Protein–RNA interactions for Protein: P13805

TNNT1, Troponin T, slow skeletal muscle, humanhuman

Predictions only

Length 278 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TNNT1P13805 KCNS3-201ENST00000304101 2333 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.34■■□□□ 1.33
TNNT1P13805 PLPP1-202ENST00000307259 1597 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.34■■□□□ 1.33
TNNT1P13805 TRIM58-201ENST00000366481 3225 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.34■■□□□ 1.33
TNNT1P13805 SUMF2-208ENST00000434526 2052 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.34■■□□□ 1.33
TNNT1P13805 GJB6-203ENST00000400065 1805 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.33■■□□□ 1.33
TNNT1P13805 RASEF-202ENST00000376447 5576 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.33■■□□□ 1.33
TNNT1P13805 P2RX4-202ENST00000337233 2032 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.33■■□□□ 1.33
TNNT1P13805 USP21-203ENST00000368002 2342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.33■■□□□ 1.33
TNNT1P13805 PFKFB3-219ENST00000640683 2311 ntTSL 5 BASIC23.33■■□□□ 1.33
TNNT1P13805 PRSS33-202ENST00000570702 1676 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.33■■□□□ 1.33
TNNT1P13805 RBM42-206ENST00000592202 1469 ntTSL 5 BASIC23.33■■□□□ 1.33
TNNT1P13805 SUSD3-202ENST00000375472 1195 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.33■■□□□ 1.33
TNNT1P13805 FAHD1-204ENST00000615972 757 ntTSL 5 BASIC23.33■■□□□ 1.33
TNNT1P13805 SLC25A5-AS1-202ENST00000445759 1616 ntTSL 1 (best) BASIC23.33■■□□□ 1.32
TNNT1P13805 ST8SIA2-201ENST00000268164 5708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.33■■□□□ 1.32
TNNT1P13805 ARFRP1-210ENST00000614942 2554 ntTSL 5 BASIC23.33■■□□□ 1.32
TNNT1P13805 TUBGCP3-204ENST00000464139 2461 ntTSL 1 (best) BASIC23.33■■□□□ 1.32
TNNT1P13805 IRF7-201ENST00000330243 1992 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC23.32■■□□□ 1.32
TNNT1P13805 CCNL1-203ENST00000461804 1998 ntTSL 2 BASIC23.32■■□□□ 1.32
TNNT1P13805 PPP1R12B-202ENST00000356764 1687 ntTSL 1 (best) BASIC23.32■■□□□ 1.32
TNNT1P13805 C1orf174-201ENST00000361605 1666 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.32■■□□□ 1.32
TNNT1P13805 C18orf25-204ENST00000615553 2329 ntTSL 5 BASIC23.32■■□□□ 1.32
TNNT1P13805 RAP1B-207ENST00000450214 1466 ntTSL 2 BASIC23.32■■□□□ 1.32
TNNT1P13805 PDK3-201ENST00000379162 1809 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.32■■□□□ 1.32
TNNT1P13805 ZNF513-202ENST00000407879 2077 ntTSL 1 (best) BASIC23.32■■□□□ 1.32
TNNT1P13805 CBWD1-203ENST00000377400 1792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.32■■□□□ 1.32
TNNT1P13805 CITED2-202ENST00000536159 1797 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC23.32■■□□□ 1.32
TNNT1P13805 AL160276.1-201ENST00000636672 1312 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.32■■□□□ 1.32
TNNT1P13805 SOX12-201ENST00000342665 4630 ntAPPRIS P1 BASIC23.31■■□□□ 1.32
TNNT1P13805 SACM1L-202ENST00000418611 2164 ntTSL 2 BASIC23.31■■□□□ 1.32
TNNT1P13805 SPOCK3-204ENST00000502330 2180 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.31■■□□□ 1.32
TNNT1P13805 FADS6-203ENST00000612771 2154 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.31■■□□□ 1.32
TNNT1P13805 ADM-207ENST00000530439 1839 ntTSL 2 BASIC23.31■■□□□ 1.32
TNNT1P13805 CTAG1B-201ENST00000328435 748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.31■■□□□ 1.32
TNNT1P13805 HMX3-201ENST00000357878 1173 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.31■■□□□ 1.32
TNNT1P13805 EBPL-205ENST00000378284 967 ntTSL 1 (best) BASIC23.31■■□□□ 1.32
TNNT1P13805 HMGA2-202ENST00000393577 611 ntTSL 3 BASIC23.31■■□□□ 1.32
TNNT1P13805 RARRES2P1-201ENST00000474487 481 ntBASIC23.31■■□□□ 1.32
TNNT1P13805 CTAG1A-202ENST00000599837 748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.31■■□□□ 1.32
TNNT1P13805 LAT-217ENST00000630764 610 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.31■■□□□ 1.32
TNNT1P13805 PTGER2-201ENST00000245457 2383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.31■■□□□ 1.32
TNNT1P13805 UAP1-201ENST00000271469 2377 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC23.31■■□□□ 1.32
TNNT1P13805 FAM129C-203ENST00000449408 2004 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.31■■□□□ 1.32
TNNT1P13805 DMWD-202ENST00000377735 3292 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.31■■□□□ 1.32
TNNT1P13805 CFAP99-206ENST00000616117 1941 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.31■■□□□ 1.32
TNNT1P13805 FGF22-201ENST00000215530 1311 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.31■■□□□ 1.32
TNNT1P13805 LGI3-202ENST00000424267 3114 ntTSL 1 (best) BASIC23.31■■□□□ 1.32
TNNT1P13805 YBX3-202ENST00000279550 1708 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.3■■□□□ 1.32
TNNT1P13805 TXNRD2-203ENST00000400519 3155 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.3■■□□□ 1.32
TNNT1P13805 SNRNP70-201ENST00000221448 1603 ntTSL 2 BASIC23.3■■□□□ 1.32
TNNT1P13805 FNDC4-201ENST00000264703 1657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.3■■□□□ 1.32
TNNT1P13805 LRP11-202ENST00000367368 1042 ntTSL 2 BASIC23.3■■□□□ 1.32
TNNT1P13805 CLTA-206ENST00000466396 695 ntTSL 2 BASIC23.3■■□□□ 1.32
TNNT1P13805 MIR6722-201ENST00000617286 78 ntBASIC23.3■■□□□ 1.32
TNNT1P13805 DNAAF3-207ENST00000527223 2228 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.3■■□□□ 1.32
TNNT1P13805 PAN3-201ENST00000380958 2833 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC23.3■■□□□ 1.32
TNNT1P13805 C20orf27-202ENST00000379772 1886 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.3■■□□□ 1.32
TNNT1P13805 JMJD1C-AS1-201ENST00000609436 1335 ntBASIC23.3■■□□□ 1.32
TNNT1P13805 FAM66B-202ENST00000606573 2630 ntTSL 1 (best) BASIC23.29■■□□□ 1.32
TNNT1P13805 RLBP1-201ENST00000268125 1810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.29■■□□□ 1.32
TNNT1P13805 DOCK9-206ENST00000427887 4176 ntTSL 1 (best) BASIC23.29■■□□□ 1.32
TNNT1P13805 IGFBP3-210ENST00000613132 2412 ntTSL 5 BASIC23.29■■□□□ 1.32
TNNT1P13805 WBP1-203ENST00000409737 1110 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC23.29■■□□□ 1.32
TNNT1P13805 ZNF503-AS2-202ENST00000466942 1430 ntTSL 2 BASIC23.29■■□□□ 1.32
TNNT1P13805 KRT125P-201ENST00000546827 989 ntBASIC23.29■■□□□ 1.32
TNNT1P13805 NAA30-203ENST00000555166 1294 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.29■■□□□ 1.32
TNNT1P13805 TPBGL-201ENST00000562197 2793 ntAPPRIS P1 BASIC23.29■■□□□ 1.32
TNNT1P13805 LSM7-204ENST00000587502 575 ntTSL 1 (best) BASIC23.29■■□□□ 1.32
TNNT1P13805 HNRNPUL1-222ENST00000617774 451 ntTSL 5 BASIC23.29■■□□□ 1.32
TNNT1P13805 SMURF1-202ENST00000361368 5581 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.29■■□□□ 1.32
TNNT1P13805 BASP1-201ENST00000322611 1878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.28■■□□□ 1.32
TNNT1P13805 SMOC2-206ENST00000535039 1875 ntTSL 5 BASIC23.28■■□□□ 1.32
TNNT1P13805 TPCN2-208ENST00000637342 2856 ntTSL 5 BASIC23.28■■□□□ 1.32
TNNT1P13805 JPT1-206ENST00000476258 2289 ntTSL 1 (best) BASIC23.28■■□□□ 1.32
TNNT1P13805 CTU2-202ENST00000453996 1751 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.28■■□□□ 1.32
TNNT1P13805 RARG-204ENST00000543726 1779 ntTSL 2 BASIC23.28■■□□□ 1.32
TNNT1P13805 MDK-203ENST00000395566 828 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.28■■□□□ 1.32
TNNT1P13805 TMEM170A-202ENST00000561878 1072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.28■■□□□ 1.32
TNNT1P13805 AC092028.1-203ENST00000608262 953 ntBASIC23.28■■□□□ 1.32
TNNT1P13805 PRMT5-228ENST00000627278 129 ntTSL 5 BASIC23.28■■□□□ 1.32
TNNT1P13805 SNUPN-207ENST00000567134 1641 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.28■■□□□ 1.32
TNNT1P13805 CTU2-201ENST00000312060 1672 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC23.28■■□□□ 1.32
TNNT1P13805 POLD2-207ENST00000452185 1659 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.28■■□□□ 1.32
TNNT1P13805 DBP-201ENST00000222122 2229 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.28■■□□□ 1.32
TNNT1P13805 ZPBP2-201ENST00000348931 1543 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.28■■□□□ 1.32
TNNT1P13805 DOC2A-218ENST00000616445 2065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.28■■□□□ 1.32
TNNT1P13805 BAALC-203ENST00000309982 2831 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.28■■□□□ 1.32
TNNT1P13805 AQP6-201ENST00000315520 1398 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.27■■□□□ 1.32
TNNT1P13805 MTNR1B-201ENST00000257068 1565 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.27■■□□□ 1.32
TNNT1P13805 SLC35C1-202ENST00000442528 1756 ntTSL 1 (best) BASIC23.27■■□□□ 1.32
TNNT1P13805 SESN3-202ENST00000416495 1408 ntTSL 1 (best) BASIC23.27■■□□□ 1.32
TNNT1P13805 IL17RE-206ENST00000454190 2757 ntTSL 2 BASIC23.27■■□□□ 1.32
TNNT1P13805 AC105935.1-201ENST00000424174 422 ntTSL 3 BASIC23.27■■□□□ 1.32
TNNT1P13805 HOXC-AS1-201ENST00000505700 548 ntTSL 2 BASIC23.27■■□□□ 1.32
TNNT1P13805 SNUPN-205ENST00000564644 1931 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.27■■□□□ 1.32
TNNT1P13805 NUDT11-201ENST00000375992 2385 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.27■■□□□ 1.32
TNNT1P13805 OSCAR-203ENST00000356532 1355 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.27■■□□□ 1.31
TNNT1P13805 OSCAR-204ENST00000358375 1389 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.27■■□□□ 1.31
TNNT1P13805 OSCAR-210ENST00000616447 1358 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.27■■□□□ 1.31
TNNT1P13805 ADAMTS2-202ENST00000274609 2044 ntTSL 1 (best) BASIC23.26■■□□□ 1.31
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 27.2 ms