Protein–RNA interactions for Protein: P23396

RPS3, 40S ribosomal protein S3, humanhuman

Known RBP eCLIP

Length 243 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RPS3P23396 MANBA-202ENST00000505239 2577 ntTSL 2 BASIC13.27□□□□□ -0.287e-7■■■■■ 27.9
RPS3P23396 PLA2G15-205ENST00000562966 572 ntTSL 212.38□□□□□ -0.432e-6■■■■■ 27.9
RPS3P23396 MANBA-201ENST00000226578 2904 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.93□□□□□ -0.57e-7■■■■■ 27.9
RPS3P23396 CPT1A-209ENST00000569129 499 ntTSL 49.9□□□□□ -0.821e-6■■■■■ 27.9
RPS3P23396 CPT1A-208ENST00000565318 511 ntTSL 59.14□□□□□ -0.951e-6■■■■■ 27.9
RPS3P23396 MANBA-207ENST00000514430 7444 ntTSL 28.11□□□□□ -1.117e-7■■■■■ 27.9
RPS3P23396 PLA2G15-210ENST00000566978 584 ntTSL 27.86□□□□□ -1.152e-6■■■■■ 27.9
RPS3P23396 ERMP1-201ENST00000214893 4974 ntTSL 1 (best)9.74□□□□□ -0.859e-7■■■■■ 27.9
RPS3P23396 RCCD1-203ENST00000555155 1871 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC23.73■■□□□ 1.391e-7■■■■■ 27.9
RPS3P23396 RCCD1-206ENST00000556618 1556 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC23.67■■□□□ 1.381e-7■■■■■ 27.9
RPS3P23396 EEF1D-217ENST00000526786 1246 ntTSL 222.46■■□□□ 1.191e-7■■■■■ 27.9
RPS3P23396 RCCD1-208ENST00000557266 2110 ntTSL 1 (best)22.24■■□□□ 1.151e-7■■■■■ 27.9
RPS3P23396 NUP210-202ENST00000420141 3134 ntTSL 1 (best)22.03■■□□□ 1.122e-29■■■■■ 27.9
RPS3P23396 MVB12A-212ENST00000543795 1154 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.47■□□□□ 0.871e-7■■■■■ 27.9
RPS3P23396 RCCD1-205ENST00000556333 735 ntTSL 1 (best)19.77■□□□□ 0.761e-7■■■■■ 27.9
RPS3P23396 RCCD1-201ENST00000394258 2689 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.16■□□□□ 0.661e-7■■■■■ 27.9
RPS3P23396 MVB12A-213ENST00000594784 705 ntTSL 518.83■□□□□ 0.61e-7■■■■■ 27.9
RPS3P23396 MVB12A-201ENST00000317040 2223 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.551e-7■■■■■ 27.9
RPS3P23396 SIM2-201ENST00000290399 4442 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.63■□□□□ 0.411e-7■■■■■ 27.9
RPS3P23396 MVB12A-202ENST00000524382 908 ntTSL 217.45■□□□□ 0.381e-7■■■■■ 27.9
RPS3P23396 RCCD1-204ENST00000555737 3157 ntTSL 1 (best)17.01■□□□□ 0.311e-7■■■■■ 27.9
RPS3P23396 EHD2-202ENST00000538399 1766 ntTSL 2 BASIC16.99■□□□□ 0.311e-7■■■■■ 27.9
RPS3P23396 HEXA-210ENST00000567213 1000 ntTSL 3 BASIC16.51■□□□□ 0.231e-11■■■■■ 27.9
RPS3P23396 HEXA-203ENST00000563908 524 ntTSL 216.47■□□□□ 0.231e-11■■■■■ 27.9
RPS3P23396 MVB12A-211ENST00000529939 1091 ntTSL 3 BASIC16.33■□□□□ 0.21e-7■■■■■ 27.9
RPS3P23396 STAT5A-201ENST00000345506 4301 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.152e-6■■■■■ 27.9
RPS3P23396 SCAF1-201ENST00000360565 4306 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC15.74■□□□□ 0.111e-7■■■■■ 27.9
RPS3P23396 EEF1D-230ENST00000530191 853 ntTSL 315.06■□□□□ 01e-7■■■■■ 27.9
RPS3P23396 RCCD1-207ENST00000556774 139 ntTSL 314.97□□□□□ -0.011e-7■■■■■ 27.9
RPS3P23396 NUP210-201ENST00000254508 7193 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.71□□□□□ -0.212e-29■■■■■ 27.9
RPS3P23396 EEF1D-247ENST00000533204 842 ntTSL 213.33□□□□□ -0.281e-7■■■■■ 27.9
RPS3P23396 EEF1D-234ENST00000530616 749 ntTSL 313.2□□□□□ -0.31e-7■■■■■ 27.9
RPS3P23396 EEF1D-236ENST00000531218 787 ntTSL 313.2□□□□□ -0.31e-7■■■■■ 27.9
RPS3P23396 GBF1-201ENST00000369983 6403 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.47□□□□□ -0.411e-7■■■■■ 27.9
RPS3P23396 HEXA-212ENST00000568260 674 ntTSL 312.16□□□□□ -0.461e-7■■■■■ 27.9
RPS3P23396 STAT5A-209ENST00000588868 3629 ntTSL 1 (best) BASIC12□□□□□ -0.492e-6■■■■■ 27.9
RPS3P23396 ESYT1-206ENST00000550515 716 ntTSL 211.54□□□□□ -0.564e-14■■■■■ 27.9
RPS3P23396 EHD2-201ENST00000263277 3585 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.42□□□□□ -0.581e-7■■■■■ 27.9
RPS3P23396 MVB12A-205ENST00000528604 656 ntTSL 311.21□□□□□ -0.611e-7■■■■■ 27.9
RPS3P23396 HEXA-216ENST00000569509 590 ntTSL 410.11□□□□□ -0.791e-7■■■■■ 27.9
RPS3P23396 FAH-209ENST00000559217 619 ntTSL 29.82□□□□□ -0.842e-6■■■■■ 27.9
RPS3P23396 PIM2-203ENST00000485431 711 ntTSL 28.87□□□□□ -0.996e-10■■■■■ 27.9
RPS3P23396 FKBP4-203ENST00000539181 370 ntTSL 37.44□□□□□ -1.221e-7■■■■■ 27.9
RPS3P23396 AC010519.1-201ENST00000599924 344 ntTSL 5 BASIC6.82□□□□□ -1.321e-7■■■■■ 27.9
RPS3P23396 PPIL1-201ENST00000373699 1739 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.99□□□□□ -1.451e-7■■■■■ 27.9
RPS3P23396 STT3A-209ENST00000527456 481 ntTSL 54.39□□□□□ -1.714e-8■■■■■ 27.9
RPS3P23396 ATP5B-203ENST00000547808 705 ntTSL 518.31■□□□□ 0.522e-22■■■■■ 27.9
RPS3P23396 GARS-209ENST00000496643 772 ntTSL 25.17□□□□□ -1.581e-6■■■■■ 27.9
RPS3P23396 GFI1B-208ENST00000636263 1604 ntTSL 5 BASIC17.53■□□□□ 0.42e-6■■■■■ 27.8
RPS3P23396 EIF4A3-204ENST00000575668 831 ntTSL 210.14□□□□□ -0.792e-6■■■■■ 27.8
RPS3P23396 HEXA-202ENST00000563762 1174 ntTSL 215.65■□□□□ 0.11e-7■■■■■ 27.8
RPS3P23396 HEXA-211ENST00000567411 1743 ntTSL 514.12□□□□□ -0.151e-7■■■■■ 27.8
RPS3P23396 AC009690.1-201ENST00000379915 4374 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.06□□□□□ -0.161e-7■■■■■ 27.8
RPS3P23396 HEXA-206ENST00000566304 1795 ntTSL 2 BASIC13.88□□□□□ -0.191e-7■■■■■ 27.8
RPS3P23396 HEXA-207ENST00000566672 1397 ntTSL 212.85□□□□□ -0.351e-7■■■■■ 27.8
RPS3P23396 HEXA-201ENST00000268097 5252 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.36□□□□□ -0.431e-7■■■■■ 27.8
RPS3P23396 HEXA-209ENST00000567159 1582 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC11.82□□□□□ -0.521e-7■■■■■ 27.8
RPS3P23396 PSMD3-205ENST00000580980 580 ntTSL 211.81□□□□□ -0.524e-10■■■■■ 27.8
RPS3P23396 HEXA-215ENST00000569410 1351 ntTSL 59.28□□□□□ -0.921e-7■■■■■ 27.8
RPS3P23396 C1QBP-204ENST00000573406 767 ntTSL 218.89■□□□□ 0.612e-9■■■■■ 27.8
RPS3P23396 PPIH-202ENST00000372549 327 ntTSL 3 BASIC17.49■□□□□ 0.394e-7■■■■■ 27.8
RPS3P23396 TUBBP1-201ENST00000248151 1335 ntBASIC10.85□□□□□ -0.674e-7■■■■■ 27.8
RPS3P23396 TUBBP1-202ENST00000518096 1646 ntBASIC10.58□□□□□ -0.724e-7■■■■■ 27.8
RPS3P23396 RPS29-208ENST00000557519 333 ntTSL 39.5□□□□□ -0.894e-12■■■■■ 27.8
RPS3P23396 RPS29-204ENST00000554075 826 ntTSL 1 (best)8.43□□□□□ -1.064e-12■■■■■ 27.8
RPS3P23396 RPS29-205ENST00000556230 624 ntTSL 1 (best)7.57□□□□□ -1.24e-12■■■■■ 27.8
RPS3P23396 C1QBP-207ENST00000576122 383 ntTSL 33.72□□□□□ -1.814e-7■■■■■ 27.8
RPS3P23396 AP000781.2-203ENST00000528835 533 ntTSL 316.53■□□□□ 0.243e-6■■■■■ 27.8
RPS3P23396 AP000781.2-202ENST00000529411 681 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC9.7□□□□□ -0.863e-6■■■■■ 27.8
RPS3P23396 CTSH-205ENST00000528191 569 ntTSL 48.95□□□□□ -0.983e-9■■■■■ 27.8
RPS3P23396 CTDNEP1-206ENST00000571409 741 ntTSL 529.32■■■□□ 2.285e-9■■■■■ 27.8
RPS3P23396 CTDNEP1-208ENST00000573600 1724 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.94■■■□□ 2.225e-9■■■■■ 27.8
RPS3P23396 CTDNEP1-201ENST00000318988 1549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.16■■□□□ 1.945e-9■■■■■ 27.8
RPS3P23396 ERI3-205ENST00000457571 975 ntTSL 524.89■■□□□ 1.581e-7■■■■■ 27.8
RPS3P23396 YIF1A-213ENST00000534374 540 ntTSL 222.51■■□□□ 1.191e-6■■■■■ 27.8
RPS3P23396 YIF1A-206ENST00000474986 860 ntTSL 1 (best)22.41■■□□□ 1.181e-6■■■■■ 27.8
RPS3P23396 YIF1A-202ENST00000376899 1042 ntTSL 222.21■■□□□ 1.151e-6■■■■■ 27.8
RPS3P23396 ERI3-203ENST00000452396 764 ntTSL 322.16■■□□□ 1.141e-7■■■■■ 27.8
RPS3P23396 YIF1A-201ENST00000359461 943 ntTSL 2 BASIC21.96■■□□□ 1.111e-6■■■■■ 27.8
RPS3P23396 YIF1A-203ENST00000376901 1124 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.111e-6■■■■■ 27.8
RPS3P23396 ERI3-201ENST00000372257 1684 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.64■■□□□ 1.051e-7■■■■■ 27.8
RPS3P23396 ERI3-209ENST00000495828 972 ntTSL 321.6■■□□□ 1.051e-7■■■■■ 27.8
RPS3P23396 BZW1-202ENST00000409226 2455 ntTSL 2 BASIC20.21■□□□□ 0.831e-7■■■■■ 27.8
RPS3P23396 YIF1A-205ENST00000471387 854 ntTSL 5 BASIC20.16■□□□□ 0.821e-6■■■■■ 27.8
RPS3P23396 YIF1A-207ENST00000484814 541 ntTSL 320.16■□□□□ 0.821e-6■■■■■ 27.8
RPS3P23396 BZW1-209ENST00000452790 1473 ntTSL 2 BASIC19.68■□□□□ 0.741e-7■■■■■ 27.8
RPS3P23396 COG4-206ENST00000530160 554 ntTSL 419.67■□□□□ 0.741e-7■■■■■ 27.8
RPS3P23396 SOD2-212ENST00000540491 454 ntTSL 318.43■□□□□ 0.541e-7■■■■■ 27.8
RPS3P23396 UBE2N-201ENST00000318066 5186 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.34■□□□□ 0.531e-7■■■■■ 27.8
RPS3P23396 YIF1A-212ENST00000528575 532 ntTSL 318.27■□□□□ 0.521e-6■■■■■ 27.8
RPS3P23396 PBK-203ENST00000522944 1499 ntTSL 2 BASIC18.06■□□□□ 0.481e-7■■■■■ 27.8
RPS3P23396 SOD2-215ENST00000546087 2558 ntTSL 2 BASIC17.42■□□□□ 0.381e-7■■■■■ 27.8
RPS3P23396 AC003688.1-201ENST00000577138 489 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.3■□□□□ 0.365e-9■■■■■ 27.8
RPS3P23396 SOD2-201ENST00000337404 991 ntTSL 2 BASIC17.24■□□□□ 0.351e-7■■■■■ 27.8
RPS3P23396 CTDNEP1-207ENST00000572043 857 ntTSL 3 BASIC17.2■□□□□ 0.345e-9■■■■■ 27.8
RPS3P23396 DNMT1-215ENST00000588913 1775 ntTSL 517.06■□□□□ 0.321e-7■■■■■ 27.8
RPS3P23396 PBK-201ENST00000301905 2118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.03■□□□□ 0.321e-7■■■■■ 27.8
RPS3P23396 DNMT1-212ENST00000587197 809 ntTSL 216.96■□□□□ 0.311e-7■■■■■ 27.8
RPS3P23396 CDC123-203ENST00000429258 646 ntTSL 316.61■□□□□ 0.251e-7■■■■■ 27.8
RPS3P23396 DNMT1-221ENST00000589538 559 ntTSL 516.03■□□□□ 0.161e-7■■■■■ 27.8
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