Protein–RNA interactions for Protein: O43426

SYNJ1, Synaptojanin-1, humanhuman

Predictions only

Length 1,573 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SYNJ1O43426 EML2-209ENST00000587152 2763 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC36.16■■■■□ 3.38
SYNJ1O43426 BEX2-204ENST00000536889 1077 ntTSL 2 BASIC36.15■■■■□ 3.38
SYNJ1O43426 AC083880.1-201ENST00000608266 535 ntBASIC36.15■■■■□ 3.38
SYNJ1O43426 REPIN1-214ENST00000489432 2058 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC36.15■■■■□ 3.38
SYNJ1O43426 DNAAF3-203ENST00000524407 2059 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC36.15■■■■□ 3.38
SYNJ1O43426 PRDX1-201ENST00000262746 1234 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC36.15■■■■□ 3.38
SYNJ1O43426 CCDC74A-201ENST00000295171 1543 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC36.14■■■■□ 3.38
SYNJ1O43426 CCDC74B-201ENST00000310463 1549 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC36.14■■■■□ 3.38
SYNJ1O43426 RUSC1-AS1-203ENST00000450199 1636 ntTSL 1 (best) BASIC36.14■■■■□ 3.38
SYNJ1O43426 POLR2J2-202ENST00000358438 2065 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC36.14■■■■□ 3.38
SYNJ1O43426 AP2S1-207ENST00000599990 829 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC36.14■■■■□ 3.38
SYNJ1O43426 AQP6-201ENST00000315520 1398 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.14■■■■□ 3.38
SYNJ1O43426 FMR1-AS1-201ENST00000594922 2005 ntTSL 1 (best) BASIC36.13■■■■□ 3.37
SYNJ1O43426 FDX2-202ENST00000393708 1012 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.13■■■■□ 3.37
SYNJ1O43426 BMP1-204ENST00000397814 836 ntTSL 4 BASIC36.13■■■■□ 3.37
SYNJ1O43426 ELOVL2-AS1-201ENST00000456190 737 ntTSL 3 BASIC36.13■■■■□ 3.37
SYNJ1O43426 CAVIN3-203ENST00000530979 957 ntTSL 2 BASIC36.13■■■■□ 3.37
SYNJ1O43426 LIMD2-206ENST00000578993 602 ntTSL 3 BASIC36.13■■■■□ 3.37
SYNJ1O43426 TPD52L1-203ENST00000368402 1308 ntTSL 1 (best) BASIC36.13■■■■□ 3.37
SYNJ1O43426 TMEM256-PLSCR3-204ENST00000573331 2557 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC36.13■■■■□ 3.37
SYNJ1O43426 NKX2-3-202ENST00000622383 1986 ntTSL 5 BASIC36.12■■■■□ 3.37
SYNJ1O43426 SOX18-201ENST00000340356 1864 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.12■■■■□ 3.37
SYNJ1O43426 MREG-201ENST00000263268 1314 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC36.12■■■■□ 3.37
SYNJ1O43426 C4orf48-201ENST00000409248 433 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC36.12■■■■□ 3.37
SYNJ1O43426 ZCCHC9-204ENST00000438268 1248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.12■■■■□ 3.37
SYNJ1O43426 ZNF148-203ENST00000468369 1025 ntTSL 1 (best) BASIC36.12■■■■□ 3.37
SYNJ1O43426 TXNL4A-203ENST00000585474 1185 ntTSL 1 (best) BASIC36.12■■■■□ 3.37
SYNJ1O43426 RBMS1-205ENST00000409972 1815 ntTSL 5 BASIC36.12■■■■□ 3.37
SYNJ1O43426 PACRGL-227ENST00000513459 1773 ntTSL 5 BASIC36.12■■■■□ 3.37
SYNJ1O43426 PEBP1-201ENST00000261313 1697 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.12■■■■□ 3.37
SYNJ1O43426 HRH3-202ENST00000340177 2659 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC36.12■■■■□ 3.37
SYNJ1O43426 MKRN4P-201ENST00000444706 1521 ntBASIC36.11■■■■□ 3.37
SYNJ1O43426 CASTOR1-201ENST00000404953 1460 ntTSL 5 BASIC36.11■■■■□ 3.37
SYNJ1O43426 CASP16P-201ENST00000428155 1433 ntTSL 1 (best) BASIC36.11■■■■□ 3.37
SYNJ1O43426 NAT16-202ENST00000443096 1286 ntTSL 1 (best) BASIC36.11■■■■□ 3.37
SYNJ1O43426 AL390816.2-201ENST00000554252 737 ntTSL 3 BASIC36.11■■■■□ 3.37
SYNJ1O43426 IFNGR2-203ENST00000405436 1684 ntTSL 5 BASIC36.11■■■■□ 3.37
SYNJ1O43426 FHL3-201ENST00000373016 1647 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.11■■■■□ 3.37
SYNJ1O43426 NEU4-204ENST00000405370 1907 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.11■■■■□ 3.37
SYNJ1O43426 STEAP1-201ENST00000297205 1313 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.11■■■■□ 3.37
SYNJ1O43426 IPO13-201ENST00000372339 1201 ntTSL 2 BASIC36.1■■■■□ 3.37
SYNJ1O43426 MAGIX-202ENST00000595224 1238 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC36.1■■■■□ 3.37
SYNJ1O43426 PRELID2-201ENST00000334744 2140 ntTSL 2 BASIC36.1■■■■□ 3.37
SYNJ1O43426 RNPS1-201ENST00000301730 1276 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC36.1■■■■□ 3.37
SYNJ1O43426 PPP1CA-202ENST00000358239 1054 ntTSL 2 BASIC36.1■■■■□ 3.37
SYNJ1O43426 MIPEPP3-201ENST00000412105 444 ntBASIC36.1■■■■□ 3.37
SYNJ1O43426 MAGI2-AS3-211ENST00000451809 707 ntTSL 3 BASIC36.1■■■■□ 3.37
SYNJ1O43426 RNA5SP413-201ENST00000516373 109 ntBASIC36.1■■■■□ 3.37
SYNJ1O43426 HMGA2-203ENST00000393578 1993 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC36.1■■■■□ 3.37
SYNJ1O43426 BSPRY-201ENST00000374183 2339 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.1■■■■□ 3.37
SYNJ1O43426 FPGS-204ENST00000393706 2230 ntTSL 2 BASIC36.09■■■■□ 3.37
SYNJ1O43426 TSPAN11-202ENST00000535215 988 ntTSL 2 BASIC36.09■■■■□ 3.37
SYNJ1O43426 Z92544.1-201ENST00000567091 730 ntTSL 3 BASIC36.09■■■■□ 3.37
SYNJ1O43426 PINK1-201ENST00000321556 2660 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.09■■■■□ 3.37
SYNJ1O43426 AC080112.2-201ENST00000578774 2094 ntTSL 4 BASIC36.09■■■■□ 3.37
SYNJ1O43426 SMAGP-205ENST00000603864 1518 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC36.08■■■■□ 3.37
SYNJ1O43426 LINC02531-201ENST00000404689 593 ntTSL 5 BASIC36.08■■■■□ 3.37
SYNJ1O43426 PPP1R14BP2-201ENST00000426284 444 ntBASIC36.08■■■■□ 3.37
SYNJ1O43426 RARRES1-204ENST00000479756 839 ntTSL 1 (best) BASIC36.08■■■■□ 3.37
SYNJ1O43426 Z97653.1-201ENST00000567096 446 ntTSL 3 BASIC36.08■■■■□ 3.37
SYNJ1O43426 SUMF1-201ENST00000272902 2159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.08■■■■□ 3.37
SYNJ1O43426 GCA-201ENST00000233612 1694 ntTSL 2 BASIC36.08■■■■□ 3.37
SYNJ1O43426 ASCL2-201ENST00000331289 1852 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.08■■■■□ 3.37
SYNJ1O43426 MFSD3-201ENST00000301327 1548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.07■■■■□ 3.37
SYNJ1O43426 GPR137-201ENST00000313074 1485 ntTSL 5 BASIC36.07■■■■□ 3.37
SYNJ1O43426 GPR137-203ENST00000411458 1495 ntTSL 2 BASIC36.07■■■■□ 3.37
SYNJ1O43426 TRIM35-203ENST00000521253 1215 ntTSL 1 (best) BASIC36.07■■■■□ 3.37
SYNJ1O43426 IL34-204ENST00000566361 1001 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC36.07■■■■□ 3.37
SYNJ1O43426 HAUS4-205ENST00000541587 1637 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.07■■■■□ 3.36
SYNJ1O43426 SRPK3-202ENST00000370101 1958 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC36.07■■■■□ 3.36
SYNJ1O43426 TMEM175-212ENST00000508204 1399 ntTSL 3 BASIC36.07■■■■□ 3.36
SYNJ1O43426 AC009086.2-201ENST00000449759 610 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC36.06■■■■□ 3.36
SYNJ1O43426 AC027451.1-201ENST00000530667 553 ntTSL 4 BASIC36.06■■■■□ 3.36
SYNJ1O43426 AC092118.2-201ENST00000613495 667 ntBASIC36.06■■■■□ 3.36
SYNJ1O43426 MYC-209ENST00000641252 345 ntBASIC36.06■■■■□ 3.36
SYNJ1O43426 WRAP73-201ENST00000270708 1665 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.06■■■■□ 3.36
SYNJ1O43426 DHRS2-202ENST00000344777 1678 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC36.06■■■■□ 3.36
SYNJ1O43426 SLC22A17-201ENST00000206544 2284 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC36.06■■■■□ 3.36
SYNJ1O43426 NR2F6-201ENST00000291442 2404 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.06■■■■□ 3.36
SYNJ1O43426 KATNAL2-208ENST00000592005 1348 ntTSL 1 (best) BASIC36.06■■■■□ 3.36
SYNJ1O43426 FNDC11-201ENST00000370097 1119 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC36.06■■■■□ 3.36
SYNJ1O43426 LINC01191-201ENST00000412690 844 ntTSL 2 BASIC36.06■■■■□ 3.36
SYNJ1O43426 DDX42-201ENST00000359353 2783 ntTSL 5 BASIC36.05■■■■□ 3.36
SYNJ1O43426 MMP23B-201ENST00000356026 1326 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.05■■■■□ 3.36
SYNJ1O43426 TMEM185A-208ENST00000611119 2662 ntTSL 2 BASIC36.05■■■■□ 3.36
SYNJ1O43426 DACT1-206ENST00000556859 2239 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC36.05■■■■□ 3.36
SYNJ1O43426 LGALS7-201ENST00000378626 466 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.05■■■■□ 3.36
SYNJ1O43426 BET1L-204ENST00000410108 637 ntTSL 3 BASIC36.05■■■■□ 3.36
SYNJ1O43426 GCSHP5-201ENST00000443090 522 ntBASIC36.05■■■■□ 3.36
SYNJ1O43426 SNHG6-203ENST00000520944 638 ntTSL 1 (best) BASIC36.05■■■■□ 3.36
SYNJ1O43426 ALDH3A2-224ENST00000626500 995 ntTSL 5 BASIC36.05■■■■□ 3.36
SYNJ1O43426 STK32C-201ENST00000298630 2086 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.05■■■■□ 3.36
SYNJ1O43426 TOX2-201ENST00000341197 1880 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC36.05■■■■□ 3.36
SYNJ1O43426 P2RX2-201ENST00000343948 1494 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC36.04■■■■□ 3.36
SYNJ1O43426 MCUB-201ENST00000394650 2278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.04■■■■□ 3.36
SYNJ1O43426 CPLX1-203ENST00000505203 2011 ntTSL 2 BASIC36.04■■■■□ 3.36
SYNJ1O43426 EIF4E3-203ENST00000421769 777 ntTSL 1 (best) BASIC36.04■■■■□ 3.36
SYNJ1O43426 COL19A1-203ENST00000478620 589 ntTSL 1 (best) BASIC36.04■■■■□ 3.36
SYNJ1O43426 OR10C1-204ENST00000622521 1039 ntBASIC36.04■■■■□ 3.36
SYNJ1O43426 SMPD5-201ENST00000528912 1390 ntTSL 5 BASIC36.04■■■■□ 3.36
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 33.3 ms