Protein–RNA interactions for Protein: O43752

STX6, Syntaxin-6, humanhuman

Predictions only

Length 255 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
STX6O43752 RABL2B-206ENST00000395598 2169 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.72■■□□□ 1.55
STX6O43752 AL356441.2-201ENST00000443009 864 ntBASIC24.72■■□□□ 1.55
STX6O43752 ERGIC1-206ENST00000519860 1000 ntTSL 3 BASIC24.72■■□□□ 1.55
STX6O43752 RAB6A-204ENST00000536566 1267 ntTSL 5 BASIC24.72■■□□□ 1.55
STX6O43752 DUX4L19-201ENST00000557448 1267 ntBASIC24.72■■□□□ 1.55
STX6O43752 LINC01881-206ENST00000614114 957 ntTSL 2 BASIC24.72■■□□□ 1.55
STX6O43752 METTL1-202ENST00000324871 2066 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.72■■□□□ 1.55
STX6O43752 RAB1B-201ENST00000311481 2007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.72■■□□□ 1.55
STX6O43752 KLC2-207ENST00000421552 2721 ntTSL 5 BASIC24.72■■□□□ 1.55
STX6O43752 TTC39C-202ENST00000317571 2442 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.72■■□□□ 1.55
STX6O43752 AC110285.2-201ENST00000571724 1565 ntTSL 2 BASIC24.71■■□□□ 1.55
STX6O43752 LINC01089-202ENST00000429892 1521 ntTSL 1 (best) BASIC24.71■■□□□ 1.55
STX6O43752 CACNG8-201ENST00000270458 8747 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.71■■□□□ 1.55
STX6O43752 MGAT4D-208ENST00000515354 1806 ntTSL 3 BASIC24.71■■□□□ 1.55
STX6O43752 DNAJC4-202ENST00000321685 1288 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.71■■□□□ 1.55
STX6O43752 SUMF1-205ENST00000458465 1102 ntTSL 2 BASIC24.71■■□□□ 1.55
STX6O43752 AC011298.3-201ENST00000615796 283 ntBASIC24.71■■□□□ 1.55
STX6O43752 KRTAP5-4-202ENST00000616115 660 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.71■■□□□ 1.55
STX6O43752 DNAJC4-212ENST00000628077 938 ntTSL 5 BASIC24.71■■□□□ 1.55
STX6O43752 DOK3-201ENST00000312943 2292 ntTSL 1 (best) BASIC24.71■■□□□ 1.55
STX6O43752 TRIM14-202ENST00000342043 1479 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.7■■□□□ 1.55
STX6O43752 LINC01011-201ENST00000445000 2811 ntTSL 2 BASIC24.7■■□□□ 1.54
STX6O43752 SLC35A3-208ENST00000638336 2438 ntTSL 1 (best) BASIC24.7■■□□□ 1.54
STX6O43752 AC133555.3-201ENST00000549950 1693 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC24.7■■□□□ 1.54
STX6O43752 AC106782.1-201ENST00000550538 1693 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC24.7■■□□□ 1.54
STX6O43752 PHPT1-201ENST00000247665 890 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.7■■□□□ 1.54
STX6O43752 PEMT-201ENST00000255389 1013 ntTSL 1 (best) BASIC24.7■■□□□ 1.54
STX6O43752 ANAPC13-201ENST00000354910 1209 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.7■■□□□ 1.54
STX6O43752 ADAMTS13-203ENST00000371910 1074 ntTSL 1 (best) BASIC24.7■■□□□ 1.54
STX6O43752 TMEM134-202ENST00000393877 823 ntTSL 1 (best) BASIC24.7■■□□□ 1.54
STX6O43752 HDHD5-203ENST00000399852 1118 ntTSL 3 BASIC24.7■■□□□ 1.54
STX6O43752 TRIR-202ENST00000588213 841 ntTSL 3 BASIC24.7■■□□□ 1.54
STX6O43752 NAE1-203ENST00000379463 1909 ntTSL 2 BASIC24.7■■□□□ 1.54
STX6O43752 MFSD3-201ENST00000301327 1548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.7■■□□□ 1.54
STX6O43752 GPC1-202ENST00000420138 1835 ntTSL 5 BASIC24.7■■□□□ 1.54
STX6O43752 NFKBIL1-203ENST00000376148 1478 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.7■■□□□ 1.54
STX6O43752 HTATIP2-201ENST00000419348 1477 ntTSL 2 BASIC24.7■■□□□ 1.54
STX6O43752 AL049796.1-201ENST00000565336 1766 ntBASIC24.7■■□□□ 1.54
STX6O43752 PXYLP1-203ENST00000502783 2066 ntTSL 2 BASIC24.7■■□□□ 1.54
STX6O43752 GUCY1A3-210ENST00000513574 2656 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.69■■□□□ 1.54
STX6O43752 PDXDC1-205ENST00000535621 2048 ntTSL 1 (best) BASIC24.69■■□□□ 1.54
STX6O43752 BASP1-201ENST00000322611 1878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.69■■□□□ 1.54
STX6O43752 STOX1-202ENST00000399162 935 ntTSL 1 (best) BASIC24.69■■□□□ 1.54
STX6O43752 STOX1-203ENST00000399165 1135 ntTSL 1 (best) BASIC24.69■■□□□ 1.54
STX6O43752 OLIG3-201ENST00000367734 2049 ntAPPRIS P1 BASIC24.69■■□□□ 1.54
STX6O43752 SMTNL2-202ENST00000389313 2280 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.69■■□□□ 1.54
STX6O43752 GGA2-211ENST00000567468 1713 ntTSL 2 BASIC24.69■■□□□ 1.54
STX6O43752 TRMT2A-204ENST00000439169 2473 ntTSL 5 BASIC24.69■■□□□ 1.54
STX6O43752 XPA-201ENST00000375128 1417 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.69■■□□□ 1.54
STX6O43752 CEBPA-201ENST00000498907 2631 ntAPPRIS P1 BASIC24.68■■□□□ 1.54
STX6O43752 CAMK2B-216ENST00000440254 2097 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC24.68■■□□□ 1.54
STX6O43752 TMEM129-201ENST00000303277 2678 ntTSL 1 (best) BASIC24.68■■□□□ 1.54
STX6O43752 MOSPD3-204ENST00000424091 1115 ntTSL 1 (best) BASIC24.68■■□□□ 1.54
STX6O43752 AP006621.3-202ENST00000530083 765 ntTSL 3 BASIC24.68■■□□□ 1.54
STX6O43752 TMC6-218ENST00000591436 1155 ntTSL 1 (best) BASIC24.68■■□□□ 1.54
STX6O43752 TMEM125-201ENST00000432792 1850 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.68■■□□□ 1.54
STX6O43752 PDCD2-203ENST00000443345 1897 ntTSL 1 (best) BASIC24.68■■□□□ 1.54
STX6O43752 WAS-201ENST00000376701 1849 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.68■■□□□ 1.54
STX6O43752 NDUFAF3-202ENST00000326925 2012 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.68■■□□□ 1.54
STX6O43752 AZIN2-204ENST00000373443 2048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.68■■□□□ 1.54
STX6O43752 SKI-201ENST00000378536 5613 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.67■■□□□ 1.54
STX6O43752 DNAJB5-201ENST00000312316 2391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.67■■□□□ 1.54
STX6O43752 PRMT5-201ENST00000216350 2271 ntTSL 2 BASIC24.67■■□□□ 1.54
STX6O43752 RTL8C-201ENST00000257013 1181 ntAPPRIS P1 BASIC24.67■■□□□ 1.54
STX6O43752 FDX2-202ENST00000393708 1012 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.67■■□□□ 1.54
STX6O43752 SF1-220ENST00000626028 704 ntTSL 2 BASIC24.67■■□□□ 1.54
STX6O43752 POMGNT2-202ENST00000441964 2531 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC24.67■■□□□ 1.54
STX6O43752 KCNMA1-252ENST00000639120 2308 ntTSL 5 BASIC24.67■■□□□ 1.54
STX6O43752 PARN-205ENST00000539279 1557 ntTSL 2 BASIC24.67■■□□□ 1.54
STX6O43752 MTMR9LP-204ENST00000441044 2624 ntTSL 1 (best) BASIC24.66■■□□□ 1.54
STX6O43752 RAB3A-201ENST00000222256 1528 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.66■■□□□ 1.54
STX6O43752 LGR4-201ENST00000379214 5206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.66■■□□□ 1.54
STX6O43752 YAP1-210ENST00000615667 5398 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.66■■□□□ 1.54
STX6O43752 TEAD2-208ENST00000598810 2191 ntTSL 1 (best) BASIC24.66■■□□□ 1.54
STX6O43752 GRINA-202ENST00000395068 1814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.66■■□□□ 1.54
STX6O43752 TMCC2-209ENST00000637895 1455 ntTSL 1 (best) BASIC24.66■■□□□ 1.54
STX6O43752 AC004707.1-201ENST00000511627 715 ntTSL 3 BASIC24.66■■□□□ 1.54
STX6O43752 GALNS-211ENST00000568311 703 ntTSL 1 (best) BASIC24.66■■□□□ 1.54
STX6O43752 T-202ENST00000366871 2250 ntTSL 1 (best) BASIC24.66■■□□□ 1.54
STX6O43752 SAV1-201ENST00000324679 3063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.66■■□□□ 1.54
STX6O43752 LYPD1-202ENST00000397463 1891 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.66■■□□□ 1.54
STX6O43752 PHACTR2-203ENST00000367584 2490 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.66■■□□□ 1.54
STX6O43752 ATAD3A-202ENST00000378755 2612 ntTSL 2 BASIC24.65■■□□□ 1.54
STX6O43752 KIRREL2-201ENST00000262625 1969 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.65■■□□□ 1.54
STX6O43752 CCDC166-201ENST00000542437 1320 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.65■■□□□ 1.54
STX6O43752 AC010616.1-201ENST00000597630 2078 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.65■■□□□ 1.54
STX6O43752 ASAP2-201ENST00000281419 5712 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.65■■□□□ 1.54
STX6O43752 MIF-201ENST00000215754 939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.65■■□□□ 1.54
STX6O43752 SNX3-202ENST00000349379 890 ntTSL 2 BASIC24.65■■□□□ 1.54
STX6O43752 PCED1A-202ENST00000360652 2016 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.65■■□□□ 1.54
STX6O43752 VEGFA-204ENST00000372064 2909 ntTSL 1 (best) BASIC24.65■■□□□ 1.54
STX6O43752 AC055876.1-201ENST00000430589 895 ntTSL 2 BASIC24.65■■□□□ 1.54
STX6O43752 GAS2-202ENST00000454584 2286 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.65■■□□□ 1.54
STX6O43752 HSD11B1L-218ENST00000581773 1687 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.65■■□□□ 1.54
STX6O43752 AP006587.3-201ENST00000525742 1516 ntBASIC24.65■■□□□ 1.54
STX6O43752 SLC22A17-202ENST00000354772 2238 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.65■■□□□ 1.54
STX6O43752 SLC26A5-209ENST00000393735 1947 ntTSL 1 (best) BASIC24.65■■□□□ 1.54
STX6O43752 TMEM17-201ENST00000335390 1797 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.65■■□□□ 1.54
STX6O43752 E4F1-206ENST00000565090 2028 ntTSL 1 (best) BASIC24.64■■□□□ 1.54
STX6O43752 TRIM46-204ENST00000368385 1864 ntTSL 1 (best) BASIC24.64■■□□□ 1.54
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 17.9 ms