Protein–RNA interactions for Protein: Q3SY84

KRT71, Keratin, type II cytoskeletal 71, humanhuman

Predictions only

Length 523 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
KRT71Q3SY84 FOXD4L3-201ENST00000342833 2039 ntAPPRIS P1 BASIC21.75■■□□□ 1.07
KRT71Q3SY84 FNDC4-201ENST00000264703 1657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.75■■□□□ 1.07
KRT71Q3SY84 ALX3-201ENST00000369792 1859 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.75■■□□□ 1.07
KRT71Q3SY84 OXCT2P1-201ENST00000447263 1535 ntBASIC21.75■■□□□ 1.07
KRT71Q3SY84 BICRA-204ENST00000614245 5697 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.75■■□□□ 1.07
KRT71Q3SY84 LAYN-209ENST00000533265 1703 ntTSL 5 BASIC21.75■■□□□ 1.07
KRT71Q3SY84 INSM1-201ENST00000310227 2829 ntAPPRIS P1 BASIC21.75■■□□□ 1.07
KRT71Q3SY84 NEUROG3-201ENST00000242462 1376 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.74■■□□□ 1.07
KRT71Q3SY84 TUBGCP3-204ENST00000464139 2461 ntTSL 1 (best) BASIC21.74■■□□□ 1.07
KRT71Q3SY84 TXNRD3-204ENST00000640433 1932 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.74■■□□□ 1.07
KRT71Q3SY84 AGAP3-202ENST00000397238 3225 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.74■■□□□ 1.07
KRT71Q3SY84 COPRS-201ENST00000302362 968 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.74■■□□□ 1.07
KRT71Q3SY84 SENP5-202ENST00000419026 973 ntTSL 3 BASIC21.74■■□□□ 1.07
KRT71Q3SY84 TMPO-AS1-201ENST00000546421 738 ntTSL 5 BASIC21.74■■□□□ 1.07
KRT71Q3SY84 STX4-201ENST00000313843 1481 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.74■■□□□ 1.07
KRT71Q3SY84 PAQR9-201ENST00000340634 2452 ntAPPRIS P1 BASIC21.74■■□□□ 1.07
KRT71Q3SY84 GNA12-201ENST00000275364 4378 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.74■■□□□ 1.07
KRT71Q3SY84 FADS6-203ENST00000612771 2154 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.74■■□□□ 1.07
KRT71Q3SY84 NAA35-202ENST00000376040 1797 ntTSL 2 BASIC21.74■■□□□ 1.07
KRT71Q3SY84 ADAMTS2-202ENST00000274609 2044 ntTSL 1 (best) BASIC21.73■■□□□ 1.07
KRT71Q3SY84 USP39-203ENST00000409470 2034 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.73■■□□□ 1.07
KRT71Q3SY84 DET1-201ENST00000268148 2267 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.73■■□□□ 1.07
KRT71Q3SY84 VRK2-201ENST00000340157 1888 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.73■■□□□ 1.07
KRT71Q3SY84 ARFRP1-210ENST00000614942 2554 ntTSL 5 BASIC21.73■■□□□ 1.07
KRT71Q3SY84 RNF32-207ENST00000405335 1938 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.73■■□□□ 1.07
KRT71Q3SY84 HTRA2-202ENST00000352222 1450 ntTSL 1 (best) BASIC21.73■■□□□ 1.07
KRT71Q3SY84 CCKBR-206ENST00000532715 1734 ntTSL 3 BASIC21.73■■□□□ 1.07
KRT71Q3SY84 PYCARD-201ENST00000247470 990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.73■■□□□ 1.07
KRT71Q3SY84 RAB33A-201ENST00000257017 1258 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.73■■□□□ 1.07
KRT71Q3SY84 TMEM240-203ENST00000624426 796 ntTSL 3 BASIC21.73■■□□□ 1.07
KRT71Q3SY84 RNF165-205ENST00000588679 2904 ntBASIC21.73■■□□□ 1.07
KRT71Q3SY84 ZNF821-202ENST00000425432 2000 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.73■■□□□ 1.07
KRT71Q3SY84 FYN-204ENST00000368678 2573 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC21.73■■□□□ 1.07
KRT71Q3SY84 AC092835.1-201ENST00000425953 1850 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.73■■□□□ 1.07
KRT71Q3SY84 AC026362.1-201ENST00000540866 5618 ntTSL 2 BASIC21.73■■□□□ 1.07
KRT71Q3SY84 MTMR12-203ENST00000382142 5187 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.73■■□□□ 1.07
KRT71Q3SY84 AC007952.6-201ENST00000573168 2673 ntBASIC21.73■■□□□ 1.07
KRT71Q3SY84 AC003957.1-201ENST00000625108 2673 ntBASIC21.73■■□□□ 1.07
KRT71Q3SY84 SLC25A22-228ENST00000628067 2692 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.73■■□□□ 1.07
KRT71Q3SY84 CBWD3-201ENST00000360171 2165 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.72■■□□□ 1.07
KRT71Q3SY84 PGF-201ENST00000238607 1693 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC21.72■■□□□ 1.07
KRT71Q3SY84 CBWD2-203ENST00000416503 1665 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.72■■□□□ 1.07
KRT71Q3SY84 HCG18-235ENST00000426882 4862 ntTSL 1 (best) BASIC21.72■■□□□ 1.07
KRT71Q3SY84 FAM3A-202ENST00000359889 1712 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.72■■□□□ 1.07
KRT71Q3SY84 SUMF2-208ENST00000434526 2052 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.72■■□□□ 1.07
KRT71Q3SY84 CREB3-201ENST00000353704 1832 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.72■■□□□ 1.07
KRT71Q3SY84 C10orf91-202ENST00000392630 1846 ntTSL 2 BASIC21.72■■□□□ 1.07
KRT71Q3SY84 SUSD3-202ENST00000375472 1195 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.72■■□□□ 1.07
KRT71Q3SY84 PTPRF-216ENST00000617451 1129 ntTSL 5 BASIC21.72■■□□□ 1.07
KRT71Q3SY84 ATOH8-201ENST00000306279 2438 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.72■■□□□ 1.07
KRT71Q3SY84 B4GALNT1-203ENST00000449184 1633 ntTSL 2 BASIC21.72■■□□□ 1.07
KRT71Q3SY84 SNUPN-205ENST00000564644 1931 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.72■■□□□ 1.07
KRT71Q3SY84 SNX27-204ENST00000458013 6403 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC21.72■■□□□ 1.07
KRT71Q3SY84 ZIM2-208ENST00000629319 2253 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.72■■□□□ 1.07
KRT71Q3SY84 WDR86-203ENST00000469830 1691 ntTSL 2 BASIC21.72■■□□□ 1.07
KRT71Q3SY84 FAM129C-203ENST00000449408 2004 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.72■■□□□ 1.07
KRT71Q3SY84 MAP3K15-201ENST00000338883 4012 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.71■■□□□ 1.07
KRT71Q3SY84 NDUFAF6-203ENST00000396124 1798 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.71■■□□□ 1.07
KRT71Q3SY84 MMP17-201ENST00000360564 2411 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.71■■□□□ 1.07
KRT71Q3SY84 CSPG5-201ENST00000264723 4080 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.71■■□□□ 1.07
KRT71Q3SY84 MAIP1-201ENST00000295079 1495 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC21.71■■□□□ 1.07
KRT71Q3SY84 NARF-202ENST00000345415 1487 ntTSL 1 (best) BASIC21.71■■□□□ 1.07
KRT71Q3SY84 C17orf82-201ENST00000623772 1530 ntBASIC21.71■■□□□ 1.07
KRT71Q3SY84 HSD11B1L-203ENST00000342970 1620 ntTSL 1 (best) BASIC21.71■■□□□ 1.07
KRT71Q3SY84 BRI3-201ENST00000297290 780 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.71■■□□□ 1.07
KRT71Q3SY84 PYY2-202ENST00000441253 1076 ntTSL 1 (best) BASIC21.71■■□□□ 1.07
KRT71Q3SY84 AC010980.1-201ENST00000587192 1142 ntBASIC21.71■■□□□ 1.07
KRT71Q3SY84 MIR6722-201ENST00000617286 78 ntBASIC21.71■■□□□ 1.07
KRT71Q3SY84 NUDT11-201ENST00000375992 2385 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.71■■□□□ 1.07
KRT71Q3SY84 C17orf67-201ENST00000397861 2013 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.71■■□□□ 1.07
KRT71Q3SY84 AP1S1-201ENST00000337619 1306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.71■■□□□ 1.07
KRT71Q3SY84 FAM43B-201ENST00000332947 2572 ntAPPRIS P1 BASIC21.71■■□□□ 1.07
KRT71Q3SY84 ME3-212ENST00000543262 2311 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.71■■□□□ 1.07
KRT71Q3SY84 ZDHHC5-201ENST00000287169 4666 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.7■■□□□ 1.06
KRT71Q3SY84 E4F1-206ENST00000565090 2028 ntTSL 1 (best) BASIC21.7■■□□□ 1.06
KRT71Q3SY84 AP002761.3-201ENST00000546324 1695 ntTSL 2 BASIC21.7■■□□□ 1.06
KRT71Q3SY84 PTCH1-210ENST00000468211 1254 ntTSL 1 (best) BASIC21.7■■□□□ 1.06
KRT71Q3SY84 TSPAN10-204ENST00000611590 1068 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.7■■□□□ 1.06
KRT71Q3SY84 FAM20B-201ENST00000263733 5984 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.7■■□□□ 1.06
KRT71Q3SY84 FGF22-201ENST00000215530 1311 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.7■■□□□ 1.06
KRT71Q3SY84 SOX8-201ENST00000293894 3049 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.7■■□□□ 1.06
KRT71Q3SY84 DMRTB1-201ENST00000371445 1910 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.7■■□□□ 1.06
KRT71Q3SY84 IRF7-201ENST00000330243 1992 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC21.7■■□□□ 1.06
KRT71Q3SY84 PCED1A-202ENST00000360652 2016 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.7■■□□□ 1.06
KRT71Q3SY84 LHX6-201ENST00000340587 3457 ntTSL 1 (best) BASIC21.7■■□□□ 1.06
KRT71Q3SY84 ACHE-204ENST00000412389 2218 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.7■■□□□ 1.06
KRT71Q3SY84 BLCAP-208ENST00000414542 2205 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.7■■□□□ 1.06
KRT71Q3SY84 MAML1-201ENST00000292599 5723 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.69■■□□□ 1.06
KRT71Q3SY84 SIMC1-203ENST00000429602 2694 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.69■■□□□ 1.06
KRT71Q3SY84 SLC46A3-202ENST00000380814 2121 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.69■■□□□ 1.06
KRT71Q3SY84 ZDHHC14-203ENST00000359775 7380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.69■■□□□ 1.06
KRT71Q3SY84 PLPP2-202ENST00000327790 1397 ntTSL 5 BASIC21.69■■□□□ 1.06
KRT71Q3SY84 EPS8L1-201ENST00000201647 2536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.69■■□□□ 1.06
KRT71Q3SY84 ERLEC1-203ENST00000405123 1756 ntTSL 5 BASIC21.69■■□□□ 1.06
KRT71Q3SY84 SMPDL3A-203ENST00000539041 1755 ntTSL 2 BASIC21.69■■□□□ 1.06
KRT71Q3SY84 KDM2A-202ENST00000398645 6511 ntTSL 1 (best) BASIC21.69■■□□□ 1.06
KRT71Q3SY84 NSMF-201ENST00000265663 2981 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.69■■□□□ 1.06
KRT71Q3SY84 NSMF-206ENST00000371475 2987 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.69■■□□□ 1.06
KRT71Q3SY84 TTYH1-202ENST00000376530 1885 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.69■■□□□ 1.06
KRT71Q3SY84 SAMD10-201ENST00000369886 2181 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.68■■□□□ 1.06
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 35.3 ms