Protein–RNA interactions for Protein: Q96C57

C12orf43, Uncharacterized protein C12orf43, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 262 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
C12orf43Q96C57 LARGE2-202ENST00000401752 2516 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.54■□□□□ 0.72
C12orf43Q96C57 BASP1-201ENST00000322611 1878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.54■□□□□ 0.72
C12orf43Q96C57 SPAST-204ENST00000621856 1715 ntTSL 1 (best) BASIC19.54■□□□□ 0.72
C12orf43Q96C57 CRACR2B-202ENST00000525077 1578 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.53■□□□□ 0.72
C12orf43Q96C57 ADAP2-201ENST00000330889 2934 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.53■□□□□ 0.72
C12orf43Q96C57 MARK2-211ENST00000513765 2671 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.53■□□□□ 0.72
C12orf43Q96C57 STK19-201ENST00000375331 1663 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.53■□□□□ 0.72
C12orf43Q96C57 PFKP-201ENST00000381072 1698 ntTSL 1 (best) BASIC19.53■□□□□ 0.72
C12orf43Q96C57 P2RX4-202ENST00000337233 2032 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.53■□□□□ 0.72
C12orf43Q96C57 PXK-211ENST00000484288 2031 ntTSL 1 (best) BASIC19.53■□□□□ 0.72
C12orf43Q96C57 SRSF4-201ENST00000373795 2387 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.53■□□□□ 0.72
C12orf43Q96C57 STARD3NL-201ENST00000009041 1728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.53■□□□□ 0.72
C12orf43Q96C57 RGMB-207ENST00000513185 2052 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.53■□□□□ 0.72
C12orf43Q96C57 TRABD2A-201ENST00000335459 1844 ntTSL 1 (best) BASIC19.53■□□□□ 0.72
C12orf43Q96C57 TNFSF11-203ENST00000398795 2199 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.53■□□□□ 0.72
C12orf43Q96C57 FGF14-IT1-202ENST00000607251 2123 ntTSL 2 BASIC19.52■□□□□ 0.72
C12orf43Q96C57 PNMA2-204ENST00000522362 4965 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.52■□□□□ 0.72
C12orf43Q96C57 GJC2-201ENST00000366714 2243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.52■□□□□ 0.72
C12orf43Q96C57 CCDC85B-201ENST00000312579 1524 ntAPPRIS P1 BASIC19.52■□□□□ 0.72
C12orf43Q96C57 FAM53A-202ENST00000461064 2159 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.52■□□□□ 0.72
C12orf43Q96C57 DET1-201ENST00000268148 2267 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.52■□□□□ 0.72
C12orf43Q96C57 IGFBP6-201ENST00000301464 1169 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.52■□□□□ 0.72
C12orf43Q96C57 RARRES2P1-201ENST00000474487 481 ntBASIC19.52■□□□□ 0.72
C12orf43Q96C57 FAM120C-203ENST00000477084 1140 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.52■□□□□ 0.72
C12orf43Q96C57 ITGBL1-202ENST00000376180 2494 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.52■□□□□ 0.72
C12orf43Q96C57 MIR222HG-201ENST00000602461 1379 ntTSL 5 BASIC19.52■□□□□ 0.72
C12orf43Q96C57 ADAM33-202ENST00000356518 3677 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.52■□□□□ 0.72
C12orf43Q96C57 NUTM2D-201ENST00000381697 3290 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC19.52■□□□□ 0.71
C12orf43Q96C57 STXBP6-203ENST00000419632 1970 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.52■□□□□ 0.71
C12orf43Q96C57 PRICKLE3-206ENST00000599218 2062 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.52■□□□□ 0.71
C12orf43Q96C57 PCDHAC2-203ENST00000615316 3011 ntBASIC19.51■□□□□ 0.71
C12orf43Q96C57 SCUBE1-201ENST00000290460 2258 ntTSL 1 (best) BASIC19.51■□□□□ 0.71
C12orf43Q96C57 LHPP-201ENST00000368839 1522 ntTSL 1 (best) BASIC19.51■□□□□ 0.71
C12orf43Q96C57 MAPK9-208ENST00000455781 4336 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC19.51■□□□□ 0.71
C12orf43Q96C57 TTBK1-202ENST00000304139 2449 ntTSL 5 BASIC19.51■□□□□ 0.71
C12orf43Q96C57 ENTPD6-201ENST00000354989 2708 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.51■□□□□ 0.71
C12orf43Q96C57 PRELID1-201ENST00000303204 1261 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.51■□□□□ 0.71
C12orf43Q96C57 AQP1-202ENST00000409611 1140 ntTSL 1 (best) BASIC19.51■□□□□ 0.71
C12orf43Q96C57 LYSMD2-202ENST00000454181 1228 ntTSL 1 (best) BASIC19.51■□□□□ 0.71
C12orf43Q96C57 TK2-216ENST00000564917 1156 ntTSL 3 BASIC19.51■□□□□ 0.71
C12orf43Q96C57 AL121906.1-201ENST00000606866 440 ntTSL 3 BASIC19.51■□□□□ 0.71
C12orf43Q96C57 AL590094.1-201ENST00000635581 706 ntTSL 2 BASIC19.51■□□□□ 0.71
C12orf43Q96C57 DTNBP1-201ENST00000338950 1880 ntTSL 1 (best) BASIC19.51■□□□□ 0.71
C12orf43Q96C57 CYP21A1P-201ENST00000342991 1971 ntTSL 3 BASIC19.51■□□□□ 0.71
C12orf43Q96C57 STMN3-201ENST00000370053 2255 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.51■□□□□ 0.71
C12orf43Q96C57 SIMC1-204ENST00000430704 1925 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC19.51■□□□□ 0.71
C12orf43Q96C57 ADAP1-218ENST00000617043 1946 ntTSL 2 BASIC19.51■□□□□ 0.71
C12orf43Q96C57 YBX3-202ENST00000279550 1708 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.51■□□□□ 0.71
C12orf43Q96C57 KCNA3-201ENST00000369769 2569 ntAPPRIS P1 BASIC19.5■□□□□ 0.71
C12orf43Q96C57 KLHL11-201ENST00000319121 2383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.5■□□□□ 0.71
C12orf43Q96C57 IL15RA-206ENST00000397248 1799 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.5■□□□□ 0.71
C12orf43Q96C57 CITED2-202ENST00000536159 1797 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC19.5■□□□□ 0.71
C12orf43Q96C57 TPI1-210ENST00000613953 1460 ntTSL 1 (best) BASIC19.5■□□□□ 0.71
C12orf43Q96C57 CCSAP-203ENST00000366687 5089 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.5■□□□□ 0.71
C12orf43Q96C57 GBX1-201ENST00000297537 1092 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.5■□□□□ 0.71
C12orf43Q96C57 CLIC3-203ENST00000494426 1017 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.5■□□□□ 0.71
C12orf43Q96C57 AL158151.1-201ENST00000372490 2047 ntTSL 2 BASIC19.5■□□□□ 0.71
C12orf43Q96C57 GPR6-202ENST00000414000 1945 ntTSL 2 BASIC19.5■□□□□ 0.71
C12orf43Q96C57 SH2D5-202ENST00000444387 1934 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.5■□□□□ 0.71
C12orf43Q96C57 NNT-AS1-206ENST00000606697 1945 ntTSL 2 BASIC19.5■□□□□ 0.71
C12orf43Q96C57 TXNRD3-204ENST00000640433 1932 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC19.5■□□□□ 0.71
C12orf43Q96C57 STRBP-201ENST00000348403 3337 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.5■□□□□ 0.71
C12orf43Q96C57 IL17RC-202ENST00000383812 2384 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.5■□□□□ 0.71
C12orf43Q96C57 IL17RC-203ENST00000403601 2388 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.5■□□□□ 0.71
C12orf43Q96C57 ME3-212ENST00000543262 2311 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.5■□□□□ 0.71
C12orf43Q96C57 CCDC92-209ENST00000545891 1790 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.49■□□□□ 0.71
C12orf43Q96C57 KPTN-201ENST00000338134 1691 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.49■□□□□ 0.71
C12orf43Q96C57 MPZL1-201ENST00000359523 5010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.49■□□□□ 0.71
C12orf43Q96C57 C19orf66-201ENST00000253110 2117 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC19.49■□□□□ 0.71
C12orf43Q96C57 CACNA1B-201ENST00000277549 7158 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.49■□□□□ 0.71
C12orf43Q96C57 CACNA1B-202ENST00000277551 7158 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.49■□□□□ 0.71
C12orf43Q96C57 GLT8D2-205ENST00000548660 1835 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.49■□□□□ 0.71
C12orf43Q96C57 NARS2-201ENST00000281038 2519 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.49■□□□□ 0.71
C12orf43Q96C57 EML3-217ENST00000531557 2509 ntTSL 5 BASIC19.49■□□□□ 0.71
C12orf43Q96C57 EPM2A-202ENST00000435470 1278 ntTSL 1 (best) BASIC19.49■□□□□ 0.71
C12orf43Q96C57 SNAI3-AS1-203ENST00000565633 829 ntTSL 5 BASIC19.49■□□□□ 0.71
C12orf43Q96C57 MIR4281-201ENST00000580852 62 ntBASIC19.49■□□□□ 0.71
C12orf43Q96C57 SOX18-201ENST00000340356 1864 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.49■□□□□ 0.71
C12orf43Q96C57 DTX4-201ENST00000227451 5642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.49■□□□□ 0.71
C12orf43Q96C57 PIF1-202ENST00000333425 2278 ntTSL 1 (best) BASIC19.49■□□□□ 0.71
C12orf43Q96C57 TJP1-208ENST00000495972 2890 ntTSL 1 (best) BASIC19.49■□□□□ 0.71
C12orf43Q96C57 POMGNT2-202ENST00000441964 2531 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC19.49■□□□□ 0.71
C12orf43Q96C57 PDCD2-204ENST00000453163 2657 ntTSL 1 (best) BASIC19.48■□□□□ 0.71
C12orf43Q96C57 BRD4-202ENST00000360016 3240 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.48■□□□□ 0.71
C12orf43Q96C57 PKIB-205ENST00000368452 1398 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.48■□□□□ 0.71
C12orf43Q96C57 PCBP4-212ENST00000484633 2009 ntTSL 5 BASIC19.48■□□□□ 0.71
C12orf43Q96C57 CDKN2C-201ENST00000262662 2904 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.48■□□□□ 0.71
C12orf43Q96C57 BRI3-201ENST00000297290 780 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.48■□□□□ 0.71
C12orf43Q96C57 EPHA10-211ENST00000540011 720 ntTSL 5 BASIC19.48■□□□□ 0.71
C12orf43Q96C57 ADORA2A-214ENST00000611543 2412 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.48■□□□□ 0.71
C12orf43Q96C57 METRN-204ENST00000568223 3325 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.48■□□□□ 0.71
C12orf43Q96C57 PRKAA1-202ENST00000354209 1918 ntTSL 1 (best) BASIC19.48■□□□□ 0.71
C12orf43Q96C57 DMRTB1-201ENST00000371445 1910 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.48■□□□□ 0.71
C12orf43Q96C57 ZBTB33-202ENST00000557385 2346 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.48■□□□□ 0.71
C12orf43Q96C57 ME2-218ENST00000640965 2476 ntTSL 5 BASIC19.48■□□□□ 0.71
C12orf43Q96C57 CREB3-201ENST00000353704 1832 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.48■□□□□ 0.71
C12orf43Q96C57 FAM53B-201ENST00000280780 1568 ntTSL 1 (best) BASIC19.48■□□□□ 0.71
C12orf43Q96C57 DMRT2-205ENST00000382255 2367 ntTSL 1 (best) BASIC19.48■□□□□ 0.71
C12orf43Q96C57 RNF180-201ENST00000296615 1727 ntTSL 1 (best) BASIC19.48■□□□□ 0.71
C12orf43Q96C57 TRPC1-203ENST00000476941 3061 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.48■□□□□ 0.71
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 28.6 ms