Protein–RNA interactions for Protein: Q96LT4

SAMD8, Sphingomyelin synthase-related protein 1, humanhuman

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SAMD8Q96LT4 RNF166-202ENST00000537718 1525 ntTSL 2 BASIC19.35■□□□□ 0.69
SAMD8Q96LT4 PPP1R3F-203ENST00000466508 1885 ntTSL 2 BASIC19.35■□□□□ 0.69
SAMD8Q96LT4 GRIN1-208ENST00000371561 5149 ntTSL 1 (best) BASIC19.34■□□□□ 0.69
SAMD8Q96LT4 RFXAP-201ENST00000255476 2304 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.34■□□□□ 0.69
SAMD8Q96LT4 LHPP-202ENST00000368842 1622 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.34■□□□□ 0.69
SAMD8Q96LT4 IKBKG-206ENST00000594239 2299 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.34■□□□□ 0.69
SAMD8Q96LT4 SUMF1-205ENST00000458465 1102 ntTSL 2 BASIC19.34■□□□□ 0.69
SAMD8Q96LT4 WDR86-AS1-204ENST00000489632 751 ntTSL 3 BASIC19.34■□□□□ 0.69
SAMD8Q96LT4 SMARCA5-AS1-201ENST00000500800 945 ntTSL 1 (best) BASIC19.34■□□□□ 0.69
SAMD8Q96LT4 HSF2BP-201ENST00000291560 1899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.34■□□□□ 0.69
SAMD8Q96LT4 VRK2-201ENST00000340157 1888 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.34■□□□□ 0.69
SAMD8Q96LT4 PTP4A3-203ENST00000520105 1866 ntTSL 5 BASIC19.34■□□□□ 0.69
SAMD8Q96LT4 ZNF707-201ENST00000358656 2183 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.34■□□□□ 0.69
SAMD8Q96LT4 DCK-201ENST00000286648 2716 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.34■□□□□ 0.69
SAMD8Q96LT4 DYRK3-202ENST00000367108 2218 ntTSL 1 (best) BASIC19.33■□□□□ 0.69
SAMD8Q96LT4 TMEM129-206ENST00000536901 2172 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.33■□□□□ 0.69
SAMD8Q96LT4 DUSP9-201ENST00000342782 2433 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.33■□□□□ 0.69
SAMD8Q96LT4 ARSA-202ENST00000356098 1895 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.33■□□□□ 0.69
SAMD8Q96LT4 SOX3-201ENST00000370536 2132 ntAPPRIS P1 BASIC19.33■□□□□ 0.69
SAMD8Q96LT4 PCMTD2-202ENST00000299468 1049 ntTSL 5 BASIC19.33■□□□□ 0.68
SAMD8Q96LT4 DNAJC4-202ENST00000321685 1288 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.33■□□□□ 0.68
SAMD8Q96LT4 NAXE-201ENST00000368233 1012 ntTSL 2 BASIC19.33■□□□□ 0.68
SAMD8Q96LT4 CDKN2A-208ENST00000498124 880 ntTSL 1 (best) BASIC19.33■□□□□ 0.68
SAMD8Q96LT4 FIZ1-205ENST00000592585 489 ntTSL 5 BASIC19.33■□□□□ 0.68
SAMD8Q96LT4 AL512631.2-201ENST00000604634 923 ntBASIC19.33■□□□□ 0.68
SAMD8Q96LT4 AC092171.4-201ENST00000609130 632 ntBASIC19.33■□□□□ 0.68
SAMD8Q96LT4 DNAJC4-212ENST00000628077 938 ntTSL 5 BASIC19.33■□□□□ 0.68
SAMD8Q96LT4 AC018553.2-201ENST00000637770 1064 ntTSL 1 (best) BASIC19.33■□□□□ 0.68
SAMD8Q96LT4 TTYH1-203ENST00000376531 1763 ntTSL 1 (best) BASIC19.33■□□□□ 0.68
SAMD8Q96LT4 SLC13A3-204ENST00000413164 2008 ntTSL 2 BASIC19.33■□□□□ 0.68
SAMD8Q96LT4 RASGEF1C-201ENST00000361132 2243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.33■□□□□ 0.68
SAMD8Q96LT4 DMRT2-203ENST00000358146 1965 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.33■□□□□ 0.68
SAMD8Q96LT4 YAP1-202ENST00000345877 5284 ntTSL 5 BASIC19.33■□□□□ 0.68
SAMD8Q96LT4 SUMF1-202ENST00000383843 1447 ntTSL 2 BASIC19.33■□□□□ 0.68
SAMD8Q96LT4 WISP2-203ENST00000372868 1600 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC19.33■□□□□ 0.68
SAMD8Q96LT4 TMC7-205ENST00000569532 2738 ntTSL 2 BASIC19.32■□□□□ 0.68
SAMD8Q96LT4 SNAP23-202ENST00000349777 2480 ntTSL 2 BASIC19.32■□□□□ 0.68
SAMD8Q96LT4 ACSL1-205ENST00000504900 1583 ntTSL 5 BASIC19.32■□□□□ 0.68
SAMD8Q96LT4 HHIPL1-202ENST00000357223 2241 ntTSL 1 (best) BASIC19.32■□□□□ 0.68
SAMD8Q96LT4 HSPB2-201ENST00000304298 1335 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.32■□□□□ 0.68
SAMD8Q96LT4 HERC2P8-204ENST00000567073 1988 ntTSL 5 BASIC19.32■□□□□ 0.68
SAMD8Q96LT4 PBX4-201ENST00000251203 1724 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.32■□□□□ 0.68
SAMD8Q96LT4 NBPF26-209ENST00000624419 1133 ntTSL 5 BASIC19.32■□□□□ 0.68
SAMD8Q96LT4 MAPK9-206ENST00000425491 2266 ntTSL 5 BASIC19.32■□□□□ 0.68
SAMD8Q96LT4 ZNF316-201ENST00000382252 5392 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.32■□□□□ 0.68
SAMD8Q96LT4 CPNE7-202ENST00000319518 2409 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.32■□□□□ 0.68
SAMD8Q96LT4 EBF4-202ENST00000380648 2910 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC19.31■□□□□ 0.68
SAMD8Q96LT4 OXCT2P1-201ENST00000447263 1535 ntBASIC19.31■□□□□ 0.68
SAMD8Q96LT4 PYCR1-203ENST00000402252 1346 ntTSL 2 BASIC19.31■□□□□ 0.68
SAMD8Q96LT4 PHOX2B-201ENST00000226382 3030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.31■□□□□ 0.68
SAMD8Q96LT4 PPP3CC-203ENST00000397775 2094 ntTSL 2 BASIC19.31■□□□□ 0.68
SAMD8Q96LT4 SPOP-206ENST00000504102 1865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.31■□□□□ 0.68
SAMD8Q96LT4 LEF1-AS1-207ENST00000512637 1675 ntTSL 1 (best) BASIC19.31■□□□□ 0.68
SAMD8Q96LT4 LINC00094-201ENST00000432807 2300 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.31■□□□□ 0.68
SAMD8Q96LT4 KLHDC1-201ENST00000359332 2691 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.31■□□□□ 0.68
SAMD8Q96LT4 FAM102B-202ENST00000405454 1585 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.31■□□□□ 0.68
SAMD8Q96LT4 LINC01123-202ENST00000419296 2436 ntTSL 2 BASIC19.31■□□□□ 0.68
SAMD8Q96LT4 CPNE9-203ENST00000383832 2068 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.31■□□□□ 0.68
SAMD8Q96LT4 SEPT5-209ENST00000438754 2241 ntTSL 2 BASIC19.31■□□□□ 0.68
SAMD8Q96LT4 TNFAIP2-209ENST00000560869 4683 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.3■□□□□ 0.68
SAMD8Q96LT4 TMEM250-205ENST00000561457 2804 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.3■□□□□ 0.68
SAMD8Q96LT4 PTCHD3P2-201ENST00000424937 1205 ntBASIC19.3■□□□□ 0.68
SAMD8Q96LT4 UBE2E2-203ENST00000425792 1248 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.3■□□□□ 0.68
SAMD8Q96LT4 HOMER3-203ENST00000433218 1418 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC19.3■□□□□ 0.68
SAMD8Q96LT4 TUBA1A-201ENST00000295766 1887 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.3■□□□□ 0.68
SAMD8Q96LT4 HTRA3-202ENST00000382512 2023 ntTSL 1 (best) BASIC19.3■□□□□ 0.68
SAMD8Q96LT4 NCKAP1-201ENST00000360982 4989 ntTSL 1 (best) BASIC19.3■□□□□ 0.68
SAMD8Q96LT4 PNMA2-204ENST00000522362 4965 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.3■□□□□ 0.68
SAMD8Q96LT4 SGTA-201ENST00000221566 2330 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.3■□□□□ 0.68
SAMD8Q96LT4 AKR7A2-201ENST00000235835 1362 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.3■□□□□ 0.68
SAMD8Q96LT4 CCKBR-206ENST00000532715 1734 ntTSL 3 BASIC19.29■□□□□ 0.68
SAMD8Q96LT4 BASP1-203ENST00000616743 1711 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC19.29■□□□□ 0.68
SAMD8Q96LT4 UBE2C-202ENST00000335046 737 ntTSL 2 BASIC19.29■□□□□ 0.68
SAMD8Q96LT4 SURF2-201ENST00000371964 842 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.29■□□□□ 0.68
SAMD8Q96LT4 CARD19-201ENST00000375464 855 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.29■□□□□ 0.68
SAMD8Q96LT4 HES6-206ENST00000409574 738 ntTSL 2 BASIC19.29■□□□□ 0.68
SAMD8Q96LT4 DYM-203ENST00000442713 2147 ntTSL 2 BASIC19.29■□□□□ 0.68
SAMD8Q96LT4 CDKN2A-207ENST00000497750 565 ntTSL 4 BASIC19.29■□□□□ 0.68
SAMD8Q96LT4 TMEM206-205ENST00000535273 2119 ntTSL 2 BASIC19.29■□□□□ 0.68
SAMD8Q96LT4 CDKN2A-212ENST00000578845 678 ntTSL 2 BASIC19.29■□□□□ 0.68
SAMD8Q96LT4 HOXA11-AS1_1.1-201ENST00000613939 98 ntBASIC19.29■□□□□ 0.68
SAMD8Q96LT4 LINC01881-206ENST00000614114 957 ntTSL 2 BASIC19.29■□□□□ 0.68
SAMD8Q96LT4 SHISA9-205ENST00000639941 1135 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.29■□□□□ 0.68
SAMD8Q96LT4 CDK5R2-201ENST00000302625 2508 ntAPPRIS P1 BASIC19.29■□□□□ 0.68
SAMD8Q96LT4 RITA1-201ENST00000548278 2053 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.29■□□□□ 0.68
SAMD8Q96LT4 MTURN-201ENST00000324453 5937 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.29■□□□□ 0.68
SAMD8Q96LT4 ESR2-204ENST00000353772 2454 ntTSL 1 (best) BASIC19.29■□□□□ 0.68
SAMD8Q96LT4 STARD3NL-202ENST00000396013 1365 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.29■□□□□ 0.68
SAMD8Q96LT4 PALM-202ENST00000338448 2725 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC19.29■□□□□ 0.68
SAMD8Q96LT4 KCNQ1-202ENST00000335475 2159 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.29■□□□□ 0.68
SAMD8Q96LT4 HAUS4-201ENST00000206474 1642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.29■□□□□ 0.68
SAMD8Q96LT4 CDC14A-203ENST00000370124 1883 ntTSL 1 (best) BASIC19.28■□□□□ 0.68
SAMD8Q96LT4 EPHA6-202ENST00000470610 2058 ntTSL 2 BASIC19.28■□□□□ 0.68
SAMD8Q96LT4 ZXDC-201ENST00000336332 2579 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.28■□□□□ 0.68
SAMD8Q96LT4 RPS6KL1-216ENST00000557413 2425 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.28■□□□□ 0.68
SAMD8Q96LT4 CTAG1B-202ENST00000359887 998 ntTSL 2 BASIC19.28■□□□□ 0.68
SAMD8Q96LT4 POLR3GL-201ENST00000369313 818 ntTSL 2 BASIC19.28■□□□□ 0.68
SAMD8Q96LT4 SNAI3-AS1-201ENST00000563261 998 ntTSL 1 (best) BASIC19.28■□□□□ 0.68
SAMD8Q96LT4 CCER2-201ENST00000571838 1057 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC19.28■□□□□ 0.68
SAMD8Q96LT4 SRR-208ENST00000576848 588 ntTSL 4 BASIC19.28■□□□□ 0.68
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