Protein–RNA interactions for Protein: Q13098

GPS1, COP9 signalosome complex subunit 1, humanhuman

Predictions only

Length 491 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
GPS1Q13098 AC007009.1-201ENST00000458624 429 ntTSL 2 BASIC21.91■■□□□ 1.1
GPS1Q13098 ARSA-202ENST00000356098 1895 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.91■■□□□ 1.1
GPS1Q13098 SPOP-206ENST00000504102 1865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.91■■□□□ 1.1
GPS1Q13098 RAP2C-202ENST00000370874 2333 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.91■■□□□ 1.1
GPS1Q13098 RASGEF1C-201ENST00000361132 2243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.91■■□□□ 1.1
GPS1Q13098 TMEM129-206ENST00000536901 2172 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.91■■□□□ 1.1
GPS1Q13098 WTAP-201ENST00000337387 1622 ntTSL 1 (best) BASIC21.91■■□□□ 1.1
GPS1Q13098 SYT6-210ENST00000641643 1587 ntBASIC21.91■■□□□ 1.1
GPS1Q13098 DMRT2-203ENST00000358146 1965 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.9■■□□□ 1.1
GPS1Q13098 CERKL-205ENST00000409440 2425 ntTSL 2 BASIC21.9■■□□□ 1.1
GPS1Q13098 CNNM4-201ENST00000377075 4800 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.9■■□□□ 1.1
GPS1Q13098 AKR7A2-201ENST00000235835 1362 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.9■■□□□ 1.1
GPS1Q13098 TSKS-202ENST00000358830 1367 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.9■■□□□ 1.1
GPS1Q13098 EFS-202ENST00000351354 2704 ntTSL 1 (best) BASIC21.9■■□□□ 1.1
GPS1Q13098 TTYH1-203ENST00000376531 1763 ntTSL 1 (best) BASIC21.9■■□□□ 1.1
GPS1Q13098 POLR3GL-201ENST00000369313 818 ntTSL 2 BASIC21.9■■□□□ 1.1
GPS1Q13098 SOX3-201ENST00000370536 2132 ntAPPRIS P1 BASIC21.9■■□□□ 1.1
GPS1Q13098 ADAMTS13-203ENST00000371910 1074 ntTSL 1 (best) BASIC21.9■■□□□ 1.1
GPS1Q13098 AL356441.2-201ENST00000443009 864 ntBASIC21.9■■□□□ 1.1
GPS1Q13098 FAM228B-208ENST00000613899 1238 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.9■■□□□ 1.1
GPS1Q13098 KCNK12-201ENST00000327876 6227 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.9■■□□□ 1.1
GPS1Q13098 PPP3CC-203ENST00000397775 2094 ntTSL 2 BASIC21.9■■□□□ 1.1
GPS1Q13098 DCK-201ENST00000286648 2716 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.9■■□□□ 1.1
GPS1Q13098 PCSK6-217ENST00000618548 4269 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.89■■□□□ 1.1
GPS1Q13098 TMEM98-206ENST00000579849 4434 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.89■■□□□ 1.1
GPS1Q13098 SMUG1-215ENST00000508394 1697 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.89■■□□□ 1.1
GPS1Q13098 TPM1-204ENST00000334895 1637 ntTSL 1 (best) BASIC21.89■■□□□ 1.09
GPS1Q13098 RPP21-222ENST00000433076 577 ntTSL 2 BASIC21.89■■□□□ 1.09
GPS1Q13098 YJEFN3-201ENST00000436027 878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.89■■□□□ 1.09
GPS1Q13098 ERGIC1-206ENST00000519860 1000 ntTSL 3 BASIC21.89■■□□□ 1.09
GPS1Q13098 AC007448.3-201ENST00000585193 689 ntTSL 2 BASIC21.89■■□□□ 1.09
GPS1Q13098 MIR4466-201ENST00000606121 54 ntBASIC21.89■■□□□ 1.09
GPS1Q13098 LINC01881-206ENST00000614114 957 ntTSL 2 BASIC21.89■■□□□ 1.09
GPS1Q13098 HHIPL1-202ENST00000357223 2241 ntTSL 1 (best) BASIC21.89■■□□□ 1.09
GPS1Q13098 TMC7-205ENST00000569532 2738 ntTSL 2 BASIC21.89■■□□□ 1.09
GPS1Q13098 CPNE9-203ENST00000383832 2068 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.89■■□□□ 1.09
GPS1Q13098 SNCB-206ENST00000614675 1407 ntTSL 1 (best) BASIC21.89■■□□□ 1.09
GPS1Q13098 DYRK3-202ENST00000367108 2218 ntTSL 1 (best) BASIC21.88■■□□□ 1.09
GPS1Q13098 SEPT5-209ENST00000438754 2241 ntTSL 2 BASIC21.88■■□□□ 1.09
GPS1Q13098 ST3GAL5-222ENST00000638572 4431 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.88■■□□□ 1.09
GPS1Q13098 ZNF707-201ENST00000358656 2183 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.88■■□□□ 1.09
GPS1Q13098 HAUS4-201ENST00000206474 1642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.88■■□□□ 1.09
GPS1Q13098 FAM110A-206ENST00000541082 1614 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.88■■□□□ 1.09
GPS1Q13098 DTX4-201ENST00000227451 5642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.88■■□□□ 1.09
GPS1Q13098 OSBPL5-208ENST00000478260 2653 ntTSL 2 BASIC21.88■■□□□ 1.09
GPS1Q13098 PCMTD2-202ENST00000299468 1049 ntTSL 5 BASIC21.88■■□□□ 1.09
GPS1Q13098 CDKN2A-207ENST00000497750 565 ntTSL 4 BASIC21.88■■□□□ 1.09
GPS1Q13098 CDKN2A-212ENST00000578845 678 ntTSL 2 BASIC21.88■■□□□ 1.09
GPS1Q13098 TRIR-202ENST00000588213 841 ntTSL 3 BASIC21.88■■□□□ 1.09
GPS1Q13098 AL138724.1-201ENST00000606771 1088 ntBASIC21.88■■□□□ 1.09
GPS1Q13098 HMBS-201ENST00000278715 1501 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.88■■□□□ 1.09
GPS1Q13098 MEIS3-202ENST00000441740 1758 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.88■■□□□ 1.09
GPS1Q13098 CDC14A-203ENST00000370124 1883 ntTSL 1 (best) BASIC21.88■■□□□ 1.09
GPS1Q13098 SNAP23-202ENST00000349777 2480 ntTSL 2 BASIC21.87■■□□□ 1.09
GPS1Q13098 TRABD2A-203ENST00000409520 1975 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.87■■□□□ 1.09
GPS1Q13098 QPCT-201ENST00000338415 1739 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.87■■□□□ 1.09
GPS1Q13098 CCKBR-206ENST00000532715 1734 ntTSL 3 BASIC21.87■■□□□ 1.09
GPS1Q13098 ANAPC13-201ENST00000354910 1209 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.87■■□□□ 1.09
GPS1Q13098 AURKAIP1-204ENST00000378853 875 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.87■■□□□ 1.09
GPS1Q13098 HDHD5-203ENST00000399852 1118 ntTSL 3 BASIC21.87■■□□□ 1.09
GPS1Q13098 AC055876.1-201ENST00000430589 895 ntTSL 2 BASIC21.87■■□□□ 1.09
GPS1Q13098 DYM-203ENST00000442713 2147 ntTSL 2 BASIC21.87■■□□□ 1.09
GPS1Q13098 VAMP2-204ENST00000488857 874 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC21.87■■□□□ 1.09
GPS1Q13098 SGTA-201ENST00000221566 2330 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.87■■□□□ 1.09
GPS1Q13098 LINC00094-201ENST00000432807 2300 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.87■■□□□ 1.09
GPS1Q13098 CENPS-CORT-201ENST00000400900 1469 ntTSL 2 BASIC21.87■■□□□ 1.09
GPS1Q13098 RITA1-201ENST00000548278 2053 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.87■■□□□ 1.09
GPS1Q13098 CPNE7-202ENST00000319518 2409 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.87■■□□□ 1.09
GPS1Q13098 DUSP9-201ENST00000342782 2433 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.87■■□□□ 1.09
GPS1Q13098 PBX4-201ENST00000251203 1724 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.86■■□□□ 1.09
GPS1Q13098 DACH1-201ENST00000611519 4789 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.86■■□□□ 1.09
GPS1Q13098 TUBA1A-201ENST00000295766 1887 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.86■■□□□ 1.09
GPS1Q13098 AP004607.7-201ENST00000527152 1677 ntBASIC21.86■■□□□ 1.09
GPS1Q13098 WT1-210ENST00000639563 1494 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.86■■□□□ 1.09
GPS1Q13098 MIF-201ENST00000215754 939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.86■■□□□ 1.09
GPS1Q13098 PEMT-201ENST00000255389 1013 ntTSL 1 (best) BASIC21.86■■□□□ 1.09
GPS1Q13098 HYI-204ENST00000372432 1066 ntTSL 1 (best) BASIC21.86■■□□□ 1.09
GPS1Q13098 TMEM134-202ENST00000393877 823 ntTSL 1 (best) BASIC21.86■■□□□ 1.09
GPS1Q13098 MOSPD3-204ENST00000424091 1115 ntTSL 1 (best) BASIC21.86■■□□□ 1.09
GPS1Q13098 DUX4L19-201ENST00000557448 1267 ntBASIC21.86■■□□□ 1.09
GPS1Q13098 AC136469.2-201ENST00000623944 1028 ntBASIC21.86■■□□□ 1.09
GPS1Q13098 SMPD2-201ENST00000258052 1645 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.86■■□□□ 1.09
GPS1Q13098 ZFYVE9-201ENST00000287727 5194 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC21.86■■□□□ 1.09
GPS1Q13098 KLHDC1-201ENST00000359332 2691 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.86■■□□□ 1.09
GPS1Q13098 B4GAT1-201ENST00000311181 2072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.86■■□□□ 1.09
GPS1Q13098 ENKD1-206ENST00000602644 1353 ntTSL 5 BASIC21.86■■□□□ 1.09
GPS1Q13098 LRRC45-201ENST00000306688 2701 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.86■■□□□ 1.09
GPS1Q13098 P2RX4-202ENST00000337233 2032 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.85■■□□□ 1.09
GPS1Q13098 HTRA3-202ENST00000382512 2023 ntTSL 1 (best) BASIC21.85■■□□□ 1.09
GPS1Q13098 C12orf75-208ENST00000612117 1329 ntTSL 1 (best) BASIC21.85■■□□□ 1.09
GPS1Q13098 SMIM19-203ENST00000417410 1466 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.85■■□□□ 1.09
GPS1Q13098 TMEM206-205ENST00000535273 2119 ntTSL 2 BASIC21.85■■□□□ 1.09
GPS1Q13098 PARD3-208ENST00000374789 6005 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.85■■□□□ 1.09
GPS1Q13098 LINC01123-202ENST00000419296 2436 ntTSL 2 BASIC21.85■■□□□ 1.09
GPS1Q13098 SLC47A1P1-202ENST00000449666 945 ntBASIC21.85■■□□□ 1.09
GPS1Q13098 SUMF1-205ENST00000458465 1102 ntTSL 2 BASIC21.85■■□□□ 1.09
GPS1Q13098 SERGEF-219ENST00000532265 1124 ntTSL 2 BASIC21.85■■□□□ 1.09
GPS1Q13098 AL034346.1-201ENST00000568244 1277 ntBASIC21.85■■□□□ 1.09
GPS1Q13098 TMC6-218ENST00000591436 1155 ntTSL 1 (best) BASIC21.85■■□□□ 1.09
GPS1Q13098 CHST8-202ENST00000434302 2225 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.85■■□□□ 1.09
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 20.3 ms