Protein–RNA interactions for Protein: P23588

EIF4B, Eukaryotic translation initiation factor 4B, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 611 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
EIF4BP23588 SOX18-201ENST00000340356 1864 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.34
EIF4BP23588 RAB28-203ENST00000338176 1787 ntTSL 3 BASIC23.45■■□□□ 1.34
EIF4BP23588 CDK5-204ENST00000485972 1758 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.34
EIF4BP23588 PACRGL-227ENST00000513459 1773 ntTSL 5 BASIC23.45■■□□□ 1.34
EIF4BP23588 KCTD13-202ENST00000561540 1773 ntTSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.34
EIF4BP23588 ARHGEF9-204ENST00000374878 2217 ntTSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
EIF4BP23588 REPIN1-214ENST00000489432 2058 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.44■■□□□ 1.34
EIF4BP23588 EFCC1-201ENST00000436022 2691 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.44■■□□□ 1.34
EIF4BP23588 TOP1MT-201ENST00000329245 1958 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
EIF4BP23588 TNFRSF18-201ENST00000328596 851 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
EIF4BP23588 ZNF451-202ENST00000370702 458 ntTSL 2 BASIC23.44■■□□□ 1.34
EIF4BP23588 AC016888.1-201ENST00000585285 565 ntTSL 3 BASIC23.44■■□□□ 1.34
EIF4BP23588 TRAPPC3-208ENST00000616074 1114 ntTSL 5 BASIC23.44■■□□□ 1.34
EIF4BP23588 MYCNOS-205ENST00000641950 531 ntBASIC23.44■■□□□ 1.34
EIF4BP23588 SLC19A1-209ENST00000485649 1896 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.44■■□□□ 1.34
EIF4BP23588 KREMEN2-203ENST00000571007 1877 ntTSL 2 BASIC23.44■■□□□ 1.34
EIF4BP23588 CD6-203ENST00000352009 1809 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
EIF4BP23588 NABP2-203ENST00000380198 1775 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
EIF4BP23588 KPTN-201ENST00000338134 1691 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
EIF4BP23588 SGMS1-210ENST00000619438 1680 ntTSL 5 BASIC23.44■■□□□ 1.34
EIF4BP23588 BMP6-201ENST00000283147 2780 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
EIF4BP23588 NOC4L-201ENST00000330579 1632 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
EIF4BP23588 WT1-204ENST00000448076 2114 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.44■■□□□ 1.34
EIF4BP23588 DCPS-201ENST00000263579 1479 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
EIF4BP23588 NCK2-201ENST00000233154 2683 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.43■■□□□ 1.34
EIF4BP23588 MPV17L-202ENST00000396385 1037 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
EIF4BP23588 ZPBP-201ENST00000046087 1213 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
EIF4BP23588 KRT18P20-201ENST00000548986 1279 ntBASIC23.43■■□□□ 1.34
EIF4BP23588 DUX4L16-201ENST00000555130 1264 ntBASIC23.43■■□□□ 1.34
EIF4BP23588 EEF1DP3-203ENST00000566025 782 ntBASIC23.43■■□□□ 1.34
EIF4BP23588 RGS7-204ENST00000366565 2494 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
EIF4BP23588 ATMIN-201ENST00000299575 4884 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
EIF4BP23588 PROSER2-205ENST00000622831 1646 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
EIF4BP23588 MEIS3-212ENST00000561293 1918 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
EIF4BP23588 DTNB-210ENST00000407186 2275 ntTSL 5 BASIC23.43■■□□□ 1.34
EIF4BP23588 ANO1-202ENST00000355303 4790 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
EIF4BP23588 DUSP26-201ENST00000256261 1835 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
EIF4BP23588 MAGI2-208ENST00000522391 4878 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.42■■□□□ 1.34
EIF4BP23588 CCDC9-201ENST00000221922 2093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
EIF4BP23588 AP006623.1-201ENST00000506172 2061 ntTSL 5 BASIC23.42■■□□□ 1.34
EIF4BP23588 IKBKG-212ENST00000617207 1949 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC23.42■■□□□ 1.34
EIF4BP23588 CITED1-201ENST00000246139 1231 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
EIF4BP23588 CFD-201ENST00000327726 1201 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
EIF4BP23588 CPED1-202ENST00000340646 1056 ntTSL 5 BASIC23.42■■□□□ 1.34
EIF4BP23588 KHDC3L-201ENST00000370367 1018 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
EIF4BP23588 CMTM8-202ENST00000458535 996 ntTSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
EIF4BP23588 ZNF696-204ENST00000520333 605 ntTSL 5 BASIC23.42■■□□□ 1.34
EIF4BP23588 UPF3A-201ENST00000351487 2235 ntTSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
EIF4BP23588 BMP2K-204ENST00000502871 3195 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
EIF4BP23588 ADRM1-204ENST00000491935 1530 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.42■■□□□ 1.34
EIF4BP23588 GADD45GIP1-201ENST00000316939 1782 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
EIF4BP23588 KDF1-201ENST00000320567 1793 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.42■■□□□ 1.34
EIF4BP23588 DONSON-210ENST00000453626 2332 ntTSL 5 BASIC23.42■■□□□ 1.34
EIF4BP23588 CBWD3-202ENST00000377342 1665 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
EIF4BP23588 CD58-203ENST00000457047 1328 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
EIF4BP23588 DPH7-201ENST00000277540 1847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
EIF4BP23588 SOCS7-202ENST00000613678 1827 ntTSL 5 BASIC23.41■■□□□ 1.34
EIF4BP23588 GGTLC1-202ENST00000286890 1028 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
EIF4BP23588 LGALS9B-201ENST00000324290 1243 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC23.41■■□□□ 1.34
EIF4BP23588 MIR663A-201ENST00000385250 93 ntBASIC23.41■■□□□ 1.34
EIF4BP23588 NCF1B-203ENST00000435988 1254 ntBASIC23.41■■□□□ 1.34
EIF4BP23588 TSPAN11-202ENST00000535215 988 ntTSL 2 BASIC23.41■■□□□ 1.34
EIF4BP23588 SLC25A29-212ENST00000555927 960 ntTSL 2 BASIC23.41■■□□□ 1.34
EIF4BP23588 AC053503.5-201ENST00000601508 636 ntBASIC23.41■■□□□ 1.34
EIF4BP23588 AC231657.2-201ENST00000624556 255 ntBASIC23.41■■□□□ 1.34
EIF4BP23588 WDR86-207ENST00000621812 1542 ntTSL 5 BASIC23.41■■□□□ 1.34
EIF4BP23588 CADM1-201ENST00000331581 1766 ntTSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
EIF4BP23588 RASSF10-201ENST00000529419 2530 ntAPPRIS P1 BASIC23.41■■□□□ 1.34
EIF4BP23588 DOK1-203ENST00000409429 1955 ntTSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
EIF4BP23588 DTNB-211ENST00000407661 2420 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
EIF4BP23588 SLC39A4-202ENST00000301305 2174 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
EIF4BP23588 CDKN1C-202ENST00000414822 2051 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
EIF4BP23588 TLE3-216ENST00000559191 1575 ntTSL 5 BASIC23.4■■□□□ 1.34
EIF4BP23588 LSR-204ENST00000361790 2210 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
EIF4BP23588 SLC41A3-201ENST00000315891 1797 ntTSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
EIF4BP23588 ZNF395-210ENST00000523095 1790 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
EIF4BP23588 SLCO3A1-201ENST00000318445 5115 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
EIF4BP23588 HRASLS-201ENST00000264735 1066 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
EIF4BP23588 KANSL1-AS1-201ENST00000398275 517 ntTSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
EIF4BP23588 C19orf73-201ENST00000408991 744 ntAPPRIS P1 BASIC23.4■■□□□ 1.34
EIF4BP23588 LINC01816-201ENST00000414141 662 ntTSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
EIF4BP23588 AC092171.1-201ENST00000455866 753 ntTSL 2 BASIC23.4■■□□□ 1.34
EIF4BP23588 BRI3-207ENST00000539286 699 ntTSL 2 BASIC23.4■■□□□ 1.34
EIF4BP23588 MBD3L1-202ENST00000595891 872 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.4■■□□□ 1.34
EIF4BP23588 FNDC5-207ENST00000640867 639 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC23.4■■□□□ 1.34
EIF4BP23588 C10orf95-201ENST00000625129 1469 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
EIF4BP23588 AC092490.1-203ENST00000514568 1972 ntTSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
EIF4BP23588 HSF4-215ENST00000521374 1515 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.39■■□□□ 1.34
EIF4BP23588 VPS29-206ENST00000549578 1523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.39■■□□□ 1.34
EIF4BP23588 TPST2-203ENST00000403880 2084 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.39■■□□□ 1.34
EIF4BP23588 PUS1-203ENST00000443358 1664 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.39■■□□□ 1.34
EIF4BP23588 MOB2-201ENST00000329957 1207 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.39■■□□□ 1.33
EIF4BP23588 DENND3-207ENST00000518347 850 ntTSL 2 BASIC23.39■■□□□ 1.33
EIF4BP23588 EDA-210ENST00000527388 927 ntTSL 1 (best) BASIC23.39■■□□□ 1.33
EIF4BP23588 NMRAL1-212ENST00000574425 1240 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.39■■□□□ 1.33
EIF4BP23588 PARD6A-203ENST00000602551 1171 ntTSL 5 BASIC23.39■■□□□ 1.33
EIF4BP23588 AC104771.1-201ENST00000603335 964 ntBASIC23.39■■□□□ 1.33
EIF4BP23588 AL161421.1-201ENST00000619666 1101 ntTSL 1 (best) BASIC23.39■■□□□ 1.33
EIF4BP23588 NRL-203ENST00000397002 1976 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.39■■□□□ 1.33
EIF4BP23588 AC079328.2-202ENST00000560903 1410 ntTSL 1 (best) BASIC23.39■■□□□ 1.33
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 55.7 ms