Protein–RNA interactions for Protein: Q06787

FMR1, Synaptic functional regulator FMR1, humanhuman

Known RBP eCLIP

Length 632 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
FMR1Q06787 CDCA2-203ENST00000518225 464 ntTSL 522.32■■□□□ 1.165e-6■■■■□ 22.9
FMR1Q06787 UNC45A-215ENST00000557212 1528 ntTSL 222.1■■□□□ 1.135e-6■■■■□ 22.9
FMR1Q06787 RBM42-201ENST00000262633 1680 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.95■■□□□ 1.15e-6■■■■□ 22.9
FMR1Q06787 UNC45A-210ENST00000553671 855 ntTSL 321.66■■□□□ 1.065e-6■■■■□ 22.9
FMR1Q06787 SPAG9-215ENST00000513746 822 ntTSL 521.65■■□□□ 1.065e-6■■■■□ 22.9
FMR1Q06787 RNPEP-209ENST00000479726 822 ntTSL 520.99■□□□□ 0.955e-6■■■■□ 22.9
FMR1Q06787 PLEKHJ1-208ENST00000588450 2858 ntTSL 220.5■□□□□ 0.875e-6■■■■□ 22.9
FMR1Q06787 JAK1-204ENST00000471473 645 ntTSL 319.62■□□□□ 0.735e-6■■■■□ 22.9
FMR1Q06787 LIG3-215ENST00000592690 722 ntTSL 219.61■□□□□ 0.735e-6■■■■□ 22.9
FMR1Q06787 SART1-208ENST00000533386 586 ntTSL 219.39■□□□□ 0.695e-6■■■■□ 22.9
FMR1Q06787 PLEKHJ1-211ENST00000589097 2251 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.3■□□□□ 0.685e-6■■■■□ 22.9
FMR1Q06787 WDR6-215ENST00000489427 564 ntTSL 419.25■□□□□ 0.675e-6■■■■□ 22.9
FMR1Q06787 MMADHC-203ENST00000428879 1726 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18■□□□□ 0.475e-6■■■■□ 22.9
FMR1Q06787 SPAG9-211ENST00000511312 943 ntTSL 217.51■□□□□ 0.395e-6■■■■□ 22.9
FMR1Q06787 SEC24D-202ENST00000419654 2786 ntTSL 5 BASIC17.45■□□□□ 0.385e-6■■■■□ 22.9
FMR1Q06787 AVL9-201ENST00000318709 6982 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.12■□□□□ 0.175e-6■■■■□ 22.9
FMR1Q06787 LIG3-205ENST00000585941 1699 ntTSL 1 (best)15.95■□□□□ 0.145e-6■■■■□ 22.9
FMR1Q06787 AVL9-204ENST00000459629 7937 ntTSL 215.52■□□□□ 0.085e-6■■■■□ 22.9
FMR1Q06787 XPO7-201ENST00000252512 4861 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.015e-6■■■■□ 22.9
FMR1Q06787 WDR6-203ENST00000419837 538 ntTSL 414.12□□□□□ -0.155e-6■■■■□ 22.9
FMR1Q06787 LIG3-212ENST00000590181 1156 ntTSL 1 (best)13.49□□□□□ -0.255e-6■■■■□ 22.9
FMR1Q06787 HELZ-204ENST00000578938 660 ntTSL 313.07□□□□□ -0.325e-6■■■■□ 22.9
FMR1Q06787 PRKCB-207ENST00000486868 467 ntTSL 313.03□□□□□ -0.325e-6■■■■□ 22.9
FMR1Q06787 AVL9-202ENST00000409301 4336 ntTSL 5 BASIC12.79□□□□□ -0.365e-6■■■■□ 22.9
FMR1Q06787 LIG3-204ENST00000585740 887 ntTSL 312.69□□□□□ -0.385e-6■■■■□ 22.9
FMR1Q06787 MMADHC-201ENST00000303319 1436 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.56□□□□□ -0.45e-6■■■■□ 22.9
FMR1Q06787 JAK1-202ENST00000465376 814 ntTSL 312.29□□□□□ -0.445e-6■■■■□ 22.9
FMR1Q06787 XPO7-202ENST00000433566 4519 ntTSL 5 BASIC12.04□□□□□ -0.485e-6■■■■□ 22.9
FMR1Q06787 LIG3-201ENST00000262327 3055 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.54□□□□□ -0.565e-6■■■■□ 22.9
FMR1Q06787 SEC24D-201ENST00000280551 4030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.49□□□□□ -0.575e-6■■■■□ 22.9
FMR1Q06787 DLGAP1-AS2-201ENST00000572856 2261 ntTSL 2 BASIC11.48□□□□□ -0.575e-11■■■■□ 22.9
FMR1Q06787 ACTN1-213ENST00000554508 585 ntTSL 410.98□□□□□ -0.655e-6■■■■□ 22.9
FMR1Q06787 ACTN1-212ENST00000554158 571 ntTSL 410.68□□□□□ -0.75e-6■■■■□ 22.9
FMR1Q06787 ZEB2-215ENST00000465070 2949 ntTSL 2 BASIC10.13□□□□□ -0.795e-6■■■■□ 22.9
FMR1Q06787 RNPEP-214ENST00000620670 683 ntTSL 39.89□□□□□ -0.835e-6■■■■□ 22.9
FMR1Q06787 MMADHC-202ENST00000422782 1462 ntTSL 5 BASIC8.85□□□□□ -0.995e-6■■■■□ 22.9
FMR1Q06787 LIG3-202ENST00000378526 8400 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC8.67□□□□□ -1.025e-6■■■■□ 22.9
FMR1Q06787 HELZ-202ENST00000417253 1872 ntTSL 58.49□□□□□ -1.055e-6■■■■□ 22.9
FMR1Q06787 ETFA-205ENST00000558803 447 ntTSL 28.34□□□□□ -1.075e-6■■■■□ 22.9
FMR1Q06787 SEC24D-211ENST00000511481 2626 ntTSL 1 (best) BASIC7.42□□□□□ -1.225e-6■■■■□ 22.9
FMR1Q06787 SPAG9-209ENST00000510283 4949 ntTSL 2 BASIC7.05□□□□□ -1.285e-6■■■■□ 22.9
FMR1Q06787 HELZ-207ENST00000580168 6279 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.18□□□□□ -1.425e-6■■■■□ 22.9
FMR1Q06787 HELZ-206ENST00000579953 6365 ntTSL 25.97□□□□□ -1.455e-6■■■■□ 22.9
FMR1Q06787 SEC24D-210ENST00000511033 576 ntTSL 45.67□□□□□ -1.55e-6■■■■□ 22.9
FMR1Q06787 HELZ-203ENST00000578783 577 ntTSL 35.64□□□□□ -1.515e-6■■■■□ 22.9
FMR1Q06787 SEC24D-206ENST00000505134 3915 ntTSL 25.36□□□□□ -1.555e-6■■■■□ 22.9
FMR1Q06787 SEC24D-214ENST00000514561 3806 ntTSL 1 (best)5.2□□□□□ -1.585e-6■■■■□ 22.9
FMR1Q06787 HELZ-201ENST00000358691 13810 ntTSL 1 (best) BASIC3.41□□□□□ -1.865e-6■■■■□ 22.9
FMR1Q06787 REPIN1-204ENST00000466559 1022 ntTSL 1 (best) BASIC33.06■■■□□ 2.882e-8■■■■□ 22.9
FMR1Q06787 IMMT-201ENST00000254636 2613 ntTSL 5 BASIC9.67□□□□□ -0.863e-6■■■■□ 22.9
FMR1Q06787 IMMT-205ENST00000419070 2172 ntTSL 58.69□□□□□ -1.023e-6■■■■□ 22.9
FMR1Q06787 CHD4-204ENST00000535810 607 ntTSL 211.15□□□□□ -0.624e-8■■■■□ 22.9
FMR1Q06787 FLNB-204ENST00000429972 9430 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.33□□□□□ -0.61e-6■■■■□ 22.9
FMR1Q06787 FLNB-201ENST00000295956 9463 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.3□□□□□ -0.61e-6■■■■□ 22.9
FMR1Q06787 FLNB-202ENST00000358537 9391 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC10.48□□□□□ -0.731e-6■■■■□ 22.9
FMR1Q06787 FLNB-214ENST00000493452 7402 ntTSL 1 (best) BASIC10.28□□□□□ -0.761e-6■■■■□ 22.9
FMR1Q06787 FLNB-212ENST00000490882 8079 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC9.63□□□□□ -0.871e-6■■■■□ 22.9
FMR1Q06787 PRPF8-216ENST00000577001 3274 ntTSL 517.06■□□□□ 0.326e-8■■■■□ 22.8
FMR1Q06787 KMT2B-201ENST00000420124 8469 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.24■□□□□ 0.831e-6■■■■□ 22.8
FMR1Q06787 DOCK8-206ENST00000454469 2087 ntTSL 221.7■■□□□ 1.064e-6■■■■□ 22.8
FMR1Q06787 DOCK8-212ENST00000479404 595 ntTSL 321.26■□□□□ 0.994e-6■■■■□ 22.8
FMR1Q06787 DOCK8-217ENST00000524396 2206 ntTSL 518.02■□□□□ 0.484e-6■■■■□ 22.8
FMR1Q06787 UNC45A-207ENST00000487875 2641 ntTSL 217.01■□□□□ 0.311e-6■■■■□ 22.8
FMR1Q06787 DOCK8-211ENST00000478380 1395 ntTSL 1 (best)13.08□□□□□ -0.314e-6■■■■□ 22.8
FMR1Q06787 DOCK8-214ENST00000487230 537 ntTSL 412.06□□□□□ -0.484e-6■■■■□ 22.8
FMR1Q06787 DOCK8-203ENST00000382341 1873 ntTSL 210.78□□□□□ -0.684e-6■■■■□ 22.8
FMR1Q06787 AP1B1-208ENST00000432560 4146 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.72■□□□□ 0.112e-6■■■■□ 22.8
FMR1Q06787 AP1B1-201ENST00000317368 3903 ntTSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.082e-6■■■■□ 22.8
FMR1Q06787 AP1B1-202ENST00000357586 4176 ntTSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 02e-6■■■■□ 22.8
FMR1Q06787 AP1B1-203ENST00000402502 2935 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.65□□□□□ -0.392e-6■■■■□ 22.8
FMR1Q06787 AP1B1-205ENST00000415447 2838 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.62□□□□□ -0.392e-6■■■■□ 22.8
FMR1Q06787 AP1B1-204ENST00000405198 3838 ntTSL 5 BASIC12.43□□□□□ -0.422e-6■■■■□ 22.8
FMR1Q06787 TLN1-206ENST00000486788 551 ntTSL 518.71■□□□□ 0.592e-10■■■■□ 22.8
FMR1Q06787 URB1-201ENST00000382751 10832 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.75□□□□□ -1.011e-6■■■■□ 22.8
FMR1Q06787 UPF1-202ENST00000594243 683 ntTSL 318.43■□□□□ 0.542e-6■■■■□ 22.8
FMR1Q06787 TLE3-221ENST00000560525 3647 ntTSL 515.87■□□□□ 0.134e-6■■■■□ 22.8
FMR1Q06787 SPTA1-201ENST00000368147 7999 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.22□□□□□ -1.254e-6■■■■□ 22.8
FMR1Q06787 FLNB-210ENST00000481470 6497 ntTSL 1 (best)10.47□□□□□ -0.731e-6■■■■□ 22.8
FMR1Q06787 NRDC-211ENST00000491410 1020 ntTSL 225.18■■□□□ 1.622e-11■■■■□ 22.8
FMR1Q06787 NRDC-205ENST00000468722 754 ntTSL 320.84■□□□□ 0.932e-11■■■■□ 22.8
FMR1Q06787 SENP5-202ENST00000419026 973 ntTSL 3 BASIC28.7■■■□□ 2.183e-6■■■■□ 22.7
FMR1Q06787 SENP5-204ENST00000445299 2491 ntTSL 2 BASIC23.05■■□□□ 1.283e-6■■■■□ 22.7
FMR1Q06787 SENP5-201ENST00000323460 6308 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.543e-6■■■■□ 22.7
FMR1Q06787 ZNF106-203ENST00000565380 5677 ntTSL 1 (best) BASIC11.69□□□□□ -0.542e-6■■■■□ 22.7
FMR1Q06787 HUWE1-214ENST00000612484 14311 ntTSL 5 BASIC5.55□□□□□ -1.527e-7■■■■□ 22.7
FMR1Q06787 FAF1-202ENST00000396153 6817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.012e-7■■■■□ 22.7
FMR1Q06787 LANCL3-203ENST00000614025 1469 ntTSL 2 BASIC32.98■■■□□ 2.872e-6■■■■□ 22.7
FMR1Q06787 BOP1-204ENST00000569403 651 ntTSL 432.7■■■□□ 2.838e-7■■■■□ 22.7
FMR1Q06787 PTPRA-208ENST00000455631 1107 ntTSL 531.01■■■□□ 2.552e-6■■■■□ 22.7
FMR1Q06787 ABHD17A-202ENST00000292577 1757 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.72■■■□□ 2.512e-6■■■■□ 22.7
FMR1Q06787 ABHD17B-202ENST00000377041 1312 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC30.33■■■□□ 2.452e-6■■■■□ 22.7
FMR1Q06787 PTPRA-207ENST00000431048 707 ntTSL 529.33■■■□□ 2.292e-6■■■■□ 22.7
FMR1Q06787 BICRA-202ENST00000594866 532 ntAPPRIS ALT2 TSL 228.37■■■□□ 2.132e-6■■■■□ 22.7
FMR1Q06787 SFXN5-210ENST00000472259 1690 ntTSL 328.32■■■□□ 2.122e-6■■■■□ 22.7
FMR1Q06787 EHBP1-204ENST00000405482 1311 ntTSL 228.29■■■□□ 2.122e-6■■■■□ 22.7
FMR1Q06787 SFXN5-213ENST00000479293 1808 ntTSL 227.97■■■□□ 2.072e-6■■■■□ 22.7
FMR1Q06787 LIMS1-208ENST00000428064 637 ntTSL 226.94■■□□□ 1.91e-11■■■■□ 22.7
FMR1Q06787 GSEC-202ENST00000629441 1572 ntTSL 2 BASIC25.98■■□□□ 1.752e-6■■■■□ 22.7
FMR1Q06787 WDR74-202ENST00000311713 1153 ntTSL 1 (best) BASIC25.32■■□□□ 1.642e-6■■■■□ 22.7
FMR1Q06787 PPP1R12C-201ENST00000263433 2924 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.25■■□□□ 1.632e-6■■■■□ 22.7
Retrieved 100 of 13,491 protein–RNA pairs in 76.1 ms