Protein–RNA interactions for Protein: P0C7W0

PRR29, Proline-rich protein 29, humanhuman

Predictions only

Length 189 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PRR29P0C7W0 AC104564.3-201ENST00000582367 638 ntBASIC23.9■■□□□ 1.42
PRR29P0C7W0 DCTD-202ENST00000438320 1972 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.9■■□□□ 1.42
PRR29P0C7W0 DOK3-202ENST00000357198 1729 ntTSL 2 BASIC23.9■■□□□ 1.42
PRR29P0C7W0 TPTEP1-205ENST00000558085 1738 ntTSL 2 BASIC23.9■■□□□ 1.42
PRR29P0C7W0 SMPD2-201ENST00000258052 1645 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.89■■□□□ 1.42
PRR29P0C7W0 NUDT10-201ENST00000356450 1917 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.89■■□□□ 1.42
PRR29P0C7W0 C1QL4-201ENST00000334221 2071 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.89■■□□□ 1.41
PRR29P0C7W0 DNPH1-201ENST00000230431 657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.89■■□□□ 1.41
PRR29P0C7W0 LYPD2-201ENST00000359228 594 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.89■■□□□ 1.41
PRR29P0C7W0 AL357078.1-201ENST00000448344 310 ntTSL 4 BASIC23.89■■□□□ 1.41
PRR29P0C7W0 ZNF584-205ENST00000596281 575 ntTSL 2 BASIC23.89■■□□□ 1.41
PRR29P0C7W0 AL136162.1-201ENST00000607711 1078 ntBASIC23.89■■□□□ 1.41
PRR29P0C7W0 CBWD3-212ENST00000616550 721 ntTSL 2 BASIC23.89■■□□□ 1.41
PRR29P0C7W0 CBWD6-216ENST00000617933 721 ntTSL 3 BASIC23.89■■□□□ 1.41
PRR29P0C7W0 CYHR1-201ENST00000306145 1409 ntTSL 1 (best) BASIC23.89■■□□□ 1.41
PRR29P0C7W0 OSBPL10-204ENST00000438237 2624 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.89■■□□□ 1.41
PRR29P0C7W0 ZNF48-201ENST00000320159 3234 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.89■■□□□ 1.41
PRR29P0C7W0 LMAN2-201ENST00000303127 1800 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.89■■□□□ 1.41
PRR29P0C7W0 GAL3ST3-201ENST00000312006 2133 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.89■■□□□ 1.41
PRR29P0C7W0 C10orf55-202ENST00000412307 2360 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.88■■□□□ 1.41
PRR29P0C7W0 ZNF331-202ENST00000411977 2248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.88■■□□□ 1.41
PRR29P0C7W0 CENPS-CORT-201ENST00000400900 1469 ntTSL 2 BASIC23.88■■□□□ 1.41
PRR29P0C7W0 ZNHIT2-201ENST00000310597 1306 ntAPPRIS P1 BASIC23.88■■□□□ 1.41
PRR29P0C7W0 TMEFF1-201ENST00000374879 2611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.88■■□□□ 1.41
PRR29P0C7W0 P2RX4-202ENST00000337233 2032 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.88■■□□□ 1.41
PRR29P0C7W0 LRP5L-203ENST00000444995 1714 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.88■■□□□ 1.41
PRR29P0C7W0 RNF208-201ENST00000391553 1077 ntAPPRIS P1 BASIC23.88■■□□□ 1.41
PRR29P0C7W0 BX842568.3-201ENST00000418104 571 ntBASIC23.88■■□□□ 1.41
PRR29P0C7W0 IFNA4-201ENST00000421715 978 ntAPPRIS P1 BASIC23.88■■□□□ 1.41
PRR29P0C7W0 AC133561.4-201ENST00000566112 224 ntBASIC23.88■■□□□ 1.41
PRR29P0C7W0 BBC3-202ENST00000341983 1538 ntTSL 1 (best) BASIC23.88■■□□□ 1.41
PRR29P0C7W0 SLC25A39-201ENST00000225308 1607 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.88■■□□□ 1.41
PRR29P0C7W0 HSF2BP-201ENST00000291560 1899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.87■■□□□ 1.41
PRR29P0C7W0 ZNF446-208ENST00000622313 1884 ntTSL 1 (best) BASIC23.87■■□□□ 1.41
PRR29P0C7W0 BOK-201ENST00000318407 2657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.87■■□□□ 1.41
PRR29P0C7W0 IRX4-206ENST00000513692 2391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.87■■□□□ 1.41
PRR29P0C7W0 RASGEF1C-201ENST00000361132 2243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.87■■□□□ 1.41
PRR29P0C7W0 CPNE9-203ENST00000383832 2068 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.87■■□□□ 1.41
PRR29P0C7W0 MYBL1-204ENST00000522677 5192 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.87■■□□□ 1.41
PRR29P0C7W0 PRADC1-201ENST00000258083 1083 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.87■■□□□ 1.41
PRR29P0C7W0 TOLLIP-208ENST00000527938 549 ntTSL 4 BASIC23.87■■□□□ 1.41
PRR29P0C7W0 HOMER3-206ENST00000594439 982 ntTSL 1 (best) BASIC23.87■■□□□ 1.41
PRR29P0C7W0 Z99916.3-201ENST00000623422 1080 ntBASIC23.87■■□□□ 1.41
PRR29P0C7W0 SPRN-201ENST00000414069 3128 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.87■■□□□ 1.41
PRR29P0C7W0 CCKBR-206ENST00000532715 1734 ntTSL 3 BASIC23.87■■□□□ 1.41
PRR29P0C7W0 SIRT3-204ENST00000525319 1475 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.87■■□□□ 1.41
PRR29P0C7W0 ACADVL-202ENST00000350303 2191 ntTSL 1 (best) BASIC23.86■■□□□ 1.41
PRR29P0C7W0 SETD9-211ENST00000628593 1306 ntTSL 1 (best) BASIC23.86■■□□□ 1.41
PRR29P0C7W0 EEF1D-204ENST00000423316 2378 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC23.86■■□□□ 1.41
PRR29P0C7W0 SAV1-201ENST00000324679 3063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.86■■□□□ 1.41
PRR29P0C7W0 DYM-203ENST00000442713 2147 ntTSL 2 BASIC23.86■■□□□ 1.41
PRR29P0C7W0 PABPC1L-202ENST00000217074 1263 ntTSL 5 BASIC23.86■■□□□ 1.41
PRR29P0C7W0 IL20RA-202ENST00000367746 1244 ntTSL 2 BASIC23.86■■□□□ 1.41
PRR29P0C7W0 SMUG1P1-201ENST00000590640 811 ntBASIC23.86■■□□□ 1.41
PRR29P0C7W0 PBX4-201ENST00000251203 1724 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.86■■□□□ 1.41
PRR29P0C7W0 YBX3-202ENST00000279550 1708 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.86■■□□□ 1.41
PRR29P0C7W0 ANKRD13D-202ENST00000447274 2881 ntTSL 1 (best) BASIC23.86■■□□□ 1.41
PRR29P0C7W0 NKX6-1-202ENST00000515820 2194 ntTSL 3 BASIC23.86■■□□□ 1.41
PRR29P0C7W0 SLC13A3-204ENST00000413164 2008 ntTSL 2 BASIC23.86■■□□□ 1.41
PRR29P0C7W0 LPAR1-201ENST00000358883 2687 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC23.86■■□□□ 1.41
PRR29P0C7W0 RAB3A-201ENST00000222256 1528 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.85■■□□□ 1.41
PRR29P0C7W0 TRIM3-202ENST00000359518 3042 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.85■■□□□ 1.41
PRR29P0C7W0 RASSF1-203ENST00000359365 1923 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.85■■□□□ 1.41
PRR29P0C7W0 SOX3-201ENST00000370536 2132 ntAPPRIS P1 BASIC23.85■■□□□ 1.41
PRR29P0C7W0 CDKN2B-202ENST00000380142 859 ntTSL 1 (best) BASIC23.85■■□□□ 1.41
PRR29P0C7W0 NRL-205ENST00000560550 788 ntTSL 1 (best) BASIC23.85■■□□□ 1.41
PRR29P0C7W0 CCDC88B-203ENST00000359902 2326 ntTSL 1 (best) BASIC23.85■■□□□ 1.41
PRR29P0C7W0 TMCC2-209ENST00000637895 1455 ntTSL 1 (best) BASIC23.85■■□□□ 1.41
PRR29P0C7W0 TMEM129-206ENST00000536901 2172 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.85■■□□□ 1.41
PRR29P0C7W0 GPSM1-206ENST00000616132 2270 ntTSL 1 (best) BASIC23.85■■□□□ 1.41
PRR29P0C7W0 PLD4-201ENST00000392593 6515 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.84■■□□□ 1.41
PRR29P0C7W0 PEX5-204ENST00000412720 2105 ntTSL 2 BASIC23.84■■□□□ 1.41
PRR29P0C7W0 HHIPL1-202ENST00000357223 2241 ntTSL 1 (best) BASIC23.84■■□□□ 1.41
PRR29P0C7W0 ZNF32-202ENST00000395797 1201 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.84■■□□□ 1.41
PRR29P0C7W0 POLR2F-203ENST00000407936 582 ntTSL 3 BASIC23.84■■□□□ 1.41
PRR29P0C7W0 KRTAP5-2-201ENST00000412090 1118 ntAPPRIS P1 BASIC23.84■■□□□ 1.41
PRR29P0C7W0 POLR2F-207ENST00000460648 518 ntTSL 4 BASIC23.84■■□□□ 1.41
PRR29P0C7W0 CDKN2A-206ENST00000494262 989 ntTSL 3 BASIC23.84■■□□□ 1.41
PRR29P0C7W0 AL034346.1-201ENST00000568244 1277 ntBASIC23.84■■□□□ 1.41
PRR29P0C7W0 AP001002.2-201ENST00000625137 386 ntBASIC23.84■■□□□ 1.41
PRR29P0C7W0 SP9-201ENST00000394967 2554 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.84■■□□□ 1.41
PRR29P0C7W0 SLC30A5-201ENST00000380860 1317 ntTSL 1 (best) BASIC23.84■■□□□ 1.41
PRR29P0C7W0 AC135279.3-201ENST00000610945 1311 ntBASIC23.84■■□□□ 1.41
PRR29P0C7W0 RITA1-201ENST00000548278 2053 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.83■■□□□ 1.41
PRR29P0C7W0 TMC7-205ENST00000569532 2738 ntTSL 2 BASIC23.83■■□□□ 1.41
PRR29P0C7W0 NUTF2-201ENST00000219169 2321 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.83■■□□□ 1.41
PRR29P0C7W0 SGTA-201ENST00000221566 2330 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.83■■□□□ 1.41
PRR29P0C7W0 EPN1-201ENST00000085079 2355 ntTSL 1 (best) BASIC23.83■■□□□ 1.41
PRR29P0C7W0 FARSA-201ENST00000314606 1814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.83■■□□□ 1.41
PRR29P0C7W0 INS-202ENST00000381330 597 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.83■■□□□ 1.41
PRR29P0C7W0 CHTF8-208ENST00000522091 863 ntTSL 2 BASIC23.83■■□□□ 1.41
PRR29P0C7W0 AC233992.3-201ENST00000607491 485 ntBASIC23.83■■□□□ 1.41
PRR29P0C7W0 CKMT1B-207ENST00000441322 1747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.83■■□□□ 1.41
PRR29P0C7W0 PXYLP1-203ENST00000502783 2066 ntTSL 2 BASIC23.83■■□□□ 1.41
PRR29P0C7W0 GSPT1-203ENST00000439887 2509 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.83■■□□□ 1.41
PRR29P0C7W0 AP006587.3-201ENST00000525742 1516 ntBASIC23.83■■□□□ 1.41
PRR29P0C7W0 FOSL1-201ENST00000312562 1669 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.83■■□□□ 1.4
PRR29P0C7W0 OTOP1-201ENST00000296358 1864 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.82■■□□□ 1.4
PRR29P0C7W0 DCK-201ENST00000286648 2716 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.82■■□□□ 1.4
PRR29P0C7W0 AC068580.1-201ENST00000446489 252 ntTSL 3 BASIC23.82■■□□□ 1.4
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 21.9 ms