Protein–RNA interactions for Protein: B4DSR2

cDNA FLJ52234, humanhuman

Predictions only

Length 109 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
B4DSR2 IKBKG-212ENST00000617207 1949 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC17.47■□□□□ 0.39
B4DSR2 ZNF784-201ENST00000325351 2021 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.47■□□□□ 0.39
B4DSR2 FITM1-201ENST00000267426 1194 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.47■□□□□ 0.39
B4DSR2 TM4SF5-201ENST00000270560 708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.47■□□□□ 0.39
B4DSR2 COA6-202ENST00000366613 641 ntTSL 1 (best) BASIC17.47■□□□□ 0.39
B4DSR2 RAMP1-202ENST00000403885 650 ntTSL 3 BASIC17.47■□□□□ 0.39
B4DSR2 TSPY20P-201ENST00000450910 630 ntBASIC17.47■□□□□ 0.39
B4DSR2 ATPIF1-203ENST00000468425 539 ntTSL 2 BASIC17.47■□□□□ 0.39
B4DSR2 AC099522.1-201ENST00000505955 881 ntTSL 3 BASIC17.47■□□□□ 0.39
B4DSR2 ALDH3A2-224ENST00000626500 995 ntTSL 5 BASIC17.47■□□□□ 0.39
B4DSR2 AQP6-201ENST00000315520 1398 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.47■□□□□ 0.39
B4DSR2 SPR-201ENST00000234454 1480 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.47■□□□□ 0.39
B4DSR2 WRAP73-201ENST00000270708 1665 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.47■□□□□ 0.39
B4DSR2 DHRS2-202ENST00000344777 1678 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.47■□□□□ 0.39
B4DSR2 TOP1MT-201ENST00000329245 1958 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.47■□□□□ 0.39
B4DSR2 BST1-202ENST00000382346 1993 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.47■□□□□ 0.39
B4DSR2 CPLX1-203ENST00000505203 2011 ntTSL 2 BASIC17.47■□□□□ 0.39
B4DSR2 HOMER1-202ENST00000334082 5881 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.47■□□□□ 0.39
B4DSR2 FHL3-201ENST00000373016 1647 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.47■□□□□ 0.39
B4DSR2 MKRN4P-201ENST00000444706 1521 ntBASIC17.47■□□□□ 0.39
B4DSR2 UBE2E3-201ENST00000392415 1347 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.47■□□□□ 0.39
B4DSR2 FJX1-201ENST00000317811 2450 ntAPPRIS P1 BASIC17.46■□□□□ 0.39
B4DSR2 PNRC1-201ENST00000336032 2065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.46■□□□□ 0.39
B4DSR2 NAT16-204ENST00000455377 1492 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.46■□□□□ 0.39
B4DSR2 TIGD5-201ENST00000504548 5390 ntAPPRIS P1 BASIC17.46■□□□□ 0.39
B4DSR2 RWDD4-206ENST00000512740 1393 ntTSL 5 BASIC17.46■□□□□ 0.39
B4DSR2 TRAPPC5-201ENST00000317378 790 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.46■□□□□ 0.39
B4DSR2 HIST1H2AM-201ENST00000359611 393 ntAPPRIS P1 BASIC17.46■□□□□ 0.39
B4DSR2 CD8B-205ENST00000393761 932 ntTSL 1 (best) BASIC17.46■□□□□ 0.39
B4DSR2 DHRS4-202ENST00000397074 785 ntTSL 5 BASIC17.46■□□□□ 0.39
B4DSR2 CD8B-206ENST00000431506 692 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.46■□□□□ 0.39
B4DSR2 UMAD1-202ENST00000463725 559 ntTSL 4 BASIC17.46■□□□□ 0.39
B4DSR2 AC105001.1-201ENST00000506149 821 ntTSL 1 (best) BASIC17.46■□□□□ 0.39
B4DSR2 DHRS4L2-204ENST00000537912 918 ntTSL 2 BASIC17.46■□□□□ 0.39
B4DSR2 RAP1B-220ENST00000539091 977 ntTSL 2 BASIC17.46■□□□□ 0.39
B4DSR2 KCNIP1-201ENST00000328939 2014 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.46■□□□□ 0.39
B4DSR2 TANGO2-202ENST00000398042 2011 ntTSL 2 BASIC17.46■□□□□ 0.39
B4DSR2 EML2-209ENST00000587152 2763 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.46■□□□□ 0.39
B4DSR2 WHAMM-201ENST00000286760 5101 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.46■□□□□ 0.39
B4DSR2 NHLH1-201ENST00000302101 2563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.46■□□□□ 0.39
B4DSR2 CACNG2-201ENST00000300105 2384 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.46■□□□□ 0.39
B4DSR2 GTF2IP1-204ENST00000616377 2632 ntTSL 2 BASIC17.46■□□□□ 0.39
B4DSR2 CBLN2-209ENST00000585159 2406 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.46■□□□□ 0.38
B4DSR2 STEAP1-201ENST00000297205 1313 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.46■□□□□ 0.38
B4DSR2 CLN3-240ENST00000631023 1586 ntTSL 5 BASIC17.45■□□□□ 0.38
B4DSR2 TULP1-202ENST00000322263 1941 ntTSL 1 (best) BASIC17.45■□□□□ 0.38
B4DSR2 MMP24-201ENST00000246186 4414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.45■□□□□ 0.38
B4DSR2 CBWD6-213ENST00000613716 1820 ntTSL 1 (best) BASIC17.45■□□□□ 0.38
B4DSR2 ASAP2-201ENST00000281419 5712 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.45■□□□□ 0.38
B4DSR2 GGA2-211ENST00000567468 1713 ntTSL 2 BASIC17.45■□□□□ 0.38
B4DSR2 FBXW7-202ENST00000281708 4976 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.45■□□□□ 0.38
B4DSR2 BHLHA15-201ENST00000314018 706 ntAPPRIS P1 BASIC17.45■□□□□ 0.38
B4DSR2 CUEDC2-201ENST00000369937 1191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.45■□□□□ 0.38
B4DSR2 AL512625.2-201ENST00000417533 625 ntBASIC17.45■□□□□ 0.38
B4DSR2 UQCRFS1P1-201ENST00000435169 820 ntBASIC17.45■□□□□ 0.38
B4DSR2 PTGIR-205ENST00000597185 775 ntTSL 3 BASIC17.45■□□□□ 0.38
B4DSR2 BHLHA15-202ENST00000609256 796 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.45■□□□□ 0.38
B4DSR2 TARDBP-228ENST00000629725 1031 ntTSL 5 BASIC17.45■□□□□ 0.38
B4DSR2 FASTK-217ENST00000540185 1609 ntTSL 5 BASIC17.45■□□□□ 0.38
B4DSR2 GRK4-206ENST00000504933 1971 ntTSL 1 (best) BASIC17.45■□□□□ 0.38
B4DSR2 AC139530.1-201ENST00000575312 1977 ntBASIC17.45■□□□□ 0.38
B4DSR2 PCYT2-201ENST00000331285 2147 ntTSL 2 BASIC17.45■□□□□ 0.38
B4DSR2 CDK5-204ENST00000485972 1758 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.45■□□□□ 0.38
B4DSR2 KRT16P2-201ENST00000414673 1423 ntBASIC17.45■□□□□ 0.38
B4DSR2 MTAP-204ENST00000460874 1434 ntTSL 2 BASIC17.45■□□□□ 0.38
B4DSR2 TNIP2-203ENST00000503235 1653 ntTSL 3 BASIC17.45■□□□□ 0.38
B4DSR2 C12orf42-208ENST00000548883 1336 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.45■□□□□ 0.38
B4DSR2 SUMF1-201ENST00000272902 2159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.45■□□□□ 0.38
B4DSR2 HLA-DPB1-211ENST00000418931 1560 ntAPPRIS P2 BASIC17.45■□□□□ 0.38
B4DSR2 SOX18-201ENST00000340356 1864 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.44■□□□□ 0.38
B4DSR2 LRP5-201ENST00000294304 5159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.44■□□□□ 0.38
B4DSR2 IL15RA-208ENST00000397251 1046 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.44■□□□□ 0.38
B4DSR2 ZCCHC9-204ENST00000438268 1248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.44■□□□□ 0.38
B4DSR2 FAM201B-201ENST00000458407 597 ntBASIC17.44■□□□□ 0.38
B4DSR2 LINC02199-202ENST00000510067 1008 ntTSL 2 BASIC17.44■□□□□ 0.38
B4DSR2 AC034102.6-201ENST00000550947 559 ntTSL 4 BASIC17.44■□□□□ 0.38
B4DSR2 IL15RA-221ENST00000620865 1037 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.44■□□□□ 0.38
B4DSR2 IL15RA-222ENST00000622442 1160 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.44■□□□□ 0.38
B4DSR2 CIRBP-246ENST00000628979 1043 ntTSL 2 BASIC17.44■□□□□ 0.38
B4DSR2 ZBTB45-205ENST00000600990 2159 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.44■□□□□ 0.38
B4DSR2 CCDC151-203ENST00000591179 1943 ntTSL 1 (best) BASIC17.44■□□□□ 0.38
B4DSR2 ATG101-201ENST00000336854 1439 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.44■□□□□ 0.38
B4DSR2 MRAS-202ENST00000423968 1803 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.44■□□□□ 0.38
B4DSR2 DCAF15-201ENST00000254337 2278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.44■□□□□ 0.38
B4DSR2 LDB1-201ENST00000361198 2285 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.44■□□□□ 0.38
B4DSR2 ARMC10-204ENST00000425331 2443 ntTSL 2 BASIC17.43■□□□□ 0.38
B4DSR2 HAUS4-201ENST00000206474 1642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.43■□□□□ 0.38
B4DSR2 H2AFX-202ENST00000530167 1614 ntAPPRIS P1 BASIC17.43■□□□□ 0.38
B4DSR2 PARD3-213ENST00000545260 5740 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.43■□□□□ 0.38
B4DSR2 CENPN-201ENST00000299572 1398 ntTSL 1 (best) BASIC17.43■□□□□ 0.38
B4DSR2 VAV3-202ENST00000370056 4990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.43■□□□□ 0.38
B4DSR2 CDCA4-202ENST00000392590 1536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.43■□□□□ 0.38
B4DSR2 WDR86-207ENST00000621812 1542 ntTSL 5 BASIC17.43■□□□□ 0.38
B4DSR2 KPTN-201ENST00000338134 1691 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.43■□□□□ 0.38
B4DSR2 TMEM51-203ENST00000400796 1842 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.43■□□□□ 0.38
B4DSR2 RBMS1-205ENST00000409972 1815 ntTSL 5 BASIC17.43■□□□□ 0.38
B4DSR2 GCC2-AS1-201ENST00000322353 558 ntTSL 2 BASIC17.43■□□□□ 0.38
B4DSR2 PPP1CA-202ENST00000358239 1054 ntTSL 2 BASIC17.43■□□□□ 0.38
B4DSR2 MIPEPP3-201ENST00000412105 444 ntBASIC17.43■□□□□ 0.38
B4DSR2 C17orf107-202ENST00000521575 1275 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.43■□□□□ 0.38
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 15.7 ms