Protein–RNA interactions for Protein: P04818

TYMS, Thymidylate synthase, humanhuman

Predictions only

Length 313 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TYMSP04818 AL158151.1-201ENST00000372490 2047 ntTSL 2 BASIC16.38■□□□□ 0.21
TYMSP04818 CSNK1D-203ENST00000392334 2047 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
TYMSP04818 AC087289.5-201ENST00000586076 3175 ntBASIC16.38■□□□□ 0.21
TYMSP04818 CPNE9-203ENST00000383832 2068 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.38■□□□□ 0.21
TYMSP04818 AL117348.2-201ENST00000432920 1625 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.37■□□□□ 0.21
TYMSP04818 ENGASE-205ENST00000579016 2579 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
TYMSP04818 FAM129C-207ENST00000599124 1918 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
TYMSP04818 CBLN2-201ENST00000269503 2945 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
TYMSP04818 NAT16-201ENST00000300303 2935 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC16.37■□□□□ 0.21
TYMSP04818 GATA4-207ENST00000532059 1459 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
TYMSP04818 CRLF3-201ENST00000324238 2957 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
TYMSP04818 KCTD13-202ENST00000561540 1773 ntTSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
TYMSP04818 AC138028.2-201ENST00000440406 1539 ntTSL 2 BASIC16.37■□□□□ 0.21
TYMSP04818 GUK1-208ENST00000366728 842 ntTSL 2 BASIC16.37■□□□□ 0.21
TYMSP04818 TMPO-AS1-201ENST00000546421 738 ntTSL 5 BASIC16.37■□□□□ 0.21
TYMSP04818 FAM173A-202ENST00000564000 1088 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.37■□□□□ 0.21
TYMSP04818 TSPAN10-204ENST00000611590 1068 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
TYMSP04818 ZBTB33-202ENST00000557385 2346 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
TYMSP04818 DSCAM-201ENST00000400454 8552 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
TYMSP04818 CACNA1A-246ENST00000637736 8340 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.37■□□□□ 0.21
TYMSP04818 COMMD5-201ENST00000305103 1373 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
TYMSP04818 NKX6-3-201ENST00000518699 1352 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.37■□□□□ 0.21
TYMSP04818 AC064853.3-201ENST00000641801 1658 ntAPPRIS P1 BASIC16.37■□□□□ 0.21
TYMSP04818 PHKA1-204ENST00000373545 6173 ntTSL 5 BASIC16.37■□□□□ 0.21
TYMSP04818 A1BG-201ENST00000263100 1722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
TYMSP04818 MCC-208ENST00000514701 2855 ntTSL 2 BASIC16.36■□□□□ 0.21
TYMSP04818 ADAMTS2-202ENST00000274609 2044 ntTSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
TYMSP04818 GPR143-203ENST00000467482 1762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
TYMSP04818 PLEKHO1-201ENST00000369124 2050 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
TYMSP04818 GPC5-201ENST00000377067 2957 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
TYMSP04818 CASKIN1-201ENST00000343516 5759 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
TYMSP04818 PHOSPHO1-201ENST00000310544 1816 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.36■□□□□ 0.21
TYMSP04818 FAM53A-202ENST00000461064 2159 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.36■□□□□ 0.21
TYMSP04818 DMPK-205ENST00000458663 2548 ntTSL 5 BASIC16.36■□□□□ 0.21
TYMSP04818 AC009511.2-201ENST00000545904 679 ntTSL 2 BASIC16.36■□□□□ 0.21
TYMSP04818 MIR4508-201ENST00000584178 70 ntBASIC16.36■□□□□ 0.21
TYMSP04818 GADD45A-205ENST00000617962 1142 ntTSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
TYMSP04818 ZNF398-202ENST00000475153 2860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
TYMSP04818 TPD52-209ENST00000518937 2856 ntTSL 2 BASIC16.36■□□□□ 0.21
TYMSP04818 SLC25A1-201ENST00000215882 1648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
TYMSP04818 AC008073.3-201ENST00000610442 2281 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.36■□□□□ 0.21
TYMSP04818 HIBADH-201ENST00000265395 1990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
TYMSP04818 PAOX-206ENST00000480071 1324 ntTSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
TYMSP04818 POMGNT1-201ENST00000371984 2728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
TYMSP04818 SNX7-201ENST00000306121 1734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
TYMSP04818 FGF2-202ENST00000608478 3880 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
TYMSP04818 INPP4A-201ENST00000074304 6752 ntTSL 5 BASIC16.36■□□□□ 0.21
TYMSP04818 EML3-217ENST00000531557 2509 ntTSL 5 BASIC16.36■□□□□ 0.21
TYMSP04818 ZSWIM8-220ENST00000604524 5465 ntTSL 5 BASIC16.35■□□□□ 0.21
TYMSP04818 LRCH4-201ENST00000310300 2552 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
TYMSP04818 HOXB3-202ENST00000460160 1525 ntTSL 5 BASIC16.35■□□□□ 0.21
TYMSP04818 PDCD2-204ENST00000453163 2657 ntTSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
TYMSP04818 NNT-AS1-206ENST00000606697 1945 ntTSL 2 BASIC16.35■□□□□ 0.21
TYMSP04818 LIMS2-207ENST00000409808 2315 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.35■□□□□ 0.21
TYMSP04818 SRCIN1-213ENST00000617146 7058 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
TYMSP04818 SMIM10L2A-201ENST00000417443 5230 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
TYMSP04818 BAALC-203ENST00000309982 2831 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
TYMSP04818 LTBP3-217ENST00000530785 2461 ntTSL 2 BASIC16.35■□□□□ 0.21
TYMSP04818 CCDC37-AS1-202ENST00000506660 986 ntTSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
TYMSP04818 MSLN-205ENST00000563941 2109 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
TYMSP04818 SPHK2-211ENST00000600537 2136 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.35■□□□□ 0.21
TYMSP04818 LRRC34-201ENST00000446859 1718 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.35■□□□□ 0.21
TYMSP04818 UROS-204ENST00000368797 1313 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
TYMSP04818 GABARAPL3-202ENST00000624044 1851 ntBASIC16.35■□□□□ 0.21
TYMSP04818 POTEC-204ENST00000620346 1988 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
TYMSP04818 NGLY1-202ENST00000280700 2473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
TYMSP04818 KLC1-208ENST00000452929 2453 ntTSL 5 BASIC16.35■□□□□ 0.21
TYMSP04818 HSF4-225ENST00000584272 1549 ntTSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
TYMSP04818 PRR14-202ENST00000300835 2198 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
TYMSP04818 ATP6V0A2-201ENST00000330342 6542 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
TYMSP04818 PAX1-201ENST00000398485 2838 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.34■□□□□ 0.21
TYMSP04818 HIC1-207ENST00000619757 6711 ntTSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
TYMSP04818 ADGRB1-201ENST00000323289 5527 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
TYMSP04818 RHNO1-204ENST00000489288 1870 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
TYMSP04818 NKX2-8-201ENST00000258829 1261 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
TYMSP04818 LRRC1-201ENST00000370882 808 ntTSL 3 BASIC16.34■□□□□ 0.21
TYMSP04818 AC018755.3-201ENST00000598755 664 ntTSL 2 BASIC16.34■□□□□ 0.21
TYMSP04818 ZNF664-207ENST00000539644 5108 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
TYMSP04818 RNF38-205ENST00000377877 1974 ntTSL 2 BASIC16.34■□□□□ 0.21
TYMSP04818 RITA1-201ENST00000548278 2053 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
TYMSP04818 ASB16-201ENST00000293414 2139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
TYMSP04818 CMTM3-201ENST00000361909 2159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
TYMSP04818 STMN4-202ENST00000350889 2288 ntTSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
TYMSP04818 ARIH2OS-201ENST00000408959 1598 ntAPPRIS P1 BASIC16.34■□□□□ 0.21
TYMSP04818 AC144652.1-201ENST00000609974 1624 ntBASIC16.34■□□□□ 0.21
TYMSP04818 ITGBL1-202ENST00000376180 2494 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
TYMSP04818 CRLF1-201ENST00000392386 1792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.21
TYMSP04818 CITED2-202ENST00000536159 1797 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.33■□□□□ 0.21
TYMSP04818 BX323043.1-201ENST00000641006 1765 ntBASIC16.33■□□□□ 0.21
TYMSP04818 PPP1R12B-212ENST00000480184 1808 ntTSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.21
TYMSP04818 TXNRD3-204ENST00000640433 1932 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.21
TYMSP04818 FBXL14-201ENST00000339235 2111 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.21
TYMSP04818 GNA14-201ENST00000341700 2482 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
TYMSP04818 AL121906.1-201ENST00000606866 440 ntTSL 3 BASIC16.33■□□□□ 0.2
TYMSP04818 SDK1-202ENST00000404826 10397 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
TYMSP04818 ENTPD6-201ENST00000354989 2708 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
TYMSP04818 CTDP1-208ENST00000613122 5866 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
TYMSP04818 C7orf49-203ENST00000430372 1579 ntTSL 5 BASIC16.33■□□□□ 0.2
TYMSP04818 RARRES2-202ENST00000466675 1618 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.33■□□□□ 0.2
TYMSP04818 TRA2A-201ENST00000297071 1845 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 23.6 ms