Protein–RNA interactions for Protein: Q5W0Q7

USPL1, SUMO-specific isopeptidase USPL1, humanhuman

Predictions only

Length 1,092 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
USPL1Q5W0Q7 SLC9A3-201ENST00000264938 2584 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.13■■□□□ 1.93
USPL1Q5W0Q7 NDUFB2-212ENST00000476279 1666 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.13■■□□□ 1.93
USPL1Q5W0Q7 KREMEN2-204ENST00000572045 2339 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.13■■□□□ 1.93
USPL1Q5W0Q7 EEF1D-256ENST00000618139 2238 ntTSL 5 BASIC27.13■■□□□ 1.93
USPL1Q5W0Q7 STEAP1-201ENST00000297205 1313 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.13■■□□□ 1.93
USPL1Q5W0Q7 HRH3-202ENST00000340177 2659 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.13■■□□□ 1.93
USPL1Q5W0Q7 PHLDB3-207ENST00000599242 2286 ntTSL 1 (best) BASIC27.13■■□□□ 1.93
USPL1Q5W0Q7 FOXG1-201ENST00000313071 4890 ntAPPRIS P1 BASIC27.12■■□□□ 1.93
USPL1Q5W0Q7 ARSB-202ENST00000396151 2316 ntTSL 1 (best) BASIC27.12■■□□□ 1.93
USPL1Q5W0Q7 SEPT5-210ENST00000455784 2070 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.12■■□□□ 1.93
USPL1Q5W0Q7 SDHC-201ENST00000342751 1127 ntTSL 1 (best) BASIC27.12■■□□□ 1.93
USPL1Q5W0Q7 SMNDC1-201ENST00000369592 1110 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC27.12■■□□□ 1.93
USPL1Q5W0Q7 BET1L-204ENST00000410108 637 ntTSL 3 BASIC27.12■■□□□ 1.93
USPL1Q5W0Q7 LINC01637-201ENST00000444039 684 ntTSL 2 BASIC27.12■■□□□ 1.93
USPL1Q5W0Q7 TRIM35-203ENST00000521253 1215 ntTSL 1 (best) BASIC27.12■■□□□ 1.93
USPL1Q5W0Q7 FGF13-208ENST00000626909 1039 ntTSL 2 BASIC27.12■■□□□ 1.93
USPL1Q5W0Q7 KCNQ2-201ENST00000344425 1426 ntTSL 1 (best) BASIC27.12■■□□□ 1.93
USPL1Q5W0Q7 SLC22A31-201ENST00000562855 1909 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.12■■□□□ 1.93
USPL1Q5W0Q7 CSNK1G3-206ENST00000511130 1356 ntTSL 2 BASIC27.11■■□□□ 1.93
USPL1Q5W0Q7 NPAS3-206ENST00000548645 2926 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.11■■□□□ 1.93
USPL1Q5W0Q7 DAZAP1-201ENST00000233078 2160 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.11■■□□□ 1.93
USPL1Q5W0Q7 ANKRD10-202ENST00000310847 1193 ntTSL 1 (best) BASIC27.11■■□□□ 1.93
USPL1Q5W0Q7 CYB5R4-201ENST00000369679 768 ntTSL 3 BASIC27.11■■□□□ 1.93
USPL1Q5W0Q7 LINC02531-201ENST00000404689 593 ntTSL 5 BASIC27.11■■□□□ 1.93
USPL1Q5W0Q7 AC007322.4-201ENST00000509611 723 ntBASIC27.11■■□□□ 1.93
USPL1Q5W0Q7 LIMD2-206ENST00000578993 602 ntTSL 3 BASIC27.11■■□□□ 1.93
USPL1Q5W0Q7 VPS29-206ENST00000549578 1523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.11■■□□□ 1.93
USPL1Q5W0Q7 ZNF213-208ENST00000576416 2240 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.1■■□□□ 1.93
USPL1Q5W0Q7 MTHFS-201ENST00000258874 907 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.1■■□□□ 1.93
USPL1Q5W0Q7 ZCCHC9-204ENST00000438268 1248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.1■■□□□ 1.93
USPL1Q5W0Q7 AC009086.2-201ENST00000449759 610 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC27.1■■□□□ 1.93
USPL1Q5W0Q7 ZNF346-203ENST00000503425 1191 ntTSL 2 BASIC27.1■■□□□ 1.93
USPL1Q5W0Q7 OVCH1-AS1-203ENST00000551108 963 ntTSL 2 BASIC27.1■■□□□ 1.93
USPL1Q5W0Q7 AC016405.3-201ENST00000607710 860 ntBASIC27.1■■□□□ 1.93
USPL1Q5W0Q7 OR10C1-204ENST00000622521 1039 ntBASIC27.1■■□□□ 1.93
USPL1Q5W0Q7 AL160396.2-202ENST00000636692 566 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.1■■□□□ 1.93
USPL1Q5W0Q7 SPINT2-201ENST00000301244 1802 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.1■■□□□ 1.93
USPL1Q5W0Q7 RBPMS2-201ENST00000300069 2008 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.1■■□□□ 1.93
USPL1Q5W0Q7 LINC00526-201ENST00000581067 1875 ntBASIC27.1■■□□□ 1.93
USPL1Q5W0Q7 MREG-201ENST00000263268 1314 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.1■■□□□ 1.93
USPL1Q5W0Q7 ADRM1-204ENST00000491935 1530 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.1■■□□□ 1.93
USPL1Q5W0Q7 GSEC-202ENST00000629441 1572 ntTSL 2 BASIC27.09■■□□□ 1.93
USPL1Q5W0Q7 OR7E47P-201ENST00000546390 1422 ntBASIC27.09■■□□□ 1.93
USPL1Q5W0Q7 MRPL38-201ENST00000309352 1888 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.09■■□□□ 1.93
USPL1Q5W0Q7 AC053503.5-201ENST00000601508 636 ntBASIC27.09■■□□□ 1.93
USPL1Q5W0Q7 TMEM5-201ENST00000261234 1918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.09■■□□□ 1.93
USPL1Q5W0Q7 AC092068.2-201ENST00000590491 1708 ntBASIC27.09■■□□□ 1.93
USPL1Q5W0Q7 HSF4-215ENST00000521374 1515 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.09■■□□□ 1.93
USPL1Q5W0Q7 VSX1-205ENST00000429762 1977 ntTSL 1 (best) BASIC27.09■■□□□ 1.93
USPL1Q5W0Q7 MAPK12-211ENST00000622558 1779 ntTSL 1 (best) BASIC27.09■■□□□ 1.93
USPL1Q5W0Q7 GFOD1-204ENST00000603223 2388 ntTSL 2 BASIC27.08■■□□□ 1.93
USPL1Q5W0Q7 FNTA-208ENST00000529687 1950 ntTSL 2 BASIC27.08■■□□□ 1.93
USPL1Q5W0Q7 ZFAND4-205ENST00000374371 2283 ntTSL 5 BASIC27.08■■□□□ 1.93
USPL1Q5W0Q7 PPP1CA-202ENST00000358239 1054 ntTSL 2 BASIC27.08■■□□□ 1.93
USPL1Q5W0Q7 C19orf25-213ENST00000592872 1287 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.08■■□□□ 1.93
USPL1Q5W0Q7 AC092118.2-201ENST00000613495 667 ntBASIC27.08■■□□□ 1.93
USPL1Q5W0Q7 ADD3-AS1-204ENST00000627565 388 ntTSL 3 BASIC27.08■■□□□ 1.93
USPL1Q5W0Q7 AP000547.3-201ENST00000592918 1576 ntTSL 1 (best) BASIC27.08■■□□□ 1.93
USPL1Q5W0Q7 MMP23B-202ENST00000378675 1309 ntTSL 1 (best) BASIC27.08■■□□□ 1.93
USPL1Q5W0Q7 MAP6D1-201ENST00000318631 2111 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.08■■□□□ 1.93
USPL1Q5W0Q7 DONSON-204ENST00000432378 1618 ntTSL 5 BASIC27.08■■□□□ 1.93
USPL1Q5W0Q7 PACRGL-227ENST00000513459 1773 ntTSL 5 BASIC27.07■■□□□ 1.92
USPL1Q5W0Q7 CCDC74A-201ENST00000295171 1543 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.07■■□□□ 1.92
USPL1Q5W0Q7 CCDC74B-201ENST00000310463 1549 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC27.07■■□□□ 1.92
USPL1Q5W0Q7 PPP1R26-201ENST00000356818 4932 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.07■■□□□ 1.92
USPL1Q5W0Q7 PDLIM2-202ENST00000308354 2236 ntTSL 1 (best) BASIC27.07■■□□□ 1.92
USPL1Q5W0Q7 PDLIM2-203ENST00000339162 2226 ntTSL 1 (best) BASIC27.07■■□□□ 1.92
USPL1Q5W0Q7 RPS2P52-201ENST00000469610 820 ntBASIC27.07■■□□□ 1.92
USPL1Q5W0Q7 SEC23A-213ENST00000557280 561 ntTSL 4 BASIC27.07■■□□□ 1.92
USPL1Q5W0Q7 TNFRSF10B-202ENST00000347739 1723 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.07■■□□□ 1.92
USPL1Q5W0Q7 DOC2A-218ENST00000616445 2065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.07■■□□□ 1.92
USPL1Q5W0Q7 CASK-201ENST00000378154 2494 ntTSL 5 BASIC27.07■■□□□ 1.92
USPL1Q5W0Q7 NABP2-203ENST00000380198 1775 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.07■■□□□ 1.92
USPL1Q5W0Q7 BARX2-201ENST00000281437 1813 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.06■■□□□ 1.92
USPL1Q5W0Q7 CASTOR1-201ENST00000404953 1460 ntTSL 5 BASIC27.06■■□□□ 1.92
USPL1Q5W0Q7 TUSC3-203ENST00000503731 1498 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC27.06■■□□□ 1.92
USPL1Q5W0Q7 C22orf34-203ENST00000405854 1593 ntTSL 5 BASIC27.06■■□□□ 1.92
USPL1Q5W0Q7 FASTK-217ENST00000540185 1609 ntTSL 5 BASIC27.06■■□□□ 1.92
USPL1Q5W0Q7 IFNGR2-203ENST00000405436 1684 ntTSL 5 BASIC27.06■■□□□ 1.92
USPL1Q5W0Q7 ZNF580-201ENST00000325333 1261 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.06■■□□□ 1.92
USPL1Q5W0Q7 AL391244.2-201ENST00000428932 543 ntTSL 2 BASIC27.06■■□□□ 1.92
USPL1Q5W0Q7 AC021660.2-201ENST00000502999 388 ntTSL 3 BASIC27.06■■□□□ 1.92
USPL1Q5W0Q7 AP000785.1-201ENST00000527314 613 ntTSL 4 BASIC27.06■■□□□ 1.92
USPL1Q5W0Q7 C12orf43-208ENST00000539736 1033 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC27.06■■□□□ 1.92
USPL1Q5W0Q7 ZNF580-203ENST00000545125 1025 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC27.06■■□□□ 1.92
USPL1Q5W0Q7 PTGER2-202ENST00000557436 643 ntTSL 3 BASIC27.06■■□□□ 1.92
USPL1Q5W0Q7 PRR16-202ENST00000407149 1747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.06■■□□□ 1.92
USPL1Q5W0Q7 BCAT2-208ENST00000598162 1329 ntTSL 1 (best) BASIC27.06■■□□□ 1.92
USPL1Q5W0Q7 AC083805.3-201ENST00000619560 1315 ntTSL 3 BASIC27.06■■□□□ 1.92
USPL1Q5W0Q7 DUSP9-202ENST00000370167 2289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.06■■□□□ 1.92
USPL1Q5W0Q7 MVD-201ENST00000301012 1823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.06■■□□□ 1.92
USPL1Q5W0Q7 AP006587.3-201ENST00000525742 1516 ntBASIC27.06■■□□□ 1.92
USPL1Q5W0Q7 KCNS1-202ENST00000537075 2136 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.05■■□□□ 1.92
USPL1Q5W0Q7 SSUH2-217ENST00000544814 1636 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC27.05■■□□□ 1.92
USPL1Q5W0Q7 FRS3-202ENST00000373018 2174 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC27.05■■□□□ 1.92
USPL1Q5W0Q7 SERTAD3-201ENST00000322354 1734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.05■■□□□ 1.92
USPL1Q5W0Q7 CNPY3-201ENST00000372836 1704 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.05■■□□□ 1.92
USPL1Q5W0Q7 ERGIC1-202ENST00000393784 2881 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.05■■□□□ 1.92
USPL1Q5W0Q7 PRDX1-201ENST00000262746 1234 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.05■■□□□ 1.92
USPL1Q5W0Q7 AL512625.2-201ENST00000417533 625 ntBASIC27.05■■□□□ 1.92
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 23.7 ms