 1884 ntBASIC19.96■□□□□ 0.79
MYBPC1Q00872 ECEL1-201ENST00000304546 2865 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.96■□□□□ 0.79
MYBPC1Q00872 PACRGL-201ENST00000295290 1937 ntTSL 5 BASIC19.96■□□□□ 0.79
MYBPC1Q00872 FAHD1-201ENST00000382666 1964 ntTSL 2 BASIC19.95■□□□□ 0.78
MYBPC1Q00872 PCSK6-214ENST00000611716 4409 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC19.95■□□□□ 0.78
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 34.1 ms