Protein–RNA interactions for Protein: O43896

KIF1C, Kinesin-like protein KIF1C, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 1,103 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
KIF1CO43896 RFXAP-201ENST00000255476 2304 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
KIF1CO43896 NKIRAS2-204ENST00000393880 1644 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.38■■□□□ 1.01
KIF1CO43896 C20orf144-201ENST00000375222 571 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
KIF1CO43896 HERC2P4-206ENST00000568097 1062 ntTSL 5 BASIC21.38■■□□□ 1.01
KIF1CO43896 TCP1-202ENST00000392168 1878 ntTSL 5 BASIC21.38■■□□□ 1.01
KIF1CO43896 EIF4E3-201ENST00000295612 2764 ntTSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
KIF1CO43896 MTCL1-201ENST00000306329 5718 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.38■■□□□ 1.01
KIF1CO43896 TMEM102-202ENST00000396568 1962 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.37■■□□□ 1.01
KIF1CO43896 CAPN1-226ENST00000533820 3083 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
KIF1CO43896 STARD3NL-202ENST00000396013 1365 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.37■■□□□ 1.01
KIF1CO43896 EGLN2-202ENST00000406058 2150 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
KIF1CO43896 JAKMIP1-203ENST00000409371 2420 ntTSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
KIF1CO43896 IQCJ-SCHIP1-202ENST00000460298 1884 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
KIF1CO43896 GFRA3-202ENST00000378362 1837 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
KIF1CO43896 AC096541.1-201ENST00000445070 1807 ntTSL 2 BASIC21.37■■□□□ 1.01
KIF1CO43896 FAIM-202ENST00000360570 1157 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC21.37■■□□□ 1.01
KIF1CO43896 AL161908.1-203ENST00000425370 506 ntTSL 2 BASIC21.37■■□□□ 1.01
KIF1CO43896 MED14OS-201ENST00000456333 900 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
KIF1CO43896 AC008443.4-201ENST00000503314 456 ntTSL 4 BASIC21.37■■□□□ 1.01
KIF1CO43896 TMED4-205ENST00000481238 1755 ntTSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
KIF1CO43896 DCK-201ENST00000286648 2716 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
KIF1CO43896 NTRK1-201ENST00000358660 2492 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.37■■□□□ 1.01
KIF1CO43896 EP300-201ENST00000263253 9587 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
KIF1CO43896 SOX4-201ENST00000244745 5852 ntAPPRIS P1 BASIC21.37■■□□□ 1.01
KIF1CO43896 CYP21A2-222ENST00000435122 1914 ntTSL 2 BASIC21.37■■□□□ 1.01
KIF1CO43896 MID1IP1-203ENST00000457894 1902 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.37■■□□□ 1.01
KIF1CO43896 COL4A3BP-201ENST00000261415 2262 ntTSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
KIF1CO43896 PLEKHB1-201ENST00000227214 2016 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
KIF1CO43896 AL591684.2-201ENST00000605970 1594 ntTSL 5 BASIC21.36■■□□□ 1.01
KIF1CO43896 EEF1D-256ENST00000618139 2238 ntTSL 5 BASIC21.36■■□□□ 1.01
KIF1CO43896 TSPY26P-201ENST00000476365 1326 ntBASIC21.36■■□□□ 1.01
KIF1CO43896 ADCK2-201ENST00000072869 2377 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
KIF1CO43896 HES3-201ENST00000377898 697 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.36■■□□□ 1.01
KIF1CO43896 MLF2-206ENST00000539187 1110 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
KIF1CO43896 AC006538.2-201ENST00000586572 543 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC21.36■■□□□ 1.01
KIF1CO43896 TRAF4-217ENST00000618771 543 ntTSL 5 BASIC21.36■■□□□ 1.01
KIF1CO43896 POLD2-207ENST00000452185 1659 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
KIF1CO43896 DVL1-204ENST00000610709 2268 ntTSL 2 BASIC21.36■■□□□ 1.01
KIF1CO43896 SUMF1-201ENST00000272902 2159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
KIF1CO43896 CDX1-201ENST00000231656 1758 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
KIF1CO43896 SIRT7-201ENST00000328666 1743 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
KIF1CO43896 ANKHD1-221ENST00000616482 2064 ntTSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
KIF1CO43896 TNFAIP2-209ENST00000560869 4683 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.35■■□□□ 1.01
KIF1CO43896 PHF2-201ENST00000359246 5569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
KIF1CO43896 OSCAR-209ENST00000616215 2016 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.35■■□□□ 1.01
KIF1CO43896 PRMT8-202ENST00000382622 2366 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
KIF1CO43896 JTB-203ENST00000368589 1216 ntTSL 2 BASIC21.35■■□□□ 1.01
KIF1CO43896 TSPY4-201ENST00000383008 1143 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.35■■□□□ 1.01
KIF1CO43896 ZEB1-AS1-201ENST00000423714 456 ntTSL 3 BASIC21.35■■□□□ 1.01
KIF1CO43896 TEAD2-210ENST00000601519 2167 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
KIF1CO43896 PACRGL-201ENST00000295290 1937 ntTSL 5 BASIC21.35■■□□□ 1.01
KIF1CO43896 MESP2-201ENST00000341735 1552 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
KIF1CO43896 LGALS9B-202ENST00000423676 1713 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
KIF1CO43896 CDC16-203ENST00000356221 2203 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
KIF1CO43896 TMC6-212ENST00000589553 2389 ntTSL 2 BASIC21.34■■□□□ 1.01
KIF1CO43896 AP002761.3-201ENST00000546324 1695 ntTSL 2 BASIC21.34■■□□□ 1.01
KIF1CO43896 FLT1-204ENST00000541932 2969 ntTSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
KIF1CO43896 BID-212ENST00000614949 1988 ntTSL 5 BASIC21.34■■□□□ 1.01
KIF1CO43896 ILF3-217ENST00000589998 2622 ntTSL 2 BASIC21.34■■□□□ 1.01
KIF1CO43896 XBP1-207ENST00000611155 1794 ntTSL 5 BASIC21.34■■□□□ 1.01
KIF1CO43896 KCNJ12-202ENST00000583088 5425 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
KIF1CO43896 CYC1-201ENST00000318911 1240 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
KIF1CO43896 GLTPD2-201ENST00000331264 1023 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
KIF1CO43896 METTL23-201ENST00000341249 1155 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
KIF1CO43896 CEP104-201ENST00000378223 1121 ntTSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
KIF1CO43896 ATP6V0E2-204ENST00000464662 513 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.34■■□□□ 1.01
KIF1CO43896 MADCAM1-208ENST00000621286 1203 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.34■■□□□ 1.01
KIF1CO43896 HSPBP1-206ENST00000587922 1449 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
KIF1CO43896 HDAC4-201ENST00000345617 8976 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
KIF1CO43896 HDAC4-215ENST00000543185 8990 ntTSL 5 BASIC21.34■■□□□ 1.01
KIF1CO43896 TSKS-202ENST00000358830 1367 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
KIF1CO43896 GAS2-202ENST00000454584 2286 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
KIF1CO43896 C7orf26-202ENST00000359073 1762 ntTSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1.01
KIF1CO43896 ATP5C1-202ENST00000356708 1163 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1.01
KIF1CO43896 POU2F3-206ENST00000543440 1953 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1.01
KIF1CO43896 JUNB-201ENST00000302754 1820 ntAPPRIS P1 BASIC21.33■■□□□ 1.01
KIF1CO43896 BTBD17-201ENST00000375366 1805 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1.01
KIF1CO43896 PARP9-207ENST00000492382 1837 ntTSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1.01
KIF1CO43896 PDIA2-201ENST00000219406 1698 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1
KIF1CO43896 MBD3-207ENST00000590550 2782 ntTSL 2 BASIC21.33■■□□□ 1
KIF1CO43896 ADCK2-203ENST00000476491 2092 ntTSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1
KIF1CO43896 PRKG2-207ENST00000628926 2623 ntTSL 2 BASIC21.33■■□□□ 1
KIF1CO43896 NUDT10-201ENST00000356450 1917 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1
KIF1CO43896 AL353803.4-201ENST00000565882 1934 ntBASIC21.33■■□□□ 1
KIF1CO43896 CADPS-201ENST00000283269 4591 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1
KIF1CO43896 DNLZ-202ENST00000371739 2934 ntTSL 5 BASIC21.32■■□□□ 1
KIF1CO43896 SCAND1-202ENST00000373991 1727 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
KIF1CO43896 NIPSNAP2-201ENST00000322090 1999 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
KIF1CO43896 PAX1-201ENST00000398485 2838 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC21.32■■□□□ 1
KIF1CO43896 MYD88-205ENST00000424893 1279 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
KIF1CO43896 UBE2E2-203ENST00000425792 1248 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.32■■□□□ 1
KIF1CO43896 ORAI3-202ENST00000562699 628 ntTSL 2 BASIC21.32■■□□□ 1
KIF1CO43896 AC011446.1-201ENST00000591825 458 ntTSL 2 BASIC21.32■■□□□ 1
KIF1CO43896 AC087623.3-201ENST00000607047 1098 ntBASIC21.32■■□□□ 1
KIF1CO43896 RCN2-202ENST00000394883 1366 ntTSL 5 BASIC21.32■■□□□ 1
KIF1CO43896 ARNTL-203ENST00000403290 2746 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
KIF1CO43896 POMZP3-202ENST00000310842 1490 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
KIF1CO43896 ADORA2A-214ENST00000611543 2412 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.31■■□□□ 1
KIF1CO43896 C2CD4B-201ENST00000380392 1579 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.31■■□□□ 1
KIF1CO43896 HMGA2-206ENST00000536545 1788 ntTSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 20.5 ms