Protein–RNA interactions for Protein: Q6UW10

SFTA2, Surfactant-associated protein 2, humanhuman

Predictions only

Length 78 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SFTA2Q6UW10 CCDC189-206ENST00000543610 1967 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.84□□□□□ -0.03
SFTA2Q6UW10 COL16A1-203ENST00000373672 5736 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.83□□□□□ -0.03
SFTA2Q6UW10 DALRD3-206ENST00000441576 1706 ntTSL 1 (best) BASIC14.83□□□□□ -0.03
SFTA2Q6UW10 AL020996.1-203ENST00000536896 2307 ntBASIC14.83□□□□□ -0.03
SFTA2Q6UW10 IQCJ-SCHIP1-203ENST00000476809 1780 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.83□□□□□ -0.03
SFTA2Q6UW10 CHRNA7-203ENST00000454250 2093 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC14.83□□□□□ -0.03
SFTA2Q6UW10 SKOR1-203ENST00000554054 3620 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.83□□□□□ -0.04
SFTA2Q6UW10 SPINT2-201ENST00000301244 1802 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.83□□□□□ -0.04
SFTA2Q6UW10 ADAMTS7-201ENST00000388820 5490 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.83□□□□□ -0.04
SFTA2Q6UW10 HMGA1-205ENST00000447654 2159 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC14.83□□□□□ -0.04
SFTA2Q6UW10 CACNB1-201ENST00000344140 1889 ntTSL 1 (best) BASIC14.83□□□□□ -0.04
SFTA2Q6UW10 UBE2E3-202ENST00000410062 1570 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.83□□□□□ -0.04
SFTA2Q6UW10 MAP3K8-203ENST00000375322 932 ntTSL 2 BASIC14.83□□□□□ -0.04
SFTA2Q6UW10 TNFRSF4-201ENST00000379236 1068 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.83□□□□□ -0.04
SFTA2Q6UW10 MIR639-201ENST00000384974 98 ntBASIC14.83□□□□□ -0.04
SFTA2Q6UW10 AL136090.1-201ENST00000446849 366 ntTSL 3 BASIC14.83□□□□□ -0.04
SFTA2Q6UW10 DNLZ-202ENST00000371739 2934 ntTSL 5 BASIC14.83□□□□□ -0.04
SFTA2Q6UW10 EPB41L4B-201ENST00000374557 4006 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.83□□□□□ -0.04
SFTA2Q6UW10 ZSWIM7-201ENST00000399277 2008 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.83□□□□□ -0.04
SFTA2Q6UW10 ZNF668-207ENST00000535577 2396 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.83□□□□□ -0.04
SFTA2Q6UW10 STARD3NL-201ENST00000009041 1728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.83□□□□□ -0.04
SFTA2Q6UW10 DYNC1LI2-201ENST00000258198 4515 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.83□□□□□ -0.04
SFTA2Q6UW10 DAPK3-201ENST00000301264 2105 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.83□□□□□ -0.04
SFTA2Q6UW10 ZBTB25-202ENST00000555220 1440 ntTSL 1 (best) BASIC14.83□□□□□ -0.04
SFTA2Q6UW10 ACADVL-202ENST00000350303 2191 ntTSL 1 (best) BASIC14.83□□□□□ -0.04
SFTA2Q6UW10 PHOSPHO1-202ENST00000413580 2173 ntTSL 2 BASIC14.83□□□□□ -0.04
SFTA2Q6UW10 FAM129C-212ENST00000601861 2180 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC14.83□□□□□ -0.04
SFTA2Q6UW10 KCNA3-201ENST00000369769 2569 ntAPPRIS P1 BASIC14.82□□□□□ -0.04
SFTA2Q6UW10 STX6-204ENST00000542060 4809 ntTSL 2 BASIC14.82□□□□□ -0.04
SFTA2Q6UW10 SLC25A1-202ENST00000451283 1514 ntTSL 2 BASIC14.82□□□□□ -0.04
SFTA2Q6UW10 TMUB1-203ENST00000462940 1549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.82□□□□□ -0.04
SFTA2Q6UW10 MTERF3-204ENST00000523821 1529 ntTSL 1 (best) BASIC14.82□□□□□ -0.04
SFTA2Q6UW10 SHCBP1L-201ENST00000367547 2317 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.82□□□□□ -0.04
SFTA2Q6UW10 NYAP1-202ENST00000454988 2777 ntTSL 5 BASIC14.82□□□□□ -0.04
SFTA2Q6UW10 PCDH7-201ENST00000361762 6403 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.82□□□□□ -0.04
SFTA2Q6UW10 RAB1B-201ENST00000311481 2007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.82□□□□□ -0.04
SFTA2Q6UW10 CBLN2-201ENST00000269503 2945 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.82□□□□□ -0.04
SFTA2Q6UW10 CFAP77-202ENST00000393215 901 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.82□□□□□ -0.04
SFTA2Q6UW10 ANKHD1-205ENST00000394723 2135 ntTSL 1 (best) BASIC14.82□□□□□ -0.04
SFTA2Q6UW10 PLEKHJ1-204ENST00000586608 935 ntTSL 3 BASIC14.82□□□□□ -0.04
SFTA2Q6UW10 UBE2E3-213ENST00000602959 909 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.82□□□□□ -0.04
SFTA2Q6UW10 SYT6-209ENST00000610222 1707 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.82□□□□□ -0.04
SFTA2Q6UW10 SREBF2-201ENST00000361204 5240 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.82□□□□□ -0.04
SFTA2Q6UW10 CHST1-201ENST00000308064 2718 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.82□□□□□ -0.04
SFTA2Q6UW10 SMOC2-206ENST00000535039 1875 ntTSL 5 BASIC14.82□□□□□ -0.04
SFTA2Q6UW10 PEX10-202ENST00000447513 1997 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.82□□□□□ -0.04
SFTA2Q6UW10 AC009831.1-201ENST00000580420 1582 ntBASIC14.81□□□□□ -0.04
SFTA2Q6UW10 DIO3-201ENST00000510508 2102 ntAPPRIS P1 BASIC14.81□□□□□ -0.04
SFTA2Q6UW10 ASCC1-205ENST00000394919 2683 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.81□□□□□ -0.04
SFTA2Q6UW10 PLCH2-205ENST00000449969 5450 ntTSL 5 BASIC14.81□□□□□ -0.04
SFTA2Q6UW10 DAG1-219ENST00000538711 5582 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.81□□□□□ -0.04
SFTA2Q6UW10 SYNGR3-202ENST00000562045 1743 ntTSL 2 BASIC14.81□□□□□ -0.04
SFTA2Q6UW10 RARG-204ENST00000543726 1779 ntTSL 2 BASIC14.81□□□□□ -0.04
SFTA2Q6UW10 MFSD7-203ENST00000404286 1826 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.81□□□□□ -0.04
SFTA2Q6UW10 EPHX3-204ENST00000602233 1805 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.81□□□□□ -0.04
SFTA2Q6UW10 CAPN1-226ENST00000533820 3083 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.81□□□□□ -0.04
SFTA2Q6UW10 EPS8L1-201ENST00000201647 2536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.81□□□□□ -0.04
SFTA2Q6UW10 MIR6765-201ENST00000614092 87 ntBASIC14.81□□□□□ -0.04
SFTA2Q6UW10 SIMC1-203ENST00000429602 2694 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.81□□□□□ -0.04
SFTA2Q6UW10 DNAJC7-203ENST00000457167 2022 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.81□□□□□ -0.04
SFTA2Q6UW10 ARHGEF28-204ENST00000437974 5792 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.81□□□□□ -0.04
SFTA2Q6UW10 SACM1L-202ENST00000418611 2164 ntTSL 2 BASIC14.81□□□□□ -0.04
SFTA2Q6UW10 CIRBP-216ENST00000588090 1459 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC14.81□□□□□ -0.04
SFTA2Q6UW10 COL18A1-202ENST00000355480 5924 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.81□□□□□ -0.04
SFTA2Q6UW10 FOXC1-201ENST00000380874 3926 ntAPPRIS P1 BASIC14.81□□□□□ -0.04
SFTA2Q6UW10 FAM46B-201ENST00000289166 2368 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.81□□□□□ -0.04
SFTA2Q6UW10 NOP56-201ENST00000329276 2400 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.81□□□□□ -0.04
SFTA2Q6UW10 TMEM230-205ENST00000379279 1636 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.81□□□□□ -0.04
SFTA2Q6UW10 ZKSCAN7-206ENST00000431636 1692 ntTSL 1 (best) BASIC14.81□□□□□ -0.04
SFTA2Q6UW10 SLC41A3-202ENST00000346785 1705 ntTSL 2 BASIC14.8□□□□□ -0.04
SFTA2Q6UW10 METTL9-202ENST00000396014 1817 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.8□□□□□ -0.04
SFTA2Q6UW10 EIF2AK3-201ENST00000303236 4646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.8□□□□□ -0.04
SFTA2Q6UW10 TRPV3-209ENST00000576742 2766 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.8□□□□□ -0.04
SFTA2Q6UW10 ST7L-201ENST00000343210 1866 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.8□□□□□ -0.04
SFTA2Q6UW10 Z83844.2-201ENST00000456099 1945 ntTSL 2 BASIC14.8□□□□□ -0.04
SFTA2Q6UW10 ZADH2-201ENST00000322342 7732 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.8□□□□□ -0.04
SFTA2Q6UW10 PCDHAC2-203ENST00000615316 3011 ntBASIC14.8□□□□□ -0.04
SFTA2Q6UW10 CRHR1-203ENST00000339069 2490 ntTSL 2 BASIC14.8□□□□□ -0.04
SFTA2Q6UW10 NOX4-204ENST00000393282 560 ntTSL 1 (best) BASIC14.8□□□□□ -0.04
SFTA2Q6UW10 EPHA10-211ENST00000540011 720 ntTSL 5 BASIC14.8□□□□□ -0.04
SFTA2Q6UW10 LINC01233-202ENST00000598832 568 ntTSL 2 BASIC14.8□□□□□ -0.04
SFTA2Q6UW10 PDE1C-206ENST00000396193 5109 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC14.8□□□□□ -0.04
SFTA2Q6UW10 MAGIX-207ENST00000615915 1757 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC14.8□□□□□ -0.04
SFTA2Q6UW10 FAM46A-203ENST00000369756 5537 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.8□□□□□ -0.04
SFTA2Q6UW10 LCORL-201ENST00000326877 5604 ntTSL 1 (best) BASIC14.8□□□□□ -0.04
SFTA2Q6UW10 AL353803.4-201ENST00000565882 1934 ntBASIC14.8□□□□□ -0.04
SFTA2Q6UW10 ZNF584-203ENST00000593920 2187 ntTSL 2 BASIC14.8□□□□□ -0.04
SFTA2Q6UW10 ZNF710-201ENST00000268154 4617 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.8□□□□□ -0.04
SFTA2Q6UW10 NUDT4-202ENST00000415493 4839 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.8□□□□□ -0.04
SFTA2Q6UW10 SUMF1-201ENST00000272902 2159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.79□□□□□ -0.04
SFTA2Q6UW10 INPP1-201ENST00000322522 1919 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.79□□□□□ -0.04
SFTA2Q6UW10 KDM5C-204ENST00000375401 6031 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.79□□□□□ -0.04
SFTA2Q6UW10 WRNIP1-202ENST00000380769 3239 ntTSL 1 (best) BASIC14.79□□□□□ -0.04
SFTA2Q6UW10 IL17RC-202ENST00000383812 2384 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.79□□□□□ -0.04
SFTA2Q6UW10 TMPO-204ENST00000393053 2374 ntTSL 1 (best) BASIC14.79□□□□□ -0.04
SFTA2Q6UW10 IL17RC-203ENST00000403601 2388 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.79□□□□□ -0.04
SFTA2Q6UW10 RUNX2-202ENST00000371432 5487 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.79□□□□□ -0.04
SFTA2Q6UW10 MAP3K6-207ENST00000493901 4309 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.79□□□□□ -0.04
SFTA2Q6UW10 PRSS23-201ENST00000280258 4015 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.79□□□□□ -0.04
SFTA2Q6UW10 EXTL3-201ENST00000220562 6483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.78□□□□□ -0.04
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 30.5 ms