Protein–RNA interactions for Protein: Q12772

SREBF2, Sterol regulatory element-binding protein 2, humanhuman

Predictions only

Length 1,141 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SREBF2Q12772 AC008667.2-201ENST00000504413 469 ntTSL 3 BASIC24.79■■□□□ 1.56
SREBF2Q12772 AC021087.1-201ENST00000512642 522 ntTSL 2 BASIC24.79■■□□□ 1.56
SREBF2Q12772 LINC01962-201ENST00000513771 411 ntTSL 2 BASIC24.79■■□□□ 1.56
SREBF2Q12772 NDUFS3-212ENST00000534208 583 ntTSL 4 BASIC24.79■■□□□ 1.56
SREBF2Q12772 AC092143.2-201ENST00000554623 985 ntTSL 3 BASIC24.79■■□□□ 1.56
SREBF2Q12772 MIR4497-201ENST00000583208 89 ntBASIC24.79■■□□□ 1.56
SREBF2Q12772 UBALD1-209ENST00000591897 1275 ntTSL 2 BASIC24.79■■□□□ 1.56
SREBF2Q12772 AP2S1-207ENST00000599990 829 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC24.79■■□□□ 1.56
SREBF2Q12772 FP565260.3-201ENST00000612610 1162 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC24.79■■□□□ 1.56
SREBF2Q12772 AC008175.2-201ENST00000612840 297 ntBASIC24.79■■□□□ 1.56
SREBF2Q12772 ABHD1-207ENST00000621324 1078 ntTSL 5 BASIC24.79■■□□□ 1.56
SREBF2Q12772 POU3F3-201ENST00000361360 3064 ntAPPRIS P1 BASIC24.79■■□□□ 1.56
SREBF2Q12772 NPHS2-201ENST00000367615 1855 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.79■■□□□ 1.56
SREBF2Q12772 ZNF598-202ENST00000562103 2717 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.78■■□□□ 1.56
SREBF2Q12772 EN1-201ENST00000295206 2457 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.78■■□□□ 1.56
SREBF2Q12772 MCAT-202ENST00000327555 1134 ntTSL 1 (best) BASIC24.78■■□□□ 1.56
SREBF2Q12772 ZDHHC12-202ENST00000372667 1187 ntTSL 5 BASIC24.78■■□□□ 1.56
SREBF2Q12772 PET117-201ENST00000432901 1141 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.78■■□□□ 1.56
SREBF2Q12772 CERNA3-201ENST00000521403 557 ntTSL 3 BASIC24.78■■□□□ 1.56
SREBF2Q12772 CBFB-203ENST00000561924 584 ntTSL 5 BASIC24.78■■□□□ 1.56
SREBF2Q12772 IFNGR2-203ENST00000405436 1684 ntTSL 5 BASIC24.78■■□□□ 1.56
SREBF2Q12772 AKAP17A-202ENST00000381261 2187 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.77■■□□□ 1.56
SREBF2Q12772 SMAGP-205ENST00000603864 1518 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.77■■□□□ 1.56
SREBF2Q12772 CDC16-204ENST00000360383 2211 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC24.77■■□□□ 1.56
SREBF2Q12772 OXSR1-203ENST00000446845 1908 ntTSL 5 BASIC24.77■■□□□ 1.56
SREBF2Q12772 ART5-202ENST00000397067 1154 ntTSL 1 (best) BASIC24.77■■□□□ 1.56
SREBF2Q12772 AC073111.3-201ENST00000478789 635 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC24.77■■□□□ 1.56
SREBF2Q12772 UBE2K-204ENST00000503368 891 ntTSL 1 (best) BASIC24.77■■□□□ 1.56
SREBF2Q12772 CLN6-206ENST00000565471 1075 ntTSL 2 BASIC24.77■■□□□ 1.56
SREBF2Q12772 PLK5-204ENST00000588430 900 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.77■■□□□ 1.56
SREBF2Q12772 JOSD2-202ENST00000595669 733 ntTSL 2 BASIC24.77■■□□□ 1.56
SREBF2Q12772 REST-211ENST00000640168 1268 ntTSL 1 (best) BASIC24.77■■□□□ 1.56
SREBF2Q12772 CEACAM3-201ENST00000344550 1022 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.76■■□□□ 1.55
SREBF2Q12772 CD99P1-203ENST00000431582 602 ntTSL 4 BASIC24.76■■□□□ 1.55
SREBF2Q12772 PBX1-209ENST00000485769 834 ntTSL 2 BASIC24.76■■□□□ 1.55
SREBF2Q12772 RPS23-206ENST00000510210 1058 ntTSL 2 BASIC24.76■■□□□ 1.55
SREBF2Q12772 AL357033.1-201ENST00000370520 1933 ntTSL 2 BASIC24.76■■□□□ 1.55
SREBF2Q12772 CSNK1G3-206ENST00000511130 1356 ntTSL 2 BASIC24.76■■□□□ 1.55
SREBF2Q12772 SLC19A1-212ENST00000567670 2029 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.76■■□□□ 1.55
SREBF2Q12772 DAZAP1-205ENST00000587079 2086 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC24.76■■□□□ 1.55
SREBF2Q12772 CCDC47-204ENST00000582252 1719 ntTSL 2 BASIC24.75■■□□□ 1.55
SREBF2Q12772 NAE1-202ENST00000359087 1825 ntTSL 2 BASIC24.75■■□□□ 1.55
SREBF2Q12772 HOXC8-201ENST00000040584 1889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.75■■□□□ 1.55
SREBF2Q12772 PRMT5-213ENST00000553897 1857 ntTSL 2 BASIC24.75■■□□□ 1.55
SREBF2Q12772 GXYLT1P3-201ENST00000453058 1193 ntBASIC24.75■■□□□ 1.55
SREBF2Q12772 UMAD1-202ENST00000463725 559 ntTSL 4 BASIC24.75■■□□□ 1.55
SREBF2Q12772 RAP1B-220ENST00000539091 977 ntTSL 2 BASIC24.75■■□□□ 1.55
SREBF2Q12772 AC090527.2-201ENST00000564080 1060 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC24.75■■□□□ 1.55
SREBF2Q12772 KLHL26-205ENST00000599006 989 ntTSL 5 BASIC24.75■■□□□ 1.55
SREBF2Q12772 FAM197Y4-202ENST00000622692 608 ntBASIC24.75■■□□□ 1.55
SREBF2Q12772 SMOX-201ENST00000278795 2164 ntTSL 1 (best) BASIC24.75■■□□□ 1.55
SREBF2Q12772 MEIS2-204ENST00000397620 2295 ntTSL 2 BASIC24.75■■□□□ 1.55
SREBF2Q12772 AC233992.2-201ENST00000531225 1596 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.75■■□□□ 1.55
SREBF2Q12772 AC099805.1-201ENST00000523987 1797 ntTSL 1 (best) BASIC24.75■■□□□ 1.55
SREBF2Q12772 H19-210ENST00000439725 1929 ntTSL 2 BASIC24.74■■□□□ 1.55
SREBF2Q12772 C15orf48-201ENST00000344300 875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.74■■□□□ 1.55
SREBF2Q12772 F8A2-201ENST00000369505 1116 ntAPPRIS P1 BASIC24.74■■□□□ 1.55
SREBF2Q12772 LSM12P1-201ENST00000411836 588 ntBASIC24.74■■□□□ 1.55
SREBF2Q12772 C12orf43-208ENST00000539736 1033 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.74■■□□□ 1.55
SREBF2Q12772 AC011446.2-202ENST00000592882 756 ntTSL 3 BASIC24.74■■□□□ 1.55
SREBF2Q12772 HAUS4-203ENST00000347758 1428 ntTSL 2 BASIC24.74■■□□□ 1.55
SREBF2Q12772 CCS-208ENST00000533244 1430 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.74■■□□□ 1.55
SREBF2Q12772 DNAH17-AS1-202ENST00000591373 1453 ntTSL 5 BASIC24.74■■□□□ 1.55
SREBF2Q12772 SLC22A31-206ENST00000614943 1860 ntTSL 5 BASIC24.74■■□□□ 1.55
SREBF2Q12772 AL139125.2-201ENST00000623134 1869 ntBASIC24.74■■□□□ 1.55
SREBF2Q12772 TBX1-202ENST00000332710 2084 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC24.74■■□□□ 1.55
SREBF2Q12772 TSEN34-201ENST00000302937 2294 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.74■■□□□ 1.55
SREBF2Q12772 FGF19-201ENST00000294312 2447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.73■■□□□ 1.55
SREBF2Q12772 MFSD7-203ENST00000404286 1826 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.73■■□□□ 1.55
SREBF2Q12772 GGTLC1-201ENST00000278765 974 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.73■■□□□ 1.55
SREBF2Q12772 WDR74-202ENST00000311713 1153 ntTSL 1 (best) BASIC24.73■■□□□ 1.55
SREBF2Q12772 MTFP1-203ENST00000407550 912 ntTSL 2 BASIC24.73■■□□□ 1.55
SREBF2Q12772 POU5F1P4-201ENST00000413175 1085 ntBASIC24.73■■□□□ 1.55
SREBF2Q12772 TMEM266-201ENST00000388942 2520 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.73■■□□□ 1.55
SREBF2Q12772 CACNB1-203ENST00000394310 1753 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.72■■□□□ 1.55
SREBF2Q12772 CERS4-208ENST00000559336 1515 ntTSL 1 (best) BASIC24.72■■□□□ 1.55
SREBF2Q12772 AL360181.5-201ENST00000368554 1044 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.72■■□□□ 1.55
SREBF2Q12772 AC073050.1-201ENST00000442316 462 ntTSL 3 BASIC24.72■■□□□ 1.55
SREBF2Q12772 NAT16-202ENST00000443096 1286 ntTSL 1 (best) BASIC24.72■■□□□ 1.55
SREBF2Q12772 SMIM1-201ENST00000444870 546 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.72■■□□□ 1.55
SREBF2Q12772 GATS-209ENST00000454084 1030 ntTSL 3 BASIC24.72■■□□□ 1.55
SREBF2Q12772 HTT-AS-201ENST00000503893 515 ntTSL 4 BASIC24.72■■□□□ 1.55
SREBF2Q12772 ABCC3-217ENST00000515707 656 ntTSL 3 BASIC24.72■■□□□ 1.55
SREBF2Q12772 AC091564.5-201ENST00000526456 820 ntTSL 4 BASIC24.72■■□□□ 1.55
SREBF2Q12772 RNF121-214ENST00000533380 870 ntTSL 3 BASIC24.72■■□□□ 1.55
SREBF2Q12772 SCN1B-203ENST00000595652 814 ntTSL 2 BASIC24.72■■□□□ 1.55
SREBF2Q12772 AC096541.1-201ENST00000445070 1807 ntTSL 2 BASIC24.72■■□□□ 1.55
SREBF2Q12772 LTB4R-201ENST00000345363 1616 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.72■■□□□ 1.55
SREBF2Q12772 MSX2-201ENST00000239243 2241 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.71■■□□□ 1.55
SREBF2Q12772 ATG16L2-201ENST00000321297 2243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.71■■□□□ 1.55
SREBF2Q12772 PIGH-201ENST00000216452 1420 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.71■■□□□ 1.55
SREBF2Q12772 TRABD2A-203ENST00000409520 1975 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.71■■□□□ 1.55
SREBF2Q12772 DUSP18-205ENST00000404885 1306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.71■■□□□ 1.55
SREBF2Q12772 CXCL3-201ENST00000296026 1075 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.71■■□□□ 1.55
SREBF2Q12772 CAVIN3-201ENST00000303927 1174 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.71■■□□□ 1.55
SREBF2Q12772 HCFC1R1-202ENST00000354679 765 ntTSL 2 BASIC24.71■■□□□ 1.55
SREBF2Q12772 FLYWCH2-202ENST00000396958 1036 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.71■■□□□ 1.55
SREBF2Q12772 ATP6V0E2-211ENST00000606024 893 ntTSL 1 (best) BASIC24.71■■□□□ 1.55
SREBF2Q12772 MAPK14-210ENST00000622903 1003 ntTSL 5 BASIC24.71■■□□□ 1.55
SREBF2Q12772 SLC35A2-213ENST00000635015 1008 ntTSL 2 BASIC24.71■■□□□ 1.55
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