Protein–RNA interactions for Protein: P54274

TERF1, Telomeric repeat-binding factor 1, humanhuman

Predictions only

Length 439 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TERF1P54274 MMP9-201ENST00000372330 2336 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.27■■□□□ 1.32
TERF1P54274 SPAST-204ENST00000621856 1715 ntTSL 1 (best) BASIC23.27■■□□□ 1.32
TERF1P54274 OXCT2P1-201ENST00000447263 1535 ntBASIC23.27■■□□□ 1.32
TERF1P54274 WDR86-207ENST00000621812 1542 ntTSL 5 BASIC23.27■■□□□ 1.32
TERF1P54274 PARD3-210ENST00000374794 5669 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.27■■□□□ 1.32
TERF1P54274 TLK2-202ENST00000343388 3227 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.27■■□□□ 1.32
TERF1P54274 FAM53B-201ENST00000280780 1568 ntTSL 1 (best) BASIC23.27■■□□□ 1.32
TERF1P54274 SPHK1-203ENST00000545180 2238 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC23.27■■□□□ 1.31
TERF1P54274 MYC-201ENST00000259523 2042 ntTSL 1 (best) BASIC23.26■■□□□ 1.31
TERF1P54274 COL4A3BP-201ENST00000261415 2262 ntTSL 1 (best) BASIC23.26■■□□□ 1.31
TERF1P54274 HOMER3-205ENST00000542541 1607 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.26■■□□□ 1.31
TERF1P54274 MAFF-202ENST00000407965 2325 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.26■■□□□ 1.31
TERF1P54274 MADCAM1-206ENST00000617201 1491 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.26■■□□□ 1.31
TERF1P54274 MADCAM1-207ENST00000619333 1485 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.26■■□□□ 1.31
TERF1P54274 MADCAM1-210ENST00000622462 1461 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.26■■□□□ 1.31
TERF1P54274 AC011551.1-201ENST00000614101 683 ntBASIC23.26■■□□□ 1.31
TERF1P54274 AURKA-202ENST00000347343 2248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.26■■□□□ 1.31
TERF1P54274 HERPUD2-201ENST00000311350 2474 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.26■■□□□ 1.31
TERF1P54274 IL15RA-206ENST00000397248 1799 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.26■■□□□ 1.31
TERF1P54274 RPS6KA2-201ENST00000265678 5824 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.26■■□□□ 1.31
TERF1P54274 HNRNPUL2-201ENST00000301785 5106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.26■■□□□ 1.31
TERF1P54274 SPAG16-204ENST00000413312 2258 ntTSL 5 BASIC23.26■■□□□ 1.31
TERF1P54274 CNTD2-202ENST00000430325 1817 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC23.26■■□□□ 1.31
TERF1P54274 WASH6P-203ENST00000460206 1826 ntTSL 5 BASIC23.26■■□□□ 1.31
TERF1P54274 SLC16A5-201ENST00000329783 1934 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.25■■□□□ 1.31
TERF1P54274 AC012123.1-201ENST00000426194 1661 ntTSL 5 BASIC23.25■■□□□ 1.31
TERF1P54274 ZNF692-202ENST00000366471 1710 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.25■■□□□ 1.31
TERF1P54274 PIANP-201ENST00000320591 2323 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.25■■□□□ 1.31
TERF1P54274 NKX6-1-201ENST00000295886 2628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.25■■□□□ 1.31
TERF1P54274 SLC16A5-202ENST00000450736 2051 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.25■■□□□ 1.31
TERF1P54274 GPC1-202ENST00000420138 1835 ntTSL 5 BASIC23.25■■□□□ 1.31
TERF1P54274 GPT-205ENST00000528431 1822 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.25■■□□□ 1.31
TERF1P54274 AC148477.1-201ENST00000537720 476 ntTSL 3 BASIC23.25■■□□□ 1.31
TERF1P54274 AC010980.1-201ENST00000587192 1142 ntBASIC23.25■■□□□ 1.31
TERF1P54274 PVT1_1.1-201ENST00000615125 194 ntBASIC23.25■■□□□ 1.31
TERF1P54274 PIAS2-203ENST00000545673 1590 ntTSL 2 BASIC23.25■■□□□ 1.31
TERF1P54274 PDE4DIP-214ENST00000479408 2746 ntTSL 5 BASIC23.25■■□□□ 1.31
TERF1P54274 EGFL8-220ENST00000395512 1312 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.25■■□□□ 1.31
TERF1P54274 ARHGAP28-203ENST00000383472 2295 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.25■■□□□ 1.31
TERF1P54274 CD8A-202ENST00000352580 1977 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.25■■□□□ 1.31
TERF1P54274 TIGD5-201ENST00000504548 5390 ntAPPRIS P1 BASIC23.25■■□□□ 1.31
TERF1P54274 NRG2-202ENST00000289422 2923 ntTSL 5 BASIC23.25■■□□□ 1.31
TERF1P54274 DACH1-201ENST00000611519 4789 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.25■■□□□ 1.31
TERF1P54274 USP39-203ENST00000409470 2034 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.25■■□□□ 1.31
TERF1P54274 DUSP15-201ENST00000278979 1732 ntTSL 2 BASIC23.25■■□□□ 1.31
TERF1P54274 RNF180-201ENST00000296615 1727 ntTSL 1 (best) BASIC23.25■■□□□ 1.31
TERF1P54274 ECHDC1-214ENST00000474289 2443 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC23.24■■□□□ 1.31
TERF1P54274 SLC6A11-202ENST00000454147 2794 ntTSL 1 (best) BASIC23.24■■□□□ 1.31
TERF1P54274 CIRBP-216ENST00000588090 1459 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC23.24■■□□□ 1.31
TERF1P54274 MEGF6-202ENST00000356575 5455 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.24■■□□□ 1.31
TERF1P54274 TULP1-201ENST00000229771 2162 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.24■■□□□ 1.31
TERF1P54274 VSX1-202ENST00000376709 2192 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.24■■□□□ 1.31
TERF1P54274 FSTL3-201ENST00000166139 2542 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.24■■□□□ 1.31
TERF1P54274 SNX4-201ENST00000251775 2513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.24■■□□□ 1.31
TERF1P54274 POMGNT2-202ENST00000441964 2531 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC23.24■■□□□ 1.31
TERF1P54274 FDFT1-210ENST00000525954 1890 ntTSL 2 BASIC23.24■■□□□ 1.31
TERF1P54274 TMEM151A-201ENST00000327259 2562 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.24■■□□□ 1.31
TERF1P54274 PNCK-215ENST00000447676 1585 ntTSL 2 BASIC23.24■■□□□ 1.31
TERF1P54274 LSM12-201ENST00000293406 2308 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.24■■□□□ 1.31
TERF1P54274 CST6-201ENST00000312134 759 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.24■■□□□ 1.31
TERF1P54274 CT47A7-201ENST00000434883 1288 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.24■■□□□ 1.31
TERF1P54274 AC120024.1-201ENST00000562672 995 ntBASIC23.24■■□□□ 1.31
TERF1P54274 NDEL1-219ENST00000585098 454 ntTSL 3 BASIC23.24■■□□□ 1.31
TERF1P54274 CHRNA3-202ENST00000348639 2030 ntTSL 1 (best) BASIC23.24■■□□□ 1.31
TERF1P54274 STARD3-201ENST00000336308 2132 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.24■■□□□ 1.31
TERF1P54274 ESYT2-201ENST00000251527 5960 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.24■■□□□ 1.31
TERF1P54274 TRPV6-209ENST00000638686 2298 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.24■■□□□ 1.31
TERF1P54274 LGI3-202ENST00000424267 3114 ntTSL 1 (best) BASIC23.24■■□□□ 1.31
TERF1P54274 PCED1A-202ENST00000360652 2016 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.23■■□□□ 1.31
TERF1P54274 ZNF394-203ENST00000426306 2017 ntTSL 1 (best) BASIC23.23■■□□□ 1.31
TERF1P54274 MTCL1-201ENST00000306329 5718 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.23■■□□□ 1.31
TERF1P54274 ITPKB-202ENST00000366784 3146 ntTSL 1 (best) BASIC23.23■■□□□ 1.31
TERF1P54274 COPRS-201ENST00000302362 968 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.23■■□□□ 1.31
TERF1P54274 PYY2-202ENST00000441253 1076 ntTSL 1 (best) BASIC23.23■■□□□ 1.31
TERF1P54274 TDRD10-202ENST00000368482 2331 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.23■■□□□ 1.31
TERF1P54274 LHX3-202ENST00000371748 2365 ntTSL 1 (best) BASIC23.23■■□□□ 1.31
TERF1P54274 PRKAA1-202ENST00000354209 1918 ntTSL 1 (best) BASIC23.23■■□□□ 1.31
TERF1P54274 SPOCK3-215ENST00000510741 1963 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.23■■□□□ 1.31
TERF1P54274 RASL12-201ENST00000220062 2640 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.23■■□□□ 1.31
TERF1P54274 OGG1-202ENST00000302008 2191 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.23■■□□□ 1.31
TERF1P54274 NGEF-202ENST00000373552 2286 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.22■■□□□ 1.31
TERF1P54274 CCT5-205ENST00000506600 1939 ntTSL 2 BASIC23.22■■□□□ 1.31
TERF1P54274 TNXA-203ENST00000507684 2038 ntBASIC23.22■■□□□ 1.31
TERF1P54274 AQP1-202ENST00000409611 1140 ntTSL 1 (best) BASIC23.22■■□□□ 1.31
TERF1P54274 ATP5G2P3-201ENST00000429083 425 ntBASIC23.22■■□□□ 1.31
TERF1P54274 SDCBP-204ENST00000447182 2103 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.22■■□□□ 1.31
TERF1P54274 AC073314.1-201ENST00000568729 2216 ntBASIC23.22■■□□□ 1.31
TERF1P54274 HTRA3-201ENST00000307358 2541 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.22■■□□□ 1.31
TERF1P54274 ACTR5-201ENST00000243903 2565 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.22■■□□□ 1.31
TERF1P54274 SNX21-212ENST00000491381 1607 ntTSL 1 (best) BASIC23.22■■□□□ 1.31
TERF1P54274 DTNBP1-201ENST00000338950 1880 ntTSL 1 (best) BASIC23.22■■□□□ 1.31
TERF1P54274 ZNF385B-204ENST00000410066 3288 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.21■■□□□ 1.31
TERF1P54274 TPST2-202ENST00000398110 1968 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.21■■□□□ 1.31
TERF1P54274 CNNM4-201ENST00000377075 4800 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.21■■□□□ 1.31
TERF1P54274 ZC3H14-219ENST00000556945 2075 ntTSL 5 BASIC23.21■■□□□ 1.31
TERF1P54274 KRT8-217ENST00000619952 2437 ntTSL 2 BASIC23.21■■□□□ 1.31
TERF1P54274 KCNH2-202ENST00000330883 3267 ntTSL 1 (best) BASIC23.21■■□□□ 1.31
TERF1P54274 BEX3-202ENST00000372634 753 ntTSL 2 BASIC23.21■■□□□ 1.31
TERF1P54274 R3HCC1-202ENST00000411463 1467 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC23.21■■□□□ 1.31
TERF1P54274 LACTBL1-201ENST00000426928 1641 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC23.21■■□□□ 1.31
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 17.7 ms