Protein–RNA interactions for Protein: P55895

RAG2, V(D)J recombination-activating protein 2, humanhuman

Predictions only

Length 527 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RAG2P55895 HES5-201ENST00000378453 1306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
RAG2P55895 LINC01547-202ENST00000397841 2303 ntTSL 2 BASIC18.43■□□□□ 0.54
RAG2P55895 NOX4-209ENST00000527626 1774 ntTSL 2 BASIC18.42■□□□□ 0.54
RAG2P55895 FAM129C-212ENST00000601861 2180 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.42■□□□□ 0.54
RAG2P55895 FAM46B-201ENST00000289166 2368 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
RAG2P55895 BLOC1S4-201ENST00000320776 1617 ntAPPRIS P1 BASIC18.42■□□□□ 0.54
RAG2P55895 RBM42-203ENST00000588161 1609 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
RAG2P55895 SUMF1-202ENST00000383843 1447 ntTSL 2 BASIC18.42■□□□□ 0.54
RAG2P55895 TRMT2A-204ENST00000439169 2473 ntTSL 5 BASIC18.42■□□□□ 0.54
RAG2P55895 SPRN-201ENST00000414069 3128 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
RAG2P55895 CLTA-206ENST00000466396 695 ntTSL 2 BASIC18.42■□□□□ 0.54
RAG2P55895 SRRM2-231ENST00000630499 1207 ntTSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
RAG2P55895 TSPAN17-202ENST00000310032 2550 ntTSL 5 BASIC18.42■□□□□ 0.54
RAG2P55895 CEL-201ENST00000372080 2384 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.42■□□□□ 0.54
RAG2P55895 HSD3B7-202ENST00000297679 2172 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
RAG2P55895 WDR86-207ENST00000621812 1542 ntTSL 5 BASIC18.42■□□□□ 0.54
RAG2P55895 FEM1AP1-201ENST00000431297 1995 ntBASIC18.42■□□□□ 0.54
RAG2P55895 POLE2-202ENST00000539565 1792 ntTSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
RAG2P55895 SETD9-201ENST00000285947 1619 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
RAG2P55895 FAM102B-201ENST00000370035 5600 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
RAG2P55895 SDSL-202ENST00000403593 1449 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
RAG2P55895 HPS6-201ENST00000299238 2649 ntAPPRIS P1 BASIC18.41■□□□□ 0.54
RAG2P55895 ILF3-217ENST00000589998 2622 ntTSL 2 BASIC18.41■□□□□ 0.54
RAG2P55895 BRSK2-201ENST00000308219 4089 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
RAG2P55895 UBE2Q1-201ENST00000292211 3210 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
RAG2P55895 DVL1-204ENST00000610709 2268 ntTSL 2 BASIC18.41■□□□□ 0.54
RAG2P55895 CCDC85B-201ENST00000312579 1524 ntAPPRIS P1 BASIC18.41■□□□□ 0.54
RAG2P55895 TMEM121-202ENST00000431372 1519 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.41■□□□□ 0.54
RAG2P55895 AC142381.2-201ENST00000566120 298 ntBASIC18.41■□□□□ 0.54
RAG2P55895 CAPNS1-205ENST00000588780 1035 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.41■□□□□ 0.54
RAG2P55895 AC106739.1-201ENST00000617035 715 ntBASIC18.41■□□□□ 0.54
RAG2P55895 CPEB1-AS1-201ENST00000560650 2138 ntTSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
RAG2P55895 SOX8-201ENST00000293894 3049 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
RAG2P55895 CA9-204ENST00000617161 1374 ntTSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
RAG2P55895 ANKLE1-204ENST00000594072 2294 ntTSL 5 BASIC18.4■□□□□ 0.54
RAG2P55895 PEX7-201ENST00000318471 1464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
RAG2P55895 NIPA2-202ENST00000359727 1531 ntTSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
RAG2P55895 BLCAP-208ENST00000414542 2205 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.4■□□□□ 0.54
RAG2P55895 NDUFS3-206ENST00000528192 561 ntTSL 5 BASIC18.4■□□□□ 0.54
RAG2P55895 AC136475.3-202ENST00000534742 812 ntTSL 2 BASIC18.4■□□□□ 0.54
RAG2P55895 HOXA11-AS1_1.1-201ENST00000613939 98 ntBASIC18.4■□□□□ 0.54
RAG2P55895 PFKP-201ENST00000381072 1698 ntTSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
RAG2P55895 MGAT5B-209ENST00000569840 4492 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC18.4■□□□□ 0.54
RAG2P55895 CRLF1-201ENST00000392386 1792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
RAG2P55895 KCTD13-202ENST00000561540 1773 ntTSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
RAG2P55895 SYNC-201ENST00000373484 1824 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.39■□□□□ 0.54
RAG2P55895 RBMS1-205ENST00000409972 1815 ntTSL 5 BASIC18.39■□□□□ 0.54
RAG2P55895 CXXC5-201ENST00000302517 2658 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.54
RAG2P55895 USP21-203ENST00000368002 2342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.53
RAG2P55895 DNAJB5-201ENST00000312316 2391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.53
RAG2P55895 RDX-202ENST00000405097 2761 ntTSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.53
RAG2P55895 B3GAT3-202ENST00000531383 2056 ntTSL 2 BASIC18.39■□□□□ 0.53
RAG2P55895 STK19-201ENST00000375331 1663 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.53
RAG2P55895 GUK1-205ENST00000366722 850 ntTSL 3 BASIC18.39■□□□□ 0.53
RAG2P55895 EBPL-204ENST00000378272 766 ntTSL 3 BASIC18.39■□□□□ 0.53
RAG2P55895 LBH-205ENST00000407930 756 ntTSL 2 BASIC18.39■□□□□ 0.53
RAG2P55895 SRD5A1P1-201ENST00000442297 786 ntBASIC18.39■□□□□ 0.53
RAG2P55895 SNHG12-212ENST00000531126 719 ntTSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.53
RAG2P55895 NRL-205ENST00000560550 788 ntTSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.53
RAG2P55895 LINC01632-201ENST00000615763 496 ntTSL 3 BASIC18.39■□□□□ 0.53
RAG2P55895 TTC7A-201ENST00000319190 5157 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.39■□□□□ 0.53
RAG2P55895 CCDC92-209ENST00000545891 1790 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.39■□□□□ 0.53
RAG2P55895 COMMD5-201ENST00000305103 1373 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.53
RAG2P55895 EEF1D-201ENST00000317198 1458 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.39■□□□□ 0.53
RAG2P55895 NTN1-201ENST00000173229 5954 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.53
RAG2P55895 ZNF513-202ENST00000407879 2077 ntTSL 1 (best) BASIC18.38■□□□□ 0.53
RAG2P55895 MAGI2-201ENST00000354212 6880 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.38■□□□□ 0.53
RAG2P55895 SNX21-212ENST00000491381 1607 ntTSL 1 (best) BASIC18.38■□□□□ 0.53
RAG2P55895 SNX7-201ENST00000306121 1734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.38■□□□□ 0.53
RAG2P55895 GLT8D2-205ENST00000548660 1835 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.38■□□□□ 0.53
RAG2P55895 UNC93B3-201ENST00000308076 687 ntBASIC18.38■□□□□ 0.53
RAG2P55895 MRPL41-201ENST00000371443 1262 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.38■□□□□ 0.53
RAG2P55895 PABPN1-207ENST00000556821 1220 ntTSL 2 BASIC18.38■□□□□ 0.53
RAG2P55895 AP003356.1-202ENST00000517910 2770 ntTSL 2 BASIC18.38■□□□□ 0.53
RAG2P55895 GFER-201ENST00000248114 2345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.38■□□□□ 0.53
RAG2P55895 PFKFB3-219ENST00000640683 2311 ntTSL 5 BASIC18.38■□□□□ 0.53
RAG2P55895 HAND2-AS1-237ENST00000616485 2420 ntTSL 2 BASIC18.38■□□□□ 0.53
RAG2P55895 PRSS33-202ENST00000570702 1676 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.38■□□□□ 0.53
RAG2P55895 OSR2-203ENST00000457907 2126 ntTSL 2 BASIC18.37■□□□□ 0.53
RAG2P55895 ACHE-204ENST00000412389 2218 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
RAG2P55895 SEPT5-209ENST00000438754 2241 ntTSL 2 BASIC18.37■□□□□ 0.53
RAG2P55895 MEDAG-201ENST00000380482 2374 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
RAG2P55895 YTHDF3-213ENST00000621820 2363 ntTSL 2 BASIC18.37■□□□□ 0.53
RAG2P55895 CARD19-201ENST00000375464 855 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
RAG2P55895 AL136162.1-201ENST00000607711 1078 ntBASIC18.37■□□□□ 0.53
RAG2P55895 GRIN1-208ENST00000371561 5149 ntTSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
RAG2P55895 RNF180-201ENST00000296615 1727 ntTSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
RAG2P55895 NDUFAF6-203ENST00000396124 1798 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.37■□□□□ 0.53
RAG2P55895 RNF32-207ENST00000405335 1938 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.37■□□□□ 0.53
RAG2P55895 SNUPN-205ENST00000564644 1931 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.37■□□□□ 0.53
RAG2P55895 POTEC-204ENST00000620346 1988 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
RAG2P55895 GRB10-206ENST00000402497 2289 ntTSL 5 BASIC18.37■□□□□ 0.53
RAG2P55895 CRTAC1-203ENST00000370597 2890 ntTSL 1 (best) BASIC18.36■□□□□ 0.53
RAG2P55895 KCNS3-201ENST00000304101 2333 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.36■□□□□ 0.53
RAG2P55895 SOX2-201ENST00000325404 2513 ntAPPRIS P1 BASIC18.36■□□□□ 0.53
RAG2P55895 ANKRD16-203ENST00000380094 2738 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.36■□□□□ 0.53
RAG2P55895 TBL1Y-203ENST00000383032 2407 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.36■□□□□ 0.53
RAG2P55895 RABL2B-206ENST00000395598 2169 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.36■□□□□ 0.53
RAG2P55895 IRF7-205ENST00000397574 1968 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.36■□□□□ 0.53
RAG2P55895 ZDHHC20-203ENST00000400590 1869 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.36■□□□□ 0.53
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 25.3 ms