Protein–RNA interactions for Protein: Q99856

ARID3A, AT-rich interactive domain-containing protein 3A, humanhuman

Predictions only

Length 593 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ARID3AQ99856 AL353743.1-201ENST00000637846 1769 ntTSL 5 BASIC23.99■■□□□ 1.43
ARID3AQ99856 MVD-201ENST00000301012 1823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.99■■□□□ 1.43
ARID3AQ99856 NAE1-202ENST00000359087 1825 ntTSL 2 BASIC23.99■■□□□ 1.43
ARID3AQ99856 FAM136A-201ENST00000037869 1810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.99■■□□□ 1.43
ARID3AQ99856 AC073934.1-201ENST00000490314 495 ntTSL 4 BASIC23.99■■□□□ 1.43
ARID3AQ99856 PRELID1-203ENST00000503216 1171 ntTSL 1 (best) BASIC23.99■■□□□ 1.43
ARID3AQ99856 LINC01881-206ENST00000614114 957 ntTSL 2 BASIC23.99■■□□□ 1.43
ARID3AQ99856 SOX11-201ENST00000322002 8719 ntAPPRIS P1 BASIC23.99■■□□□ 1.43
ARID3AQ99856 NANOS2-201ENST00000341294 1657 ntAPPRIS P1 BASIC23.99■■□□□ 1.43
ARID3AQ99856 BX088645.1-201ENST00000636699 1728 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.98■■□□□ 1.43
ARID3AQ99856 ANKRD24-201ENST00000262970 3711 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.98■■□□□ 1.43
ARID3AQ99856 EMC9-201ENST00000216799 835 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.98■■□□□ 1.43
ARID3AQ99856 SURF2-201ENST00000371964 842 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.98■■□□□ 1.43
ARID3AQ99856 ZNF419-210ENST00000520540 568 ntTSL 4 BASIC23.98■■□□□ 1.43
ARID3AQ99856 SESN3-202ENST00000416495 1408 ntTSL 1 (best) BASIC23.98■■□□□ 1.43
ARID3AQ99856 EGR3-203ENST00000519492 1500 ntTSL 5 BASIC23.98■■□□□ 1.43
ARID3AQ99856 SPAST-203ENST00000615843 5212 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.98■■□□□ 1.43
ARID3AQ99856 UPF1-207ENST00000599848 5311 ntTSL 1 (best) BASIC23.97■■□□□ 1.43
ARID3AQ99856 UBE2QL1-201ENST00000399816 4317 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.97■■□□□ 1.43
ARID3AQ99856 MARK1-205ENST00000611084 5321 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.97■■□□□ 1.43
ARID3AQ99856 ANKRD9-201ENST00000286918 6727 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.97■■□□□ 1.43
ARID3AQ99856 SUMF1-202ENST00000383843 1447 ntTSL 2 BASIC23.97■■□□□ 1.43
ARID3AQ99856 BAD-203ENST00000394532 1157 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.97■■□□□ 1.43
ARID3AQ99856 HOMER3-203ENST00000433218 1418 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC23.97■■□□□ 1.43
ARID3AQ99856 RCE1-202ENST00000524506 1379 ntTSL 5 BASIC23.97■■□□□ 1.43
ARID3AQ99856 AL445237.1-202ENST00000604581 425 ntTSL 5 BASIC23.97■■□□□ 1.43
ARID3AQ99856 FAM228B-208ENST00000613899 1238 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.97■■□□□ 1.43
ARID3AQ99856 HCN1-202ENST00000634658 4738 ntTSL 3 BASIC23.97■■□□□ 1.43
ARID3AQ99856 ASPHD2-201ENST00000215906 3357 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.97■■□□□ 1.43
ARID3AQ99856 LPCAT4-201ENST00000314891 2262 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.96■■□□□ 1.43
ARID3AQ99856 DLL3-202ENST00000356433 2055 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.96■■□□□ 1.43
ARID3AQ99856 GPR137B-202ENST00000366592 2042 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.96■■□□□ 1.43
ARID3AQ99856 SLC25A5-AS1-202ENST00000445759 1616 ntTSL 1 (best) BASIC23.96■■□□□ 1.43
ARID3AQ99856 VGF-203ENST00000611537 1622 ntTSL 5 BASIC23.96■■□□□ 1.43
ARID3AQ99856 HDHD5-203ENST00000399852 1118 ntTSL 3 BASIC23.96■■□□□ 1.43
ARID3AQ99856 AGPAT5-201ENST00000285518 3685 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.96■■□□□ 1.43
ARID3AQ99856 PRMT5-201ENST00000216350 2271 ntTSL 2 BASIC23.96■■□□□ 1.43
ARID3AQ99856 CBFA2T2-201ENST00000342704 2864 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.96■■□□□ 1.43
ARID3AQ99856 TJP1-208ENST00000495972 2890 ntTSL 1 (best) BASIC23.96■■□□□ 1.43
ARID3AQ99856 AC242852.2-201ENST00000615738 1807 ntBASIC23.96■■□□□ 1.43
ARID3AQ99856 FAM53B-201ENST00000280780 1568 ntTSL 1 (best) BASIC23.95■■□□□ 1.43
ARID3AQ99856 ZNRF1-202ENST00000335325 4620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.95■■□□□ 1.43
ARID3AQ99856 PNRC1-201ENST00000336032 2065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.95■■□□□ 1.42
ARID3AQ99856 UBE2H-201ENST00000355621 5151 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.95■■□□□ 1.42
ARID3AQ99856 PACRGL-201ENST00000295290 1937 ntTSL 5 BASIC23.95■■□□□ 1.42
ARID3AQ99856 TNFRSF6B-201ENST00000369996 1124 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.95■■□□□ 1.42
ARID3AQ99856 NIPSNAP2-205ENST00000446778 1882 ntTSL 2 BASIC23.95■■□□□ 1.42
ARID3AQ99856 NECTIN1-201ENST00000264025 5840 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.95■■□□□ 1.42
ARID3AQ99856 HOXA11-201ENST00000006015 2295 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.95■■□□□ 1.42
ARID3AQ99856 ARL6IP4-201ENST00000315580 1644 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.95■■□□□ 1.42
ARID3AQ99856 NRG2-202ENST00000289422 2923 ntTSL 5 BASIC23.94■■□□□ 1.42
ARID3AQ99856 SIMC1-204ENST00000430704 1925 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC23.94■■□□□ 1.42
ARID3AQ99856 RIMBP3-201ENST00000619918 6105 ntAPPRIS P1 BASIC23.94■■□□□ 1.42
ARID3AQ99856 METTL21A-210ENST00000458426 1366 ntTSL 1 (best) BASIC23.94■■□□□ 1.42
ARID3AQ99856 PUF60-203ENST00000453551 1842 ntTSL 1 (best) BASIC23.94■■□□□ 1.42
ARID3AQ99856 CRMP1-201ENST00000324989 3146 ntTSL 1 (best) BASIC23.94■■□□□ 1.42
ARID3AQ99856 FUS-210ENST00000568685 1785 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.94■■□□□ 1.42
ARID3AQ99856 SYNGR3-202ENST00000562045 1743 ntTSL 2 BASIC23.94■■□□□ 1.42
ARID3AQ99856 LINC01529-204ENST00000636474 1715 ntBASIC23.94■■□□□ 1.42
ARID3AQ99856 SOX3-201ENST00000370536 2132 ntAPPRIS P1 BASIC23.94■■□□□ 1.42
ARID3AQ99856 AC105935.1-201ENST00000424174 422 ntTSL 3 BASIC23.94■■□□□ 1.42
ARID3AQ99856 FAM3C-201ENST00000359943 2508 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.94■■□□□ 1.42
ARID3AQ99856 SEC61A2-205ENST00000379033 2462 ntTSL 2 BASIC23.94■■□□□ 1.42
ARID3AQ99856 TBXA2R-201ENST00000375190 2608 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.94■■□□□ 1.42
ARID3AQ99856 PRSS29P-202ENST00000568091 1864 ntTSL 5 BASIC23.94■■□□□ 1.42
ARID3AQ99856 MYH7B-201ENST00000262873 6293 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.94■■□□□ 1.42
ARID3AQ99856 TBL1Y-201ENST00000346432 2312 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.93■■□□□ 1.42
ARID3AQ99856 CTAG1B-202ENST00000359887 998 ntTSL 2 BASIC23.93■■□□□ 1.42
ARID3AQ99856 TMC6-218ENST00000591436 1155 ntTSL 1 (best) BASIC23.93■■□□□ 1.42
ARID3AQ99856 MIR663AHG-233ENST00000609248 830 ntTSL 5 BASIC23.93■■□□□ 1.42
ARID3AQ99856 LY6H-205ENST00000615409 980 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.93■■□□□ 1.42
ARID3AQ99856 RHOBTB2-201ENST00000251822 5451 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.93■■□□□ 1.42
ARID3AQ99856 CNTFR-202ENST00000378980 2052 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.93■■□□□ 1.42
ARID3AQ99856 LINC00094-201ENST00000432807 2300 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.93■■□□□ 1.42
ARID3AQ99856 DCAF4-202ENST00000358377 2024 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.93■■□□□ 1.42
ARID3AQ99856 PCP4L1-201ENST00000504449 1424 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.93■■□□□ 1.42
ARID3AQ99856 JAGN1-201ENST00000307768 1693 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.92■■□□□ 1.42
ARID3AQ99856 SAMD10-201ENST00000369886 2181 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.92■■□□□ 1.42
ARID3AQ99856 HNRNPAB-201ENST00000355836 1602 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.92■■□□□ 1.42
ARID3AQ99856 LYSMD4-210ENST00000545021 2431 ntTSL 4 BASIC23.92■■□□□ 1.42
ARID3AQ99856 PTPN12-201ENST00000248594 3406 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.92■■□□□ 1.42
ARID3AQ99856 PKIB-204ENST00000368448 1561 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.92■■□□□ 1.42
ARID3AQ99856 NFKBID-201ENST00000396901 1834 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.92■■□□□ 1.42
ARID3AQ99856 AC011498.4-201ENST00000586020 1803 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.92■■□□□ 1.42
ARID3AQ99856 NFKBID-211ENST00000641389 1834 ntAPPRIS ALT2 BASIC23.92■■□□□ 1.42
ARID3AQ99856 RASSF5-202ENST00000579436 2064 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.92■■□□□ 1.42
ARID3AQ99856 NAB2-202ENST00000342556 2318 ntTSL 5 BASIC23.92■■□□□ 1.42
ARID3AQ99856 BACE2-201ENST00000328735 2824 ntTSL 1 (best) BASIC23.92■■□□□ 1.42
ARID3AQ99856 CLPSL2-202ENST00000403376 405 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.92■■□□□ 1.42
ARID3AQ99856 MAST4-206ENST00000406374 1066 ntTSL 1 (best) BASIC23.92■■□□□ 1.42
ARID3AQ99856 PLEKHJ1-213ENST00000591099 1092 ntTSL 2 BASIC23.92■■□□□ 1.42
ARID3AQ99856 HOXA11-AS1_1.1-201ENST00000613939 98 ntBASIC23.92■■□□□ 1.42
ARID3AQ99856 SHISA9-205ENST00000639941 1135 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.92■■□□□ 1.42
ARID3AQ99856 GATM-206ENST00000558336 1522 ntTSL 2 BASIC23.92■■□□□ 1.42
ARID3AQ99856 EFCAB1-202ENST00000433756 2286 ntTSL 2 BASIC23.92■■□□□ 1.42
ARID3AQ99856 ADGRA3-204ENST00000502482 2870 ntTSL 1 (best) BASIC23.92■■□□□ 1.42
ARID3AQ99856 PPAN-201ENST00000253107 1657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.92■■□□□ 1.42
ARID3AQ99856 POLD2-207ENST00000452185 1659 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.92■■□□□ 1.42
ARID3AQ99856 BLOC1S4-201ENST00000320776 1617 ntAPPRIS P1 BASIC23.92■■□□□ 1.42
ARID3AQ99856 ARRDC2-201ENST00000222250 2503 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.91■■□□□ 1.42
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 23.4 ms