Protein–RNA interactions for Protein: Q9UHB7

AFF4, AF4/FMR2 family member 4, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 1,163 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
AFF4Q9UHB7 HTATIP2-208ENST00000532505 595 ntTSL 2 BASIC22.54■■□□□ 1.2
AFF4Q9UHB7 WT1-AS_3.1-201ENST00000613262 234 ntBASIC22.54■■□□□ 1.2
AFF4Q9UHB7 PARP1-210ENST00000629232 477 ntTSL 5 BASIC22.54■■□□□ 1.2
AFF4Q9UHB7 COMT-203ENST00000403184 2217 ntTSL 2 BASIC22.54■■□□□ 1.2
AFF4Q9UHB7 ARMC10-204ENST00000425331 2443 ntTSL 2 BASIC22.53■■□□□ 1.2
AFF4Q9UHB7 ARHGAP27-201ENST00000290470 1376 ntTSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
AFF4Q9UHB7 CSNK1G3-206ENST00000511130 1356 ntTSL 2 BASIC22.53■■□□□ 1.2
AFF4Q9UHB7 KPTN-201ENST00000338134 1691 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
AFF4Q9UHB7 SOCS7-202ENST00000613678 1827 ntTSL 5 BASIC22.53■■□□□ 1.2
AFF4Q9UHB7 TOP1MT-201ENST00000329245 1958 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
AFF4Q9UHB7 FAM207A-201ENST00000291634 927 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
AFF4Q9UHB7 NDUFS3-207ENST00000529276 558 ntTSL 2 BASIC22.53■■□□□ 1.2
AFF4Q9UHB7 AL050303.2-201ENST00000619798 666 ntBASIC22.53■■□□□ 1.2
AFF4Q9UHB7 TLE3-216ENST00000559191 1575 ntTSL 5 BASIC22.53■■□□□ 1.2
AFF4Q9UHB7 MRPL37-206ENST00000605337 1582 ntTSL 5 BASIC22.53■■□□□ 1.2
AFF4Q9UHB7 KREMEN2-203ENST00000571007 1877 ntTSL 2 BASIC22.53■■□□□ 1.2
AFF4Q9UHB7 FBXW4-201ENST00000331272 2483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
AFF4Q9UHB7 CREB3L3-202ENST00000595923 1491 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
AFF4Q9UHB7 IKBKG-212ENST00000617207 1949 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC22.53■■□□□ 1.2
AFF4Q9UHB7 C11orf63-201ENST00000227349 3147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
AFF4Q9UHB7 KCNT1-201ENST00000263604 5245 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.53■■□□□ 1.2
AFF4Q9UHB7 MFSD3-201ENST00000301327 1548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.2
AFF4Q9UHB7 TOR2A-201ENST00000336067 1370 ntTSL 2 BASIC22.52■■□□□ 1.2
AFF4Q9UHB7 SDK1-201ENST00000389531 7606 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.52■■□□□ 1.2
AFF4Q9UHB7 CCM2L-201ENST00000262659 2523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.2
AFF4Q9UHB7 DTYMK-201ENST00000305784 1232 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.2
AFF4Q9UHB7 ARL6IP4-205ENST00000412505 818 ntTSL 5 BASIC22.52■■□□□ 1.2
AFF4Q9UHB7 SLC7A5P1-201ENST00000568957 537 ntBASIC22.52■■□□□ 1.2
AFF4Q9UHB7 MFSD14C-203ENST00000602917 786 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.2
AFF4Q9UHB7 AC005181.1-201ENST00000604782 1256 ntBASIC22.52■■□□□ 1.2
AFF4Q9UHB7 ARL6IP4-204ENST00000392435 1339 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.2
AFF4Q9UHB7 KCNH6-203ENST00000580652 1703 ntTSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
AFF4Q9UHB7 AUTS2-203ENST00000406775 5950 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
AFF4Q9UHB7 CYB5R4-201ENST00000369679 768 ntTSL 3 BASIC22.51■■□□□ 1.19
AFF4Q9UHB7 HAGH-201ENST00000397353 1257 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.51■■□□□ 1.19
AFF4Q9UHB7 TRNT1-207ENST00000420393 854 ntTSL 3 BASIC22.51■■□□□ 1.19
AFF4Q9UHB7 AL121832.2-201ENST00000610979 668 ntBASIC22.51■■□□□ 1.19
AFF4Q9UHB7 AC010536.3-201ENST00000620306 533 ntBASIC22.51■■□□□ 1.19
AFF4Q9UHB7 CD99-212ENST00000624481 1089 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.51■■□□□ 1.19
AFF4Q9UHB7 FRMD8-203ENST00000416776 1818 ntTSL 2 BASIC22.51■■□□□ 1.19
AFF4Q9UHB7 SLC19A1-209ENST00000485649 1896 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.51■■□□□ 1.19
AFF4Q9UHB7 GADD45GIP1-201ENST00000316939 1782 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
AFF4Q9UHB7 P3H3-201ENST00000290510 2632 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
AFF4Q9UHB7 DPH7-201ENST00000277540 1847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
AFF4Q9UHB7 RUSC1-AS1-203ENST00000450199 1636 ntTSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
AFF4Q9UHB7 ERF-201ENST00000222329 2698 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
AFF4Q9UHB7 SNF8-202ENST00000502492 2319 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
AFF4Q9UHB7 NAA20-201ENST00000310450 920 ntTSL 2 BASIC22.5■■□□□ 1.19
AFF4Q9UHB7 AL355802.2-201ENST00000402069 882 ntBASIC22.5■■□□□ 1.19
AFF4Q9UHB7 CNN2P6-201ENST00000439038 900 ntBASIC22.5■■□□□ 1.19
AFF4Q9UHB7 LINC01117-201ENST00000443670 699 ntTSL 5 BASIC22.5■■□□□ 1.19
AFF4Q9UHB7 BTBD2-201ENST00000255608 2649 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
AFF4Q9UHB7 TMEM198B-205ENST00000487582 1581 ntTSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
AFF4Q9UHB7 TMEM51-203ENST00000400796 1842 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
AFF4Q9UHB7 CRHR1-202ENST00000314537 2535 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
AFF4Q9UHB7 KCNS1-202ENST00000537075 2136 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
AFF4Q9UHB7 PREB-201ENST00000260643 2166 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
AFF4Q9UHB7 CASTOR1-201ENST00000404953 1460 ntTSL 5 BASIC22.49■■□□□ 1.19
AFF4Q9UHB7 EXOSC6-201ENST00000435634 5153 ntAPPRIS P1 BASIC22.49■■□□□ 1.19
AFF4Q9UHB7 GGA2-211ENST00000567468 1713 ntTSL 2 BASIC22.49■■□□□ 1.19
AFF4Q9UHB7 AC092490.1-203ENST00000514568 1972 ntTSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
AFF4Q9UHB7 ASAP2-201ENST00000281419 5712 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
AFF4Q9UHB7 TANGO2-202ENST00000398042 2011 ntTSL 2 BASIC22.49■■□□□ 1.19
AFF4Q9UHB7 COL19A1-203ENST00000478620 589 ntTSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
AFF4Q9UHB7 BEX2-204ENST00000536889 1077 ntTSL 2 BASIC22.49■■□□□ 1.19
AFF4Q9UHB7 AC005410.1-201ENST00000579522 462 ntTSL 3 BASIC22.49■■□□□ 1.19
AFF4Q9UHB7 SCN1B-203ENST00000595652 814 ntTSL 2 BASIC22.49■■□□□ 1.19
AFF4Q9UHB7 IRX5-201ENST00000320990 2061 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
AFF4Q9UHB7 HAUS4-201ENST00000206474 1642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
AFF4Q9UHB7 TYMP-202ENST00000395678 1614 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
AFF4Q9UHB7 HYAL2-207ENST00000442581 2318 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.48■■□□□ 1.19
AFF4Q9UHB7 GPR137-201ENST00000313074 1485 ntTSL 5 BASIC22.48■■□□□ 1.19
AFF4Q9UHB7 AVPI1-201ENST00000370626 1457 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
AFF4Q9UHB7 GPR137-203ENST00000411458 1495 ntTSL 2 BASIC22.48■■□□□ 1.19
AFF4Q9UHB7 ZNF395-210ENST00000523095 1790 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
AFF4Q9UHB7 SEPT5-210ENST00000455784 2070 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
AFF4Q9UHB7 AP006623.1-201ENST00000506172 2061 ntTSL 5 BASIC22.48■■□□□ 1.19
AFF4Q9UHB7 CBWD6-213ENST00000613716 1820 ntTSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
AFF4Q9UHB7 PTPRM-211ENST00000580170 5941 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
AFF4Q9UHB7 INTS11-205ENST00000429572 1104 ntTSL 2 BASIC22.48■■□□□ 1.19
AFF4Q9UHB7 AC083906.2-201ENST00000511578 360 ntBASIC22.48■■□□□ 1.19
AFF4Q9UHB7 F2RL3-202ENST00000599210 613 ntTSL 2 BASIC22.48■■□□□ 1.19
AFF4Q9UHB7 FP565260.3-201ENST00000612610 1162 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
AFF4Q9UHB7 KCTD8-201ENST00000360029 2587 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
AFF4Q9UHB7 TANGO2-201ENST00000327374 2273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
AFF4Q9UHB7 FHL3-201ENST00000373016 1647 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
AFF4Q9UHB7 TUB-201ENST00000299506 2019 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
AFF4Q9UHB7 KDM3B-201ENST00000314358 6813 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
AFF4Q9UHB7 CDKN1C-202ENST00000414822 2051 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
AFF4Q9UHB7 NEURL4-201ENST00000315614 5182 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
AFF4Q9UHB7 ATP5A1-220ENST00000593152 2258 ntTSL 2 BASIC22.47■■□□□ 1.19
AFF4Q9UHB7 C14orf80-201ENST00000329886 1947 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
AFF4Q9UHB7 AP005205.2-201ENST00000577327 491 ntTSL 2 BASIC22.47■■□□□ 1.19
AFF4Q9UHB7 AC027307.1-201ENST00000590252 457 ntTSL 5 BASIC22.47■■□□□ 1.19
AFF4Q9UHB7 HOXA10-206ENST00000613671 2175 ntTSL 5 BASIC22.47■■□□□ 1.19
AFF4Q9UHB7 KRT7-201ENST00000331817 1754 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
AFF4Q9UHB7 RILPL1-205ENST00000636882 2258 ntTSL 5 BASIC22.47■■□□□ 1.19
AFF4Q9UHB7 OSR2-210ENST00000523368 1519 ntTSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
AFF4Q9UHB7 SLC39A14-202ENST00000289952 2137 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.46■■□□□ 1.19
AFF4Q9UHB7 ASPSCR1-201ENST00000306729 2123 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.46■■□□□ 1.19
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 17.7 ms