Protein–RNA interactions for Protein: P54829

PTPN5, Tyrosine-protein phosphatase non-receptor type 5, humanhuman

Predictions only

Length 565 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PTPN5P54829 CEACAM4-201ENST00000221954 1205 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
PTPN5P54829 SNRNP25-202ENST00000383018 1085 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
PTPN5P54829 EMC6-202ENST00000397133 762 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.09■■□□□ 1.13
PTPN5P54829 MNX1-AS1-201ENST00000480284 1041 ntTSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
PTPN5P54829 AL731577.2-201ENST00000508096 555 ntTSL 2 BASIC22.09■■□□□ 1.13
PTPN5P54829 AC008550.1-201ENST00000511500 884 ntBASIC22.09■■□□□ 1.13
PTPN5P54829 BRI3-207ENST00000539286 699 ntTSL 2 BASIC22.09■■□□□ 1.13
PTPN5P54829 AC089999.2-201ENST00000552525 248 ntTSL 3 BASIC22.09■■□□□ 1.13
PTPN5P54829 CEACAM4-203ENST00000600925 899 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.09■■□□□ 1.13
PTPN5P54829 PEX10-204ENST00000507596 1941 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.09■■□□□ 1.13
PTPN5P54829 UBA5-208ENST00000473651 1513 ntTSL 5 BASIC22.09■■□□□ 1.13
PTPN5P54829 CBWD5-207ENST00000382405 1791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
PTPN5P54829 LACTBL1-201ENST00000426928 1641 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC22.09■■□□□ 1.13
PTPN5P54829 RBM42-203ENST00000588161 1609 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
PTPN5P54829 PCK2-201ENST00000216780 2357 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
PTPN5P54829 HSDL1-202ENST00000434463 1493 ntTSL 2 BASIC22.09■■□□□ 1.13
PTPN5P54829 PNLIPRP2-204ENST00000591655 1456 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.09■■□□□ 1.13
PTPN5P54829 KLHDC9-201ENST00000368011 1314 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.13
PTPN5P54829 XPA-201ENST00000375128 1417 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.13
PTPN5P54829 METTL5-206ENST00000409965 880 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.13
PTPN5P54829 PEX26-203ENST00000428061 815 ntTSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.13
PTPN5P54829 CHTF8-210ENST00000523421 766 ntTSL 3 BASIC22.08■■□□□ 1.13
PTPN5P54829 PHB2-213ENST00000546111 858 ntTSL 2 BASIC22.08■■□□□ 1.13
PTPN5P54829 AC006058.3-201ENST00000606217 1069 ntBASIC22.08■■□□□ 1.13
PTPN5P54829 REST-211ENST00000640168 1268 ntTSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.13
PTPN5P54829 MYCNOS-205ENST00000641950 531 ntBASIC22.08■■□□□ 1.13
PTPN5P54829 SIRT3-202ENST00000524564 1395 ntTSL 2 BASIC22.08■■□□□ 1.12
PTPN5P54829 EPM2A-209ENST00000638262 2679 ntTSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.12
PTPN5P54829 SDC3-202ENST00000339394 1580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.12
PTPN5P54829 CTU2-201ENST00000312060 1672 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC22.07■■□□□ 1.12
PTPN5P54829 FJX1-201ENST00000317811 2450 ntAPPRIS P1 BASIC22.07■■□□□ 1.12
PTPN5P54829 SLC9A3-201ENST00000264938 2584 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
PTPN5P54829 OSR2-210ENST00000523368 1519 ntTSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
PTPN5P54829 PFKFB3-201ENST00000317350 1999 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.07■■□□□ 1.12
PTPN5P54829 AMZ2-202ENST00000359904 2402 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.07■■□□□ 1.12
PTPN5P54829 HSD17B10-202ENST00000375298 823 ntTSL 3 BASIC22.07■■□□□ 1.12
PTPN5P54829 VKORC1-204ENST00000394971 664 ntTSL 5 BASIC22.07■■□□□ 1.12
PTPN5P54829 CFL1-211ENST00000531407 1062 ntTSL 2 BASIC22.07■■□□□ 1.12
PTPN5P54829 ABCC6P2-202ENST00000542005 706 ntTSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
PTPN5P54829 ABCC6-204ENST00000575728 714 ntTSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
PTPN5P54829 USP36-216ENST00000589424 970 ntTSL 5 BASIC22.07■■□□□ 1.12
PTPN5P54829 AC104187.1-201ENST00000607510 612 ntBASIC22.07■■□□□ 1.12
PTPN5P54829 ALDH3A2-224ENST00000626500 995 ntTSL 5 BASIC22.07■■□□□ 1.12
PTPN5P54829 ERF-201ENST00000222329 2698 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
PTPN5P54829 SGMS1-210ENST00000619438 1680 ntTSL 5 BASIC22.07■■□□□ 1.12
PTPN5P54829 HMGA2-203ENST00000393578 1993 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
PTPN5P54829 NKIRAS2-204ENST00000393880 1644 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.06■■□□□ 1.12
PTPN5P54829 PIKFYVE-203ENST00000392202 2039 ntTSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
PTPN5P54829 SYNGR1-201ENST00000216155 497 ntTSL 3 BASIC22.06■■□□□ 1.12
PTPN5P54829 PHPT1-201ENST00000247665 890 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
PTPN5P54829 MIPEPP3-201ENST00000412105 444 ntBASIC22.06■■□□□ 1.12
PTPN5P54829 GNAS-AS1-201ENST00000424094 1156 ntTSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
PTPN5P54829 AC128676.1-201ENST00000454392 318 ntBASIC22.06■■□□□ 1.12
PTPN5P54829 C14orf28-204ENST00000557112 1097 ntTSL 5 BASIC22.06■■□□□ 1.12
PTPN5P54829 PRR35-201ENST00000409413 2216 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
PTPN5P54829 PROSER2-205ENST00000622831 1646 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
PTPN5P54829 CFP-202ENST00000377005 1435 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
PTPN5P54829 ERI3-201ENST00000372257 1684 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
PTPN5P54829 AC007326.4-201ENST00000638240 1669 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.05■■□□□ 1.12
PTPN5P54829 MRPL39-201ENST00000307301 1199 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.05■■□□□ 1.12
PTPN5P54829 LGALS9B-201ENST00000324290 1243 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC22.05■■□□□ 1.12
PTPN5P54829 MRPL39-202ENST00000352957 1110 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
PTPN5P54829 SMNDC1-201ENST00000369592 1110 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.05■■□□□ 1.12
PTPN5P54829 APTR-203ENST00000430801 583 ntTSL 5 BASIC22.05■■□□□ 1.12
PTPN5P54829 AC011611.3-201ENST00000552367 569 ntTSL 4 BASIC22.05■■□□□ 1.12
PTPN5P54829 MMD2-204ENST00000612910 778 ntTSL 5 BASIC22.05■■□□□ 1.12
PTPN5P54829 CACTIN-AS1-201ENST00000592274 1913 ntTSL 2 BASIC22.05■■□□□ 1.12
PTPN5P54829 CASK-201ENST00000378154 2494 ntTSL 5 BASIC22.05■■□□□ 1.12
PTPN5P54829 PEX5-205ENST00000420616 2477 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
PTPN5P54829 AC096677.1-201ENST00000454651 1516 ntTSL 2 BASIC22.05■■□□□ 1.12
PTPN5P54829 TGIF1-206ENST00000405385 1689 ntTSL 2 BASIC22.04■■□□□ 1.12
PTPN5P54829 BIN1-205ENST00000351659 2365 ntTSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
PTPN5P54829 GLT8D2-205ENST00000548660 1835 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.04■■□□□ 1.12
PTPN5P54829 SCAND1-202ENST00000373991 1727 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
PTPN5P54829 CKLF-201ENST00000264001 669 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
PTPN5P54829 CNN2P6-201ENST00000439038 900 ntBASIC22.04■■□□□ 1.12
PTPN5P54829 FAM213B-215ENST00000537325 1096 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.04■■□□□ 1.12
PTPN5P54829 C14orf144-202ENST00000555282 854 ntTSL 3 BASIC22.04■■□□□ 1.12
PTPN5P54829 DHRS4-207ENST00000559632 1003 ntTSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
PTPN5P54829 LIMD2-206ENST00000578993 602 ntTSL 3 BASIC22.04■■□□□ 1.12
PTPN5P54829 AC016888.1-201ENST00000585285 565 ntTSL 3 BASIC22.04■■□□□ 1.12
PTPN5P54829 AC027682.4-201ENST00000605277 798 ntTSL 5 BASIC22.04■■□□□ 1.12
PTPN5P54829 TMEM44-211ENST00000473092 1508 ntTSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
PTPN5P54829 ATP5G2-201ENST00000338662 1792 ntTSL 2 BASIC22.04■■□□□ 1.12
PTPN5P54829 DACT3-201ENST00000300875 2526 ntTSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
PTPN5P54829 CPNE2-202ENST00000535318 2316 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
PTPN5P54829 GRK4-206ENST00000504933 1971 ntTSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
PTPN5P54829 AC096537.1-201ENST00000437416 684 ntTSL 5 BASIC22.03■■□□□ 1.12
PTPN5P54829 SMIM1-201ENST00000444870 546 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
PTPN5P54829 ABHD1-207ENST00000621324 1078 ntTSL 5 BASIC22.03■■□□□ 1.12
PTPN5P54829 ANKRD54-201ENST00000215941 2184 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
PTPN5P54829 PICK1-202ENST00000404072 2164 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.03■■□□□ 1.12
PTPN5P54829 OSCAR-201ENST00000284648 2055 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
PTPN5P54829 C21orf2-202ENST00000339818 2233 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
PTPN5P54829 UBE2E3-201ENST00000392415 1347 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.03■■□□□ 1.12
PTPN5P54829 ARRDC1-AS1-203ENST00000623970 2210 ntTSL 5 BASIC22.02■■□□□ 1.12
PTPN5P54829 DENND5A-201ENST00000328194 5031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
PTPN5P54829 PCSK6-218ENST00000619160 3093 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
PTPN5P54829 LIPT2-201ENST00000310109 1018 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.02■■□□□ 1.12
PTPN5P54829 PPP1CA-202ENST00000358239 1054 ntTSL 2 BASIC22.02■■□□□ 1.12
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 27.7 ms