Protein–RNA interactions for Protein: Q5VTH9

WDR78, WD repeat-containing protein 78, humanhuman

Predictions only

Length 848 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
WDR78Q5VTH9 PPP2R2C-203ENST00000382599 1807 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.51■■□□□ 1.51
WDR78Q5VTH9 CENPN-201ENST00000299572 1398 ntTSL 1 (best) BASIC24.51■■□□□ 1.51
WDR78Q5VTH9 CPLX1-203ENST00000505203 2011 ntTSL 2 BASIC24.51■■□□□ 1.51
WDR78Q5VTH9 MRPL37-206ENST00000605337 1582 ntTSL 5 BASIC24.5■■□□□ 1.51
WDR78Q5VTH9 MTMR14-202ENST00000351233 2105 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.5■■□□□ 1.51
WDR78Q5VTH9 DTYMK-201ENST00000305784 1232 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.5■■□□□ 1.51
WDR78Q5VTH9 ZNF644-203ENST00000361321 1253 ntTSL 2 BASIC24.5■■□□□ 1.51
WDR78Q5VTH9 TSPAN11-202ENST00000535215 988 ntTSL 2 BASIC24.5■■□□□ 1.51
WDR78Q5VTH9 GGTLC3-201ENST00000619998 968 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.5■■□□□ 1.51
WDR78Q5VTH9 VPS29-206ENST00000549578 1523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.5■■□□□ 1.51
WDR78Q5VTH9 C22orf34-203ENST00000405854 1593 ntTSL 5 BASIC24.5■■□□□ 1.51
WDR78Q5VTH9 USP36-218ENST00000590546 1771 ntTSL 1 (best) BASIC24.49■■□□□ 1.51
WDR78Q5VTH9 HRH3-202ENST00000340177 2659 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.49■■□□□ 1.51
WDR78Q5VTH9 CYS1-201ENST00000381813 2738 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.49■■□□□ 1.51
WDR78Q5VTH9 HSD17B10-202ENST00000375298 823 ntTSL 3 BASIC24.49■■□□□ 1.51
WDR78Q5VTH9 C2orf82-203ENST00000409533 561 ntAPPRIS P2 TSL 4 BASIC24.49■■□□□ 1.51
WDR78Q5VTH9 NRXN2-205ENST00000409571 6381 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.49■■□□□ 1.51
WDR78Q5VTH9 UQCRFS1P1-201ENST00000435169 820 ntBASIC24.49■■□□□ 1.51
WDR78Q5VTH9 AC009086.2-201ENST00000449759 610 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC24.49■■□□□ 1.51
WDR78Q5VTH9 JADE2-211ENST00000612830 1251 ntTSL 1 (best) BASIC24.49■■□□□ 1.51
WDR78Q5VTH9 ALDH3A2-224ENST00000626500 995 ntTSL 5 BASIC24.49■■□□□ 1.51
WDR78Q5VTH9 MKRN4P-201ENST00000444706 1521 ntBASIC24.49■■□□□ 1.51
WDR78Q5VTH9 RNF166-202ENST00000537718 1525 ntTSL 2 BASIC24.49■■□□□ 1.51
WDR78Q5VTH9 REPIN1-214ENST00000489432 2058 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.49■■□□□ 1.51
WDR78Q5VTH9 SMAD1-201ENST00000302085 1966 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.48■■□□□ 1.51
WDR78Q5VTH9 MFSD7-201ENST00000322224 2123 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.48■■□□□ 1.51
WDR78Q5VTH9 IFNGR2-203ENST00000405436 1684 ntTSL 5 BASIC24.48■■□□□ 1.51
WDR78Q5VTH9 ZNF148-203ENST00000468369 1025 ntTSL 1 (best) BASIC24.48■■□□□ 1.51
WDR78Q5VTH9 RNA5SP413-201ENST00000516373 109 ntBASIC24.48■■□□□ 1.51
WDR78Q5VTH9 C12orf42-208ENST00000548883 1336 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.48■■□□□ 1.51
WDR78Q5VTH9 AC068338.2-201ENST00000563278 1430 ntBASIC24.48■■□□□ 1.51
WDR78Q5VTH9 MIR4758-201ENST00000577688 71 ntBASIC24.48■■□□□ 1.51
WDR78Q5VTH9 SYT6-209ENST00000610222 1707 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.48■■□□□ 1.51
WDR78Q5VTH9 CIRBP-246ENST00000628979 1043 ntTSL 2 BASIC24.48■■□□□ 1.51
WDR78Q5VTH9 QPCT-201ENST00000338415 1739 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.47■■□□□ 1.51
WDR78Q5VTH9 AP006587.3-201ENST00000525742 1516 ntBASIC24.47■■□□□ 1.51
WDR78Q5VTH9 MTAP-204ENST00000460874 1434 ntTSL 2 BASIC24.47■■□□□ 1.51
WDR78Q5VTH9 CSNK1G3-206ENST00000511130 1356 ntTSL 2 BASIC24.47■■□□□ 1.51
WDR78Q5VTH9 MED10-201ENST00000255764 1141 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.47■■□□□ 1.51
WDR78Q5VTH9 MAL-201ENST00000309988 1112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.47■■□□□ 1.51
WDR78Q5VTH9 CYB5R4-201ENST00000369679 768 ntTSL 3 BASIC24.47■■□□□ 1.51
WDR78Q5VTH9 CUEDC2-201ENST00000369937 1191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.47■■□□□ 1.51
WDR78Q5VTH9 BET1L-204ENST00000410108 637 ntTSL 3 BASIC24.47■■□□□ 1.51
WDR78Q5VTH9 BSPRY-201ENST00000374183 2339 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.47■■□□□ 1.51
WDR78Q5VTH9 BST1-202ENST00000382346 1993 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.47■■□□□ 1.51
WDR78Q5VTH9 EID2B-201ENST00000326282 1865 ntAPPRIS P1 BASIC24.47■■□□□ 1.51
WDR78Q5VTH9 AP000547.3-201ENST00000592918 1576 ntTSL 1 (best) BASIC24.46■■□□□ 1.51
WDR78Q5VTH9 TMEM44-211ENST00000473092 1508 ntTSL 1 (best) BASIC24.46■■□□□ 1.51
WDR78Q5VTH9 LRP5-201ENST00000294304 5159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.46■■□□□ 1.51
WDR78Q5VTH9 AC073210.2-201ENST00000430369 194 ntBASIC24.46■■□□□ 1.51
WDR78Q5VTH9 EEF1DP3-203ENST00000566025 782 ntBASIC24.46■■□□□ 1.51
WDR78Q5VTH9 SCN1B-203ENST00000595652 814 ntTSL 2 BASIC24.46■■□□□ 1.51
WDR78Q5VTH9 AL136982.7-201ENST00000609363 465 ntTSL 4 BASIC24.46■■□□□ 1.51
WDR78Q5VTH9 MYO19-221ENST00000620640 1186 ntTSL 2 BASIC24.46■■□□□ 1.51
WDR78Q5VTH9 AC008694.1-202ENST00000636953 945 ntBASIC24.46■■□□□ 1.51
WDR78Q5VTH9 SNX24-211ENST00000513881 1563 ntTSL 1 (best) BASIC24.46■■□□□ 1.51
WDR78Q5VTH9 ONECUT3-201ENST00000382349 8318 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.45■■□□□ 1.51
WDR78Q5VTH9 ZBTB42-202ENST00000555360 1411 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.45■■□□□ 1.51
WDR78Q5VTH9 C1orf122-202ENST00000373043 2229 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.45■■□□□ 1.5
WDR78Q5VTH9 NABP2-203ENST00000380198 1775 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.45■■□□□ 1.5
WDR78Q5VTH9 STEAP1-201ENST00000297205 1313 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.45■■□□□ 1.5
WDR78Q5VTH9 SBK2-201ENST00000344158 1056 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.45■■□□□ 1.5
WDR78Q5VTH9 IPO13-201ENST00000372339 1201 ntTSL 2 BASIC24.45■■□□□ 1.5
WDR78Q5VTH9 YBEY-204ENST00000397692 433 ntTSL 1 (best) BASIC24.45■■□□□ 1.5
WDR78Q5VTH9 MIPEPP3-201ENST00000412105 444 ntBASIC24.45■■□□□ 1.5
WDR78Q5VTH9 SBK2-202ENST00000413299 1085 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.45■■□□□ 1.5
WDR78Q5VTH9 AC053503.5-201ENST00000601508 636 ntBASIC24.45■■□□□ 1.5
WDR78Q5VTH9 SH3YL1-201ENST00000356150 1763 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.44■■□□□ 1.5
WDR78Q5VTH9 IGF2-AS-201ENST00000381361 2063 ntTSL 2 BASIC24.44■■□□□ 1.5
WDR78Q5VTH9 UBE2E3-201ENST00000392415 1347 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC24.44■■□□□ 1.5
WDR78Q5VTH9 NUDT8-202ENST00000376693 728 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.44■■□□□ 1.5
WDR78Q5VTH9 ZNF295-AS1-201ENST00000412906 952 ntTSL 1 (best) BASIC24.44■■□□□ 1.5
WDR78Q5VTH9 C12orf43-208ENST00000539736 1033 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.44■■□□□ 1.5
WDR78Q5VTH9 FP565260.3-201ENST00000612610 1162 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC24.44■■□□□ 1.5
WDR78Q5VTH9 PKM-204ENST00000449901 2526 ntTSL 2 BASIC24.43■■□□□ 1.5
WDR78Q5VTH9 KLHDC9-201ENST00000368011 1314 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.43■■□□□ 1.5
WDR78Q5VTH9 NDEL1-201ENST00000334527 2372 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.43■■□□□ 1.5
WDR78Q5VTH9 SDHC-201ENST00000342751 1127 ntTSL 1 (best) BASIC24.43■■□□□ 1.5
WDR78Q5VTH9 RAMP1-202ENST00000403885 650 ntTSL 3 BASIC24.43■■□□□ 1.5
WDR78Q5VTH9 CCDC74B-203ENST00000409128 789 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.43■■□□□ 1.5
WDR78Q5VTH9 ZCCHC9-204ENST00000438268 1248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.43■■□□□ 1.5
WDR78Q5VTH9 CALM1-202ENST00000447653 1104 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC24.43■■□□□ 1.5
WDR78Q5VTH9 C17orf107-202ENST00000521575 1275 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.43■■□□□ 1.5
WDR78Q5VTH9 SLC7A5P1-201ENST00000568957 537 ntBASIC24.43■■□□□ 1.5
WDR78Q5VTH9 AC016405.3-201ENST00000607710 860 ntBASIC24.43■■□□□ 1.5
WDR78Q5VTH9 DYRK1B-201ENST00000323039 2535 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.43■■□□□ 1.5
WDR78Q5VTH9 KCNH6-203ENST00000580652 1703 ntTSL 1 (best) BASIC24.43■■□□□ 1.5
WDR78Q5VTH9 CASTOR1-201ENST00000404953 1460 ntTSL 5 BASIC24.43■■□□□ 1.5
WDR78Q5VTH9 GNB2-201ENST00000303210 1878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.43■■□□□ 1.5
WDR78Q5VTH9 PTP4A3-203ENST00000520105 1866 ntTSL 5 BASIC24.43■■□□□ 1.5
WDR78Q5VTH9 FASTK-217ENST00000540185 1609 ntTSL 5 BASIC24.43■■□□□ 1.5
WDR78Q5VTH9 GRTP1-203ENST00000375431 1384 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.42■■□□□ 1.5
WDR78Q5VTH9 LRRC34-201ENST00000446859 1718 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.42■■□□□ 1.5
WDR78Q5VTH9 GGA2-211ENST00000567468 1713 ntTSL 2 BASIC24.42■■□□□ 1.5
WDR78Q5VTH9 MSANTD3-207ENST00000622639 1748 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC24.42■■□□□ 1.5
WDR78Q5VTH9 OIP5-201ENST00000220514 1236 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.42■■□□□ 1.5
WDR78Q5VTH9 BEX2-204ENST00000536889 1077 ntTSL 2 BASIC24.42■■□□□ 1.5
WDR78Q5VTH9 PSME3-210ENST00000590720 998 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.42■■□□□ 1.5
WDR78Q5VTH9 PET100-202ENST00000594797 719 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.42■■□□□ 1.5
WDR78Q5VTH9 AC120498.10-201ENST00000621827 505 ntBASIC24.42■■□□□ 1.5
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 101.8 ms