Protein–RNA interactions for Protein: Q15788

NCOA1, Nuclear receptor coactivator 1, humanhuman

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Length 1,441 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
NCOA1Q15788 ADD3-AS1-204ENST00000627565 388 ntTSL 3 BASIC32.11■■■□□ 2.73
NCOA1Q15788 ASPSCR1-202ENST00000306739 1843 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC32.11■■■□□ 2.73
NCOA1Q15788 FRMD8-203ENST00000416776 1818 ntTSL 2 BASIC32.11■■■□□ 2.73
NCOA1Q15788 KDF1-201ENST00000320567 1793 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC32.11■■■□□ 2.73
NCOA1Q15788 GPR143-203ENST00000467482 1762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.11■■■□□ 2.73
NCOA1Q15788 PTPN13-205ENST00000502971 1708 ntTSL 1 (best) BASIC32.11■■■□□ 2.73
NCOA1Q15788 CALM1-202ENST00000447653 1104 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC32.1■■■□□ 2.73
NCOA1Q15788 PSME3-210ENST00000590720 998 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.1■■■□□ 2.73
NCOA1Q15788 AC079328.2-202ENST00000560903 1410 ntTSL 1 (best) BASIC32.1■■■□□ 2.73
NCOA1Q15788 SLC25A11-201ENST00000225665 1897 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.1■■■□□ 2.73
NCOA1Q15788 KCNQ3-202ENST00000519445 2801 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC32.1■■■□□ 2.73
NCOA1Q15788 ADRM1-204ENST00000491935 1530 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC32.1■■■□□ 2.73
NCOA1Q15788 BTBD2-201ENST00000255608 2649 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.1■■■□□ 2.73
NCOA1Q15788 RAX2-202ENST00000555978 2145 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.1■■■□□ 2.73
NCOA1Q15788 PLAGL1-207ENST00000417959 1645 ntTSL 1 (best) BASIC32.1■■■□□ 2.73
NCOA1Q15788 SOX18-201ENST00000340356 1864 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.09■■■□□ 2.73
NCOA1Q15788 EFCAB6-202ENST00000356087 1129 ntTSL 5 BASIC32.09■■■□□ 2.73
NCOA1Q15788 IPO13-201ENST00000372339 1201 ntTSL 2 BASIC32.09■■■□□ 2.73
NCOA1Q15788 AC007322.1-201ENST00000426983 750 ntBASIC32.09■■■□□ 2.73
NCOA1Q15788 DM1-AS-203ENST00000590076 730 ntTSL 4 BASIC32.09■■■□□ 2.73
NCOA1Q15788 AC053503.5-201ENST00000601508 636 ntBASIC32.09■■■□□ 2.73
NCOA1Q15788 VPS29-206ENST00000549578 1523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.09■■■□□ 2.73
NCOA1Q15788 WDR86-207ENST00000621812 1542 ntTSL 5 BASIC32.09■■■□□ 2.73
NCOA1Q15788 CSNK1G3-206ENST00000511130 1356 ntTSL 2 BASIC32.09■■■□□ 2.73
NCOA1Q15788 TNK2-201ENST00000333602 5270 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.09■■■□□ 2.73
NCOA1Q15788 CD6-203ENST00000352009 1809 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC32.09■■■□□ 2.73
NCOA1Q15788 NAA20-201ENST00000310450 920 ntTSL 2 BASIC32.09■■■□□ 2.73
NCOA1Q15788 AL390816.2-201ENST00000554252 737 ntTSL 3 BASIC32.09■■■□□ 2.73
NCOA1Q15788 OSR2-210ENST00000523368 1519 ntTSL 1 (best) BASIC32.08■■■□□ 2.73
NCOA1Q15788 DTYMK-201ENST00000305784 1232 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.08■■■□□ 2.73
NCOA1Q15788 AL596275.1-201ENST00000423464 877 ntBASIC32.08■■■□□ 2.73
NCOA1Q15788 AC010536.3-201ENST00000620306 533 ntBASIC32.08■■■□□ 2.73
NCOA1Q15788 SOCS7-202ENST00000613678 1827 ntTSL 5 BASIC32.07■■■□□ 2.72
NCOA1Q15788 PCK2-201ENST00000216780 2357 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.07■■■□□ 2.72
NCOA1Q15788 C12orf42-208ENST00000548883 1336 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC32.07■■■□□ 2.72
NCOA1Q15788 MAP1LC3A-202ENST00000374837 961 ntTSL 3 BASIC32.07■■■□□ 2.72
NCOA1Q15788 LGALS7-201ENST00000378626 466 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.07■■■□□ 2.72
NCOA1Q15788 ARL6IP4-205ENST00000412505 818 ntTSL 5 BASIC32.07■■■□□ 2.72
NCOA1Q15788 MBD3L1-202ENST00000595891 872 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC32.07■■■□□ 2.72
NCOA1Q15788 CACNG2-201ENST00000300105 2384 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.07■■■□□ 2.72
NCOA1Q15788 CTDSP2-204ENST00000548823 1368 ntTSL 1 (best) BASIC32.07■■■□□ 2.72
NCOA1Q15788 NHLH1-201ENST00000302101 2563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.07■■■□□ 2.72
NCOA1Q15788 IFNGR2-203ENST00000405436 1684 ntTSL 5 BASIC32.06■■■□□ 2.72
NCOA1Q15788 PRR35-201ENST00000409413 2216 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.06■■■□□ 2.72
NCOA1Q15788 GGTLC1-202ENST00000286890 1028 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.06■■■□□ 2.72
NCOA1Q15788 LINC01816-201ENST00000414141 662 ntTSL 1 (best) BASIC32.06■■■□□ 2.72
NCOA1Q15788 APTR-203ENST00000430801 583 ntTSL 5 BASIC32.06■■■□□ 2.72
NCOA1Q15788 AC027451.1-201ENST00000530667 553 ntTSL 4 BASIC32.06■■■□□ 2.72
NCOA1Q15788 SLC7A5P1-201ENST00000568957 537 ntBASIC32.06■■■□□ 2.72
NCOA1Q15788 AC005789.1-201ENST00000585411 297 ntTSL 3 BASIC32.06■■■□□ 2.72
NCOA1Q15788 ELAC1-204ENST00000591429 975 ntTSL 1 (best) BASIC32.06■■■□□ 2.72
NCOA1Q15788 KRT7-201ENST00000331817 1754 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.06■■■□□ 2.72
NCOA1Q15788 KCNH6-203ENST00000580652 1703 ntTSL 1 (best) BASIC32.05■■■□□ 2.72
NCOA1Q15788 AVPR2-201ENST00000337474 1622 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.05■■■□□ 2.72
NCOA1Q15788 SEPT5-210ENST00000455784 2070 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.05■■■□□ 2.72
NCOA1Q15788 SGMS1-210ENST00000619438 1680 ntTSL 5 BASIC32.05■■■□□ 2.72
NCOA1Q15788 VIL1-204ENST00000440053 1454 ntTSL 1 (best) BASIC32.05■■■□□ 2.72
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NCOA1Q15788 MAGI2-AS3-211ENST00000451809 707 ntTSL 3 BASIC32.05■■■□□ 2.72
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NCOA1Q15788 AC139530.1-201ENST00000575312 1977 ntBASIC32.05■■■□□ 2.72
NCOA1Q15788 SLC25A47-202ENST00000557052 1552 ntTSL 1 (best) BASIC32.04■■■□□ 2.72
NCOA1Q15788 OLIG1-201ENST00000382348 2277 ntAPPRIS P1 BASIC32.04■■■□□ 2.72
NCOA1Q15788 GGA2-211ENST00000567468 1713 ntTSL 2 BASIC32.04■■■□□ 2.72
NCOA1Q15788 FDX2-202ENST00000393708 1012 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.04■■■□□ 2.72
NCOA1Q15788 HOXD12-201ENST00000404162 841 ntTSL 1 (best) BASIC32.04■■■□□ 2.72
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NCOA1Q15788 SNF8-202ENST00000502492 2319 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC32.04■■■□□ 2.72
NCOA1Q15788 KCNS1-202ENST00000537075 2136 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.04■■■□□ 2.72
NCOA1Q15788 PACRGL-227ENST00000513459 1773 ntTSL 5 BASIC32.04■■■□□ 2.72
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NCOA1Q15788 CEACAM4-201ENST00000221954 1205 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC32.03■■■□□ 2.72
NCOA1Q15788 MRPL39-201ENST00000307301 1199 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC32.03■■■□□ 2.72
NCOA1Q15788 MRPL39-202ENST00000352957 1110 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC32.03■■■□□ 2.72
NCOA1Q15788 AQP12B-201ENST00000407834 1094 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC32.03■■■□□ 2.72
NCOA1Q15788 CEACAM4-203ENST00000600925 899 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC32.03■■■□□ 2.72
NCOA1Q15788 RNF4-207ENST00000506706 2098 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.03■■■□□ 2.72
NCOA1Q15788 COMT-203ENST00000403184 2217 ntTSL 2 BASIC32.03■■■□□ 2.72
NCOA1Q15788 PLPP7-201ENST00000372261 972 ntTSL 2 BASIC32.02■■■□□ 2.72
NCOA1Q15788 MANBAL-202ENST00000373606 1208 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.02■■■□□ 2.72
NCOA1Q15788 LINC02531-201ENST00000404689 593 ntTSL 5 BASIC32.02■■■□□ 2.72
NCOA1Q15788 PET100-202ENST00000594797 719 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.02■■■□□ 2.72
NCOA1Q15788 CRTAC1-202ENST00000370591 2348 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC32.02■■■□□ 2.72
NCOA1Q15788 RUSC1-AS1-203ENST00000450199 1636 ntTSL 1 (best) BASIC32.02■■■□□ 2.72
NCOA1Q15788 GADD45GIP1-201ENST00000316939 1782 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.02■■■□□ 2.72
NCOA1Q15788 KHSRP-201ENST00000398148 2993 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC32.01■■■□□ 2.71
NCOA1Q15788 KPTN-201ENST00000338134 1691 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.01■■■□□ 2.71
NCOA1Q15788 HSF4-215ENST00000521374 1515 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.01■■■□□ 2.71
NCOA1Q15788 ATG101-201ENST00000336854 1439 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.01■■■□□ 2.71
NCOA1Q15788 CDYL-203ENST00000397588 2184 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.01■■■□□ 2.71
NCOA1Q15788 CYB5R4-201ENST00000369679 768 ntTSL 3 BASIC32■■■□□ 2.71
NCOA1Q15788 TSPAN11-202ENST00000535215 988 ntTSL 2 BASIC32■■■□□ 2.71
NCOA1Q15788 TUSC3-203ENST00000503731 1498 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC32■■■□□ 2.71
NCOA1Q15788 ATP5A1-220ENST00000593152 2258 ntTSL 2 BASIC32■■■□□ 2.71
NCOA1Q15788 KREMEN2-203ENST00000571007 1877 ntTSL 2 BASIC32■■■□□ 2.71
NCOA1Q15788 RNA5SP413-201ENST00000516373 109 ntBASIC32■■■□□ 2.71
NCOA1Q15788 HTATIP2-208ENST00000532505 595 ntTSL 2 BASIC32■■■□□ 2.71
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