Protein–RNA interactions for Protein: Q96SD1

DCLRE1C, Protein artemis, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 692 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
DCLRE1CQ96SD1 SPHK1-202ENST00000392496 1779 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.16■□□□□ 0.66
DCLRE1CQ96SD1 ANO8-201ENST00000159087 4152 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.16■□□□□ 0.66
DCLRE1CQ96SD1 UCHL5-205ENST00000367454 1815 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC19.16■□□□□ 0.66
DCLRE1CQ96SD1 CACNA1B-201ENST00000277549 7158 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.16■□□□□ 0.66
DCLRE1CQ96SD1 CACNA1B-202ENST00000277551 7158 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.16■□□□□ 0.66
DCLRE1CQ96SD1 TMEM161A-202ENST00000450333 1930 ntTSL 2 BASIC19.15■□□□□ 0.66
DCLRE1CQ96SD1 PRMT8-202ENST00000382622 2366 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.15■□□□□ 0.66
DCLRE1CQ96SD1 ZNF668-207ENST00000535577 2396 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.15■□□□□ 0.66
DCLRE1CQ96SD1 ZNF282-204ENST00000610704 3722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.15■□□□□ 0.66
DCLRE1CQ96SD1 SLC35A3-208ENST00000638336 2438 ntTSL 1 (best) BASIC19.15■□□□□ 0.66
DCLRE1CQ96SD1 SDC3-202ENST00000339394 1580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.15■□□□□ 0.66
DCLRE1CQ96SD1 ME2-202ENST00000382927 2492 ntTSL 1 (best) BASIC19.15■□□□□ 0.66
DCLRE1CQ96SD1 NKX1-2-201ENST00000451024 3364 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.15■□□□□ 0.66
DCLRE1CQ96SD1 SPPL2B-212ENST00000618220 2459 ntTSL 1 (best) BASIC19.15■□□□□ 0.66
DCLRE1CQ96SD1 KANK3-203ENST00000593649 2672 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.15■□□□□ 0.66
DCLRE1CQ96SD1 SPAST-204ENST00000621856 1715 ntTSL 1 (best) BASIC19.15■□□□□ 0.66
DCLRE1CQ96SD1 SEPT5-209ENST00000438754 2241 ntTSL 2 BASIC19.15■□□□□ 0.66
DCLRE1CQ96SD1 C11orf91-201ENST00000379011 811 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.15■□□□□ 0.66
DCLRE1CQ96SD1 HM13-AS1-201ENST00000412178 489 ntTSL 3 BASIC19.15■□□□□ 0.66
DCLRE1CQ96SD1 NKX2-5-202ENST00000424406 1124 ntTSL 1 (best) BASIC19.15■□□□□ 0.66
DCLRE1CQ96SD1 MIR4466-201ENST00000606121 54 ntBASIC19.15■□□□□ 0.66
DCLRE1CQ96SD1 AL138724.1-201ENST00000606771 1088 ntBASIC19.15■□□□□ 0.66
DCLRE1CQ96SD1 HOXA11-AS1_1.1-201ENST00000613939 98 ntBASIC19.15■□□□□ 0.66
DCLRE1CQ96SD1 GRAMD1B-217ENST00000640939 1212 ntTSL 5 BASIC19.15■□□□□ 0.66
DCLRE1CQ96SD1 CASP9-203ENST00000375890 1351 ntTSL 2 BASIC19.15■□□□□ 0.66
DCLRE1CQ96SD1 HS3ST3A1-201ENST00000284110 2527 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.15■□□□□ 0.66
DCLRE1CQ96SD1 NR2F1-AS1-210ENST00000606739 1431 ntTSL 2 BASIC19.15■□□□□ 0.66
DCLRE1CQ96SD1 FMR1-201ENST00000218200 4333 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.15■□□□□ 0.66
DCLRE1CQ96SD1 NRXN2-203ENST00000377551 6373 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.15■□□□□ 0.66
DCLRE1CQ96SD1 HAGHL-212ENST00000564537 1667 ntTSL 2 BASIC19.14■□□□□ 0.66
DCLRE1CQ96SD1 SCAND1-202ENST00000373991 1727 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.14■□□□□ 0.66
DCLRE1CQ96SD1 CNTD2-202ENST00000430325 1817 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC19.14■□□□□ 0.65
DCLRE1CQ96SD1 CERS4-205ENST00000558331 1803 ntTSL 5 BASIC19.14■□□□□ 0.65
DCLRE1CQ96SD1 SPATA5L1-201ENST00000305560 2570 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.14■□□□□ 0.65
DCLRE1CQ96SD1 HPS6-201ENST00000299238 2649 ntAPPRIS P1 BASIC19.14■□□□□ 0.65
DCLRE1CQ96SD1 AC006455.2-201ENST00000429931 906 ntBASIC19.14■□□□□ 0.65
DCLRE1CQ96SD1 WDR86-AS1-204ENST00000489632 751 ntTSL 3 BASIC19.14■□□□□ 0.65
DCLRE1CQ96SD1 SUMF1-202ENST00000383843 1447 ntTSL 2 BASIC19.14■□□□□ 0.65
DCLRE1CQ96SD1 SYT7-201ENST00000263846 4854 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.14■□□□□ 0.65
DCLRE1CQ96SD1 ZNF37BP-201ENST00000435805 1695 ntTSL 5 BASIC19.14■□□□□ 0.65
DCLRE1CQ96SD1 ACAA1-202ENST00000333167 1785 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.14■□□□□ 0.65
DCLRE1CQ96SD1 FNDC10-201ENST00000422725 2085 ntAPPRIS P1 BASIC19.13■□□□□ 0.65
DCLRE1CQ96SD1 RASGRP2-207ENST00000377497 2221 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.13■□□□□ 0.65
DCLRE1CQ96SD1 HOMER3-203ENST00000433218 1418 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC19.13■□□□□ 0.65
DCLRE1CQ96SD1 ARHGEF7-202ENST00000317133 4361 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.13■□□□□ 0.65
DCLRE1CQ96SD1 AC133637.1-201ENST00000624115 1537 ntBASIC19.13■□□□□ 0.65
DCLRE1CQ96SD1 NKIRAS2-204ENST00000393880 1644 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.13■□□□□ 0.65
DCLRE1CQ96SD1 AC004687.1-201ENST00000579003 1625 ntBASIC19.13■□□□□ 0.65
DCLRE1CQ96SD1 CHN1-203ENST00000409156 1761 ntTSL 2 BASIC19.13■□□□□ 0.65
DCLRE1CQ96SD1 COL15A1-205ENST00000610452 5422 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.13■□□□□ 0.65
DCLRE1CQ96SD1 DTNBP1-201ENST00000338950 1880 ntTSL 1 (best) BASIC19.13■□□□□ 0.65
DCLRE1CQ96SD1 DMRT2-203ENST00000358146 1965 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.13■□□□□ 0.65
DCLRE1CQ96SD1 RAB1B-201ENST00000311481 2007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.13■□□□□ 0.65
DCLRE1CQ96SD1 TMEM206-205ENST00000535273 2119 ntTSL 2 BASIC19.13■□□□□ 0.65
DCLRE1CQ96SD1 KCNMA1-209ENST00000372443 5059 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.13■□□□□ 0.65
DCLRE1CQ96SD1 ZFYVE9-201ENST00000287727 5194 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC19.13■□□□□ 0.65
DCLRE1CQ96SD1 PLEKHH3-201ENST00000293349 2987 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC19.12■□□□□ 0.65
DCLRE1CQ96SD1 AC090360.1-201ENST00000569722 2218 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.12■□□□□ 0.65
DCLRE1CQ96SD1 DOC2A-218ENST00000616445 2065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.12■□□□□ 0.65
DCLRE1CQ96SD1 RBBP7-202ENST00000380084 2036 ntTSL 2 BASIC19.12■□□□□ 0.65
DCLRE1CQ96SD1 PMPCA-203ENST00000399219 1987 ntTSL 2 BASIC19.12■□□□□ 0.65
DCLRE1CQ96SD1 GRTP1-202ENST00000375430 1834 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.12■□□□□ 0.65
DCLRE1CQ96SD1 POLD2-218ENST00000610533 1619 ntTSL 1 (best) BASIC19.12■□□□□ 0.65
DCLRE1CQ96SD1 STK19-202ENST00000375333 1557 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.12■□□□□ 0.65
DCLRE1CQ96SD1 TBX1-203ENST00000359500 1538 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.12■□□□□ 0.65
DCLRE1CQ96SD1 ACYP2-202ENST00000394666 993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.12■□□□□ 0.65
DCLRE1CQ96SD1 KRTAP5-4-201ENST00000399682 1181 ntAPPRIS P5 BASIC19.12■□□□□ 0.65
DCLRE1CQ96SD1 AC007009.1-201ENST00000458624 429 ntTSL 2 BASIC19.12■□□□□ 0.65
DCLRE1CQ96SD1 CDKN3-207ENST00000543789 610 ntTSL 5 BASIC19.12■□□□□ 0.65
DCLRE1CQ96SD1 SF1-220ENST00000626028 704 ntTSL 2 BASIC19.12■□□□□ 0.65
DCLRE1CQ96SD1 SHISA9-205ENST00000639941 1135 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.12■□□□□ 0.65
DCLRE1CQ96SD1 SLC22A17-202ENST00000354772 2238 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.12■□□□□ 0.65
DCLRE1CQ96SD1 C7orf26-201ENST00000344417 2182 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.12■□□□□ 0.65
DCLRE1CQ96SD1 PRICKLE3-206ENST00000599218 2062 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.12■□□□□ 0.65
DCLRE1CQ96SD1 LTBP3-201ENST00000301873 4443 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.11■□□□□ 0.65
DCLRE1CQ96SD1 FUBP3-201ENST00000319725 3124 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.11■□□□□ 0.65
DCLRE1CQ96SD1 SOX18-201ENST00000340356 1864 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.11■□□□□ 0.65
DCLRE1CQ96SD1 TPTEP1-205ENST00000558085 1738 ntTSL 2 BASIC19.11■□□□□ 0.65
DCLRE1CQ96SD1 B3GALT4-204ENST00000451237 1694 ntAPPRIS P1 BASIC19.11■□□□□ 0.65
DCLRE1CQ96SD1 MRPS2-202ENST00000371785 1640 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC19.11■□□□□ 0.65
DCLRE1CQ96SD1 SNX21-212ENST00000491381 1607 ntTSL 1 (best) BASIC19.11■□□□□ 0.65
DCLRE1CQ96SD1 PLPP1-201ENST00000264775 1550 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC19.11■□□□□ 0.65
DCLRE1CQ96SD1 MESP2-201ENST00000341735 1552 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.11■□□□□ 0.65
DCLRE1CQ96SD1 SYT6-210ENST00000641643 1587 ntBASIC19.11■□□□□ 0.65
DCLRE1CQ96SD1 AQP6-201ENST00000315520 1398 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.11■□□□□ 0.65
DCLRE1CQ96SD1 UNKL-205ENST00000397464 2180 ntTSL 2 BASIC19.11■□□□□ 0.65
DCLRE1CQ96SD1 C16orf95-201ENST00000253461 953 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.11■□□□□ 0.65
DCLRE1CQ96SD1 SLC46A3-202ENST00000380814 2121 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC19.11■□□□□ 0.65
DCLRE1CQ96SD1 VAMP2-204ENST00000488857 874 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC19.11■□□□□ 0.65
DCLRE1CQ96SD1 MIR3181-201ENST00000578512 73 ntBASIC19.11■□□□□ 0.65
DCLRE1CQ96SD1 AC010336.5-201ENST00000594308 317 ntTSL 3 BASIC19.11■□□□□ 0.65
DCLRE1CQ96SD1 EYA2-202ENST00000327619 2702 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.11■□□□□ 0.65
DCLRE1CQ96SD1 TRIP6-201ENST00000200457 1942 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.11■□□□□ 0.65
DCLRE1CQ96SD1 DYRK2-202ENST00000344096 8912 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC19.11■□□□□ 0.65
DCLRE1CQ96SD1 PARD3-207ENST00000374788 5996 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC19.11■□□□□ 0.65
DCLRE1CQ96SD1 MDFI-203ENST00000373051 1622 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.11■□□□□ 0.65
DCLRE1CQ96SD1 AC109460.3-201ENST00000569969 5296 ntTSL 2 BASIC19.1■□□□□ 0.65
DCLRE1CQ96SD1 EPCAM-202ENST00000405271 1530 ntTSL 5 BASIC19.1■□□□□ 0.65
DCLRE1CQ96SD1 SOHLH1-201ENST00000298466 1987 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.1■□□□□ 0.65
DCLRE1CQ96SD1 FAM3C-201ENST00000359943 2508 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.1■□□□□ 0.65
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 17.7 ms