Protein–RNA interactions for Protein: Q08477

CYP4F3, Docosahexaenoic acid omega-hydroxylase CYP4F3, humanhuman

Predictions only

Length 520 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CYP4F3Q08477 AC137767.1-201ENST00000602918 1920 ntBASIC21.17■□□□□ 0.98
CYP4F3Q08477 ZFP69B-204ENST00000484445 1976 ntTSL 1 (best) BASIC21.17■□□□□ 0.98
CYP4F3Q08477 SLC35A3-204ENST00000427993 2062 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.17■□□□□ 0.98
CYP4F3Q08477 TMEM200B-202ENST00000521452 2501 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.16■□□□□ 0.98
CYP4F3Q08477 AKT2-234ENST00000579047 2029 ntTSL 1 (best) BASIC21.16■□□□□ 0.98
CYP4F3Q08477 PRPSAP2-201ENST00000268835 1910 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.16■□□□□ 0.98
CYP4F3Q08477 H1FX-201ENST00000333762 1507 ntAPPRIS P1 BASIC21.16■□□□□ 0.98
CYP4F3Q08477 UBA5-208ENST00000473651 1513 ntTSL 5 BASIC21.16■□□□□ 0.98
CYP4F3Q08477 AC004854.2-201ENST00000608450 1441 ntBASIC21.16■□□□□ 0.98
CYP4F3Q08477 PPCS-202ENST00000372560 793 ntTSL 1 (best) BASIC21.16■□□□□ 0.98
CYP4F3Q08477 HAGH-201ENST00000397353 1257 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC21.16■□□□□ 0.98
CYP4F3Q08477 METTL26-203ENST00000397664 604 ntTSL 2 BASIC21.16■□□□□ 0.98
CYP4F3Q08477 BIN1-202ENST00000316724 2693 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.16■□□□□ 0.98
CYP4F3Q08477 DMRT1-201ENST00000382276 2222 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.16■□□□□ 0.98
CYP4F3Q08477 PRELID2-201ENST00000334744 2140 ntTSL 2 BASIC21.16■□□□□ 0.98
CYP4F3Q08477 DGKQ-201ENST00000273814 4636 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.16■□□□□ 0.98
CYP4F3Q08477 VSX1-205ENST00000429762 1977 ntTSL 1 (best) BASIC21.16■□□□□ 0.98
CYP4F3Q08477 TULP1-202ENST00000322263 1941 ntTSL 1 (best) BASIC21.16■□□□□ 0.98
CYP4F3Q08477 KLF3-203ENST00000514033 1871 ntTSL 1 (best) BASIC21.15■□□□□ 0.98
CYP4F3Q08477 SYT6-209ENST00000610222 1707 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.15■□□□□ 0.98
CYP4F3Q08477 BBC3-202ENST00000341983 1538 ntTSL 1 (best) BASIC21.15■□□□□ 0.98
CYP4F3Q08477 FBXL22-201ENST00000360587 1526 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.15■□□□□ 0.98
CYP4F3Q08477 ADAD2-201ENST00000268624 2283 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC21.15■□□□□ 0.98
CYP4F3Q08477 DAZAP1-211ENST00000592522 2157 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC21.15■□□□□ 0.98
CYP4F3Q08477 BID-202ENST00000342111 854 ntTSL 1 (best) BASIC21.15■□□□□ 0.98
CYP4F3Q08477 MIR663A-201ENST00000385250 93 ntBASIC21.15■□□□□ 0.98
CYP4F3Q08477 JDP2-202ENST00000419727 972 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.15■□□□□ 0.98
CYP4F3Q08477 FNDC3B-204ENST00000421757 946 ntTSL 1 (best) BASIC21.15■□□□□ 0.98
CYP4F3Q08477 MYD88-205ENST00000424893 1279 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.15■□□□□ 0.98
CYP4F3Q08477 LRRC75A-AS1-202ENST00000470491 1057 ntTSL 1 (best) BASIC21.15■□□□□ 0.98
CYP4F3Q08477 C12orf75-205ENST00000549893 719 ntTSL 3 BASIC21.15■□□□□ 0.98
CYP4F3Q08477 TRAPPC5-203ENST00000595985 411 ntTSL 3 BASIC21.15■□□□□ 0.98
CYP4F3Q08477 WWOX-218ENST00000627394 894 ntTSL 5 BASIC21.15■□□□□ 0.98
CYP4F3Q08477 KCNIP1-201ENST00000328939 2014 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.15■□□□□ 0.98
CYP4F3Q08477 SLC19A1-212ENST00000567670 2029 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.15■□□□□ 0.98
CYP4F3Q08477 OAZ2-201ENST00000326005 1934 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.15■□□□□ 0.98
CYP4F3Q08477 SLC25A11-201ENST00000225665 1897 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.15■□□□□ 0.98
CYP4F3Q08477 STX5-201ENST00000294179 1794 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.15■□□□□ 0.98
CYP4F3Q08477 CACNG2-201ENST00000300105 2384 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.15■□□□□ 0.98
CYP4F3Q08477 HNF4A-205ENST00000443598 1603 ntTSL 1 (best) BASIC21.15■□□□□ 0.98
CYP4F3Q08477 SMG7-AS1-201ENST00000421703 2220 ntTSL 1 (best) BASIC21.14■□□□□ 0.98
CYP4F3Q08477 WWC2-AS2-201ENST00000578387 2183 ntBASIC21.14■□□□□ 0.98
CYP4F3Q08477 SPHK1-201ENST00000323374 2138 ntTSL 1 (best) BASIC21.14■□□□□ 0.98
CYP4F3Q08477 IRX2-202ENST00000382611 2630 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.14■□□□□ 0.98
CYP4F3Q08477 ANKHD1-204ENST00000394722 2035 ntTSL 1 (best) BASIC21.14■□□□□ 0.98
CYP4F3Q08477 YWHAZ-205ENST00000395956 2974 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.14■□□□□ 0.97
CYP4F3Q08477 UBALD1-208ENST00000591401 1305 ntTSL 5 BASIC21.14■□□□□ 0.97
CYP4F3Q08477 HCFC1R1-201ENST00000248089 965 ntTSL 1 (best) BASIC21.14■□□□□ 0.97
CYP4F3Q08477 MFF-208ENST00000409616 1247 ntTSL 5 BASIC21.14■□□□□ 0.97
CYP4F3Q08477 CCDC74B-205ENST00000409943 1296 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.14■□□□□ 0.97
CYP4F3Q08477 AC073343.2-201ENST00000413182 548 ntTSL 4 BASIC21.14■□□□□ 0.97
CYP4F3Q08477 HCFC1R1-207ENST00000574980 845 ntTSL 5 BASIC21.14■□□□□ 0.97
CYP4F3Q08477 LRRC75A-201ENST00000409083 2656 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC21.14■□□□□ 0.97
CYP4F3Q08477 LACTBL1-201ENST00000426928 1641 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC21.14■□□□□ 0.97
CYP4F3Q08477 ANKHD1-221ENST00000616482 2064 ntTSL 1 (best) BASIC21.14■□□□□ 0.97
CYP4F3Q08477 GUSB-201ENST00000304895 2300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.13■□□□□ 0.97
CYP4F3Q08477 KAT2B-201ENST00000263754 4833 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.13■□□□□ 0.97
CYP4F3Q08477 CCDC7-201ENST00000277657 1899 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.13■□□□□ 0.97
CYP4F3Q08477 NRXN2-205ENST00000409571 6381 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.13■□□□□ 0.97
CYP4F3Q08477 CFD-201ENST00000327726 1201 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.13■□□□□ 0.97
CYP4F3Q08477 ATP6V0E2-204ENST00000464662 513 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.13■□□□□ 0.97
CYP4F3Q08477 AC092468.1-201ENST00000491321 562 ntTSL 4 BASIC21.13■□□□□ 0.97
CYP4F3Q08477 DDN-AS1-201ENST00000547395 858 ntTSL 2 BASIC21.13■□□□□ 0.97
CYP4F3Q08477 FAM110A-206ENST00000541082 1614 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.13■□□□□ 0.97
CYP4F3Q08477 FNTA-208ENST00000529687 1950 ntTSL 2 BASIC21.13■□□□□ 0.97
CYP4F3Q08477 PDE5A-201ENST00000264805 3020 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.13■□□□□ 0.97
CYP4F3Q08477 FAM102B-202ENST00000405454 1585 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.13■□□□□ 0.97
CYP4F3Q08477 AC096677.1-201ENST00000454651 1516 ntTSL 2 BASIC21.13■□□□□ 0.97
CYP4F3Q08477 TBXA2R-202ENST00000411851 1494 ntTSL 2 BASIC21.13■□□□□ 0.97
CYP4F3Q08477 SH3YL1-201ENST00000356150 1763 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.13■□□□□ 0.97
CYP4F3Q08477 IQSEC3-201ENST00000382841 2701 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC21.13■□□□□ 0.97
CYP4F3Q08477 TDRKH-205ENST00000368827 2318 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.12■□□□□ 0.97
CYP4F3Q08477 ZDHHC16-203ENST00000353979 1647 ntTSL 1 (best) BASIC21.12■□□□□ 0.97
CYP4F3Q08477 RBM42-203ENST00000588161 1609 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.12■□□□□ 0.97
CYP4F3Q08477 STK19-202ENST00000375333 1557 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.12■□□□□ 0.97
CYP4F3Q08477 C2CD4B-201ENST00000380392 1579 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.12■□□□□ 0.97
CYP4F3Q08477 FOXK2-201ENST00000335255 5265 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.12■□□□□ 0.97
CYP4F3Q08477 ANKRD63-201ENST00000434396 1143 ntAPPRIS P1 BASIC21.12■□□□□ 0.97
CYP4F3Q08477 AC011767.1-201ENST00000617410 1153 ntBASIC21.12■□□□□ 0.97
CYP4F3Q08477 RNF114-202ENST00000622920 1284 ntTSL 5 BASIC21.12■□□□□ 0.97
CYP4F3Q08477 ASPSCR1-202ENST00000306739 1843 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.12■□□□□ 0.97
CYP4F3Q08477 RHCE-204ENST00000349320 1810 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.12■□□□□ 0.97
CYP4F3Q08477 IER2-201ENST00000292433 2085 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.12■□□□□ 0.97
CYP4F3Q08477 TMEM159-201ENST00000233047 2014 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.12■□□□□ 0.97
CYP4F3Q08477 PIKFYVE-203ENST00000392202 2039 ntTSL 1 (best) BASIC21.12■□□□□ 0.97
CYP4F3Q08477 PTPN13-205ENST00000502971 1708 ntTSL 1 (best) BASIC21.12■□□□□ 0.97
CYP4F3Q08477 RELL2-205ENST00000518856 1419 ntTSL 5 BASIC21.12■□□□□ 0.97
CYP4F3Q08477 XBP1-207ENST00000611155 1794 ntTSL 5 BASIC21.11■□□□□ 0.97
CYP4F3Q08477 MT3-201ENST00000200691 569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.11■□□□□ 0.97
CYP4F3Q08477 FMR1-202ENST00000334557 1295 ntTSL 1 (best) BASIC21.11■□□□□ 0.97
CYP4F3Q08477 CHPF-202ENST00000373891 1079 ntTSL 2 BASIC21.11■□□□□ 0.97
CYP4F3Q08477 LTB-211ENST00000446745 853 ntTSL 1 (best) BASIC21.11■□□□□ 0.97
CYP4F3Q08477 ZNF717-203ENST00000477374 1169 ntTSL 2 BASIC21.11■□□□□ 0.97
CYP4F3Q08477 LOXL1-AS1-208ENST00000565756 885 ntTSL 2 BASIC21.11■□□□□ 0.97
CYP4F3Q08477 PARP1-210ENST00000629232 477 ntTSL 5 BASIC21.11■□□□□ 0.97
CYP4F3Q08477 ERI3-201ENST00000372257 1684 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.11■□□□□ 0.97
CYP4F3Q08477 STK19-201ENST00000375331 1663 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.11■□□□□ 0.97
CYP4F3Q08477 TGIF1-206ENST00000405385 1689 ntTSL 2 BASIC21.11■□□□□ 0.97
CYP4F3Q08477 CREB1-205ENST00000430624 2005 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.11■□□□□ 0.97
CYP4F3Q08477 REXO1-201ENST00000170168 4591 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.11■□□□□ 0.97
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 20.9 ms