Protein–RNA interactions for Protein: Q8IWF9

CCDC83, Coiled-coil domain-containing protein 83, humanhuman

Predictions only

Length 413 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CCDC83Q8IWF9 CPEB1-AS1-201ENST00000560650 2138 ntTSL 1 (best) BASIC25.06■■□□□ 1.6
CCDC83Q8IWF9 FPGS-202ENST00000373228 1383 ntTSL 5 BASIC25.05■■□□□ 1.6
CCDC83Q8IWF9 GCH1-202ENST00000395514 1977 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.05■■□□□ 1.6
CCDC83Q8IWF9 BCL11B-203ENST00000443726 2599 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.05■■□□□ 1.6
CCDC83Q8IWF9 PKD1P6-201ENST00000343738 4769 ntBASIC25.05■■□□□ 1.6
CCDC83Q8IWF9 LMAN2-201ENST00000303127 1800 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.05■■□□□ 1.6
CCDC83Q8IWF9 SOCS7-202ENST00000613678 1827 ntTSL 5 BASIC25.05■■□□□ 1.6
CCDC83Q8IWF9 PTPRM-211ENST00000580170 5941 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.05■■□□□ 1.6
CCDC83Q8IWF9 PPP3CC-203ENST00000397775 2094 ntTSL 2 BASIC25.05■■□□□ 1.6
CCDC83Q8IWF9 PHPT1-201ENST00000247665 890 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.05■■□□□ 1.6
CCDC83Q8IWF9 AC061979.1-201ENST00000532061 434 ntTSL 5 BASIC25.05■■□□□ 1.6
CCDC83Q8IWF9 GJD3-201ENST00000578689 885 ntAPPRIS P1 BASIC25.05■■□□□ 1.6
CCDC83Q8IWF9 GGA2-211ENST00000567468 1713 ntTSL 2 BASIC25.05■■□□□ 1.6
CCDC83Q8IWF9 DGKQ-201ENST00000273814 4636 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.05■■□□□ 1.6
CCDC83Q8IWF9 WHAMM-201ENST00000286760 5101 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.05■■□□□ 1.6
CCDC83Q8IWF9 TRIB3-201ENST00000217233 2499 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.05■■□□□ 1.6
CCDC83Q8IWF9 KDELR1-203ENST00000597017 1594 ntTSL 2 BASIC25.05■■□□□ 1.6
CCDC83Q8IWF9 AC091230.1-202ENST00000564823 5356 ntTSL 2 BASIC25.04■■□□□ 1.6
CCDC83Q8IWF9 SPOP-206ENST00000504102 1865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.04■■□□□ 1.6
CCDC83Q8IWF9 AC003102.1-202ENST00000563394 1796 ntBASIC25.04■■□□□ 1.6
CCDC83Q8IWF9 LYPD2-201ENST00000359228 594 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.04■■□□□ 1.6
CCDC83Q8IWF9 CKLF-205ENST00000417030 628 ntAPPRIS ALT2 TSL 4 BASIC25.04■■□□□ 1.6
CCDC83Q8IWF9 BX842568.3-201ENST00000418104 571 ntBASIC25.04■■□□□ 1.6
CCDC83Q8IWF9 RALB-203ENST00000420510 1252 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.04■■□□□ 1.6
CCDC83Q8IWF9 AL136162.1-201ENST00000607711 1078 ntBASIC25.04■■□□□ 1.6
CCDC83Q8IWF9 RUFY1-201ENST00000319449 2646 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.04■■□□□ 1.6
CCDC83Q8IWF9 ITGBL1-206ENST00000618057 2368 ntTSL 1 (best) BASIC25.04■■□□□ 1.6
CCDC83Q8IWF9 ZNF48-201ENST00000320159 3234 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.04■■□□□ 1.6
CCDC83Q8IWF9 C8orf82-201ENST00000313465 2186 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.04■■□□□ 1.6
CCDC83Q8IWF9 ORAI3-201ENST00000318663 2206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.04■■□□□ 1.6
CCDC83Q8IWF9 DISC1-212ENST00000535983 2505 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.04■■□□□ 1.6
CCDC83Q8IWF9 IKBKG-206ENST00000594239 2299 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.03■■□□□ 1.6
CCDC83Q8IWF9 CACNG8-201ENST00000270458 8747 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.03■■□□□ 1.6
CCDC83Q8IWF9 AL357078.1-201ENST00000448344 310 ntTSL 4 BASIC25.03■■□□□ 1.6
CCDC83Q8IWF9 ZNF584-205ENST00000596281 575 ntTSL 2 BASIC25.03■■□□□ 1.6
CCDC83Q8IWF9 SMPD2-201ENST00000258052 1645 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.03■■□□□ 1.6
CCDC83Q8IWF9 AVPR2-203ENST00000370049 1307 ntTSL 1 (best) BASIC25.03■■□□□ 1.6
CCDC83Q8IWF9 AC243965.2-201ENST00000612576 2671 ntTSL 5 BASIC25.03■■□□□ 1.6
CCDC83Q8IWF9 LLGL2-202ENST00000375227 1374 ntTSL 1 (best) BASIC25.03■■□□□ 1.6
CCDC83Q8IWF9 LRP5L-203ENST00000444995 1714 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.03■■□□□ 1.6
CCDC83Q8IWF9 C1QL4-201ENST00000334221 2071 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.03■■□□□ 1.6
CCDC83Q8IWF9 BRSK2-212ENST00000531197 3163 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.03■■□□□ 1.6
CCDC83Q8IWF9 AL024507.2-201ENST00000606070 2574 ntBASIC25.02■■□□□ 1.6
CCDC83Q8IWF9 CENPS-CORT-201ENST00000400900 1469 ntTSL 2 BASIC25.02■■□□□ 1.6
CCDC83Q8IWF9 TMCC2-209ENST00000637895 1455 ntTSL 1 (best) BASIC25.02■■□□□ 1.6
CCDC83Q8IWF9 AL606970.3-201ENST00000446811 2246 ntTSL 2 BASIC25.02■■□□□ 1.6
CCDC83Q8IWF9 HSF2BP-201ENST00000291560 1899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.02■■□□□ 1.6
CCDC83Q8IWF9 TRIP13-201ENST00000166345 2672 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.02■■□□□ 1.6
CCDC83Q8IWF9 NEU4-204ENST00000405370 1907 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.02■■□□□ 1.6
CCDC83Q8IWF9 SPRN-201ENST00000414069 3128 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.02■■□□□ 1.6
CCDC83Q8IWF9 PITX1-201ENST00000265340 2406 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.02■■□□□ 1.6
CCDC83Q8IWF9 RNF208-201ENST00000391553 1077 ntAPPRIS P1 BASIC25.02■■□□□ 1.6
CCDC83Q8IWF9 TOLLIP-208ENST00000527938 549 ntTSL 4 BASIC25.02■■□□□ 1.6
CCDC83Q8IWF9 AL034346.1-201ENST00000568244 1277 ntBASIC25.02■■□□□ 1.6
CCDC83Q8IWF9 OSBPL10-204ENST00000438237 2624 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.02■■□□□ 1.6
CCDC83Q8IWF9 ECE2-203ENST00000359140 3147 ntTSL 1 (best) BASIC25.01■■□□□ 1.59
CCDC83Q8IWF9 MAGI2-212ENST00000626691 4599 ntTSL 5 BASIC25.01■■□□□ 1.59
CCDC83Q8IWF9 ZNF446-208ENST00000622313 1884 ntTSL 1 (best) BASIC25.01■■□□□ 1.59
CCDC83Q8IWF9 ZNF32-202ENST00000395797 1201 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.01■■□□□ 1.59
CCDC83Q8IWF9 DCTD-202ENST00000438320 1972 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.01■■□□□ 1.59
CCDC83Q8IWF9 ZNHIT2-201ENST00000310597 1306 ntAPPRIS P1 BASIC25.01■■□□□ 1.59
CCDC83Q8IWF9 GAL3ST3-201ENST00000312006 2133 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.01■■□□□ 1.59
CCDC83Q8IWF9 ASAP2-201ENST00000281419 5712 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.01■■□□□ 1.59
CCDC83Q8IWF9 UBE2Q1-201ENST00000292211 3210 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.01■■□□□ 1.59
CCDC83Q8IWF9 SLC25A39-201ENST00000225308 1607 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.01■■□□□ 1.59
CCDC83Q8IWF9 DYM-203ENST00000442713 2147 ntTSL 2 BASIC25■■□□□ 1.59
CCDC83Q8IWF9 RASGEF1C-201ENST00000361132 2243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25■■□□□ 1.59
CCDC83Q8IWF9 C10orf55-202ENST00000412307 2360 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25■■□□□ 1.59
CCDC83Q8IWF9 PRADC1-201ENST00000258083 1083 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25■■□□□ 1.59
CCDC83Q8IWF9 CYHR1-201ENST00000306145 1409 ntTSL 1 (best) BASIC25■■□□□ 1.59
CCDC83Q8IWF9 BAZ1A-201ENST00000358716 5920 ntTSL 1 (best) BASIC25■■□□□ 1.59
CCDC83Q8IWF9 RAB3A-201ENST00000222256 1528 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25■■□□□ 1.59
CCDC83Q8IWF9 TERF1-202ENST00000276603 1677 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC25■■□□□ 1.59
CCDC83Q8IWF9 NUDT10-201ENST00000356450 1917 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25■■□□□ 1.59
CCDC83Q8IWF9 ACADVL-202ENST00000350303 2191 ntTSL 1 (best) BASIC25■■□□□ 1.59
CCDC83Q8IWF9 SEPT5-209ENST00000438754 2241 ntTSL 2 BASIC25■■□□□ 1.59
CCDC83Q8IWF9 EEF1D-204ENST00000423316 2378 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC25■■□□□ 1.59
CCDC83Q8IWF9 BOK-201ENST00000318407 2657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.99■■□□□ 1.59
CCDC83Q8IWF9 FAM171A2-201ENST00000293443 3160 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.99■■□□□ 1.59
CCDC83Q8IWF9 BBC3-202ENST00000341983 1538 ntTSL 1 (best) BASIC24.99■■□□□ 1.59
CCDC83Q8IWF9 POLR2F-203ENST00000407936 582 ntTSL 3 BASIC24.99■■□□□ 1.59
CCDC83Q8IWF9 ZNF331-202ENST00000411977 2248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.99■■□□□ 1.59
CCDC83Q8IWF9 CKMT1B-207ENST00000441322 1747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.99■■□□□ 1.59
CCDC83Q8IWF9 ANKRD13D-202ENST00000447274 2881 ntTSL 1 (best) BASIC24.99■■□□□ 1.59
CCDC83Q8IWF9 POLR2F-207ENST00000460648 518 ntTSL 4 BASIC24.99■■□□□ 1.59
CCDC83Q8IWF9 IRX4-206ENST00000513692 2391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.99■■□□□ 1.59
CCDC83Q8IWF9 CCKBR-206ENST00000532715 1734 ntTSL 3 BASIC24.99■■□□□ 1.59
CCDC83Q8IWF9 NRL-205ENST00000560550 788 ntTSL 1 (best) BASIC24.99■■□□□ 1.59
CCDC83Q8IWF9 SMUG1P1-201ENST00000590640 811 ntBASIC24.99■■□□□ 1.59
CCDC83Q8IWF9 HOMER3-206ENST00000594439 982 ntTSL 1 (best) BASIC24.99■■□□□ 1.59
CCDC83Q8IWF9 AC135279.3-201ENST00000610945 1311 ntBASIC24.99■■□□□ 1.59
CCDC83Q8IWF9 SETD9-211ENST00000628593 1306 ntTSL 1 (best) BASIC24.99■■□□□ 1.59
CCDC83Q8IWF9 TRIM3-202ENST00000359518 3042 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.99■■□□□ 1.59
CCDC83Q8IWF9 LPAR1-201ENST00000358883 2687 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC24.99■■□□□ 1.59
CCDC83Q8IWF9 CPNE9-203ENST00000383832 2068 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.98■■□□□ 1.59
CCDC83Q8IWF9 PDZRN4-202ENST00000402685 3347 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.98■■□□□ 1.59
CCDC83Q8IWF9 UBALD1-208ENST00000591401 1305 ntTSL 5 BASIC24.98■■□□□ 1.59
CCDC83Q8IWF9 TRIR-201ENST00000242784 970 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.98■■□□□ 1.59
CCDC83Q8IWF9 IL20RA-202ENST00000367746 1244 ntTSL 2 BASIC24.98■■□□□ 1.59
CCDC83Q8IWF9 SRM-201ENST00000376957 1266 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.98■■□□□ 1.59
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 31.6 ms