Protein–RNA interactions for Protein: P16219

ACADS, Short-chain specific acyl-CoA dehydrogenase, mitochondrial, humanhuman

Predictions only

Length 412 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ACADSP16219 RHNO1-204ENST00000489288 1870 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.39■□□□□ 0.86
ACADSP16219 GABARAPL3-202ENST00000624044 1851 ntBASIC20.39■□□□□ 0.86
ACADSP16219 TPBGL-201ENST00000562197 2793 ntAPPRIS P1 BASIC20.39■□□□□ 0.85
ACADSP16219 NARS2-201ENST00000281038 2519 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.39■□□□□ 0.85
ACADSP16219 NTRK1-201ENST00000358660 2492 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.39■□□□□ 0.85
ACADSP16219 DET1-201ENST00000268148 2267 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.39■□□□□ 0.85
ACADSP16219 STMN4-202ENST00000350889 2288 ntTSL 1 (best) BASIC20.39■□□□□ 0.85
ACADSP16219 TMEM189-201ENST00000371650 2222 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.39■□□□□ 0.85
ACADSP16219 PCBP4-212ENST00000484633 2009 ntTSL 5 BASIC20.39■□□□□ 0.85
ACADSP16219 CACNA1A-218ENST00000635895 8657 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.39■□□□□ 0.85
ACADSP16219 CACNA1A-257ENST00000638009 8665 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.39■□□□□ 0.85
ACADSP16219 CACNA1B-201ENST00000277549 7158 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.39■□□□□ 0.85
ACADSP16219 CACNA1B-202ENST00000277551 7158 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.39■□□□□ 0.85
ACADSP16219 DMRT2-205ENST00000382255 2367 ntTSL 1 (best) BASIC20.38■□□□□ 0.85
ACADSP16219 PTOV1-220ENST00000601675 1587 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.38■□□□□ 0.85
ACADSP16219 MED25-211ENST00000617849 1548 ntTSL 1 (best) BASIC20.38■□□□□ 0.85
ACADSP16219 MGAT5B-201ENST00000301618 4486 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC20.38■□□□□ 0.85
ACADSP16219 SNHG12-212ENST00000531126 719 ntTSL 1 (best) BASIC20.38■□□□□ 0.85
ACADSP16219 JAGN1-201ENST00000307768 1693 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.38■□□□□ 0.85
ACADSP16219 PRR14-202ENST00000300835 2198 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.38■□□□□ 0.85
ACADSP16219 TMPRSS5-212ENST00000545579 2163 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.38■□□□□ 0.85
ACADSP16219 NEURL4-203ENST00000570460 4890 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.38■□□□□ 0.85
ACADSP16219 ZFYVE19-201ENST00000299173 1555 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.38■□□□□ 0.85
ACADSP16219 SRRM3-204ENST00000611745 3612 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.38■□□□□ 0.85
ACADSP16219 GNA12-201ENST00000275364 4378 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.37■□□□□ 0.85
ACADSP16219 CDHR5-201ENST00000349570 2318 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.37■□□□□ 0.85
ACADSP16219 NES-201ENST00000368223 5558 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.37■□□□□ 0.85
ACADSP16219 SCUBE1-201ENST00000290460 2258 ntTSL 1 (best) BASIC20.37■□□□□ 0.85
ACADSP16219 CITED2-202ENST00000536159 1797 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC20.37■□□□□ 0.85
ACADSP16219 METTL24-201ENST00000338882 1119 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.37■□□□□ 0.85
ACADSP16219 NOX4-204ENST00000393282 560 ntTSL 1 (best) BASIC20.37■□□□□ 0.85
ACADSP16219 ACOT1-202ENST00000557556 1271 ntTSL 1 (best) BASIC20.37■□□□□ 0.85
ACADSP16219 SIMC1-204ENST00000430704 1925 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC20.37■□□□□ 0.85
ACADSP16219 BIN2-210ENST00000615107 2255 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.37■□□□□ 0.85
ACADSP16219 FGFR1-214ENST00000447712 5900 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.37■□□□□ 0.85
ACADSP16219 CREB3-201ENST00000353704 1832 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.37■□□□□ 0.85
ACADSP16219 RBMS1-205ENST00000409972 1815 ntTSL 5 BASIC20.37■□□□□ 0.85
ACADSP16219 OBSL1-204ENST00000404537 5841 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.37■□□□□ 0.85
ACADSP16219 CMTM3-201ENST00000361909 2159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.36■□□□□ 0.85
ACADSP16219 NOX4-209ENST00000527626 1774 ntTSL 2 BASIC20.36■□□□□ 0.85
ACADSP16219 PHF11-202ENST00000378319 1359 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.36■□□□□ 0.85
ACADSP16219 P2RX4-202ENST00000337233 2032 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.36■□□□□ 0.85
ACADSP16219 CYP2A7-202ENST00000301146 2281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.36■□□□□ 0.85
ACADSP16219 AL355490.1-201ENST00000445808 805 ntTSL 3 BASIC20.36■□□□□ 0.85
ACADSP16219 NEURL1B-203ENST00000522853 1263 ntTSL 1 (best) BASIC20.36■□□□□ 0.85
ACADSP16219 AL590094.1-201ENST00000635581 706 ntTSL 2 BASIC20.36■□□□□ 0.85
ACADSP16219 DHRS11-215ENST00000618403 1598 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.36■□□□□ 0.85
ACADSP16219 CDO1-201ENST00000250535 1860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.36■□□□□ 0.85
ACADSP16219 LGI3-202ENST00000424267 3114 ntTSL 1 (best) BASIC20.36■□□□□ 0.85
ACADSP16219 STRBP-201ENST00000348403 3337 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.36■□□□□ 0.85
ACADSP16219 LYSMD2-201ENST00000267838 1759 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.36■□□□□ 0.85
ACADSP16219 CCDC92-209ENST00000545891 1790 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.36■□□□□ 0.85
ACADSP16219 CYB561-213ENST00000581573 2344 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.36■□□□□ 0.85
ACADSP16219 FAR2P4-203ENST00000560285 1739 ntTSL 2 BASIC20.36■□□□□ 0.85
ACADSP16219 SPAST-204ENST00000621856 1715 ntTSL 1 (best) BASIC20.36■□□□□ 0.85
ACADSP16219 UBE2Z-201ENST00000360943 3122 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.36■□□□□ 0.85
ACADSP16219 TAF15-215ENST00000605844 2191 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.35■□□□□ 0.85
ACADSP16219 TMEM230-205ENST00000379279 1636 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.35■□□□□ 0.85
ACADSP16219 LACTBL1-201ENST00000426928 1641 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC20.35■□□□□ 0.85
ACADSP16219 PARP2-202ENST00000429687 1881 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.35■□□□□ 0.85
ACADSP16219 BRPF3-202ENST00000357641 6052 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.35■□□□□ 0.85
ACADSP16219 RGS11-204ENST00000397770 2390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.35■□□□□ 0.85
ACADSP16219 BRI3-201ENST00000297290 780 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.35■□□□□ 0.85
ACADSP16219 RFLNA-202ENST00000338359 652 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.35■□□□□ 0.85
ACADSP16219 PTRH1-208ENST00000543175 814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.35■□□□□ 0.85
ACADSP16219 TK2-216ENST00000564917 1156 ntTSL 3 BASIC20.35■□□□□ 0.85
ACADSP16219 FOXC2-201ENST00000320354 2478 ntAPPRIS P1 BASIC20.35■□□□□ 0.85
ACADSP16219 SYNGR3-202ENST00000562045 1743 ntTSL 2 BASIC20.35■□□□□ 0.85
ACADSP16219 TTBK1-202ENST00000304139 2449 ntTSL 5 BASIC20.35■□□□□ 0.85
ACADSP16219 GLS-201ENST00000320717 4834 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.35■□□□□ 0.85
ACADSP16219 REM2-201ENST00000267396 1923 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.35■□□□□ 0.85
ACADSP16219 ME3-212ENST00000543262 2311 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.35■□□□□ 0.85
ACADSP16219 MIR222HG-201ENST00000602461 1379 ntTSL 5 BASIC20.34■□□□□ 0.85
ACADSP16219 PIF1-202ENST00000333425 2278 ntTSL 1 (best) BASIC20.34■□□□□ 0.85
ACADSP16219 PNCK-215ENST00000447676 1585 ntTSL 2 BASIC20.34■□□□□ 0.85
ACADSP16219 PXK-211ENST00000484288 2031 ntTSL 1 (best) BASIC20.34■□□□□ 0.85
ACADSP16219 ZNF276-208ENST00000568064 2203 ntTSL 5 BASIC20.34■□□□□ 0.85
ACADSP16219 DMRTB1-201ENST00000371445 1910 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.34■□□□□ 0.85
ACADSP16219 CHST8-203ENST00000438847 2133 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.34■□□□□ 0.85
ACADSP16219 TMEM238-201ENST00000444469 1000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.34■□□□□ 0.85
ACADSP16219 AL031848.2-201ENST00000607670 837 ntBASIC20.34■□□□□ 0.85
ACADSP16219 HCG18-235ENST00000426882 4862 ntTSL 1 (best) BASIC20.34■□□□□ 0.85
ACADSP16219 PRSS33-202ENST00000570702 1676 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.34■□□□□ 0.85
ACADSP16219 ME2-218ENST00000640965 2476 ntTSL 5 BASIC20.34■□□□□ 0.85
ACADSP16219 MAPK8IP1-201ENST00000241014 3050 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.34■□□□□ 0.85
ACADSP16219 BRSK1-201ENST00000309383 3079 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.34■□□□□ 0.85
ACADSP16219 RARRES2-202ENST00000466675 1618 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.34■□□□□ 0.85
ACADSP16219 PRPS1-203ENST00000372428 1748 ntTSL 2 BASIC20.33■□□□□ 0.85
ACADSP16219 MAML1-201ENST00000292599 5723 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.33■□□□□ 0.85
ACADSP16219 EVX1-201ENST00000222761 1500 ntTSL 1 (best) BASIC20.33■□□□□ 0.85
ACADSP16219 PPP3CC-203ENST00000397775 2094 ntTSL 2 BASIC20.33■□□□□ 0.85
ACADSP16219 CECR2-202ENST00000342247 6178 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.33■□□□□ 0.85
ACADSP16219 AC007326.4-201ENST00000638240 1669 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.33■□□□□ 0.85
ACADSP16219 EPM2A-202ENST00000435470 1278 ntTSL 1 (best) BASIC20.33■□□□□ 0.85
ACADSP16219 BX323043.1-201ENST00000641006 1765 ntBASIC20.33■□□□□ 0.84
ACADSP16219 AC018445.3-201ENST00000624177 1945 ntBASIC20.33■□□□□ 0.84
ACADSP16219 NEIL3-201ENST00000264596 2408 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.33■□□□□ 0.84
ACADSP16219 ACVR1C-201ENST00000243349 8994 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.33■□□□□ 0.84
ACADSP16219 YBX3-202ENST00000279550 1708 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.33■□□□□ 0.84
ACADSP16219 LINC00092-201ENST00000412122 1726 ntTSL 1 (best) BASIC20.33■□□□□ 0.84
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 24.3 ms