Protein–RNA interactions for Protein: Q9UQ52

CNTN6, Contactin-6, humanhuman

Predictions only

Length 1,028 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CNTN6Q9UQ52 PROSER2-205ENST00000622831 1646 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
CNTN6Q9UQ52 SH2B1-204ENST00000395532 2529 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.74■■□□□ 1.23
CNTN6Q9UQ52 CCKBR-206ENST00000532715 1734 ntTSL 3 BASIC22.74■■□□□ 1.23
CNTN6Q9UQ52 NOXA1-202ENST00000392815 1464 ntTSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
CNTN6Q9UQ52 PRPSAP2-201ENST00000268835 1910 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
CNTN6Q9UQ52 NEU4-204ENST00000405370 1907 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
CNTN6Q9UQ52 PSIP1-201ENST00000380715 1966 ntTSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
CNTN6Q9UQ52 CCNL1-203ENST00000461804 1998 ntTSL 2 BASIC22.73■■□□□ 1.23
CNTN6Q9UQ52 NME4-201ENST00000219479 995 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
CNTN6Q9UQ52 JTB-203ENST00000368589 1216 ntTSL 2 BASIC22.73■■□□□ 1.23
CNTN6Q9UQ52 MOSPD3-202ENST00000379527 1016 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.73■■□□□ 1.23
CNTN6Q9UQ52 NME4-202ENST00000382940 766 ntTSL 3 BASIC22.73■■□□□ 1.23
CNTN6Q9UQ52 NT5C3AP1-201ENST00000394500 1012 ntBASIC22.73■■□□□ 1.23
CNTN6Q9UQ52 C17orf74-202ENST00000574034 1287 ntTSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
CNTN6Q9UQ52 AC127029.2-201ENST00000577329 502 ntTSL 3 BASIC22.73■■□□□ 1.23
CNTN6Q9UQ52 NME4-211ENST00000620944 1193 ntTSL 2 BASIC22.73■■□□□ 1.23
CNTN6Q9UQ52 MIR6084-201ENST00000622012 110 ntBASIC22.73■■□□□ 1.23
CNTN6Q9UQ52 CPT2-209ENST00000636935 803 ntTSL 5 BASIC22.73■■□□□ 1.23
CNTN6Q9UQ52 MFF-203ENST00000349901 1716 ntTSL 2 BASIC22.73■■□□□ 1.23
CNTN6Q9UQ52 SMPD5-201ENST00000528912 1390 ntTSL 5 BASIC22.73■■□□□ 1.23
CNTN6Q9UQ52 SPAG16-202ENST00000331683 2177 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
CNTN6Q9UQ52 LINC00969-219ENST00000453324 1439 ntTSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
CNTN6Q9UQ52 HMCES-203ENST00000417226 1490 ntTSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
CNTN6Q9UQ52 HERC2P8-204ENST00000567073 1988 ntTSL 5 BASIC22.72■■□□□ 1.23
CNTN6Q9UQ52 P4HTM-202ENST00000383729 2127 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
CNTN6Q9UQ52 IFNGR2-203ENST00000405436 1684 ntTSL 5 BASIC22.72■■□□□ 1.23
CNTN6Q9UQ52 ANO1-202ENST00000355303 4790 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
CNTN6Q9UQ52 GSX2-205ENST00000611459 1262 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
CNTN6Q9UQ52 SLC18A3-201ENST00000374115 2420 ntAPPRIS P1 BASIC22.72■■□□□ 1.23
CNTN6Q9UQ52 GPR35-204ENST00000430267 1399 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.72■■□□□ 1.23
CNTN6Q9UQ52 SYNDIG1-201ENST00000376862 2522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
CNTN6Q9UQ52 PRICKLE3-206ENST00000599218 2062 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
CNTN6Q9UQ52 RUSC1-AS1-203ENST00000450199 1636 ntTSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
CNTN6Q9UQ52 SYNGR2-201ENST00000225777 2325 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
CNTN6Q9UQ52 RAPH1-210ENST00000453034 2394 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
CNTN6Q9UQ52 SNX7-201ENST00000306121 1734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
CNTN6Q9UQ52 CDC14A-203ENST00000370124 1883 ntTSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
CNTN6Q9UQ52 CENPB-201ENST00000379751 2840 ntAPPRIS P1 BASIC22.71■■□□□ 1.23
CNTN6Q9UQ52 ZNF784-201ENST00000325351 2021 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
CNTN6Q9UQ52 AK1-201ENST00000223836 736 ntTSL 3 BASIC22.71■■□□□ 1.23
CNTN6Q9UQ52 CYC1-201ENST00000318911 1240 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
CNTN6Q9UQ52 CCDC28B-201ENST00000373602 1089 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
CNTN6Q9UQ52 EIF6-201ENST00000374436 1252 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
CNTN6Q9UQ52 ATP10A-207ENST00000619904 988 ntTSL 5 BASIC22.71■■□□□ 1.23
CNTN6Q9UQ52 PDXK-205ENST00000398081 2251 ntTSL 2 BASIC22.71■■□□□ 1.23
CNTN6Q9UQ52 ECHDC2-221ENST00000536120 1446 ntTSL 3 BASIC22.71■■□□□ 1.23
CNTN6Q9UQ52 SMPD2-201ENST00000258052 1645 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
CNTN6Q9UQ52 FAHD1-202ENST00000382668 1845 ntTSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
CNTN6Q9UQ52 HSF2BP-201ENST00000291560 1899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
CNTN6Q9UQ52 SPIRE2-202ENST00000393062 2172 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.23
CNTN6Q9UQ52 TANGO2-212ENST00000434570 2180 ntTSL 2 BASIC22.7■■□□□ 1.23
CNTN6Q9UQ52 RNPEP-201ENST00000295640 2427 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
CNTN6Q9UQ52 NMRAL1-202ENST00000404295 1233 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
CNTN6Q9UQ52 RNF114-202ENST00000622920 1284 ntTSL 5 BASIC22.7■■□□□ 1.22
CNTN6Q9UQ52 SGMS1-210ENST00000619438 1680 ntTSL 5 BASIC22.7■■□□□ 1.22
CNTN6Q9UQ52 TTYH1-203ENST00000376531 1763 ntTSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
CNTN6Q9UQ52 KLHL17-205ENST00000622660 1950 ntTSL 5 BASIC22.7■■□□□ 1.22
CNTN6Q9UQ52 PABPC1L2A-201ENST00000373519 2237 ntAPPRIS P1 BASIC22.7■■□□□ 1.22
CNTN6Q9UQ52 LCK-214ENST00000619559 2099 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
CNTN6Q9UQ52 RASL12-202ENST00000421977 1523 ntTSL 2 BASIC22.69■■□□□ 1.22
CNTN6Q9UQ52 LINC01089-202ENST00000429892 1521 ntTSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
CNTN6Q9UQ52 RPL8-201ENST00000262584 1041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
CNTN6Q9UQ52 LBX2-202ENST00000377566 1186 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
CNTN6Q9UQ52 AC092675.2-201ENST00000413274 541 ntTSL 4 BASIC22.69■■□□□ 1.22
CNTN6Q9UQ52 PRMT1-221ENST00000610806 1192 ntTSL 3 BASIC22.69■■□□□ 1.22
CNTN6Q9UQ52 MPPED1-203ENST00000443721 2507 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.69■■□□□ 1.22
CNTN6Q9UQ52 NPAS3-201ENST00000346562 5847 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
CNTN6Q9UQ52 SPOP-206ENST00000504102 1865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
CNTN6Q9UQ52 PAQR6-212ENST00000540423 1729 ntTSL 3 BASIC22.68■■□□□ 1.22
CNTN6Q9UQ52 COMMD5-207ENST00000543949 1571 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.68■■□□□ 1.22
CNTN6Q9UQ52 DCTN3-202ENST00000341694 899 ntTSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
CNTN6Q9UQ52 DCTN3-205ENST00000378916 773 ntTSL 2 BASIC22.68■■□□□ 1.22
CNTN6Q9UQ52 AL390816.2-201ENST00000554252 737 ntTSL 3 BASIC22.68■■□□□ 1.22
CNTN6Q9UQ52 RYK-208ENST00000620660 2942 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
CNTN6Q9UQ52 PUF60-203ENST00000453551 1842 ntTSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
CNTN6Q9UQ52 ILDR2-206ENST00000528703 2446 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.68■■□□□ 1.22
CNTN6Q9UQ52 PXYLP1-203ENST00000502783 2066 ntTSL 2 BASIC22.67■■□□□ 1.22
CNTN6Q9UQ52 AP004608.1-201ENST00000531319 1402 ntTSL 2 BASIC22.67■■□□□ 1.22
CNTN6Q9UQ52 RASD1-202ENST00000579152 1404 ntTSL 2 BASIC22.67■■□□□ 1.22
CNTN6Q9UQ52 AC135048.1-201ENST00000566056 1318 ntTSL 2 BASIC22.67■■□□□ 1.22
CNTN6Q9UQ52 ILKAP-211ENST00000612675 1335 ntTSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
CNTN6Q9UQ52 PHLDA3-201ENST00000367309 896 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.67■■□□□ 1.22
CNTN6Q9UQ52 RPUSD3-206ENST00000433535 1178 ntTSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
CNTN6Q9UQ52 WRNIP1-204ENST00000380773 2670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
CNTN6Q9UQ52 PEX5-204ENST00000412720 2105 ntTSL 2 BASIC22.67■■□□□ 1.22
CNTN6Q9UQ52 TMEM200B-202ENST00000521452 2501 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
CNTN6Q9UQ52 SLC2A11-202ENST00000316185 1555 ntTSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
CNTN6Q9UQ52 TSPAN17-207ENST00000508164 2457 ntTSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
CNTN6Q9UQ52 TFG-201ENST00000240851 1978 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
CNTN6Q9UQ52 POFUT1-201ENST00000375730 1507 ntTSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
CNTN6Q9UQ52 HLA-C-201ENST00000376228 1536 ntAPPRIS P2 BASIC22.67■■□□□ 1.22
CNTN6Q9UQ52 LOXL1-201ENST00000261921 2351 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
CNTN6Q9UQ52 MPST-205ENST00000404802 1453 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.66■■□□□ 1.22
CNTN6Q9UQ52 PPP1R3F-203ENST00000466508 1885 ntTSL 2 BASIC22.66■■□□□ 1.22
CNTN6Q9UQ52 ARHGEF25-201ENST00000286494 2552 ntTSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
CNTN6Q9UQ52 NR2F2-204ENST00000453270 1712 ntTSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
CNTN6Q9UQ52 KCNH6-203ENST00000580652 1703 ntTSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
CNTN6Q9UQ52 TTYH1-201ENST00000301194 2088 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
CNTN6Q9UQ52 CDIPT-201ENST00000219789 2353 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
CNTN6Q9UQ52 FAM83D-202ENST00000619850 2361 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 28.2 ms