Protein–RNA interactions for Protein: Q53RE8

ANKRD39, Ankyrin repeat domain-containing protein 39, humanhuman

Predictions only

Length 183 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ANKRD39Q53RE8 LIMS2-207ENST00000409808 2315 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.29■□□□□ 0.04
ANKRD39Q53RE8 STMN3-201ENST00000370053 2255 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
ANKRD39Q53RE8 JRK-211ENST00000615982 2823 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
ANKRD39Q53RE8 GMDS-202ENST00000380815 1752 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
ANKRD39Q53RE8 PRRT4-201ENST00000446477 3544 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.29■□□□□ 0.04
ANKRD39Q53RE8 SRSF4-201ENST00000373795 2387 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
ANKRD39Q53RE8 GAL3ST3-203ENST00000527878 1599 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
ANKRD39Q53RE8 HNRNPLP2-201ENST00000568980 1570 ntBASIC15.28■□□□□ 0.04
ANKRD39Q53RE8 SMTNL2-202ENST00000389313 2280 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
ANKRD39Q53RE8 MTMR1-208ENST00000445323 4516 ntTSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
ANKRD39Q53RE8 ME3-202ENST00000393324 2240 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
ANKRD39Q53RE8 CCDC24-201ENST00000372318 1463 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
ANKRD39Q53RE8 FGFR2-204ENST00000356226 3547 ntTSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
ANKRD39Q53RE8 CPNE9-203ENST00000383832 2068 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.28■□□□□ 0.04
ANKRD39Q53RE8 UTS2R-201ENST00000313135 1357 ntAPPRIS P1 BASIC15.28■□□□□ 0.04
ANKRD39Q53RE8 NUDT10-202ENST00000376006 2001 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
ANKRD39Q53RE8 SPIRE2-201ENST00000378247 3235 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
ANKRD39Q53RE8 SNUPN-205ENST00000564644 1931 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.28■□□□□ 0.04
ANKRD39Q53RE8 DUX4L28-201ENST00000623687 678 ntBASIC15.28■□□□□ 0.04
ANKRD39Q53RE8 FDXR-201ENST00000293195 1875 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
ANKRD39Q53RE8 HCG18-235ENST00000426882 4862 ntTSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
ANKRD39Q53RE8 PCDHAC2-203ENST00000615316 3011 ntBASIC15.28■□□□□ 0.04
ANKRD39Q53RE8 EIF3C-211ENST00000566866 2986 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
ANKRD39Q53RE8 NUDT11-201ENST00000375992 2385 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
ANKRD39Q53RE8 GAS7-205ENST00000542249 1799 ntTSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
ANKRD39Q53RE8 SLC41A3-202ENST00000346785 1705 ntTSL 2 BASIC15.28■□□□□ 0.04
ANKRD39Q53RE8 KCNK6-201ENST00000263372 5722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
ANKRD39Q53RE8 PDIA2-201ENST00000219406 1698 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
ANKRD39Q53RE8 RABL2B-206ENST00000395598 2169 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
ANKRD39Q53RE8 TNFSF11-203ENST00000398795 2199 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
ANKRD39Q53RE8 ZNF419-204ENST00000415379 2186 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.28■□□□□ 0.04
ANKRD39Q53RE8 USF2-201ENST00000222305 1634 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
ANKRD39Q53RE8 AL591684.2-201ENST00000605970 1594 ntTSL 5 BASIC15.28■□□□□ 0.04
ANKRD39Q53RE8 ZNF513-202ENST00000407879 2077 ntTSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
ANKRD39Q53RE8 HERPUD2-202ENST00000396081 3057 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
ANKRD39Q53RE8 GOLGA2P6-201ENST00000340929 2049 ntBASIC15.27■□□□□ 0.04
ANKRD39Q53RE8 SYT3-206ENST00000600079 2463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.04
ANKRD39Q53RE8 RUNX2-211ENST00000625924 1458 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.04
ANKRD39Q53RE8 INPP4A-201ENST00000074304 6752 ntTSL 5 BASIC15.27■□□□□ 0.04
ANKRD39Q53RE8 RNF32-207ENST00000405335 1938 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.27■□□□□ 0.04
ANKRD39Q53RE8 MON1A-201ENST00000296473 2370 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.04
ANKRD39Q53RE8 DMRT2-205ENST00000382255 2367 ntTSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.04
ANKRD39Q53RE8 EPB41L4A-AS2-201ENST00000623705 1396 ntBASIC15.27■□□□□ 0.04
ANKRD39Q53RE8 TRABD2A-201ENST00000335459 1844 ntTSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.04
ANKRD39Q53RE8 TRADD-202ENST00000486556 1833 ntTSL 2 BASIC15.27■□□□□ 0.04
ANKRD39Q53RE8 FGFR1-214ENST00000447712 5900 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.04
ANKRD39Q53RE8 SLC39A13-202ENST00000362021 2296 ntTSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.04
ANKRD39Q53RE8 MXRA8-209ENST00000477278 2728 ntTSL 5 BASIC15.27■□□□□ 0.04
ANKRD39Q53RE8 TUB-203ENST00000534099 1759 ntTSL 2 BASIC15.27■□□□□ 0.04
ANKRD39Q53RE8 AL691447.2-201ENST00000454869 2162 ntTSL 2 BASIC15.27■□□□□ 0.04
ANKRD39Q53RE8 URI1-202ENST00000392271 3444 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.04
ANKRD39Q53RE8 MSLN-205ENST00000563941 2109 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.04
ANKRD39Q53RE8 FGF14-IT1-202ENST00000607251 2123 ntTSL 2 BASIC15.27■□□□□ 0.04
ANKRD39Q53RE8 KIFC3-203ENST00000445690 3379 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.04
ANKRD39Q53RE8 TMEM260-202ENST00000538838 1638 ntTSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.03
ANKRD39Q53RE8 VEGFA-209ENST00000425836 1575 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.03
ANKRD39Q53RE8 EPS8L2-205ENST00000526198 2289 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.03
ANKRD39Q53RE8 MAPRE3-203ENST00000405074 1801 ntTSL 3 BASIC15.27■□□□□ 0.03
ANKRD39Q53RE8 CPEB1-AS1-201ENST00000560650 2138 ntTSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
ANKRD39Q53RE8 TBL2-201ENST00000305632 3161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
ANKRD39Q53RE8 LZTS3-201ENST00000329152 5257 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
ANKRD39Q53RE8 NRXN2-201ENST00000265459 6621 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.26■□□□□ 0.03
ANKRD39Q53RE8 BX088645.1-201ENST00000636699 1728 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.26■□□□□ 0.03
ANKRD39Q53RE8 NSMCE4A-202ENST00000369023 1394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
ANKRD39Q53RE8 C17orf67-201ENST00000397861 2013 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
ANKRD39Q53RE8 ST3GAL3-207ENST00000353126 1969 ntTSL 5 BASIC15.26■□□□□ 0.03
ANKRD39Q53RE8 AVPR2-201ENST00000337474 1622 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
ANKRD39Q53RE8 IKBKG-206ENST00000594239 2299 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
ANKRD39Q53RE8 SAMD14-203ENST00000503131 1938 ntTSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
ANKRD39Q53RE8 HSD17B1-201ENST00000225929 1265 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.26■□□□□ 0.03
ANKRD39Q53RE8 PGAM5-201ENST00000317555 1182 ntTSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
ANKRD39Q53RE8 PLEKHF2-202ENST00000519516 1144 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.26■□□□□ 0.03
ANKRD39Q53RE8 CHST11-203ENST00000547956 936 ntTSL 2 BASIC15.26■□□□□ 0.03
ANKRD39Q53RE8 SUZ12P1-203ENST00000578195 985 ntBASIC15.26■□□□□ 0.03
ANKRD39Q53RE8 MCCC1-201ENST00000265594 2545 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
ANKRD39Q53RE8 FAM83H-201ENST00000388913 5654 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.26■□□□□ 0.03
ANKRD39Q53RE8 IRF3-228ENST00000601291 1556 ntTSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
ANKRD39Q53RE8 AL133373.2-201ENST00000623187 2828 ntBASIC15.26■□□□□ 0.03
ANKRD39Q53RE8 AL445183.2-201ENST00000439621 1871 ntTSL 2 BASIC15.26■□□□□ 0.03
ANKRD39Q53RE8 TTBK1-202ENST00000304139 2449 ntTSL 5 BASIC15.26■□□□□ 0.03
ANKRD39Q53RE8 FAM213B-204ENST00000419916 2749 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
ANKRD39Q53RE8 DNAJB5-201ENST00000312316 2391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
ANKRD39Q53RE8 GPR108-201ENST00000264080 2057 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
ANKRD39Q53RE8 CDKN2C-203ENST00000396148 2086 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
ANKRD39Q53RE8 SLC12A4-202ENST00000422611 4670 ntTSL 2 BASIC15.26■□□□□ 0.03
ANKRD39Q53RE8 SCUBE1-201ENST00000290460 2258 ntTSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
ANKRD39Q53RE8 ME2-206ENST00000638410 2289 ntTSL 5 BASIC15.26■□□□□ 0.03
ANKRD39Q53RE8 ME2-210ENST00000639255 2262 ntTSL 5 BASIC15.26■□□□□ 0.03
ANKRD39Q53RE8 PCMT1-205ENST00000464889 1984 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
ANKRD39Q53RE8 SNX27-204ENST00000458013 6403 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.25■□□□□ 0.03
ANKRD39Q53RE8 LRWD1-201ENST00000292616 2215 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
ANKRD39Q53RE8 APBB3-203ENST00000357560 2218 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.25■□□□□ 0.03
ANKRD39Q53RE8 FAM53A-202ENST00000461064 2159 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.25■□□□□ 0.03
ANKRD39Q53RE8 FAM167A-204ENST00000528897 1620 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.25■□□□□ 0.03
ANKRD39Q53RE8 KREMEN2-203ENST00000571007 1877 ntTSL 2 BASIC15.25■□□□□ 0.03
ANKRD39Q53RE8 SAE1-203ENST00000413379 2313 ntTSL 2 BASIC15.25■□□□□ 0.03
ANKRD39Q53RE8 TCAM1P-201ENST00000463377 452 ntTSL 3 BASIC15.25■□□□□ 0.03
ANKRD39Q53RE8 AC097358.2-201ENST00000607541 1159 ntBASIC15.25■□□□□ 0.03
ANKRD39Q53RE8 NRL-202ENST00000396997 1517 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
ANKRD39Q53RE8 PDK1-203ENST00000410055 2990 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 28 ms