Protein–RNA interactions for Protein: P63132

HERVK_113, Endogenous retrovirus group K member 113 Pol protein, humanhuman

Predictions only

Length 956 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
HERVK_113P63132 AC004707.1-201ENST00000511627 715 ntTSL 3 BASIC20.84■□□□□ 0.93
HERVK_113P63132 LRP5L-203ENST00000444995 1714 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.84■□□□□ 0.93
HERVK_113P63132 CIZ1-206ENST00000372954 2731 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.84■□□□□ 0.93
HERVK_113P63132 GSN-204ENST00000373818 2657 ntTSL 1 (best) BASIC20.83■□□□□ 0.93
HERVK_113P63132 STIM2-204ENST00000467087 5154 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.83■□□□□ 0.93
HERVK_113P63132 RTL8C-201ENST00000257013 1181 ntAPPRIS P1 BASIC20.83■□□□□ 0.93
HERVK_113P63132 KRTAP5-1-201ENST00000382171 942 ntAPPRIS P1 BASIC20.83■□□□□ 0.93
HERVK_113P63132 HM13-AS1-201ENST00000412178 489 ntTSL 3 BASIC20.83■□□□□ 0.93
HERVK_113P63132 EPN1-201ENST00000085079 2355 ntTSL 1 (best) BASIC20.83■□□□□ 0.93
HERVK_113P63132 RELA-201ENST00000308639 2681 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.83■□□□□ 0.92
HERVK_113P63132 CDC14A-203ENST00000370124 1883 ntTSL 1 (best) BASIC20.83■□□□□ 0.92
HERVK_113P63132 ACADVL-202ENST00000350303 2191 ntTSL 1 (best) BASIC20.83■□□□□ 0.92
HERVK_113P63132 CCDC88B-203ENST00000359902 2326 ntTSL 1 (best) BASIC20.83■□□□□ 0.92
HERVK_113P63132 DMRT2-203ENST00000358146 1965 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.83■□□□□ 0.92
HERVK_113P63132 RASGEF1C-201ENST00000361132 2243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.82■□□□□ 0.92
HERVK_113P63132 CPNE9-203ENST00000383832 2068 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.82■□□□□ 0.92
HERVK_113P63132 AC003102.1-202ENST00000563394 1796 ntBASIC20.82■□□□□ 0.92
HERVK_113P63132 EEF1D-201ENST00000317198 1458 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.82■□□□□ 0.92
HERVK_113P63132 TRIM14-202ENST00000342043 1479 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.82■□□□□ 0.92
HERVK_113P63132 SMIM19-203ENST00000417410 1466 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.82■□□□□ 0.92
HERVK_113P63132 TMEM129-206ENST00000536901 2172 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.82■□□□□ 0.92
HERVK_113P63132 PRICKLE4-201ENST00000394259 939 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.82■□□□□ 0.92
HERVK_113P63132 SH3D19-211ENST00000604030 5228 ntTSL 5 BASIC20.82■□□□□ 0.92
HERVK_113P63132 PPP3CC-203ENST00000397775 2094 ntTSL 2 BASIC20.82■□□□□ 0.92
HERVK_113P63132 TRIB3-201ENST00000217233 2499 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.82■□□□□ 0.92
HERVK_113P63132 DOCK5-208ENST00000481100 2166 ntTSL 1 (best) BASIC20.82■□□□□ 0.92
HERVK_113P63132 DAZAP2-201ENST00000412716 2598 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.82■□□□□ 0.92
HERVK_113P63132 SMPD2-201ENST00000258052 1645 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.82■□□□□ 0.92
HERVK_113P63132 OTOP1-201ENST00000296358 1864 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.81■□□□□ 0.92
HERVK_113P63132 AC025164.2-201ENST00000501008 1898 ntTSL 5 BASIC20.81■□□□□ 0.92
HERVK_113P63132 DPF1-217ENST00000614244 2356 ntTSL 1 (best) BASIC20.81■□□□□ 0.92
HERVK_113P63132 YAP1-210ENST00000615667 5398 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.81■□□□□ 0.92
HERVK_113P63132 SOCS7-202ENST00000613678 1827 ntTSL 5 BASIC20.81■□□□□ 0.92
HERVK_113P63132 TRIM3-214ENST00000536344 2704 ntTSL 2 BASIC20.81■□□□□ 0.92
HERVK_113P63132 XPA-201ENST00000375128 1417 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.81■□□□□ 0.92
HERVK_113P63132 SNX3-202ENST00000349379 890 ntTSL 2 BASIC20.81■□□□□ 0.92
HERVK_113P63132 AP006621.3-202ENST00000530083 765 ntTSL 3 BASIC20.81■□□□□ 0.92
HERVK_113P63132 GALNS-211ENST00000568311 703 ntTSL 1 (best) BASIC20.81■□□□□ 0.92
HERVK_113P63132 TUBA1A-201ENST00000295766 1887 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.81■□□□□ 0.92
HERVK_113P63132 PBX4-201ENST00000251203 1724 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.81■□□□□ 0.92
HERVK_113P63132 NUTF2-201ENST00000219169 2321 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.81■□□□□ 0.92
HERVK_113P63132 RITA1-201ENST00000548278 2053 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.81■□□□□ 0.92
HERVK_113P63132 FARSA-201ENST00000314606 1814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.81■□□□□ 0.92
HERVK_113P63132 FGFR2-211ENST00000369059 3003 ntTSL 5 BASIC20.8■□□□□ 0.92
HERVK_113P63132 IKBKG-206ENST00000594239 2299 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.8■□□□□ 0.92
HERVK_113P63132 DYM-203ENST00000442713 2147 ntTSL 2 BASIC20.8■□□□□ 0.92
HERVK_113P63132 HLA-C-201ENST00000376228 1536 ntAPPRIS P2 BASIC20.8■□□□□ 0.92
HERVK_113P63132 CIZ1-203ENST00000357558 2907 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.8■□□□□ 0.92
HERVK_113P63132 PABPC1L-202ENST00000217074 1263 ntTSL 5 BASIC20.8■□□□□ 0.92
HERVK_113P63132 AP000662.2-202ENST00000530595 2790 ntTSL 2 BASIC20.8■□□□□ 0.92
HERVK_113P63132 FOXK2-201ENST00000335255 5265 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.8■□□□□ 0.92
HERVK_113P63132 STRADB-201ENST00000194530 2293 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.8■□□□□ 0.92
HERVK_113P63132 NFKBIL1-203ENST00000376148 1478 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.8■□□□□ 0.92
HERVK_113P63132 RASSF1-203ENST00000359365 1923 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.8■□□□□ 0.92
HERVK_113P63132 KCNIP2-207ENST00000358038 2489 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.8■□□□□ 0.92
HERVK_113P63132 AZIN2-204ENST00000373443 2048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.8■□□□□ 0.92
HERVK_113P63132 SOX3-201ENST00000370536 2132 ntAPPRIS P1 BASIC20.8■□□□□ 0.92
HERVK_113P63132 PEX5-204ENST00000412720 2105 ntTSL 2 BASIC20.8■□□□□ 0.92
HERVK_113P63132 LETM1-201ENST00000302787 5462 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.8■□□□□ 0.92
HERVK_113P63132 LPAR1-201ENST00000358883 2687 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC20.8■□□□□ 0.92
HERVK_113P63132 RAP2C-202ENST00000370874 2333 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.79■□□□□ 0.92
HERVK_113P63132 PPP1R13B-201ENST00000202556 4958 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.79■□□□□ 0.92
HERVK_113P63132 DCTD-202ENST00000438320 1972 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.79■□□□□ 0.92
HERVK_113P63132 ITGBL1-206ENST00000618057 2368 ntTSL 1 (best) BASIC20.79■□□□□ 0.92
HERVK_113P63132 DCTPP1-201ENST00000319285 1222 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.79■□□□□ 0.92
HERVK_113P63132 KDELR3-202ENST00000409006 931 ntTSL 1 (best) BASIC20.79■□□□□ 0.92
HERVK_113P63132 SERTAD4-AS1-202ENST00000475406 591 ntTSL 2 BASIC20.79■□□□□ 0.92
HERVK_113P63132 TOLLIP-208ENST00000527938 549 ntTSL 4 BASIC20.79■□□□□ 0.92
HERVK_113P63132 C15orf61-202ENST00000557807 769 ntTSL 2 BASIC20.79■□□□□ 0.92
HERVK_113P63132 INAFM2-202ENST00000638170 3052 ntAPPRIS P1 BASIC20.79■□□□□ 0.92
HERVK_113P63132 TMCC2-209ENST00000637895 1455 ntTSL 1 (best) BASIC20.79■□□□□ 0.92
HERVK_113P63132 TERF1-202ENST00000276603 1677 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC20.79■□□□□ 0.92
HERVK_113P63132 AC009014.1-201ENST00000607574 1667 ntAPPRIS P1 BASIC20.79■□□□□ 0.92
HERVK_113P63132 RBKS-201ENST00000302188 1973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.79■□□□□ 0.92
HERVK_113P63132 GCH1-202ENST00000395514 1977 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.79■□□□□ 0.92
HERVK_113P63132 DUSP5-201ENST00000369583 2557 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.79■□□□□ 0.92
HERVK_113P63132 TATDN2-201ENST00000287652 5342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.79■□□□□ 0.92
HERVK_113P63132 RAB3A-201ENST00000222256 1528 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.78■□□□□ 0.92
HERVK_113P63132 P2RX4-202ENST00000337233 2032 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.78■□□□□ 0.92
HERVK_113P63132 GNS-207ENST00000542058 2020 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.78■□□□□ 0.92
HERVK_113P63132 SEPT5-209ENST00000438754 2241 ntTSL 2 BASIC20.78■□□□□ 0.92
HERVK_113P63132 AP005233.1-201ENST00000562341 2424 ntTSL 2 BASIC20.78■□□□□ 0.92
HERVK_113P63132 BOK-201ENST00000318407 2657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.78■□□□□ 0.92
HERVK_113P63132 HPCAL1-201ENST00000307845 1751 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.78■□□□□ 0.92
HERVK_113P63132 C16orf95-201ENST00000253461 953 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.78■□□□□ 0.92
HERVK_113P63132 FDX2-202ENST00000393708 1012 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.78■□□□□ 0.92
HERVK_113P63132 AL357078.1-201ENST00000448344 310 ntTSL 4 BASIC20.78■□□□□ 0.92
HERVK_113P63132 AC061979.1-201ENST00000532061 434 ntTSL 5 BASIC20.78■□□□□ 0.92
HERVK_113P63132 CDKN3-207ENST00000543789 610 ntTSL 5 BASIC20.78■□□□□ 0.92
HERVK_113P63132 HHIPL1-202ENST00000357223 2241 ntTSL 1 (best) BASIC20.78■□□□□ 0.92
HERVK_113P63132 C10orf91-202ENST00000392630 1846 ntTSL 2 BASIC20.78■□□□□ 0.92
HERVK_113P63132 FAM3A-202ENST00000359889 1712 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.78■□□□□ 0.92
HERVK_113P63132 KCNQ5-205ENST00000370398 6345 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.78■□□□□ 0.92
HERVK_113P63132 NR2F2-204ENST00000453270 1712 ntTSL 1 (best) BASIC20.78■□□□□ 0.92
HERVK_113P63132 LONP1-203ENST00000585374 2882 ntTSL 5 BASIC20.77■□□□□ 0.92
HERVK_113P63132 CHST8-202ENST00000434302 2225 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.77■□□□□ 0.92
HERVK_113P63132 GAL3ST3-201ENST00000312006 2133 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.77■□□□□ 0.92
HERVK_113P63132 UBE2Q1-201ENST00000292211 3210 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.77■□□□□ 0.92
HERVK_113P63132 HTRA3-202ENST00000382512 2023 ntTSL 1 (best) BASIC20.77■□□□□ 0.92
HERVK_113P63132 CENPH-201ENST00000283006 1389 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.77■□□□□ 0.92
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 47.6 ms