Protein–RNA interactions for Protein: Q9Y546

LRRC42, Leucine-rich repeat-containing protein 42, humanhuman

Predictions only

Length 428 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
LRRC42Q9Y546 NKX2-1-203ENST00000518149 2583 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.15■□□□□ 0.82
LRRC42Q9Y546 CERS5-203ENST00000422340 2855 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.15■□□□□ 0.82
LRRC42Q9Y546 MTA1-207ENST00000435036 2888 ntTSL 5 BASIC20.15■□□□□ 0.82
LRRC42Q9Y546 DENND4B-201ENST00000361217 5706 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
LRRC42Q9Y546 TAF10-201ENST00000299424 1215 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
LRRC42Q9Y546 CA15P2-201ENST00000611168 834 ntBASIC20.15■□□□□ 0.82
LRRC42Q9Y546 WBP1-202ENST00000393972 1325 ntTSL 2 BASIC20.15■□□□□ 0.82
LRRC42Q9Y546 FAM151B-201ENST00000282226 1717 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
LRRC42Q9Y546 ZNF692-202ENST00000366471 1710 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
LRRC42Q9Y546 SUMO3-204ENST00000411651 1921 ntTSL 2 BASIC20.15■□□□□ 0.82
LRRC42Q9Y546 CCT5-205ENST00000506600 1939 ntTSL 2 BASIC20.15■□□□□ 0.82
LRRC42Q9Y546 C7orf43-206ENST00000456769 2046 ntTSL 2 BASIC20.15■□□□□ 0.82
LRRC42Q9Y546 KRT8-217ENST00000619952 2437 ntTSL 2 BASIC20.15■□□□□ 0.82
LRRC42Q9Y546 REPS1-203ENST00000409812 2511 ntTSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
LRRC42Q9Y546 TMEM259-209ENST00000592590 2509 ntTSL 5 BASIC20.15■□□□□ 0.82
LRRC42Q9Y546 BACE2-202ENST00000330333 2993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
LRRC42Q9Y546 LRP8-204ENST00000371454 3322 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.82
LRRC42Q9Y546 KCTD15-202ENST00000430256 2555 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.14■□□□□ 0.82
LRRC42Q9Y546 ARHGAP28-203ENST00000383472 2295 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.14■□□□□ 0.81
LRRC42Q9Y546 POLD2-202ENST00000406581 2158 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.14■□□□□ 0.81
LRRC42Q9Y546 NUDT16L1-202ENST00000405142 2040 ntTSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.81
LRRC42Q9Y546 SAMD14-203ENST00000503131 1938 ntTSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.81
LRRC42Q9Y546 C10orf91-202ENST00000392630 1846 ntTSL 2 BASIC20.14■□□□□ 0.81
LRRC42Q9Y546 FAM3A-202ENST00000359889 1712 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.14■□□□□ 0.81
LRRC42Q9Y546 BAZ1A-202ENST00000360310 6010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.81
LRRC42Q9Y546 BRD4-202ENST00000360016 3240 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.81
LRRC42Q9Y546 CADPS-202ENST00000357948 5190 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.81
LRRC42Q9Y546 ARHGAP5-203ENST00000396582 5786 ntTSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.81
LRRC42Q9Y546 KDM3B-201ENST00000314358 6813 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
LRRC42Q9Y546 ZNF12-201ENST00000342651 2921 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.13■□□□□ 0.81
LRRC42Q9Y546 AC104581.1-201ENST00000324348 2852 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.13■□□□□ 0.81
LRRC42Q9Y546 CCKBR-206ENST00000532715 1734 ntTSL 3 BASIC20.13■□□□□ 0.81
LRRC42Q9Y546 ANGPTL6-203ENST00000589181 1579 ntTSL 5 BASIC20.13■□□□□ 0.81
LRRC42Q9Y546 MAPK9-208ENST00000455781 4336 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC20.13■□□□□ 0.81
LRRC42Q9Y546 SHROOM1-202ENST00000378676 2352 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.13■□□□□ 0.81
LRRC42Q9Y546 HOMER3-201ENST00000221222 1384 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC20.13■□□□□ 0.81
LRRC42Q9Y546 SUSD1-204ENST00000374270 3124 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
LRRC42Q9Y546 ZDHHC3-203ENST00000342790 1336 ntTSL 5 BASIC20.13■□□□□ 0.81
LRRC42Q9Y546 CAPN1-226ENST00000533820 3083 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
LRRC42Q9Y546 DYM-203ENST00000442713 2147 ntTSL 2 BASIC20.13■□□□□ 0.81
LRRC42Q9Y546 UBE2F-201ENST00000272930 2009 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
LRRC42Q9Y546 JMJD8-201ENST00000412368 2038 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
LRRC42Q9Y546 GRAMD2B-219ENST00000544396 2822 ntTSL 2 BASIC20.13■□□□□ 0.81
LRRC42Q9Y546 FOXP4-205ENST00000409208 3341 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.13■□□□□ 0.81
LRRC42Q9Y546 WASH6P-203ENST00000460206 1826 ntTSL 5 BASIC20.13■□□□□ 0.81
LRRC42Q9Y546 ZNF385B-204ENST00000410066 3288 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
LRRC42Q9Y546 ARFRP1-208ENST00000612256 2974 ntTSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
LRRC42Q9Y546 CALY-201ENST00000252939 2271 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
LRRC42Q9Y546 CASP9-210ENST00000546424 4463 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.12■□□□□ 0.81
LRRC42Q9Y546 CGRRF1-201ENST00000216420 2057 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
LRRC42Q9Y546 FAM102B-201ENST00000370035 5600 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
LRRC42Q9Y546 SLC39A5-209ENST00000454355 1968 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
LRRC42Q9Y546 SNX4-201ENST00000251775 2513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
LRRC42Q9Y546 HSPD1-202ENST00000388968 2455 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
LRRC42Q9Y546 REST-210ENST00000638187 1334 ntTSL 5 BASIC20.12■□□□□ 0.81
LRRC42Q9Y546 MCCD1-201ENST00000376191 955 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
LRRC42Q9Y546 KLHL21-203ENST00000463043 667 ntTSL 5 BASIC20.12■□□□□ 0.81
LRRC42Q9Y546 ENTPD6-202ENST00000360031 2766 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
LRRC42Q9Y546 GMPPA-205ENST00000373917 1630 ntTSL 5 BASIC20.12■□□□□ 0.81
LRRC42Q9Y546 PFKFB4-204ENST00000416568 1575 ntTSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
LRRC42Q9Y546 NPY4R-201ENST00000374312 1956 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
LRRC42Q9Y546 NPY4R2-201ENST00000576178 1956 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
LRRC42Q9Y546 AGTR1-209ENST00000497524 2359 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
LRRC42Q9Y546 PACRGL-201ENST00000295290 1937 ntTSL 5 BASIC20.12■□□□□ 0.81
LRRC42Q9Y546 ARHGAP22-204ENST00000417247 2340 ntTSL 2 BASIC20.11■□□□□ 0.81
LRRC42Q9Y546 LHFPL3-202ENST00000424859 1852 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
LRRC42Q9Y546 C1orf198-201ENST00000366663 3858 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
LRRC42Q9Y546 NR1H2-204ENST00000593926 1828 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC20.11■□□□□ 0.81
LRRC42Q9Y546 CCDC50-202ENST00000392456 2454 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
LRRC42Q9Y546 ARL6IP4-211ENST00000454885 1318 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
LRRC42Q9Y546 TMSB15B-201ENST00000419165 1666 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.11■□□□□ 0.81
LRRC42Q9Y546 AC093536.1-201ENST00000569153 554 ntBASIC20.11■□□□□ 0.81
LRRC42Q9Y546 AC020922.1-201ENST00000591954 3058 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.11■□□□□ 0.81
LRRC42Q9Y546 MTNR1B-201ENST00000257068 1565 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
LRRC42Q9Y546 CCDC106-207ENST00000591578 1592 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
LRRC42Q9Y546 DENND2D-202ENST00000369752 1894 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.11■□□□□ 0.81
LRRC42Q9Y546 NAT14-201ENST00000205194 1536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
LRRC42Q9Y546 SDCBP-204ENST00000447182 2103 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
LRRC42Q9Y546 WT1-205ENST00000452863 2768 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
LRRC42Q9Y546 ECHDC1-214ENST00000474289 2443 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC20.11■□□□□ 0.81
LRRC42Q9Y546 TNXA-203ENST00000507684 2038 ntBASIC20.1■□□□□ 0.81
LRRC42Q9Y546 PPP1R12B-202ENST00000356764 1687 ntTSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
LRRC42Q9Y546 CERS1-202ENST00000542296 1947 ntTSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
LRRC42Q9Y546 TANGO2-212ENST00000434570 2180 ntTSL 2 BASIC20.1■□□□□ 0.81
LRRC42Q9Y546 PARD6A-201ENST00000219255 1248 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
LRRC42Q9Y546 GPSM1-201ENST00000291775 2114 ntTSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
LRRC42Q9Y546 AC008105.2-203ENST00000591361 550 ntTSL 4 BASIC20.1■□□□□ 0.81
LRRC42Q9Y546 SKI-201ENST00000378536 5613 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
LRRC42Q9Y546 ERLEC1-203ENST00000405123 1756 ntTSL 5 BASIC20.1■□□□□ 0.81
LRRC42Q9Y546 PHLDB3-207ENST00000599242 2286 ntTSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
LRRC42Q9Y546 FBXO41-204ENST00000520530 3293 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.1■□□□□ 0.81
LRRC42Q9Y546 KLHDC2-201ENST00000298307 5514 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
LRRC42Q9Y546 RCN3-201ENST00000270645 1859 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
LRRC42Q9Y546 ST3GAL3-206ENST00000351035 2377 ntTSL 5 BASIC20.09■□□□□ 0.81
LRRC42Q9Y546 ZGPAT-206ENST00000448100 1881 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
LRRC42Q9Y546 TMEM11-201ENST00000317635 2095 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
LRRC42Q9Y546 SIGLEC15-201ENST00000389474 1573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
LRRC42Q9Y546 UROS-204ENST00000368797 1313 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
LRRC42Q9Y546 RCCD1-201ENST00000394258 2689 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
LRRC42Q9Y546 BAX-202ENST00000345358 793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 24.7 ms